Transcriptome analysis of polar bea

Transcriptome analysis of polar bears (Ursus maritimus) yielded sequences with highest similarity to the human endogenous retrovirus group HERV-K(HML-2). Further analysis of the polar bear draft genome identified an endogenous betaretrovirus group comprising 26 proviral copies and 231 solo LTRs. Molecular dating indicates the group originated before the divergence of bears from a common ancestor but is not present in all carnivores. Closely related sequences were identified in the giant panda (Ailuropoda melanoleuca) and characterized from its genome. We have designated the polar bear and giant panda sequences U. maritimusendogenous retrovirus (UmaERV) and A. melanoleuca endogenous retrovirus (AmeERV), respectively. Phylogenetic analysis demonstrated that the bear virus group is nested within the HERV-K supergroup among bovine and bat endogenous retroviruses suggesting a complex evolutionary history within the HERV-K group. All individual remnants of proviral sequences contain numerous frameshifts and stop codons and thus, the virus is likely non-infectious.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การวิเคราะห์ Transcriptome ของหมีขั้วโลก (Ursus maritimus) หาลำดับ มีความคล้ายคลึงกันสูงสุดในกลุ่ม retrovirus endogenous มนุษย์ HERV-K(HML-2) การวิเคราะห์จีโนมร่างหมีขั้วโลกระบุการ endogenous betaretrovirus กลุ่มสำเนา proviral 26 และ 231 โซโล LTRs. เดทโมเลกุลบ่งชี้กลุ่มมาก่อน divergence ของหมีจากบรรพบุรุษร่วมกัน แต่ไม่มีใน carnivores ทั้งหมด ลำดับที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดได้ระบุในไจแอนท์แพนด้า (Ailuropoda melanoleuca) และลักษณะจากกลุ่มของ เรากำหนดหมีขั้วโลก และหมีแพนด้ายักษ์ retrovirus maritimusendogenous ลำดับประเทศ (UmaERV) และ endogenous retrovirus A. melanoleuca (AmeERV), ตามลำดับ วิเคราะห์ phylogenetic แสดงว่า กลุ่มไวรัสหมีซ้อนอยู่ภายใน supergroup HERV K ระหว่างวัวและค้างคาว endogenous retroviruses แนะนำประวัติวิวัฒนาการซับซ้อนภายในกลุ่ม HERV-K เศษทั้งหมดแต่ละลำดับ proviral ประกอบด้วย frameshifts จำนวนมาก และหยุด codons และ ดังนั้น ไวรัสจะไม่ติดเชื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์การแสดงออกของยีนของหมีขั้วโลก (หมีขั้วโลก) ผลลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันมากที่สุดในกลุ่ม retrovirus ภายนอกของมนุษย์ Herv-K (HML-2) การวิเคราะห์เพิ่มเติมของจีโนมหมีขั้วโลกร่างระบุกลุ่ม betaretrovirus ภายนอกประกอบไปด้วย 26 สำเนา proviral และ 231 LTRs เดี่ยว เดทโมเลกุลบ่งชี้ว่ากลุ่มที่เกิดขึ้นก่อนที่จะแตกต่างของหมีจากบรรพบุรุษร่วมกัน แต่ไม่ได้อยู่ในสัตว์กินเนื้อทั้งหมด อย่างใกล้ชิดลำดับที่เกี่ยวข้องที่ระบุไว้ในแพนด้ายักษ์ (Ailuropoda melanoleuca) และโดดเด่นจากจีโนมของ เราได้รับมอบหมายให้หมีขั้วโลกและหมีแพนด้ายักษ์ลำดับ U. maritimusendogenous retrovirus (UmaERV) และ A. melanoleuca retrovirus ภายนอก (AmeERV) ตามลำดับ การวิเคราะห์ phylogenetic แสดงให้เห็นว่ากลุ่มไวรัสหมีซ้อนภายใน Herv-K หินใหญ่หมู่วัวและค้างคาวเบื้องหลังไวรัสภายนอกแนะนำประวัติศาสตร์วิวัฒนาการที่ซับซ้อนภายใน Herv-K กลุ่ม ทั้งหมดที่เหลือของแต่ละลำดับ proviral มี frameshifts จำนวนมากและหยุด codons และทำให้ไวรัสมีโอกาสที่ไม่ติดเชื้อ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์ทราน ริปโตมของหมีขั้วโลก ( หมีขั้วโลก ) ให้ผลลำดับกับความเหมือนสูงสุดของมนุษย์ในกลุ่ม herv-k รีโทรไวรัส ( hml-2 ) การวิเคราะห์ต่อไปของหมีขั้วโลกร่างพันธุกรรมระบุ betaretrovirus ภายในกลุ่มและเดี่ยว ltrs โพรไวรัลดีฉบับ 26 มี .โมเลกุล พบว่า กลุ่มที่มาก่อนคบกับความแตกต่างของหมีจากบรรพบุรุษ แต่ไม่อยู่ในสัตว์กินเนื้อ . ลำดับความสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดที่ถูกระบุในหมีแพนด้า ( หมีแพนด้า ) และลักษณะของโครโมโซม . เราได้กำหนดเป็นหมีขั้วโลกหมีแพนด้า และลำดับรึเปล่า U . maritimusendogenous รีโทรไวรัส ( umaerv ) และอะไร Aรีโทรไวรัส ( หรือ แพนด้ายักษ์ไหมภายใน ameerv ) ตามลำดับ การวิเคราะห์ ซึ่งแสดงให้เห็นว่ากลุ่มหมีเป็นไวรัสอยู่ใน herv-k supergroup ของวัวและพบว่าค้างคาวรีโทรไวรัสที่วิวัฒนาการประวัติศาสตร์ภายในกลุ่ม herv-k . เศษบุคคลทั้งหมดของโพรไวรัลดีลำดับประกอบด้วย frameshifts มากมายและหยุดซิสและ จึงไวรัสมีโอกาสไม่ติดเชื้อ .