16S rDNA sequence analysisGenomic D

16S rDNA sequence analysis

Genomic DNA of a potentially useful strain was extracted by
the standard method (Sambrook, Fritsch, & Maniatis, 1989) and
16S rDNA was amplified using GeneAmp PCR System 9600. The
F-primer was 5-GGGTGAGTACACGTGGGTGA-3 and the R-primer was 5-GCCCAGAGACCCGCCTTCGC-3. The PCR product size was 1507 bp. A 603 bp region of the amplified DNA was partially
sequenced using the ABI 377 DNA sequencer. The BLAST program
from the NCBI database (Altschul et al., 1997) was used to identify
the most closely related species to the strain.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

16S rDNA ลำดับวิเคราะห์Genomic DNA ของต้องใช้ประโยชน์อาจถูกสกัดโดยวิธีมาตรฐาน (Sambrook, Fritsch, & Maniatis, 1989) และ16S rDNA ถูกขยายโดยใช้ GeneAmp PCR ระบบ 9600 ที่รองพื้น F ถูก 5 - GGGTGAGTACACGTGGGTGA-3 และ R-สีรองพื้นมี 5 - GCCCAGAGACCCGCCTTCGC-3 ขนาดผลิตภัณฑ์ PCR ถูก 1507 bp ภูมิภาค bp 603 เอ็นเอาต์ได้บางส่วนเรียงลำดับโดยใช้ sequencer ABI 377 ดีเอ็นเอ โปรแกรมระเบิดจาก NCBI ที่ใช้เพื่อระบุฐานข้อมูล (Altschul และ al., 1997)ส่วนใหญ่พันธุ์ที่สัมพันธ์ใกล้ชิดกับสายพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

16S rDNA วิเคราะห์ลำดับจีโนมดีเอ็นเอของสายพันธุ์ที่มีประโยชน์อาจถูกสกัดโดยวิธีการมาตรฐาน (Sambrook, Fritsch และ Maniatis, 1989) และ16S rDNA ถูกขยายโดยใช้ระบบ GeneAmp PCR 9600 F-5 เป็นไพรเมอร์? -GGGTGAGTACACGTGGGTGA-3? และ R-ไพรเมอร์ 5? -GCCCAGAGACCCGCCTTCGC-3 ?. ขนาดผลิตภัณฑ์ PCR เป็น 1,507 bp ภูมิภาค 603 bp ดีเอ็นเอขยายบางส่วนได้รับการจัดลำดับการใช้ ABI 377 ซีเควนดีเอ็นเอ โปรแกรม BLAST จากฐานข้อมูล NCBI (Altschul et al., 1997) ถูกนำมาใช้ในการระบุสายพันธุ์ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับความเครียด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ 16S rDNA sequence

ดีเอ็นเออาจมีประโยชน์เมื่อยถูกสกัดโดยวิธีมาตรฐาน ( sambrook
, & Fritsch maniatis , 1989 ) และ
16S rDNA ถูกขยายการใช้ระบบ PCR geneamp 9600 .
f-primer 5  - gggtgagtacacgtgggtga-3  และ r-primer 5  - gcccagagacccgccttcgc-3  . pcr ผลิตภัณฑ์ขนาดทดลองตลอดความดันโลหิต เป็น 603 BP เขตของแถบดีเอ็นเอ
บางส่วนลำดับการใช้อบิ 377 DNA sequencer ได้ โปรแกรมระเบิด
จาก ncbi ฐานข้อมูล ( แอลเชิล et al . , 1997 ) ถูกใช้เพื่อระบุ
ที่สุดเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิดสายพันธุ์