ABSTRACTSeed shape and size are amo

ABSTRACT
Seed shape and size are among the most important agronomic traits because they affect yield and market price. To obtain accurate seed size data, a large number of measurements are needed because there is little difference in size among seeds from one plant. To promote genetic analysis and selection for seed shape in plant breeding, efficient, reliable, high-throughput seed phenotyping methods are required. We developed SmartGrain software for high-throughput measurement of seed shape. This software uses a new image analysis method to reduce the time taken in the preparation of seeds and in image capture. Outlines of seeds are automatically recognized from digital images, and several shape parameters, such as seed length, width, area, and perimeter length, are calculated. To validate the software, we performed a quantitative trait locus (QTL) analysis for rice (Oryza sativa) seed shape using backcrossed inbred lines derived from a cross between japonica cultivars Koshihikari and Nipponbare, which showed small differences in seed shape. SmartGrain removed areas of awns and pedicels automatically, and several QTLs were detected for six shape parameters. The allelic effect of a QTL for seed length detected on chromosome 11 was confirmed in advanced backcross progeny; the cv Nipponbare allele increased seed length and, thus, seed weight. High-throughput measurement with SmartGrain reduced sampling error and made it possible to distinguish between lines with small differences in seed shape. SmartGrain could accurately recognize seed not only of rice but also of several other species, including Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). The software is free to researchers

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

นามธรรม
เมล็ดรูปร่างและขนาดมีลักษณะลักษณะทางพืชไร่สำคัญเนื่องจากจะส่งผลต่อผลผลิตและราคาตลาด รับข้อมูลขนาดเมล็ดที่ถูกต้อง วัดเป็นจำนวนมากจำเป็นเนื่องจากมีความแตกต่างน้อยขนาดระหว่างเมล็ดจากพืชหนึ่ง การวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและเลือกรูปร่างเมล็ดในพืชพันธุ์ มีประสิทธิภาพ เชื่อถือ ได้ จำเป็นต้องใช้วิธี phenotyping เมล็ดอัตราความเร็วสูง เราพัฒนาซอฟแวร์ SmartGrain สำหรับวัดอัตราความเร็วสูงของรูปร่างของเมล็ด ซอฟต์แวร์นี้ใช้วิธีการวิเคราะห์รูปแบบใหม่เพื่อลดเวลาที่ใช้ ในการเตรียมเมล็ดพันธุ์ และ ในการจับภาพ เค้าร่างของเมล็ดโดยอัตโนมัติได้รับการยอมรับจากภาพดิจิตอล และพารามิเตอร์รูปร่างต่าง ๆ เมล็ดความยาว ความกว้าง พื้นที่ ความ ยาวเส้นรอบรูป และคำนวณ การตรวจสอบซอฟต์แวร์ เราทำการวิเคราะห์เชิงปริมาณติดโลกัสโพล (QTL) สำหรับรูปร่างเมล็ดข้าว (Oryza ซา) ใช้ backcrossed บรรทัด inbred มาข้ามระหว่าง japonica พันธุ์ Koshihikari และ Nipponbare ซึ่งแสดงให้เห็นความแตกต่างของขนาดเล็กรูปร่างเมล็ด SmartGrain เอา awns และ pedicels โดยอัตโนมัติ และพบ QTLs หลายพารามิเตอร์รูปร่างหก ผล allelic QTL สำหรับความยาวเมล็ดที่พบบนโครโมโซม 11 ได้รับการยืนยันในลูกหลานไหม้ขั้นสูง cv Nipponbare allele เพิ่มความยาวของเมล็ดและ จึง น้ำหนักเมล็ด วัดอัตราความเร็วสูงกับ SmartGrain ลดข้อผิดพลาดในการสุ่มตัวอย่าง และทำให้สามารถแยกความแตกต่างระหว่างบรรทัดที่มีความแตกต่างของขนาดเล็กรูปร่างเมล็ด SmartGrain ได้อย่างถูกต้องรู้จักเมล็ดไม่เพียงแต่ข้าว แต่ยังหลาย ชนิดอื่น รวม Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) ซอฟต์แวร์มีอิสระที่จะวิจัย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อ
รูปร่างเมล็ดพันธุ์และขนาดเป็นหนึ่งในลักษณะทางการเกษตรที่สำคัญที่สุดเพราะพวกเขาส่งผลกระทบต่อผลผลิตและราคาในตลาด เพื่อให้ได้ข้อมูลขนาดของเมล็ดที่ถูกต้องเป็นจำนวนมากของการวัดมีความจำเป็นเพราะมีความแตกต่างเล็ก ๆ น้อย ๆ ในขนาดของเมล็ดจากพืช เพื่อส่งเสริมการวิเคราะห์ทางพันธุกรรมและการเลือกสำหรับรูปร่างเมล็ดพันธุ์ในการปรับปรุงพันธุ์พืชที่มีประสิทธิภาพและเชื่อถือได้สูงผ่านวิธีการ phenotyping เมล็ดพันธุ์จะต้อง เราได้พัฒนาซอฟแวร์ SmartGrain สำหรับการวัดความเร็วสูงของรูปร่างเมล็ด ซอฟแวร์นี้จะใช้วิธีการวิเคราะห์ภาพใหม่เพื่อลดเวลาในการเตรียมเมล็ดและในการจับภาพ โครงร่างของเมล็ดจะรับรู้โดยอัตโนมัติจากภาพดิจิตอลและพารามิเตอร์รูปร่างหลายเช่นความยาวเมล็ดกว้างพื้นที่และระยะเวลาในปริมณฑลที่มีการคำนวณ ในการตรวจสอบซอฟแวร์ที่เราดำเนินการทีลักษณะเชิงปริมาณ (QTL) การวิเคราะห์ข้าว (Oryza sativa) รูปร่างเมล็ดพันธุ์โดยใช้สายพันธุ์แท้ที่ได้มาจากการปรับปรุงพันธุ์ลูกผสมระหว่างพันธุ์ japonica Koshihikari และ Nipponbare ซึ่งแสดงให้เห็นความแตกต่างเล็ก ๆ ในรูปร่างเมล็ด SmartGrain ออกพื้นที่ของสนามอาคารและก้านดอกโดยอัตโนมัติและหลาย QTLs ถูกตรวจพบเป็นเวลาหกพารามิเตอร์รูปร่าง ผล allelic ของ QTL สำหรับความยาวเมล็ดตรวจพบบนโครโมโซม 11 ได้รับการยืนยันในลูกหลานผสมกลับขั้นสูง พันธุ์ Nipponbare อัลลีลที่เพิ่มขึ้นมีความยาวเมล็ดพันธุ์และทำให้เมล็ดน้ำหนัก วัดสูงผ่านด้วย SmartGrain ลดสุ่มตัวอย่างข้อผิดพลาดและทำให้มันเป็นไปได้ที่จะแยกแยะระหว่างเส้นที่มีความแตกต่างเล็ก ๆ ในรูปร่างเมล็ด SmartGrain ถูกต้องสามารถรับรู้ไม่เพียงเมล็ดพันธุ์ข้าว แต่ยังสายพันธุ์อื่น ๆ อีกหลายรวมทั้ง Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) ซอฟแวร์ฟรีที่นักวิจัย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

และขนาดรูปร่างเมล็ดนามธรรม
อยู่ในหมู่ที่สำคัญที่สุด เพราะมีผลกระทบต่อผลผลิตและลักษณะทางการเกษตรในราคาที่ตลาด เพื่อให้ได้ข้อมูลที่ถูกต้อง ขนาดเมล็ด ตัวเลขขนาดใหญ่ของการวัดจำเป็นเพราะมีความแตกต่างในขนาดของเมล็ดจากต้นหนึ่ง เพื่อส่งเสริมการวิเคราะห์พันธุกรรมและการคัดเลือกเมล็ดพันธุ์ รูปร่าง ในการผสมพันธุ์พืช มีประสิทธิภาพ เชื่อถือได้เมล็ดอวิธีการช่วยได้เป็นอย่างดี เราได้พัฒนาซอฟต์แวร์ที่ช่วย smartgrain การวัดรูปร่างเมล็ด ซอฟต์แวร์นี้ใช้วิธีวิเคราะห์ภาพใหม่เพื่อลดระยะเวลาในการเตรียมการของเมล็ด และในการจับภาพ . เค้าโครงของเมล็ดโดยอัตโนมัติได้รับการยอมรับจากภาพดิจิตอลและพารามิเตอร์รูปร่างหลายแบบ เช่น เมล็ด ความกว้าง ความยาว พื้นที่และความยาวเส้นรอบรูปที่มีการคํานวณ การตรวจสอบซอฟแวร์ เราได้แสดงเหลืองปรีดียาธร ( QTL ) การวิเคราะห์ข้าว ( Oryza sativa ) รูปร่างเมล็ดใช้ backcrossed สายพันธุ์แท้สายที่มาจากข้ามระหว่างญี่ปุ่นและโคชิฮิคาริ พันธุ์ nipponbare ซึ่งแสดงความแตกต่างเล็ก ๆในรูปร่างของเมล็ด smartgrain ออกพื้นที่และ awns pedicels โดยอัตโนมัติหลายตำแหน่ง และถูกตรวจพบ 6 รูปร่างพารามิเตอร์ ผลของยาฆ่าแมลง QTL ความยาวเมล็ดพบบนโครโมโซมคู่ที่ 11 ได้รับการยืนยันในรุ่นลูก ( CV nipponbare ขั้นสูง ในการเพิ่มความยาวของเมล็ดพันธุ์และ , จึง , น้ำหนักเมล็ด การวัดด้วยอัตราความเร็วสูง smartgrain ลดข้อผิดพลาดการสุ่มตัวอย่างและทำให้มันเป็นไปได้ที่จะแยกความแตกต่างระหว่างเส้นที่มีความแตกต่างเล็ก ๆในรูปร่างของเมล็ดsmartgrain อาจถูกต้องรู้จักเมล็ดพันธุ์ข้าวไม่เพียง แต่ยังของชนิดอื่น ๆหลายแห่งรวมถึง Arabidopsis ( Arabidopsis thaliana ) ซอฟต์แวร์ฟรีสำหรับนักวิจัย