On the basis of alignment of different sequences
related to S. stercoralis, deposited in GenBank (accession
nos.: AB526297, AB526298, AB526299, AB526300), two sets
of primer pairs were designed for nested PCR using DNASIS
software (Hitachi, Tokyo, Japan) to enable amplification of a
509-bp target in the first PCR round and a 261-bp target in
the second PCR round in the mitochondrial cytochrome c oxi-dase subunit 1 (cox1) gene. PCR reactions were performed
in 20 μL volumes containing 2 × red PCR premix (Ampliqon,
Odense, Denmark), 10 pmol of each primer and 4μLof
DNA template for the first amplification round, and 1μLof
1/40 diluted first-round PCR product for the second amplifica-tion round
บนพื้นฐานของการจัดตำแหน่งของลำดับที่แตกต่างกัน
ที่เกี่ยวข้องกับเอส stercoralis ฝากใน GenBank (ภาคยานุวัติ
Nos .: AB526297, AB526298, AB526299, AB526300) สองชุด
ของคู่ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบสำหรับใช้ที่ซ้อนกัน PCR DNASIS
ซอฟแวร์ (ฮิตาชิกรุงโตเกียวประเทศญี่ปุ่น ) เพื่อให้สามารถใช้เครื่องขยายเสียงของ
เป้าหมาย 509-BP ในรอบแรก PCR และเป้าหมาย 261-BP ใน
สองวิธี PCR ในรอบยล cytochrome C-oxi Dase subunit 1 (cox1) ยีน ปฏิกิริยา PCR ถูกดำเนินการ
ใน 20 เล่มไมโครลิตรมี 2 ×แดง PCR พรีมิกซ์ (Ampliqon,
Odense, เดนมาร์ก), 10 pmol ของแต่ละไพรเมอร์และ4μLof
แม่แบบดีเอ็นเอสำหรับรอบการขยายแรกและ1μLof
1/40 ปรับลดครั้งแรกในรอบสินค้า PCR สำหรับ รอบที่สอง amplifica-การ
การแปล กรุณารอสักครู่..
บนพื้นฐานของการเรียงตัวของลำดับต่าง ๆความสัมพันธ์กับเอส Strongyloides stercoralis ฝากเงินบริเวณ ( สูเลขที่ : ab526297 ab526298 ab526299 , , , , ab526300 ) 2 ชุดไพรเมอร์คู่ถูกออกแบบให้สามารถใช้ dnasis ซ้อนกันซอฟต์แวร์ ( ฮิตาชิ โตเกียว ประเทศญี่ปุ่น เพื่อให้เพิ่มปริมาณเป็น509 BP ในเป้าหมายแรก และเป้าหมายโดยรอบเป็น 261 BP ในรอบสองในไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอมั่ม oxi เดส 1 1 ( cox1 ) ยีน ปฏิกิริยา PCR ได้ใน 20 μ L ปริมาณบรรจุ 2 × PCR ( ampliqon สีแดง , รวมOdense , เดนมาร์ก ) , 10 pmol ของแต่ละคู่ และ 4 μลอฟแม่แบบ DNA amplification ในรอบแรก และ 1 μลอฟ1 / 40 ซึ่งรอบแรกตรวจรอบสองผ่าน amplifica ผลิตภัณฑ์สำหรับ
การแปล กรุณารอสักครู่..