Taq DNA polymerase, 2 mM MgCl2, 200

Taq DNA polymerase, 2 mM MgCl2, 200 mM dNTP mix, buffer solution
(10%) and ultrapure water to complete the volume. Thermocycling
conditions had an initial stage of 4 min at 92 C, followed
by 40 cycles of 1 min at 92 C, 1.30 min at 40 C, 2 min at 72 C,
followed by a final extension step of 72 C for 5 min, after which the
reaction was cooled at 20 C for 20 min. Amplification products
were submitted to electrophoresis on 1.4% agarose gels submerged
in 1  TBE buffer for 4 h at 60 V. The gel was then stained by immersion
for 20 min in a solution containing ethidium bromide
(0.05%) (Sambrook et al., 1989), and visualized/photographed under
U.V. light for posterior analysis. DNA fragment sizes were estimated
by comparison to a molecular size marker (1 Kb). Each observed
band was considered a locus under Mendelian segregation, and a
presence/absence (1/0) binomial matrix was generated in order to
calculate intra and interspecific diversities.
Genetic diversity and structure of the six locations were estimated
using ARLEQUIN 3.5 (Excoffier et al., 2005). Structure between
areas was inferred through pairwise Fst values, with
significance tests based on 1023 permutations (Excoffier et al.,
1992). The Fst values were considered low, moderate, high and
very high when ranging from 0 to 0.05, 0.05e0.15, 0.15e0.25, and
>0.25, respectively (Wright, 1978). These values were used to
construct a UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetical
Average) dendrogram in R 3.2.2, using the dendro_data and
hclust functions in package ggdendro. ARLEQUIN was also used to
test for Isolation by Distance through a Mantel test (Mantel, 1967)
that compared Fst and geographical distances (as calculated by
coastline distances) between groups.
2.4

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Taq DNA พอลิเมอเรส MgCl2 ผสม dNTP 200 mM, 2 mM ละลายบัฟเฟอร์(10%) และน้ำบริสุทธิ์พิเศษเพื่อทำเสียง เทอร์โม゚เงื่อนไขมีระยะเริ่มต้นของ 4 นาทีที่ 92 C ตามโดย 40 รอบ 1 นาทีที่ 92 C, 1.30 นาทีที่ 40 C, 2 นาทีที่ 72 Cตาม ด้วยขั้นตอนสุดท้ายนามสกุลของ 72 C 5 นาที หลังจากปฏิกิริยาความร้อน 20 c เป็นเวลา 20 นาทีขยายผลิตภัณฑ์ส่งมาที่อิบน 1.4% agarose เจจมอยู่ใต้น้ำในบัฟเฟอร์ TBE 1 สำหรับ 4 h 60 V เจลแล้วถูกย้อม โดยการแช่20 นาทีในการแก้ปัญหาที่ประกอบด้วยโบรไมด์ ethidium(0.05%) (Sambrook et al. 1989), และแสดงเป็นภาพ/ถ่ายภาพภายใต้เปลือกเบาสำหรับวิเคราะห์หลัง ขนาดส่วนของดีเอ็นเอที่ถูกประเมินโดยเปรียบเทียบกับเครื่องหมายขนาดโมเลกุล (1 Kb) แต่ละปฏิบัติวงได้รับการพิจารณาทีภายใต้การแบ่งแยกของเมนเดลพันธุ และสร้างสถานะการขาดงาน (1/0) ทวินามเมตริกซ์การคำนวณอินทราและ interspecific ความหลากหลายประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมและโครงสร้างของสถานหกใช้ทุก 3.5 (Excoffier et al. 2005) โครงสร้างระหว่างพื้นที่ถูกสรุปผ่านค่า Fst แพร์ไวส์ ด้วยการทดสอบนัยสำคัญคะแนนจาก 1023 วิธีเรียงสับเปลี่ยน (Excoffier et al.,1992) ค่า Fst พิจารณาว่าต่ำ ปานกลาง สูง และสูงมากเมื่อตั้งแต่ 0 ถึง 0.05, 0.05e0.15, 0.15e0.25 และ> 0.25 ตามลำดับ (Wright, 1978) ค่าเหล่านี้ใช้ในการสร้าง UPGMA (Unweighted คู่กลุ่มวิธี ด้วย ArithmeticalDendrogram เฉลี่ย) ใน R 3.2.2, dendro_data การใช้ และฟังก์ชั่น hclust ในแพคเกจ ggdendro ยังใช้ทุกแยกตามระยะทางการทดสอบผ่านการทดสอบหิ้ง (หิ้ง 1967)ที่เปรียบเทียบ Fst และระยะทางทางภูมิศาสตร์ (ตามที่คำนวณโดยระยะชายฝั่ง) ระหว่างกลุ่ม2.4

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Taq DNA Polymerase, 2 mm MgCl2 200 มิลลิผสม dNTP, สารละลายบัฟเฟอร์
(10%) และน้ำบริสุทธิ์ให้เสร็จสมบูรณ์ระดับเสียง Thermocycling
เงื่อนไขมีขั้นตอนเริ่มต้นของ 4 นาทีที่ 92 C ตาม
40 รอบ 1 นาทีที่ 92 C, 1.30 นาทีที่ 40 C, 2 นาทีที่ 72 C,
ตามด้วยขั้นตอนการขยายสุดท้ายของ 72 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 นาทีหลังจากที่ ซึ่ง
ปฏิกิริยาถูกระบายความร้อนที่ 20 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 20 นาที ผลิตภัณฑ์เครื่องขยายเสียง
ถูกส่งไป electrophoresis บน 1.4% เจล agarose จมอยู่ใต้น้ำ
ใน 1? บัฟเฟอร์ TBE 4 ชั่วโมงที่ 60 โวลต์เจลได้รับการย้อมสีแล้วโดยการแช่
เป็นเวลา 20 นาทีในการแก้ปัญหาที่มี ethidium bromide
(0.05%) (Sambrook et al., 1989) และมองเห็น / ถ่ายภาพภายใต้
U.V. แสงสำหรับการวิเคราะห์หลัง ดีเอ็นเอชิ้นส่วนขนาดประมาณ
โดยการเปรียบเทียบกับเครื่องหมายโมเลกุลขนาด (1 Kb) แต่ละข้อสังเกต
วงก็ถือว่าเป็นสถานทีภายใต้การแยกจากกันของเมนเดลและ
มี / ไม่มี (1/0) เมทริกซ์ทวินามถูกสร้างขึ้นเพื่อ
คำนวณความหลากหลายภายในและ interspecific.
ความหลากหลายทางพันธุกรรมและโครงสร้างของสถานที่หกอยู่ที่ประมาณ
โดยใช้ Arlequin 3.5 (Excoffier et al., 2005) โครงสร้างระหว่าง
พื้นที่ได้รับการสรุปผ่านค่า Fst คู่กับ
การทดสอบอย่างมีนัยสำคัญขึ้นอยู่กับพีชคณิต 1023 (Excoffier et al.,
1992) ค่า Fst ได้รับการพิจารณาต่ำปานกลางสูงและ
สูงมากเมื่อตั้งแต่ 0 ถึง 0.05, 0.05e0.15, 0.15e0.25 และ
> 0.25 ตามลำดับ (ไรท์ 1978) ค่าเหล่านี้ถูกนำมาใช้เพื่อ
สร้าง UPGMA (ชั่งวิธีการจับคู่กลุ่มคณิตศาสตร์
เฉลี่ย) dendrogram ใน R 3.2.2 ใช้ dendro_data และ
hclust ฟังก์ชั่นในแพคเกจ ggdendro Arlequin ยังถูกใช้ในการ
ทดสอบการแยกโดยระยะทางผ่านการทดสอบ Mantel (Mantel, 1967)
ว่าเมื่อเทียบ Fst และระยะทางภูมิศาสตร์ (คำนวณตาม
ระยะทางชายฝั่งทะเล) ระหว่างกลุ่ม.
2.4

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข่าวที่ปลอมเกิดจากการสร้างเรื่องมาจากคนที่อคติกับคนที่ถูกเขียนข่าว