3. ResultsOverall, 421 samples from

3. Results
Overall, 421 samples from eight different species of psittacine
birds were tested for the presence of Circovirus using real-time
PCR method. A total of 190 samples (45.13%) were found to be positive
(Table 1) of which the year wise percentage in 2010, 2011,
2012, 2013 and 2014 were 15%, 53%, 44%, 30% and 51%, respectively
(Fig. 1).
Circovirus was detected in a large number of African Grey parrots
and the percentage of positive samples was found to be 58.33%
whereas in Cockatoos about 34.42% ofthe samples tested were positive
(Table 1). Macaws and Parakeets showed a good number of
positives as well, with 25.53% samples being positive in Macaws
and 16.66% of Parakeet samples detected as positive. Parrots of
knownandunknownspecies showed a positivepercentage of 35.2%
and comprised of Indian ring neck parrots, yellow parrots, Senegal
parrots and others. Not all samples submitted to the lab had species
identified (Table 1). The birds were also segregated into two groups
based on where they came from. All those birds that belonged to
the farms and wildlife centers were considered as captive while
the birds that came from private owners, veterinary clinics and
pet-shops were grouped as imported. In 2011, 43 out of a total of
69 captive birds were tested positive (Table 2). Total captive birds
tested in 2012 and 2013 were 21 and 19 and the number tested
positive were 8 and 5, respectively (Table 2). The total number of
imported birds tested positive from 2010 to 2013 ranged from 2 to
20. Thehighestnumber ofimported birds was tested in2014, where
66 out of a total of 128 birds were positive for circovirus (Table 2).
Figs. 2 and 3(a) show the amplification plots for a range of dilutions
of circovirus positive DNA from blood and feather carried out
to determine sensitivity of the test. DNA from blood (initial concentration
86 ng/L) and feather (initial concentration 35 ng/L)
was serially diluted 10 fold. Ct values for the first and last dilutions
were 15 and 37 for blood and 18 and 39 for feather, respectively.
Results indicate that Circovirus was detected from as low as 8.5 fg
of total DNA (Fig. 2(a)) and 3.5 fg of total DNA (Fig. 3(a)) from blood
and feather samples, respectively. Standard curves obtained for circovirus
DNA from blood and feather are shown in Figs. 2 and 3(b).
The PCR efficiency values for each of these was 1.9 and 2.1 respectively.
Fig. 2(c) depicts corresponding amplification curves obtained for
the internal control in the 560 channel. The first dilution having the
lowest Ct value in the target 530 channel shows suppression of IC
amplification as would be expected for a strongly positive sample.
Fig. 4 shows multiple sequence alignment of circovirus DNA
from seven African Grey Parrots, three Macaws and two Cockatoos
compared to an NCBI reference sequence (gi: 90994631). The
results show some sequence variations in circovirus sequences of
three African Grey Parrots (AGP2, AGP3 and AGP4) compared to the
virus sequence from other species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3. ผลลัพธ์โดยรวม 421 ตัวอย่างจาก 8 พันธุ์ psittacineนกได้ผ่านทดสอบของ Circovirus ใช้แบบเรียลไทม์วิธีการ PCR พบว่าจำนวนตัวอย่าง 190 (45.13%) เป็นค่าบวก(ตารางที่ 1) ซึ่งปีฉลาดเปอร์เซ็นต์ใน 2010, 20112012, 2013 และ 2014 มี 15%, 53%, 44%, 30% และ 51% ตามลำดับ(รูปที่ 1)Circovirus ที่พบในนกแก้วเทาแอฟริกันจำนวนมากและพบว่าเปอร์เซ็นต์ของตัวอย่างบวก 58.33%ในขณะที่ใน Cockatoos เกี่ยวกับ 34.42% ของตัวอย่างทดสอบเป็นบวก(ตารางที่ 1) คอว์และหนูเผือกแสดงจำนวนบวกกับ 25.53% ตัวอย่างการบวกในคอว์เป็นอย่างดีและ 16.66% ของนกแก้วตัวอย่างตรวจที่เป็นบวก นกแก้วของknownandunknownspecies พบ positivepercentage 35.2%และประกอบด้วยนกแก้วคอแหวนอินเดีย สีนกแก้ว เซเนกัลนกแก้วและอื่น ๆ ทั้งหมดตัวอย่างส่งห้องปฏิบัติมีพันธุ์ระบุ (ตาราง 1) นกยังแยกเป็น 2 กลุ่มตามที่มา นกเหล่านั้นทั้งหมดที่เป็นของฟาร์มและศูนย์สัตว์ป่าถือว่าเป็นในขณะที่ถูกคุมขังนกที่มาจากเจ้าของส่วนตัว คลินิกสัตวแพทย์ และร้านค้าสัตว์เลี้ยงถูกจัดกลุ่มนำ ใน 2011, 43 จากทั้งหมดนกเชลย 69 ได้ผ่านการทดสอบเป็นบวก (ตาราง 2) นกเชลยทั้งหมดทดสอบใน 2012 และ 2013 21 และ 19 และหมายเลขทดสอบบวกได้ 5 และ 8 ตามลำดับ (ตารางที่ 2) จำนวนทั้งหมดนกนำเข้าผ่านทดสอบในเชิงบวกจาก 2010 2013 ตั้งแต่ 220. Thehighestnumber ofimported นกถูกทดสอบ in2014 ที่66 จากทั้งหมด 128 นกถูกบวกสำหรับ circovirus (ตาราง 2)มะเดื่อ. 2 และพัฒนาการแสดงแปลงขยายสำหรับ dilutionsของ circovirus บวกดีเอ็นเอจากเลือดและขนนกดำเนินการตรวจสอบความไวของการทดสอบ ดีเอ็นเอจากเลือด (เข้มข้นเริ่มต้น86 ng/L) และขนนก (ความเข้มข้นเริ่มต้น 35 ng/L)ถูก serially เจือจาง 10 เท่า ค่า ct dilutions แรก และสุดท้ายได้ 15 และ 37 เลือด และ 18 และ 39 สำหรับขนนก ตามลำดับผลระบุว่า พบ Circovirus จากต่ำสุด 8.5 fgของดีเอ็นเอทั้งหมด (รูป 2(a)) และ 3.5 fg ของดีเอ็นเอทั้งหมด (3(a)) รูปจากเลือดและตัว อย่างขนนก ตามลำดับ กราฟมาตรฐานที่ได้ circovirusดีเอ็นเอจากเลือดและขนจะแสดงในมะเดื่อ. 2 และหมายค่าประสิทธิภาพของ PCR สำหรับแต่ละเหล่านี้เป็น 1.9 และ 2.1 ตามลำดับรูป 2(c) มีภาพขยายที่สอดคล้องกันที่เส้นโค้งได้การควบคุมภายในในช่อง 560 มีเจือจางแรกค่าต่ำสุดของ Ct ในช่อง 530 เป้าหมายแสดงปราบปรามของ ICขยายตามจะที่คาดไว้สำหรับตัวอย่างที่ดีอย่างยิ่งรูปที่ 4 แสดงหลายลำดับตำแหน่งของ circovirus ดีเอ็นเอจากนก แก้วเทาแอฟริกันเจ็ด คอว์สาม และสอง Cockatoosเมื่อเทียบกับลำดับการอ้างอิงของ NCBI (gi: 90994631) การผลลัพธ์แสดงบางรูปแบบลำดับในลำดับ circovirusสามดำเทานกแก้ว (AGP2, AGP3 และ AGP4) เปรียบเทียบกับการลำดับไวรัสจากสายพันธุ์อื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3. ผล
โดยรวม 421 ตัวอย่างจากแปดสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของ psittacine
นกได้มีการทดสอบการปรากฏตัวของ circovirus โดยใช้เวลาจริง
วิธี PCR รวม 190 ตัวอย่าง (45.13%) พบว่ามีการบวก
(ตารางที่ 1) ซึ่งมีค่าที่ชาญฉลาดในปีในปี 2010, 2011,
2012, ปี 2013 และปี 2014 เกิดขึ้น 15%, 53%, 44%, 30% และ 51% ตามลำดับ
(รูปที่ 1)..
circovirus ถูกตรวจพบในจำนวนมากของนกแก้วสีเทาแอฟริกัน
และร้อยละของตัวอย่างที่ดีก็จะพบว่า 58.33%
ในขณะที่ในคักคาทูเกี่ยวกับ 34.42% ofthe ตัวอย่างการทดสอบเป็นบวก
(ตารางที่ 1) มาคอว์และหนูเผือกแสดงให้เห็นตัวเลขที่ดีของ
ผลบวกเป็นอย่างดีกับตัวอย่าง 25.53% เป็นบวกในคอว์
และ 16.66% ของกลุ่มตัวอย่างที่ตรวจพบว่าเป็นนกแก้วในเชิงบวก นกแก้วของ
knownandunknownspecies แสดงให้เห็น positivepercentage 35.2% ใน
และอินเดียประกอบด้วยแหวนนกแก้วคอนกแก้วสีเหลือง, เซเนกัล
นกแก้วและอื่น ๆ ไม่ได้ตัวอย่างทั้งหมดที่ส่งไปยังห้องปฏิบัติการได้สายพันธุ์ที่
ระบุ (ตารางที่ 1) นกก็ถูกแยกออกเป็นสองกลุ่ม
ตามสถานที่ที่พวกเขามาจาก นกเหล่านั้นที่อยู่ใน
ฟาร์มและศูนย์สัตว์ป่าได้รับการพิจารณาเป็นเชลยในขณะที่
นกที่มาจากภาคเอกชนเป็นเจ้าของคลินิกสัตวแพทย์และ
สัตว์เลี้ยงที่ร้านค้าถูกแบ่งเป็นนำเข้า ในปี 2011 ที่ 43 จากทั้งหมด
69 นกเชลยได้รับการทดสอบในเชิงบวก (ตารางที่ 2) นกเชลยรวม
การทดสอบในปี 2012 และปี 2013 คือ 21 และ 19 และหมายเลขที่ผ่านการทดสอบ
ในเชิงบวก 8 และ 5 ตามลำดับ (ตารางที่ 2) จำนวนรวมของ
นกที่นำเข้าผ่านการทดสอบบวก 2010-2013 อยู่ในช่วงที่จะ 2 จาก
20 Thehighestnumber นก ofimported ได้รับการทดสอบ in2014 ที่
66 จากทั้งหมด 128 นกเป็นบวกสำหรับ circovirus (ตารางที่ 2).
มะเดื่อ 2 และ 3 (ก) แสดงแผนการขยายสำหรับช่วงของการเจือจาง
ดีเอ็นเอบวก circovirus จากเลือดและขนนกดำเนินการ
เพื่อตรวจสอบความไวของการทดสอบ ดีเอ็นเอจากเลือด (เริ่มต้นที่ความเข้มข้น
86 ng / L) และขนนก (เริ่มต้นที่ความเข้มข้น 35 ng / L)
เป็นลำดับเจือจาง 10 เท่า ค่า CT สำหรับเจือจางแรกและครั้งสุดท้าย
15 และ 37 เลือดและ 18 และ 39 สำหรับขนตามลำดับ.
ผลการวิจัยพบว่า circovirus ที่ตรวจพบจากที่ต่ำเป็น 8.5 FG
ดีเอ็นเอรวม (รูป. 2 (ก)) 3.5 FG ของ ดีเอ็นเอรวม (รูปที่ 3. (ก)) จากเลือด
และขนตัวอย่างตามลำดับ เส้นโค้งมาตรฐานได้รับสำหรับ circovirus
ดีเอ็นเอจากเลือดและขนจะแสดงในมะเดื่อ 2 และ 3 (ข).
ค่าประสิทธิภาพ PCR สำหรับแต่ละเหล่านี้เป็น 1.9 และ 2.1 ตามลำดับ.
รูป 2 (ค) แสดงให้เห็นถึงการขยายเส้นโค้งที่สอดคล้องกันได้รับสำหรับ
การควบคุมภายในในช่องทาง 560 เจือจางแรกมี
มูลค่ากะรัตต่ำสุดในช่องเป้าหมาย 530 แสดงให้เห็นว่าการปราบปรามของ IC
ขยายเป็นจะเป็นที่คาดหวังสำหรับตัวอย่างในเชิงบวกอย่างมาก.
รูป 4 แสดงลำดับการจัดเรียงหลายดีเอ็นเอ circovirus
จากเจ็ดสีเทานกแก้วแอฟริกันสาม Macaws และสองคักคาทู
เทียบกับลำดับการอ้างอิง NCBI (GI: 90994631)
ผลที่ได้แสดงรูปแบบลำดับบางอย่างในลำดับ circovirus ของ
สามแอฟริกันนกแก้วสีเทา (AGP2, AGP3 และ AGP4) เมื่อเทียบกับ
ลำดับไวรัสจากสายพันธุ์อื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3 . ผลลัพธ์โดยรวม , 421 คน จาก 8 ชนิดที่แตกต่างกันของ psittacineนกถูกทดสอบสำหรับการปรากฏตัวของเซอร์โคไวรัส ใช้ เวลาวิธี PCR จำนวน 190 ตัวอย่าง ( 45.13 พบว่าเป็นบวก( ตารางที่ 1 ) ซึ่งปีปัญญาเปอร์เซ็นต์ใน 2010 , 2011 ,2012 , 2013 และ 2014 เป็นร้อยละ 15 และร้อยละ 53 44 % , 30 % และ 51% ตามลำดับ( รูปที่ 1 )เซอร์โคไวรัสที่ตรวจพบในตัวเลขขนาดใหญ่ของนกแก้วสีเทาแอฟริกันและค่าร้อยละของตัวอย่างบวก พบว่าเป็น 58.33 %ส่วนในเรื่องของหนอน 34.42 % ตัวอย่างทดสอบเป็นบวก( ตารางที่ 1 ) มา คอว์และ parakeets แสดงจํานวนดีแจ้งเช่นกัน ตัวอย่าง 2.75 % เป็นบวกในมา คอว์16.66 % ของตัวอย่างนกแก้วและตรวจพบว่าเป็นบวก นกแก้วของknownandunknownspecies แสดง positivepercentage 35.2 % ของซึ่งประกอบด้วย อินเดีย นกแก้วคอแหวนสีเหลือง , นกแก้ว , เซเนกัลนกแก้วและคนอื่น ๆ ตัวอย่างทั้งหมดส่งไปยังห้องแล็บมีชนิดระบุ ( ตารางที่ 1 ) นกยังแยกได้เป็น 2 กลุ่มขึ้นอยู่กับว่ามันมาจากไหน พวกนกนั้นเป็นของฟาร์มและศูนย์สัตว์ป่าถูกถือว่าเป็นเชลย ในขณะที่นกที่มาจากเจ้าของเอกชน และคลินิกสัตวแพทย์ร้านค้าสัตว์เลี้ยงถูกจัดกลุ่มเป็นสินค้านำเข้า ใน 2011 , 43 จำนวน69 นกเชลยถูกทดสอบเป็นบวก ( ตารางที่ 2 ) นกเชลยทั้งหมดทดสอบในปี 2012 และ 2013 คือ 21 และ 19 และหมายเลขที่ทดสอบบวกจำนวน 8 และ 5 ตามลำดับ ( ตารางที่ 2 ) จำนวนของนำเข้านกทดสอบในเชิงบวกจาก 2010 ถึง 2013 ระหว่าง 220 . thehighestnumber ofimported นกถูกทดสอบ in2014 , ที่66 จำนวน 128 นกเป็นบวกสำหรับเซอร์โคไวรัส ( ตารางที่ 2 )มะเดื่อ . 2 และ 3 ( ) แสดงการขยายช่วงของวิธีการแปลงสำหรับเซอร์โคไวรัสบวกของดีเอ็นเอจากเลือดและขนนกออกมาเพื่อตรวจสอบความไวของการทดสอบ ดีเอ็นเอจากเลือด ( ความเข้มข้นเริ่มต้น86 กรัม / ลิตร ) และขน ( ความเข้มข้น 35 กรัม / ลิตร )คือเป็นเจือจาง 10 เท่า CT ค่าแรกและวิธีการสุดท้ายอายุ 15 และ 37 เลือดและ 18 และ 39 ขนนก ตามลำดับผลการวิจัย พบว่า เซอร์โคไวรัสที่ตรวจพบจากที่ต่ำเป็น 8.5 FGของดีเอ็นเอทั้งหมด ( รูปที่ 2 ( ก ) และ 3.5 FG ของดีเอ็นเอทั้งหมด ( รูปที่ 3 ( ก ) จากเลือดและขนนกตามลำดับ เส้นโค้งมาตรฐานการศึกษาสำหรับเซอร์โคไวรัสดีเอ็นเอจากเลือดและขนจะเป็นมะเดื่อ . 2 และ 3 ( B )ค่าเพิ่มประสิทธิภาพสำหรับแต่ละเหล่านี้คือ 1.9 และ 2.1 ตามลำดับรูปที่ 2 ( c ) แสดงให้เห็นเส้นโค้งที่ขยายได้สำหรับการควบคุมภายในใน 560 ช่อง ครั้งแรกที่เจือจางค่า CT ถูกที่สุดในเป้าหมาย 530 แสดงช่องการปราบปรามของไอซี( ที่คาดว่าจะเป็นตัวอย่างที่ดีอย่างยิ่งรูปที่ 4 แสดงการเรียงลำดับหลายของเซอร์โคไวรัสดีเอ็นเอนกแก้วสีเทาแอฟริกันจากเจ็ดสามสองหนอนมา คอว์เทียบกับ ncbi อ้างอิงลำดับ ( กี : 90994631 ) ที่ผลลัพธ์ที่แสดงลำดับการเปลี่ยนแปลงลำดับของเซอร์โคไวรัสนกแก้วสีเทาแอฟริกัน ( agp2 สาม , และ agp3 agp4 ) เมื่อเทียบกับลำดับจากไวรัสชนิดอื่น ๆ