The bases are oriented perpendicula

The bases are oriented perpendicular to the helix axis. They are hydrophobic in the direction perpendicular to the plane of the bases (cannot form hydrogen bonds with water). The interaction energy between two bases in a double-helical structure is therefore a combination of hydrogen-bonding between complementary bases, and hydrophobic interactions between the neighboring stacks of base-pairs.

Even in the single-stranded state, the bases prefer to be stacked (like the steps of a spiral staircase if the bases are identical) and a single-stranded chain can also have regions of helical conformation.

The backbone of polynucleotides are highly charged (1 unit negative charge for each phosphate group; 2 negative charges per base-pair). If there is no salt in the surrounding medium, there is a strong repulsion between the two strands and they will fall apart. Therefore counter-ions are essential for the double-helical structure. Counter-ions shield the charges on the sugar-phosphate backbone. They may also contribute to an attractive interaction from fluctuating counter-ions around the backbone, similar to the Van der Waals interactions for fluctuating induced dipoles.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ฐานเป็นแนวเส้นตั้งฉากกับแกนเกลียว พวกเขาเป็น hydrophobic ในทิศทางตั้งฉากกับเครื่องบินของฐาน (ไม่แบบพันธบัตรไฮโดรเจนน้ำ) พลังงานโต้ตอบระหว่างฐานสองในโครงสร้างคู่ helical จึงใช้ไฮโดรเจนที่ยึดระหว่างฐานเสริม และการโต้ตอบ hydrophobic ระหว่างกองฐานคู่ใกล้เคียงแม้แต่ในรัฐเดี่ยวควั่น ฐานชอบซ้อน (เช่นขั้นตอนของบันไดถ้าฐานเหมือนกัน) และยังมีห่วงโซ่เดียวควั่นแคว้น helical conformationแกนหลักของ polynucleotides ขอคิดค่าใช้จ่าย (ต่อ 1 หน่วยประจุลบสำหรับแต่ละกลุ่มฟอสเฟต ค่าติดลบ 2 ต่อฐานคู่) ถ้ามีไม่มีเกลือในรอบสื่อ repulsion แรงระหว่าง strands สอง และพวกเขาจะอยู่กัน ดังนั้น ประจุซึ่งเป็นสิ่งจำเป็นสำหรับโครงสร้างคู่ helical ประจุปราบปรามป้องกันค่าบนแกนหลักน้ำตาลฟอสเฟต นอกจากนี้พวกเขายังอาจนำไปสู่การโต้ตอบที่น่าสนใจจากกันปราบปรามความรอบแกนหลัก คล้ายกับการโต้ตอบของ Van der Waals สำหรับ dipoles ความเหนี่ยวนำให้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ฐานเป็นเชิงตั้งฉากกับแกนเกลียว พวกเขาจะไม่ชอบน้ำไปในทิศทางที่ตั้งฉากกับระนาบของฐาน (ไม่สามารถสร้างพันธะไฮโดรเจนกับน้ำ) พลังงานปฏิสัมพันธ์ระหว่างสองฐานในโครงสร้างสองขดลวดดังนั้นจึงเป็นเรื่องการรวมกันของไฮโดรเจนพันธะระหว่างฐานที่สมบูรณ์และปฏิสัมพันธ์ระหว่างน้ำกองใกล้เคียงฐานคู่แม้จะอยู่ในสถานะเดียวที่ควั่นฐานชอบที่จะซ้อนกัน (เช่นเดียวกับขั้นตอนของบันไดเวียนถ้าฐานเป็นเหมือนกัน) และห่วงโซ่เดียวติดยังสามารถมีภูมิภาคของโครงสร้างขดลวดกระดูกสันหลังของ polynucleotides เป็นค่าใช้จ่ายสูง (1 หน่วยประจุลบสำหรับแต่ละกลุ่มฟอสเฟต 2 ประจุลบต่อฐาน -pair) หากมีเกลือในสื่อโดยรอบไม่มีมีแรงผลักที่แข็งแกร่งระหว่างสองเส้นและพวกเขาจะกระจุย ดังนั้นเคาน์เตอร์อิออนมีความจำเป็นสำหรับโครงสร้างสองขดลวด เคาน์เตอร์ไอออน-ป้องกันค่าใช้จ่ายที่เกี่ยวกับกระดูกสันหลังน้ำตาลฟอสเฟต พวกเขายังอาจนำไปสู่การทำงานร่วมกันที่น่าสนใจจากความผันผวนของเคาน์เตอร์ไอออนรอบกระดูกสันหลังคล้ายกับแวนเดอร์ Waals ปฏิสัมพันธ์สำหรับผันผวนไดโพลเกิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ฐานเชิงตั้งฉากกับเกลียวแกน พวกเขาเป็นไฮโดรโฟบิกในทิศทางตั้งฉากกับระนาบของฐาน ( ไม่สามารถสร้างพันธะไฮโดรเจนกับน้ำ ) ปฏิสัมพันธ์ระหว่างพลังงานสองฐานในคู่ ขดลวด โครงสร้างจึงเป็นการรวมกันของพันธะไฮโดรเจนระหว่างเบสทรานซิสเตอร์ และปฏิสัมพันธ์ ) ระหว่างเพื่อนบ้านกอง

คู่เบสแม้ในเดียวติดรัฐ ฐานที่ชอบซ้อนกัน ( เหมือนขั้นบันไดของบันไดถ้าฐานเป็นเหมือนกัน ) และซิงเกิ้ลติดโซ่ยังสามารถมีพื้นที่ของลานโครงสร้าง

หัวใจของ polynucleotides คิดราคาสูง ( 1 หน่วยประจุลบสำหรับแต่ละกลุ่มฟอสเฟต 2 ประจุลบต่อคู่ ฐาน ) ถ้าไม่มีเกลือในรอบกลางมีแรงผลักระหว่างสองเส้นและพวกเขาจะแยกจากกัน ดังนั้น เคาน์เตอร์ไอออนที่จำเป็นสำหรับโครงสร้างเกลียวคู่ เคาน์เตอร์ไอออนป้องกันค่าใช้จ่ายในน้ำตาลฟอสเฟตกระดูกสันหลัง พวกเขายังอาจมีผลต่อการปฏิสัมพันธ์ที่น่าสนใจจากสินค้าเคาน์เตอร์ไอออนรอบกระดูกสันหลังคล้ายกับแวนเดอวาลส์ปฏิสัมพันธ์เพื่อให้เกิดความผันผวนคู่อิเลคตรอน .