PCR amplification.A single product

PCR amplification.
A single product of approximately 560 to 600 bp was obtained from all the PCR amplifications with primers ITS1 and ITS4 for 17 biocontrol isolates of Trichoderma spp.

DNA sequencing.
The ITS1 region of five isolates (isolates 11, 24, 260, 2925, and 2931), representing the two T. harzianum major groups, had been previously sequenced (12). ITS2 sequence was completed for these strains, as well as the further biocontrol strains included in this study. The size of PCR products amplified with the primer pair ITS1-ITS4 ranged from 563 to 602 bp and contained ITS1, ITS2, and the 5.8S rDNA gene and also 11 bp of the 3′ end of the 18S rDNA and 36 bp of the 5′ end of the 28S rDNA.

ITS1 and ITS2 lengths of the 17 biocontrol isolates were split into three groups. The first group included 6 strains, a second group included 10 strains, and a third group included one strain only. The ITS lengths were in agreement with those shown in an earlier study of T. longibrachiatum strains (20). The different ITS lengths are given in Table ​Table2.2. The length of the 5.8S gene was 158 bp for the 17 strains investigated, and no sequence variation was detected among strains.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กระบือผลิตภัณฑ์เดียวประมาณ 560 ไป 600 bp มาจากทั้งหมดที่ PCR amplifications กับไพรเมอร์ ITS1 และ ITS4 สำหรับ 17 biocontrol แยกเชื้อลำดับดีเอ็นเอภูมิภาค ITS1 ของห้าแยก (แยก 11, 24, 260, 2925 และ 2931), 2 T. harzianum กลุ่มหลัก เป็นตัวแทนได้รับก่อนหน้านี้ตามลำดับ (12) ลำดับ ITS2 เสร็จสำหรับสายพันธุ์เหล่านี้ เป็น biocontrol เพิ่มเติมสายพันธุ์รวมอยู่ในการศึกษานี้ ขยายขนาดของผลิตภัณฑ์ PCR กับคู่ไพรเมอร์ ITS1 ITS4 โจมตีระยะไกลจาก 563 bp และมี ITS1, ITS2, 602 และ 5.8S ของ rDNA ยีน และ 11 bp สิ้น 3′ rDNA 18 ปีและ 36 bp ของปลาย 5 ′ของ 28S rDNAความยาว ITS1 และ ITS2 ของแยก biocontrol 17 ถูกแบ่งออกเป็นสามกลุ่ม กลุ่มแรกรวมสายพันธุ์ 6 กลุ่มสองรวม 10 สายพันธุ์ และกลุ่มที่สามอยู่สายพันธุ์หนึ่งเท่านั้น ความยาวของข้อตกลงที่แสดงในการศึกษาก่อนหน้านี้ของสายพันธุ์ longibrachiatum T. (20) ได้ ความยาวของที่แตกต่างกันได้ในตาราง Table2.2 ความยาวของ 5.8S กับ ยีนเป็น 158 bp สำหรับสายพันธุ์ 17 ตรวจสอบ และเปลี่ยนแปลงลำดับไม่พบในสายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขยาย PCR.
ผลิตภัณฑ์เดียวประมาณ 560-600 bp ที่ได้รับจากทุกเครื่องขยายเสียง PCR กับไพรเมอร์ ITS1 และ ITS4 17 ควบคุมทางชีวภาพแยกเชื้อรา Trichoderma spp.

ลำดับดีเอ็นเอ.
ภูมิภาค ITS1 ห้าสายพันธุ์ (แยก 11, 24, 260, 2925 และ 2931) คิดเป็นสองเชื้อราไตรโคเดกลุ่มใหญ่ได้รับการลำดับขั้นตอนก่อนหน้านี้ (12) ลำดับ ITS2 เสร็จสมบูรณ์สำหรับสายพันธุ์เหล่านี้เช่นเดียวกับสายพันธุ์ควบคุมทางชีวภาพต่อไปรวมอยู่ในการศึกษาครั้งนี้ ขนาดของผลิตภัณฑ์ PCR ขยายกับคู่ไพรเมอร์ ITS1-ITS4 อยู่ในช่วง 563-602 ความดันโลหิตและมี ITS1, ITS2 และยีน 5.8S rDNA และ 11 bp ของปลาย 3 'ของ 18S rDNA และ 36 bp ของ 5 'ตอนท้ายของ 28S rDNA.

ITS1 และ ITS2 ความยาวของ 17 สายพันธุ์ควบคุมทางชีวภาพถูกแบ่งออกเป็นสามกลุ่ม กลุ่มแรกรวม 6 สายพันธุ์ซึ่งเป็นกลุ่มที่สองรวม 10 สายพันธุ์และกลุ่มที่สามรวมถึงหนึ่งในสายพันธุ์เท่านั้น ความยาวของมันได้ในข้อตกลงกับผู้ที่แสดงให้เห็นในการศึกษาก่อนหน้านี้ทีสายพันธุ์ longibrachiatum (20) แตกต่างกันที่ความยาวของมันจะถูกกำหนดในตาราง Table2.2 ความยาวของ 5.8S ยีน 158 bp สำหรับ 17 สายพันธุ์ที่ตรวจสอบและไม่มีการเปลี่ยนแปลงลำดับที่ตรวจพบในหมู่สายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เพื่อขยาย .ผลิตภัณฑ์เดียวประมาณ 560 600 เบสที่ได้จาก PCR ไพรเมอร์ทั้งหมด amplifications กับ its1 its4 17 และไบโอคอนโทรลเชื้อ Trichoderma spp .การจัดลำดับดีเอ็นเอการ its1 ภาคห้าแยก ( แยก 11 , 24 , 260 , โปรแกรม , และ 1 ) หรือ 2 T . harzianum สาขากลุ่มมาก่อนหน้านี้ ( 12 ) its2 ลำดับแล้วเสร็จ สำหรับสายพันธุ์เหล่านี้ รวมทั้งเพิ่มเติมไบโอคอนโทรล สายพันธุ์ รวมอยู่ในการศึกษานี้ ขนาดของ PCR ไพรเมอร์คู่กับผลิตภัณฑ์ its1-its4 ระหว่างเขากับ 602 BP และมี its1 its2 , และ 5.8s rDNA ยีนอีก 11 BP ของ 3 นั้นปลาย 18S rDNA และ 36 ขนาดนั้น 5 ปลาย 28s ด้วย .และความยาวของ its1 its2 17 ไบโอคอนโทรลแยกแบ่งออกเป็น 3 กลุ่ม คือ กลุ่มแรกรวม 6 สายพันธุ์ กลุ่มที่สองรวม 10 สายพันธุ์ และกลุ่มที่สาม ได้แก่ สายพันธุ์หนึ่งเท่านั้น ความยาวของมันสอดคล้องกับที่แสดงในการศึกษาก่อนหน้านี้ของ longibrachiatum สายพันธุ์ ( 20 ) ความแตกต่างของความยาวจะได้รับในตาราง​ table2.2 . ความยาวของ 5.8s ยีน 158 BP สำหรับ 17 สายพันธุ์ และลำดับการสอบสวนไม่พบในสายพันธุ์