a b s t r a c tGenetic identificati

a b s t r a c t
Genetic identification of aqueous environmental DNA (eDNA) provides site occupancy inferences for rare
aquatic macrofauna that are often easier to obtain than direct observations of organisms. This relative
ease makes eDNA sampling a valuable tool for conservation biology. Research on the origin, state, transport,
and fate of eDNA shed by aquatic macrofauna is needed to describe the spatiotemporal context for
eDNA-based occupancy inferences and to guide eDNA sampling design. We tested the hypothesis that
eDNA is more concentrated in surficial sediments than in surface water by measuring the concentration
of aqueous and sedimentary eDNA from an invasive fish, bigheaded Asian carp (Hypophthalmichthys spp.),
in experimental ponds and natural rivers. We modified a simple, low-cost DNA extraction method to
yield inhibitor-free eDNA from both sediment and water samples. Carp eDNA was 8–1800 times more
concentrated per gram of sediment than per milliliter of water and was detected in sediments up to
132 days after carp removal – five times longer than any previous reports of macrobial eDNA persistence
in water. These results may be explained by particle settling and/or retarded degradation of sedimentadsorbed
DNA molecules. Compared to aqueous eDNA, sedimentary eDNA could provide a more abundant
and longer-lasting source of genetic material for inferring current-or-past site occupancy by aquatic
macrofauna, particularly benthic species. However, resuspension and transport of sedimentary eDNA
could complicate the spatiotemporal inferences from surface water sampling, which is currently the predominant
eDNA-based approach. We discuss these implications in the context of conservation-oriented
monitoring in aquatic ecosystems.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

แบบ b s t r c tรหัสพันธุกรรมของ DNA อควีสิ่งแวดล้อม (เรื่อง) ให้ inferences สำหรับไซต์สำหรับการหายากmacrofauna น้ำที่มักง่ายกว่าสามารถสังเกตการณ์โดยตรงของสิ่งมีชีวิต ญาตินี้ความง่ายในการทำเรื่องที่สุ่มตัวอย่างเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับชีววิทยาเชิงอนุรักษ์ วิจัยในจุดเริ่มต้น สถานะ ขน ส่งและชะตากรรมของ eDNA หลั่ง โดย macrofauna น้ำต้องอธิบายบริบท spatiotemporal สำหรับinferences พักตามเรื่องและ ให้คำแนะนำเรื่องการออกแบบการสุ่มตัวอย่าง เราทดสอบในสมมติฐานที่เรื่องจะมากขึ้นเข้มข้นในตะกอน surficial กว่าผิวน้ำ โดยการวัดความเข้มข้นของตะกอน และอควีเรื่องจากปลารุกราน เอเชีย bigheaded เหน็บ (สกุลปลาหัวโตโอ),ในบ่อทดลองและแม่น้ำสาย เราปรับง่าย ต้น ทุนต่ำดีเอ็นเอแยกวิธีการผลผลิตปราศจากสารยับยั้งเรื่องจากตัวอย่างน้ำและตะกอน เรื่องปลาคาร์ฟได้ 8 – 1800 ครั้งมากขึ้นเข้มข้นต่อกรัมของตะกอนมากกว่าละ milliliter ของน้ำ และพบในตะกอนสูง132 วันหลังเอาปลาคาร์ฟ – ห้าครั้งยาวกว่ารายงานใด ๆ ก่อนหน้านี้ที่ macrobial มีอยู่เรื่องในน้ำ ผลลัพธ์เหล่านี้อาจอธิบายได้ โดยการตกตะกอนของอนุภาค หรือปัญญาอ่อนของ sedimentadsorbedโมเลกุลดีเอ็นเอ เมื่อเทียบกับ eDNA อควี เรื่องตะกอนสามารถให้มากขึ้นและยาวนานแหล่งวัสดุทางพันธุกรรมสำหรับ inferring สำหรับไซต์ปัจจุบัน หรืออดีตโดยน้ำmacrofauna พันธุ์ธรรมชาติโดยเฉพาะอย่างยิ่งการ อย่างไรก็ตาม resuspension ตะกอน และการขนส่งของเรื่องตะกอนไม่ complicate inferences spatiotemporal จากสุ่มตัวอย่างน้ำผิวดิน ซึ่งเป็นอยู่ในปัจจุบันกันเรื่องตามแนวทางการ เราหารือผลกระทบเหล่านี้ในบริบทของการอนุรักษ์มุ่งเน้นตรวจสอบในระบบนิเวศทางน้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

นามธรรม
ประจำตัวทางพันธุกรรมของดีเอ็นเอสิ่งแวดล้อมน้ำ (เอ็ด) ให้การหาข้อสรุปการเข้าพักสถานที่ที่หายาก
สัตว์ทะเลน้ำที่มักจะง่ายกว่าที่จะได้รับการสังเกตโดยตรงของสิ่งมีชีวิต นี้ญาติ
ง่ายดายทำให้เอ็ดสุ่มตัวอย่างเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับชีววิทยาการอนุรักษ์ งานวิจัยเกี่ยวกับต้นกำเนิดของรัฐ, การขนส่ง,
และชะตากรรมของเอ็ดน่าหลั่งจากสัตว์ทะเลน้ำเป็นสิ่งจำเป็นที่จะอธิบายบริบท spatiotemporal สำหรับ
การหาข้อสรุปการเข้าพักเอ็ดน่าใช้และเพื่อเป็นแนวทางในการออกแบบการสุ่มตัวอย่าง EDNA เราได้ทดสอบสมมติฐานที่ว่า
เอ็ดน่ามีความเข้มข้นมากขึ้นในตะกอนดิน surficial กว่าในน้ำผิวดินโดยการวัดความเข้มข้น
ของเอ็ดน้ำและตะกอนจากปลารุกรานอวดดีปลาคาร์พเอเชีย (เอสพีพี Hypophthalmichthys.)
ในบ่อทดลองและแม่น้ำธรรมชาติ เราแก้ไขที่ง่ายและต้นทุนต่ำวิธีการสกัดดีเอ็นเอเพื่อ
ให้ผลยับยั้งฟรี EDNA จากทั้งตะกอนและตัวอย่างน้ำ ปลาคาร์พ EDNA เป็น 8-1800 ครั้ง
ต่อกรัมเข้มข้นของตะกอนกว่าต่อมิลลิลิตรของน้ำและถูกตรวจพบในตะกอนได้ถึง
132 วันหลังจากการกำจัดปลาคาร์พ - ห้าครั้งนานกว่ารายงานก่อนหน้าใด ๆ ของการติดตา macrobial EDNA
ในน้ำ ผลลัพธ์เหล่านี้อาจจะอธิบายโดยการตกตะกอนของอนุภาคและ / หรือการย่อยสลายปัญญาอ่อนของ sedimentadsorbed
โมเลกุลดีเอ็นเอ เมื่อเทียบกับน้ำเอ็ดน่าตะกอนเอ็ดน่าจะให้ความอุดมสมบูรณ์มากขึ้น
แหล่งที่มาและติดทนนานของสารพันธุกรรมสำหรับการเข้าพักอนุมานเว็บไซต์ปัจจุบันหรือที่ผ่านมาโดยน้ำ
สัตว์ทะเลชนิดหน้าดินโดยเฉพาะอย่างยิ่ง อย่างไรก็ตามแขวนลอยและการขนส่งของเอ็ดน่าตะกอน
อาจมีความซับซ้อนการหาข้อสรุป spatiotemporal จากพื้นผิวการเก็บตัวอย่างน้ำซึ่งขณะนี้เด่น
วิธี EDNA ตาม เราหารือผลกระทบเหล่านี้ในบริบทของการอนุรักษ์ที่มุ่งเน้นการ
ตรวจสอบในระบบนิเวศทางน้ำ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

B S T R A C T
พันธุกรรมของดีเอ็นเอการสิ่งแวดล้อมน้ำ ( เอ็ดน่า ) มีการใช้เว็บไซต์เพื่อหายาก
ขนาดใหญ่น้ำที่มักจะง่ายที่จะได้รับมากกว่าโดยตรงสังเกตของสิ่งมีชีวิต ญาติง่าย
ทำให้เอ็ดน่าคนเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับชีววิทยาการอนุรักษ์ งานวิจัยเกี่ยวกับที่มา , รัฐ , การขนส่ง ,
และโชคชะตาของ เอ็ดน่า หลั่ง โดยสัตว์น้ำขนาดใหญ่เป็นสิ่งจำเป็นเพื่ออธิบายบริบท spatiotemporal สำหรับ
เอ็ดน่าพักและเอ็ดน่าใช้ตามคู่มือการออกแบบการสุ่มตัวอย่าง เราทดสอบสมมติฐานที่
เอ็ดน่าที่มีความเข้มข้นมากขึ้นในเกี่ยวกับพื้นผิวดินตะกอนมากกว่าในน้ำ โดยการวัดความเข้มข้นของน้ำและตะกอน
เอ็ดน่า จากปลา bigheaded รุกรานเอเชียปลาคาร์พ ( สกุลปลาหัวโต spp . ) ,
ในบ่อทดลองและ แม่น้ำธรรมชาติ เราดัดง่าย , ต้นทุนต่ำวิธีการสกัดดีเอ็นเอโดยเอ็ดน่า

ฟรีจากทั้งผลผลิตตะกอนและน้ำตัวอย่าง ปลาคาร์พ เอ็ดน่า อายุ 8 –มากกว่า 1800 ครั้ง
เข้มข้น 1 กรัมต่อมิลลิลิตรของน้ำและตะกอนกว่าที่ตรวจพบในดินตะกอนขึ้น

132 วัน หลังจากที่นานกว่าใด ๆรายงานก่อนหน้านี้ของ macrobial เอ็ดน่าติดตา
–กำจัดปลาคาร์พห้าครั้งในน้ำ ผลลัพธ์เหล่านี้อาจอธิบายได้อนุภาคตกตะกอน และ / หรือ การย่อยสลายปัญญาอ่อน sedimentadsorbed
ดีเอ็นเอโมเลกุล เมื่อเทียบกับน้ำ เอ็ดน่า หินชั้น เอ็ดน่า สามารถให้มากขึ้น
และยั่งยืนอีกต่อไปแหล่งพันธุกรรมสำหรับการเข้าพักในปัจจุบันหรือที่ผ่านมาเว็บไซต์โดยทางน้ำ
ขนาดใหญ่ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสัตว์ชนิด อย่างไรก็ตาม resuspension และการขนส่งของเอ็ดน่า
หินตะกอนอาจทำให้ spatiotemporal อนุมานจากตัวอย่างน้ำผิวดิน ซึ่งปัจจุบันเป็นโดด
เอ็ดน่า ตามแนวทาง เราหารือเกี่ยวกับผลกระทบเหล่านี้ในบริบทของการอนุรักษ์เชิง
ติดตามสัตว์น้ำระบบนิเวศวิทยา