A gene set analysis function for on

A gene set analysis function for one-sided test (OLS) and two-sided test (multivariate analysis of variance). Three multiple comparison procedures, Dunnett, Tukey, and sequential pairwise compar- ison, are implemented. MAVTgsa computes the p-values and FDR (false discovery rate) q-values for all gene sets. The p-values for individual genes in a significant gene set are also listed. MAVT- gsa generates a GST-plot of the empirical distribution function of the ranked test statistics of a given gene set.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีนที่กำหนดฟังก์ชันการวิเคราะห์ทดสอบด้านเดียว (OLS) การทดสอบแบบสองหน้า (ตัวแปรพหุการวิเคราะห์ของผลต่าง) สามมีใช้หลายขั้นตอนเปรียบเทียบ Dunnett, Tukey และลำดับแพร์ไวส์ compar-ison MAVTgsa คำนวณค่า p และค่า q FDR (อัตราการค้นพบเท็จ) สำหรับชุดยีนทั้งหมด ยังอยู่ค่า p ในยีนแต่ละยีนที่สำคัญในการ MAVT-gsa สร้างพล็อต GST ของฟังก์ชันการแจกผลของสถิติทดสอบอันดับของชุดยีนที่กำหนด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ชุดยีนฟังก์ชั่นการวิเคราะห์สำหรับการทดสอบด้านเดียว (OLS) และการทดสอบสองด้าน (การวิเคราะห์หลายตัวแปรความแปรปรวน) สามขั้นตอนการเปรียบเทียบหลาย Dunnett, ทูกีและลำดับจากจำนวน compar- เมดิสันจะดำเนินการ MAVTgsa คำนวณค่า P-และ FDR (อัตราการค้นพบเท็จ) คิวค่าสำหรับชุดของยีนทั้งหมด พีค่าสำหรับยีนในแต่ละชุดของยีนที่สำคัญยังมีการระบุไว้ MAVT- gsa สร้าง GST พล็อตของฟังก์ชั่นการกระจายเชิงประจักษ์ของสถ​​ิติทดสอบการจัดอันดับของชุดของยีนที่กำหนด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ฟังก์ชันการวิเคราะห์ยีนชุดทดสอบข้างเดียว ( OLS ) และการทดสอบแบบสองด้าน ( เมื่อวิเคราะห์ความแปรปรวน ) สามเปรียบเทียบพหุคูณขั้นตอน Dunnett คู่และลำดับขั้นตอน , compar - อีสัน จะใช้ mavtgsa คำนวณ p-values และ FDR ( อัตราการค้นพบเท็จ ) q-values สำหรับชุดของยีนทั้งหมด การ p-values สำหรับยีนแต่ละยีนสำคัญในชุดยังมีอยู่mavt - GSA สร้าง GST แปลงเชิงฟังก์ชันการแจกแจงของสถิติทดสอบของการได้รับยีนชุด .