genome amplification. We found 57%

genome amplification. We found 57% of samples (17/30) positive
for the presence of KRAS mutations on codons 12e13
(Table 3). Processing of the same samples by TaqMeltPCR
revealed only one positive sample (patient #24) thereby
demonstrating the clear superiority of ddPCR to detect very
low amounts of mutant copies (Supp. data 3).
3.3. KRAS status observed in CTCs is significantly
concordant with matched tumor tissues
In parallel, we compared the CTC results with the genotype
detected in the corresponding tumor tissues. The concordance
analysis was carried out for the 26 patients for whose
CTC genotype and formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE)
tumors were available. 17 tumor samples were genotyped by
MiSeq with the trusight illumina kit with a cut-off fixed to
5% while the 9 additional samples were analyzed by HRM
and sequencing due to a poorer quality of extracted DNA.
For these 26 tumors, we found 12 (46%) with KRAS mutations
in codon 12e13. Five tumors harbored mutation c38G > A
(G13D), 3 tumors the mutation c35G > A (G12D), and one tumor
each had the following mutations c34G > T (G12C), c34G > A
(G12S), c.35G > T (G12V) while the exact mutation could not
be determined for the last tumor. Comparing the KRAS genotype
in the tumors with the presence of at least one mutation
in the CTCs showed concordant results in 77% of cases (20/26)
[Ki2 ¼ 7.83, Pr ¼ 0.019] (Table 4). Specifically, among 12 tumor
samples with codon 12e13 KRAS mutations, we observed 10
positive samples for the 10 corresponding CTCs samples using
the KRAS multiplex assay (Sensitivityw83%) whereas 2 CTC
samples revealed the wild-type genotype, in contrast to the
corresponding tumors (patients 11 and 37). Moreover, out of
14 tumor samples with wild-type KRAS, 10 CTCs sample
were negative (Specificityw71.4%) while 4 were positive (patients
5, 23, 31 and 39). The 4 patients with CTC positive are

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขยายกลุ่ม เราพบ 57% ของตัวอย่าง (17/30) บวกสำหรับการปรากฏตัวของพันธุ์คราสบน codons 12e13(ตารางที่ 3) การประมวลผลอย่างเดียวกันโดย TaqMeltPCRเปิดเผยตัวอย่างบวกเดียวเท่านั้น (ผู้ป่วย #24) จึงแสดงให้เห็นความชัดเจนของ ddPCR การตรวจสอบมากจำนวนสำเนากลายพันธุ์ (Supp. ข้อมูล 3) ต่ำ3.3 สังเกตใน CTCs สถานะคราสอย่างมีนัยสำคัญจับคู่ concordant กับเนื้อเยื่อของเนื้องอกเราเปรียบเทียบผลการ CTC ที่ มีจีโนไทป์แบบขนานตรวจพบในเนื้อเยื่อมะเร็งที่สอดคล้องกัน สอดคล้องกับวิเคราะห์ผู้ป่วย 26 สำหรับที่ดำเนินจีโนไทป์แบบ CTC และ formalin คงฝังพาราฟิน (FFPE)เนื้องอกได้ ตัวอย่างเนื้องอก 17 ถูก genotyped โดยMiSeq กับ trusight kit illumina กับตัดที่ถาวรไป5% ในขณะที่มีวิเคราะห์ตัวอย่างเพิ่มเติม 9 โดย HRMและลำดับเนื่องจากมีคุณภาพย่อมสกัดดีเอ็นเอสำหรับเนื้องอกเหล่านี้ 26 เราพบ 12 (46%) กับพันธุ์คราสในรหัสพันธุกรรม 12e13 เนื้องอกที่ห้า harbored c38G กลายพันธุ์ > A(G13D), เนื้องอก 3 c35G กลายพันธุ์ > (G12D), และเนื้องอกหนึ่งแต่ละมีการกลายพันธุ์ c34G ต่อไปนี้ > T (G12C), c34G > A(G12S), c.35G > T (G12V) ไม่กลายพันธุ์แน่นอนกำหนดสำหรับเนื้องอกครั้งสุดท้าย เปรียบเทียบจีโนไทป์คราสในเนื้องอกมีการกลายพันธุ์น้อยใน CTCs concordant ผลลัพธ์ที่แสดงให้เห็นว่า 77% ของกรณี (20/26)[Ki2 ¼ 7.83, Pr ¼ 0.019] (ตารางที่ 4) เฉพาะ หนึ่งใน 12 เนื้องอกตัวอย่างที่ มีรหัสพันธุกรรม 12e13 คราสกลายพันธุ์ เราสังเกต 10ตัวอย่างบวกสำหรับตัว 10 อย่าง CTCs สอดคล้องกันโดยใช้คราส multiplex assay (Sensitivityw83%) ในขณะที่ 2 CTCตัวอย่างเปิดเผยป่าชนิดจีโนไทป์ ตรงกันข้ามกับการเนื้องอกที่เกี่ยวข้อง (ผู้ป่วย 11 และ 37) นอกจากนี้ จากตัวอย่างเนื้องอก 14 กับป่าชนิดคราส CTCs 10 อย่างถูกลบ (Specificityw71.4%) ในขณะที่ 4 บวก (ผู้ป่วย5, 23, 31 และ 39) ผู้ป่วย 4 กับ CTC บวก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขยายจีโนม เราพบว่า 57% ของกลุ่มตัวอย่าง (17/30) ในเชิงบวก
สำหรับการปรากฏตัวของการกลายพันธุ์ KRAS บน codons 12e13
(ตารางที่ 3) การประมวลผลของตัวอย่างเดียวกันโดยการ TaqMeltPCR
เปิดเผยเพียงหนึ่งตัวอย่างในเชิงบวก (ผู้ป่วย # 24) จึง
แสดงให้เห็นถึงความเหนือกว่าชัดเจนของ ddPCR ในการตรวจสอบมาก
ปริมาณต่ำของสำเนากลายพันธุ์ (ภาคผนวก. ข้อมูล 3)
3.3 สถานะ KRAS สังเกตใน CTCs อย่างมีนัยสำคัญ
สอดคล้องกับการจับคู่เนื้อเยื่อเนื้องอก
ในแบบคู่ขนานเราเมื่อเทียบกับผลที่ได้คุยกับจีโนไทป์
ตรวจพบในเนื้อเยื่อของเนื้องอกที่สอดคล้องกัน สอดคล้อง
วิเคราะห์ได้ดำเนินการสำหรับผู้ป่วยที่มี 26
CTC จีโนไทป์และฟอร์มาลินคงพาราฟินฝังตัว (FFPE)
เนื้องอกที่มีอยู่ 17 ตัวอย่างเนื้องอกถูก genotyped โดย
MiSeq กับชุด Trusight Illumina มีการตัดออกจับจ้องไปที่
5% ในขณะที่ 9 ตัวอย่างเพิ่มเติมได้วิเคราะห์โดยการบริหารทรัพยากรมนุษย์
และลำดับเนื่องจากการด้อยคุณภาพของ DNA ที่สกัด
เหล่านี้ 26 เนื้องอกเราพบ 12 (46%) ที่มีการกลายพันธุ์ KRAS
ใน codon 12e13 ห้าเนื้องอกเก็บงำกลายพันธุ์ C38G> เอ
(G13D) 3 เนื้องอกกลายพันธุ์ c35G> A (G12D) และเนื้องอก
แต่ละคนก็มีการกลายพันธุ์ต่อไป c34G> T (G12C) c34G> เอ
(G12S) c.35G> T ( G12V) ในขณะที่การกลายพันธุ์ที่แน่นอนไม่
ได้รับการพิจารณาสำหรับเนื้องอกที่ผ่านมา เปรียบเทียบยีน KRAS
ในเนื้องอกที่มีการปรากฏตัวของอย่างน้อยหนึ่งกลายพันธุ์
ใน CTCs แสดงให้เห็นว่าผลการพ้องใน 77% ของราย (20/26)
[Ki2 ¼ 7.83, Pr ¼ 0.019] (ตารางที่ 4) โดยเฉพาะในหมู่ 12 เนื้องอก
ตัวอย่างที่มีการกลายพันธุ์ codon 12e13 KRAS เราสังเกต 10
ตัวอย่างในเชิงบวกสำหรับ 10 ตัวอย่าง CTCs ใช้ที่สอดคล้องกัน
KRAS ทดสอบ multiplex (Sensitivityw83%) ในขณะที่ 2 CTC
ตัวอย่างเปิดเผยชนิดป่าจีโนไทป์ในทางตรงกันข้ามกับ
เนื้องอกที่สอดคล้องกัน ( ผู้ป่วยที่ 11 และ 37) นอกจากนี้จาก
14 ตัวอย่างเนื้องอกกับชนิดป่า KRAS ตัวอย่าง 10 CTCs
เป็นลบ (Specificityw71.4%) ในขณะที่ 4 เป็นบวก (ผู้ป่วยที่
5, 23, 31 และ 39) ผู้ป่วยที่ 4 กับ CTC บวก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จีโนม ( . เราพบว่า 57% ของกลุ่มตัวอย่าง ( 17 / 30 ) บวกสำหรับการปรากฏตัวของ kras การกลายพันธุ์ใน 12e13 ซิส( ตารางที่ 3 ) การประมวลผลของตัวอย่างเดียวกัน โดย taqmeltpcrพบเพียงหนึ่งตัวอย่าง ( บวกผู้ป่วย # 24 ) จึงแสดงให้เห็นถึงความเหนือกว่าชัดเจนของ ddpcr ตรวจสอบมากปริมาณชุดกลายพันธุ์ ( ร่วมกับข้อมูล 3 )3.3 . kras สถานะที่พบใน ctcs เป็นอย่างมากสอดคล้องกันกับเข้ากับเนื้อเยื่อเนื้องอกในแบบคู่ขนาน เราเทียบ CTC ผลลัพธ์ที่มีพันธุกรรมพบว่าในเนื้อเยื่อมะเร็งที่สอดคล้องกัน ความสอดคล้องวิเคราะห์สำหรับ 26 ผู้ป่วยที่มีCTC โตฟอร์มาลินพาราฟินฝังตัว ( ffpe ) ถาวรเนื้องอกได้ จำนวน genotyped 17 เนื้องอกโดยmiseq กับ trusight Illumina Kit กับตัดคงที่5% ขณะที่ 9 ตัวอย่าง วิเคราะห์โดยวิธีเพิ่มเติมจัดลำดับและเนื่องจากคุณภาพที่ด้อยของการสกัดดีเอ็นเอสำหรับ 26 เนื้องอก พบ 12 ( 46% ) กับ kras การกลายพันธุ์ในการส่งเสริม 12e13 . 5 เนื้องอก harbored การกลายพันธุ์ c38g >( g13d ) 3 เนื้องอกการกลายพันธุ์ c35g > ( g12d ) และเนื้องอกแต่ละคนมีต่อการกลายพันธุ์ c34g > T ( g12c ) c34g >( g12s ) c.35g > T ( g12v ) ในขณะที่การกลายพันธุ์ที่แน่นอนไม่ได้ได้รับการพิจารณาสำหรับเนื้องอกครั้งสุดท้าย เปรียบเทียบ kras พันธุกรรมในเนื้องอก ด้วยการแสดงตนของอย่างน้อยหนึ่งกลายพันธุ์ใน ctcs ให้ผลสอดคล้องกันใน 77 เปอร์เซ็นต์ของกรณี ( 20 / 25 )[ ki2 ¼ 7.83 PR ¼ 0.019 ] ( ตารางที่ 4 ) โดยเฉพาะในหมู่ 12 เนื้องอกตัวอย่าง 12e13 kras รหัสพันธุกรรมการกลายพันธุ์ พบ 10บวกจำนวน 10 ตัวอย่าง โดยใช้ ctcs สอดคล้องกันการ kras PCR assay ( sensitivityw83 % ) ส่วน 2 CTCพบของพันธุกรรม ในทางตรงกันข้ามกับเนื้องอกที่เกี่ยวข้อง ( 11 ราย และ 37 ) นอกจากนี้ ออกจาก14 ตัวอย่างกับเนื้องอกของ kras 10 ctcs ตัวอย่างเป็นลบ ( specificityw71.4 % ) ในขณะที่ 4 บวก ( ผู้ป่วย5 , 23 , 31 และ 39 ) 4 ผู้ป่วย CTC บวกเป็น