pseudoknot is a nucleic acid second

pseudoknot is a nucleic acid secondary structure containing at least two stem-loop structures in which half of one stem is intercalated between the two halves of another stem. Pseudoknots fold into knot-shaped three-dimensional conformations but are not true topological knots. The base pairing in pseudoknots is not well nested; that is, base pairs occur that "overlap" one another in sequence position. This makes the presence of general pseudoknots in nucleic acid sequences impossible to predict by the standard method of dynamic programming, which uses a recursive scoring system to identify paired stems and consequently cannot detect non-nested base pairs with the most common algorithms. Limited subclasses of pseudoknots can be predicted using dynamic programs described in.[9] Newer structure prediction techniques such as stochastic context-free grammars also do not take pseudoknots into account.

Several important biological processes rely on RNA molecules that form pseudoknots. For example, the RNA component of human telomerase contains a pseudoknot that is critical for activity.[8] Though DNA can also form pseudoknots, they are generally not present in biological DNA.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

pseudoknot เป็นกรดนิวคลีอิกโครงสร้างวนรอบลำต้นน้อยสองซึ่งครึ่งหนึ่งของลำต้นหนึ่งจะแนะระหว่างสองซีกของลำต้นอื่นที่ประกอบด้วยโครงสร้างรอง Pseudoknots พับเป็นรูปปม conformations สามมิติ แต่ไม่จริง topological นอต ฐานที่จับคู่ใน pseudoknots ไม่ดีซ้อนกัน นั่นคือ คู่เบสเกิดขึ้นที่ "ซ้อน" ในลำดับตำแหน่ง ทำให้การปรากฏตัวของ pseudoknots ทั่วไปในลำดับของกรดนิวคลีอิกไปทำนาย โดยวิธีมาตรฐานของการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิก ซึ่งใช้ระบบการให้คะแนนซ้ำระบุจับลำต้น และจึง ไม่สามารถตรวจพบไม่ใช่ซ้อนคู่เบสกับขั้นตอนวิธีทั่วไป จำกัดระดับของ pseudoknots สามารถคาดการณ์การใช้ไดนามิกโปรแกรมอธิบายเทคนิคการทำนายโครงสร้างใหม่นิ้ว [9] เช่น stochastic ปราศจากบริบท grammars ยังทำ pseudoknots เข้าบัญชีกระบวนการทางชีวภาพที่สำคัญหลายพึ่งโมเลกุล RNA pseudoknots ตัวอย่าง องค์ประกอบของมนุษย์เทโลเมอเรส RNA ประกอบด้วย pseudoknot ที่มีความสำคัญสำหรับกิจกรรม [8] แม้ว่าดีเอ็นเอสามารถรูปแบบ pseudoknots พวกเขาโดยทั่วไปไม่มีอยู่ในดีเอ็นเอทางชีวภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

pseudoknot เป็นกรดนิวคลีอิกโครงสร้างทุติยภูมิที่มีอย่างน้อยสองโครงสร้างลำต้นวงในซึ่งครึ่งหนึ่งต้นกำเนิดเป็นอธิกมาสระหว่างสองส่วนของลำต้นอีก Pseudoknots พับเป็น conformations สามมิติโบว์รูป แต่ไม่นอตทอพอโลยีที่แท้จริง การจับคู่ในฐาน pseudoknots จะไม่ซ้อนกันดี; ว่ามีฐานคู่เกิดขึ้นว่า "ทับซ้อน" อีกคนหนึ่งอยู่ในตำแหน่งลำดับ นี้จะทำให้การปรากฏตัวของ pseudoknots ทั่วไปในกรดนิวคลีลำดับเป็นไปไม่ได้ที่จะคาดการณ์โดยวิธีมาตรฐานของการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิกซึ่งใช้ระบบการให้คะแนน recursive เพื่อแจ้งจับคู่ลำต้นและจึงไม่สามารถตรวจสอบที่ไม่ซ้อนกันฐานคู่กับอัลกอริทึมที่พบมากที่สุด subclasses จำกัด ของ pseudoknots สามารถคาดการณ์การใช้โปรแกรมแบบไดนามิกที่อธิบายไว้ใน. [9] โครงสร้างใหม่กว่าเทคนิคการทำนายเช่นสุ่มไวยากรณ์บริบทฟรียังไม่ได้ใช้ pseudoknots เข้าบัญชี.

กระบวนการทางชีวภาพที่สำคัญหลายพึ่งพาโมเลกุล RNA ที่ฟอร์ม pseudoknots ยกตัวอย่างเช่นองค์ประกอบอาร์เอ็นเอของดีเอ็นเอมนุษย์มี pseudoknot ว่าเป็นสิ่งสำคัญสำหรับกิจกรรม. [8] แม้ว่าดีเอ็นเอยังสามารถสร้าง pseudoknots, พวกเขามักจะไม่ได้อยู่ในดีเอ็นเอทางชีวภาพ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

pseudoknot เป็นกรดนิวคลีอิกโครงสร้างทุติยภูมิที่มีอย่างน้อยสองก้านห่วงโครงสร้างในที่ครึ่งหนึ่งของลำต้นเป็นอธิกมาสระหว่างสองส่วนของลำต้น อีก pseudoknots พับเป็นปมรูปโครงสร้างสามมิติแต่ไม่จริงทอพอโลยีน๊อต ฐานคู่ใน pseudoknots จะไม่ซ้อนกัน คือ ฐานคู่ เกิดขึ้นที่ " ทับซ้อน " อีกหนึ่งตำแหน่งในลำดับ นี้จะทำให้การปรากฏตัวของ pseudoknots ทั่วไปในกรดนิวคลีอิกดังนี้ เป็นไปไม่ได้ที่จะทำนายโดยวิธีการเขียนโปรแกรมแบบไดนามิกซึ่งใช้ระบบการให้คะแนนของผู้ระบุคู่ต้นและจึงไม่สามารถตรวจพบไม่ซ้อนคู่เบสด้วยกลไกที่พบบ่อยที่สุด จำกัด subclasses ของ pseudoknots สามารถคาดการณ์การใช้ไดนามิกโปรแกรมที่อธิบายไว้ใน [ 9 ] ใหม่ทำนายโครงสร้างเทคนิคเช่นบริบท Stochastic ไวยากรณ์ฟรียังไม่ได้ใช้ pseudoknots เข้าบัญชีกระบวนการทางชีวภาพที่สำคัญหลายพึ่งพาโมเลกุล RNA ที่ฟอร์ม pseudoknots . ตัวอย่างเช่น องค์ประกอบของยีนมะเร็งมนุษย์ประกอบด้วย pseudoknot ที่สําคัญสําหรับกิจกรรม [ 8 ] แม้ว่า DNA สามารถฟอร์ม pseudoknots , พวกเขาโดยทั่วไปไม่ได้อยู่ในดีเอ็นเอทางชีวภาพ