The data accumulated with GlbN [20–

The data accumulated with GlbN [20–22,26] has provided a set of
criteria for the addition of histidine to the ferrous heme. The first is
proximity. The histidine must be within reach of a heme vinyl, and sp3
geometry at the vinylic Cα atom must be sterically possible; however,
the histidine need not be optimally oriented in the starting material as
long as the barrier to adopt the productive state can be overcome
thermally. The second is the ionization state of the histidine. In GlbN,
data are consistent with the histidine providing the proton to the
vinyl Cβ. Protonation is the rate determining step and the reaction
should be carried out at a sufficiently low pH. A third criterion is the
nature of the iron distal ligand. These are either permissive (histidine,
cyanide, water/5-coordinate) [20] or inhibiting (O2 and NO•, data not
shown; CO) [21,26]. The inhibiting ligands have a slow dissociation
rate constant, and their electron-withdrawing property is presumably
responsible for the inhibition. In GlbN, the permissive ligands are nottightly bound and may or may not be released prior to protonation and
nucleophilic attackThe behavior of the CtrHb variants brings new insights into the
mechanism and limitations of the histidine addition. FerrousWT CtrHb
at neutral pH is reported to be a mixture of 4-, 5-, and 6-coordinate
species, with equilibrium favoring the 5-coordinate high-spin complex
[29]. In preliminary experiments, this protein was found to lose heme
rapidly to apomyoglobin (half-life of ~8 min at pH 7.7, data not
shown). Optical spectra suggest the same mixture of species in reduced
T111H CtrHb and a slight increase in the population of a 6-coordinate
species in L75H CtrHb (Supporting Information Fig. S1B). The failure of
ferrous T111H and L75H CtrHbs to react therefore appears related to
absent or fleeting heme–protein contacts.
The modification occurs when reducing the well-folded cyanomet
state. A priori, steric (i.e., correct seating of the heme), electrostatic,
or heme electronic factors can all contribute to the reactivity. Attempts
to crosslink in the presence of azide as an alternative anionic ligand
were not successful (Supporting Information Fig. S21) and imidazole
coordination led only to partial crosslinking (Supporting Information
Fig. S22). The possibility that cyanide promotes the covalentmodification
by stabilizing the protonated vinyl seems unlikely given that binding of
this anionic ligand is not expected to perturb significantly the electron
distribution of the ferrous heme [54]. Thus, the data point to steric
effects as the major determinants of reactivity in the absence of inhibiting
ligands.
The protein conformation adopted when cyanide is bound may
influence the reaction via subtle effects on the vinyl groups.We showed
above that in the cyanomet complex, the major heme orientational
isomer of WT CtrHb has the 2-vinyl group out of the heme plane and in
a cis-like orientation, whereas T111H CtrHb undergoes a rearrangement
to a trans-like orientation (Supporting Information Fig. S11). The
stereochemistry of the products indicates that the reactive vinyl is in atrans-like conformation. This conformation has a higher degree of
conjugation with the porphyrin ring than cis-like conformations [55]
and may undergo protonation more readily. Whether a trans vinyl
configuration is in general a necessary condition for reaction is not
clear. Regardless, the lack of reaction between H111 and the 2-vinyl
(major isomer) in T111H CtrHb shows that a trans vinyl near a histidine
is an insufficient feature for reaction. Facile heme reorientation associated
with lowheme and exogenous ligand affinity in the ferrous state presents
H111 with the 4-vinyl group as a competitive alternative to the 2-vinyl
group. Thus, the yield of T111H CtrHb-A4 exceeds the minor isomer
content in the cyanomet starting material. Likewise, the yield of L75H
CtrHb-B exceeds the initial major isomer content. As anticipated, heme
reorientation on a relatively rapid time scale emerges as a significant
advantage for reaction.
In natural heme proteins, the vinyl groups are often surrounded
by hydrophobic side chains. In prior work, we surveyed over 300
structures for the presence of leucines with Cα atom within 7 Å of
a vinyl Cα atom and Cβ atom within 6 Å of the same vinyl Cα atom
[22]. These criteria identified L79 in GlbN and L75 in CtrHb as
candidates for histidine replacement and heme modification. Many
other leucines were found. Examples include L106 in nitrophorin 2
(1PEE), L211 in chlorite dismutase (2VXH), L37 in ascorbate
peroxidase (1APX), and L71 in cytochrome b5 (3NER), chosen to
highlight proteins that have architectures different from that of
globins. Many isoleucines, filtered by the same distance criteria,
also occupy positions where a histidine may react. For in vitro
applications, screening of pH conditions and permissive exogenous
ligands that seat the heme properly can be systematically explored.
Thus, it is reasonable to expect that many natural heme proteins
can be modified to undergo the reaction, or artificial proteins can
be designed to present a histidine with appropriate geometry to
the heme.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้อมูลสะสมกับ GlbN [20-22,26] ได้ให้ชุดของเงื่อนไขสำหรับแห่ง histidine กับ heme เหล็ก เป็นครั้งแรกความใกล้ชิดกัน Histidine ต้อง within reach of heme ไวนิล และ sp3เรขาคณิตที่อะตอม Cα vinylic ต้องได้ sterically อย่างไรก็ตามhistidine จำเป็นไม่ได้อย่างเหมาะสมมุ่งเน้นในวัสดุเริ่มต้นเป็นจึงเป็นอุปสรรคต่อการนำมาใช้ รัฐมีประสิทธิภาพสามารถเอาชนะแพ ที่สองคือ รัฐ histidine การ ionization ใน GlbNข้อมูลไม่สอดคล้องกับ histidine ให้โปรตอนไปไวนิล Cβ Protonation คือ อัตราที่กำหนดขั้นตอนและปฏิกิริยาควรจะดำเนินการที่มี pH ต่ำเพียงพอ เกณฑ์ที่สามคือการธรรมชาติของลิแกนด์กระดูกเหล็ก มีทั้ง permissive (histidineไซยาไนด์ น้ำ 5-พิกัด) [20] หรือ inhibiting (O2 และ NO• ข้อมูลไม่แสดง CO) [21.26] Inhibiting ligands มี dissociation ช้าค่าคงอัตรา คุณสมบัติของอิเล็กตรอนถอนเป็นสันนิษฐานว่ารับผิดชอบในการยับยั้งการ ใน GlbN, permissive ligands มี nottightly ผูก และอาจ หรือไม่อาจจะออกก่อน protonation และnucleophilic attackThe พฤติกรรมของตัวแปร CtrHb นำเจาะลึกใหม่กลไกและข้อจำกัดของการเพิ่ม histidine FerrousWT CtrHbที่ค่า pH เป็นกลางมีรายงานเป็น การผสมผสานระหว่าง 4, 5- และ 6 พิกัดสายพันธุ์ มีสมดุลนความซับซ้อนสูงหมุน 5 พิกัด[29] . ในการทดลองเบื้องต้น โปรตีนนี้พบเสีย hemeอย่างรวดเร็วเป็น apomyoglobin (half-life ~ 8 นาทีที่ค่า pH 7.7 ข้อมูลไม่แสดง) แรมสเป็คตราแสงแนะนำเดียวกันผสมพันธุ์ในลดลงT111H CtrHb และเพิ่มขึ้นเล็กน้อยจากประชากร 6-พิกัดสปีชีส์ใน L75H CtrHb (สนับสนุนฟิกข้อมูล S1B) ความล้มเหลวของเหล็ก T111H และ L75H CtrHbs การตอบสนองดังนั้นปรากฏที่เกี่ยวข้องกับขาด หรือหายวับไปติดต่อ heme – โปรตีนการเปลี่ยนแปลงเกิดขึ้นเมื่อลด cyanomet พับอย่างดีรัฐ Priori ความ steric (เช่น แก้ไขนั่งของ heme), ไฟฟ้า สถิตหรือ heme อิเล็กทรอนิกส์ปัจจัยสามารถทั้งหมดนำไปสู่การเกิดปฏิกิริยา ความพยายามการ crosslink ในต่อหน้าของ azide เป็นลิแกนด์ย้อมตัวอื่นไม่ประสบความสำเร็จ (สนับสนุนข้อมูลฟิก S21) และอิมิดาโซลเท่ากับ crosslinking บางส่วน (สนับสนุนข้อมูลประสานงานฟิก S22) ความเป็นไปได้ว่า ไซยาไนด์ covalentmodification การส่งเสริมโดย stabilizing protonated ไวนิลดูเหมือนว่าไม่น่าที่มัดลิแกนด์นี้ย้อมไม่คาดว่าจะ perturb อย่างมีนัยสำคัญอิเล็กตรอนกระจายของ heme เหล็ก [54] ดังนั้น ข้อมูลชี้ stericลักษณะเป็นดีเทอร์มิแนนต์หลักของการเกิดปฏิกิริยาของ inhibitingligandsConformation โปรตีนที่นำมาใช้เมื่อผูกไซยาไนด์อาจมีอิทธิพลต่อปฏิกิริยาทางกลุ่มไวนิลรายละเอียดผลเราพบว่ากล่าวว่า cyanomet ซับซ้อน heme สำคัญ orientationalไอโซเมอร์ของ WT CtrHb มีกลุ่ม 2-ไวนิล จากเครื่องบิน heme และในแนวแบบ cis เช่น ในขณะที่ T111H CtrHb ทนี้ rearrangement เป็นการวางแนวเหมือนทรานส์ (สนับสนุนฟิกข้อมูล S11) ที่stereochemistry ผลิตภัณฑ์บ่งชี้ว่า เป็นไวนิลปฏิกิริยาในเช่น atrans conformation Conformation นี้ได้ระดับที่สูงconjugation ด้วยแหวน porphyrin กว่า cis เช่น conformations [55]และอาจรับ protonation มากขึ้น ว่าไวนิลทรานส์ตั้งค่าคอนฟิกโดยทั่วไปคือ เงื่อนไขจำเป็นสำหรับปฏิกิริยาไม่ล้าง ไม่คำนึงถึง ไม่มีปฏิกิริยาระหว่าง H111 และไวนิล 2(หลังใหญ่) ใน T111H CtrHb แสดงให้เห็นว่าไวนิลทรานส์ใกล้ histidine เป็นเป็นคุณลักษณะไม่เพียงพอสำหรับปฏิกิริยา Reorientation ร่ม heme ที่เกี่ยวข้องlowheme และลิแกนด์บ่อย แสดงความสัมพันธ์ในเหล็กH111 กับกลุ่ม 4-ไวนิลไวนิล 2 ทางการแข่งขันกลุ่ม ดังนั้น ผลตอบแทนของ T111H CtrHb-A4 เกินหลังรองเนื้อหาใน cyanomet วัสดุเริ่มต้น ในทำนองเดียวกัน ผลตอบแทนของ L75HCtrHb-B เกินเนื้อหาหลังเริ่มต้นใหญ่ เป็น heme คาดreorientation บนสเกลเวลาค่อนข้างรวดเร็วขึ้นเป็นการสำคัญประโยชน์สำหรับปฏิกิริยาในโปรตีนธรรมชาติ heme กลุ่มไวนิลมักล้อมรอบโดย hydrophobic ด้านโซ่ ในการทำงานก่อนหน้านี้ เราสำรวจกว่า 300โครงสร้างสำหรับสถานะของ leucines กับ Cα อะตอมภายใน 7 Åไวนิล Cα อะตอมและอะตอม Cβ ภายใน 6 Åของอะตอม Cα ไวนิลเหมือนกัน[22] ระบุเกณฑ์เหล่านี้ L79 ใน GlbN และ L75 ใน CtrHb เป็นตัวเลือกสำหรับการปรับเปลี่ยนแทนและ heme histidine หลายพบ leucines อื่น ๆ ตัวอย่างเช่น L106 nitrophorin 2(1PEE), ใน chlorite dismutase (2VXH), L37 ใน ascorbate L211peroxidase (1APX), และ L71 ใน cytochrome b5 (3NER), เลือกเน้นโปรตีนที่มีสถาปัตยกรรมที่แตกต่างจากที่globins Isoleucines มาก กรอง โดยใช้เงื่อนไขระยะทางเดียวยัง ครองตำแหน่งที่อาจมีต่อ histidine เป็น สำหรับการเพาะเลี้ยงใบสมัคร ตรวจสภาพค่า pH และ permissive บ่อยสามารถจะอุดม ligands ที่นั่งแรก heme ถูกต้องอย่างเป็นระบบดังนั้น จึงเหมาะสมที่จะคาดหวังให้ heme ธรรมชาติโปรตีนสามารถปรับเปลี่ยนการรับปฏิกิริยา หรือโปรตีนเทียมสามารถออกแบบให้นำเสนอ histidine เป็นเรขาคณิตที่เหมาะสมกับheme

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ข้อมูลสะสม GlbN [20-22,26] ได้ให้ชุดของ
เกณฑ์สำหรับการเพิ่มขึ้นของฮิสติดีนจะ heme เหล็ก ประการแรกคือ
ความใกล้ชิด ฮิสติดีนต้องอยู่ในการเข้าถึงของไวนิล heme และ SP3
เรขาคณิตที่อะตอม vinylic Cαต้องเป็นไปได้ sterically; แต่
ฮิสติดีนไม่จำเป็นต้องมุ่งเน้นอย่างดีที่สุดในวัสดุเริ่มต้นเป็น
เวลานานเป็นอุปสรรคที่จะนำมาผลิตรัฐจะสามารถเอาชนะ
ความร้อน ที่สองคือรัฐไอออนไนซ์ฮิสติดีน ใน GlbN,
ข้อมูลมีความสอดคล้องกับฮิสติดีนให้โปรตอน
ไวนิลCβ โปรตอนเป็นอัตราการกำหนดขั้นตอนและปฏิกิริยา
ควรจะดำเนินการที่มีค่า pH ต่ำเพียงพอ เกณฑ์ที่สามคือ
ธรรมชาติของแกนด์ปลายเหล็ก เหล่านี้มีทั้งการอนุญาต (ฮิสติดีน
ไซยาไนด์น้ำ / 5 พิกัด) [20] หรือยับยั้ง (O2 และไม่มี•ข้อมูลไม่ได้
แสดงให้เห็น; CO) [21,26] แกนด์ยับยั้งมีการแยกตัวออกช้า
อัตราดอกเบี้ยคงที่และทรัพย์สินที่ดึงอิเล็กตรอนของพวกเขาคือน่าจะ
รับผิดชอบในการยับยั้ง ใน GlbN, แกนด์บุตรมีความผูกพัน nottightly และอาจจะหรืออาจไม่ได้รับการปล่อยตัวออกมาก่อนที่จะมีโปรตอนและ
พฤติกรรมการโจมตี nucleophilic ของ CtrHb พันธุ์นำข้อมูลเชิงลึกใหม่เข้าสู่
กลไกและข้อ จำกัด ของนอกจากนี้ฮิสติดีน FerrousWT CtrHb
ที่ pH เป็นกลางเป็นรายงานที่เป็นส่วนผสมของ 4, 5- 6 และพิกัด
ชนิดที่มีความสมดุลความนิยม 5 พิกัดซับซ้อนสูงปั่น
[29] ในการทดลองเบื้องต้นโปรตีนชนิดนี้ถูกพบว่าเสีย heme
อย่างรวดเร็ว apomyoglobin (ครึ่งชีวิต ~ 8 นาทีที่พีเอช 7.7, ข้อมูลไม่
แสดง) สเปกตรัม Optical แนะนำส่วนผสมเดียวกันของชนิดในลดลง
T111H CtrHb และเพิ่มขึ้นเล็กน้อยในประชากรของ 6 พิกัด
ชนิดใน L75H CtrHb (สนับสนุนข้อมูลรูป. S1B) ความล้มเหลวของ
T111H เหล็กและ L75H CtrHbs ที่จะตอบสนองจึงจะปรากฏขึ้นที่เกี่ยวข้องกับ
รายชื่อผู้ติดต่อ heme โปรตีนขาดหรือหายวับไป.
การปรับเปลี่ยนเกิดขึ้นเมื่อลด cyanomet ดีพับ
รัฐ เบื้องต้น, steric (เช่นที่นั่งที่ถูกต้องของ heme) ไฟฟ้าสถิต
หรือปัจจัยอิเล็กทรอนิกส์ heme ทั้งหมดสามารถนำไปสู่การเกิดปฏิกิริยา ความพยายาม
ที่จะ Crosslink ในการปรากฏตัวของ azide เป็นแกนด์ประจุลบทางเลือกที่
ไม่ประสบความสำเร็จ (สนับสนุนข้อมูลรูป. S21) และ imidazole
การประสานงานนำเท่านั้นที่จะเชื่อมขวางบางส่วน (สนับสนุนข้อมูล
รูป. S22) เป็นไปได้ว่าไซยาไนด์ส่งเสริม covalentmodification
โดยเสถียรภาพไวนิลโปรโตเนตดูเหมือนจะได้รับน่าที่ผูกพันของ
แกนด์ประจุลบนี้ไม่ได้คาดหวังว่าจะรบกวนอย่างมีนัยสำคัญอิเล็กตรอน
กระจายของ heme เหล็ก [54] ดังนั้นจุดข้อมูลเพื่อ steric
ผลกระทบเป็นปัจจัยสำคัญของการเกิดปฏิกิริยาในกรณีที่ไม่มีการยับยั้ง
แกนด์.
โครงสร้างโปรตีนที่นำมาใช้เมื่อไซยาไนด์ถูกผูกไว้อาจ
มีผลต่อการเกิดปฏิกิริยาผ่านทางผลกระทบที่ลึกซึ้งเกี่ยวกับไวนิล groups.We แสดงให้เห็น
ข้างต้นว่าในที่ซับซ้อน cyanomet, heme สำคัญ orientational
isomer ของ WT CtrHb มีกลุ่มที่ 2 ไวนิลออกมาจากเครื่องบินฮีมและใน
การวางแนวทางถูกต้องเหมือนในขณะที่ T111H CtrHb ผ่านการปรับปรุงใหม่
เพื่อการวางแนวทรานส์เช่น (สนับสนุนข้อมูลรูป. S11)
สเตอริโอของผลิตภัณฑ์ที่แสดงให้เห็นว่ามีปฏิกิริยาไวนิลเป็นในรูปแบบ Atrans เหมือน โครงสร้างนี้มีระดับที่สูงขึ้นของ
การผันกับแหวน porphyrin กว่า conformations ถูกต้องเหมือน [55]
และอาจได้รับโปรตอนมากขึ้นอย่างรวดเร็ว ไม่ว่าจะเป็นไวนิลทรานส์
กำหนดค่าโดยทั่วไปเป็นเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับการเกิดปฏิกิริยาที่ไม่
ชัดเจน โดยไม่คำนึงถึงการขาดการเกิดปฏิกิริยาระหว่าง H111 และ 2 ไวนิล
(isomer หลัก) ใน T111H CtrHb แสดงให้เห็นว่าไวนิลทรานส์ซึ่งอยู่ใกล้กับฮิสติดีน
เป็นคุณลักษณะที่ไม่เพียงพอสำหรับการเกิดปฏิกิริยา reorientation heme ง่ายที่เกี่ยวข้อง
กับ lowheme และความสัมพันธ์แกนด์ภายนอกในสภาพเหล็กนำเสนอ
H111 กับกลุ่ม 4 ไวนิลเป็นทางเลือกที่สามารถแข่งขันกับ 2 ไวนิล
กลุ่ม ดังนั้นผลผลิตของ T111H CtrHb-A4 เกิน isomer เล็กน้อย
เนื้อหาใน cyanomet เริ่มต้นวัสดุ ในทำนองเดียวกันผลผลิตของ L75H
CtrHb-B เกินเนื้อหา isomer เริ่มต้นที่สำคัญ ขณะที่คาดว่าจะ heme
reorientation ในระดับที่ค่อนข้างเวลาอย่างรวดเร็วโผล่ออกมาเป็นอย่างมีนัยสำคัญ
ได้เปรียบสำหรับการเกิดปฏิกิริยา.
ในโปรตีนฮีมธรรมชาติกลุ่มไวนิลมักจะถูกล้อมรอบ
โดยโซ่ด้านที่ไม่ชอบน้ำ ในการทำงานก่อนที่เราสำรวจกว่า 300
โครงสร้างการปรากฏตัวของ leucines กับอะตอมCαภายใน 7 ของ
ไวนิลCαอะตอมและอะตอมCβภายใน 6 ของไวนิลเดียวกันอะตอมCα
[22] เกณฑ์เหล่านี้ระบุ L79 ใน GlbN และ L75 ใน CtrHb เป็น
ผู้สมัครเพื่อทดแทนฮิสติดีนและการเปลี่ยนแปลง heme หลาย
leucines อื่น ๆ ที่ถูกพบ ตัวอย่าง ได้แก่ L106 ใน nitrophorin 2
(1PEE), L211 ใน chlorite dismutase (2VXH), L37 ใน ascorbate
peroxidase (1APX) และ L71 ใน cytochrome b5 (3NER) เลือกที่จะ
เน้นโปรตีนที่มีสถาปัตยกรรมที่แตกต่างจากที่
globins isoleucines หลายกรองตามเกณฑ์ระยะเดียวกัน
ยังครองตำแหน่งที่ฮิสติดีนอาจทำปฏิกิริยา สำหรับในหลอดทดลอง
การใช้งาน, การตรวจคัดกรองของสภาพความเป็นกรดด่างและภายนอกบุตร
แกนด์ที่ที่นั่ง heme อย่างถูกต้องสามารถได้รับการสำรวจอย่างเป็นระบบ.
ดังนั้นจึงมีเหตุผลที่จะคาดหวังว่าโปรตีนฮีมธรรมชาติหลายอย่าง
สามารถแก้ไขได้จะได้รับการตอบสนองหรือโปรตีนเทียมสามารถ
ได้รับการออกแบบมาเพื่อ นำเสนอฮิสติดีนที่มีรูปทรงเรขาคณิตที่เหมาะสมกับ
heme

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข้อมูลสะสมกับ glbn [ 20 – 22,26 ] ได้ให้ชุดของเกณฑ์ นอกจากนี้
ีนกับ heme เหล็ก . อย่างแรกคือ
ความใกล้ชิด และเมื่อต้องอยู่ในอุ้งมือของฮีมไวนิลและ SP3
เรขาคณิตที่ vinylic C αอะตอมต้อง sterically ไปได้ อย่างไรก็ตาม เมื่อไม่ต้องดีที่สุด

เน้นตั้งต้นเป็นถ้ากั้นอุปการะรัฐมีประสิทธิภาพสามารถเอาชนะ
แช . ส่วนที่สอง คือ วางสถานะของฮิสติดีน . ใน glbn
, ข้อมูลมีความสอดคล้องกับฮิสติดีนให้โปรตอนกับ
ไวนิล C บีตา . โปรตอนเป็นขั้นกำหนดอัตราและปฏิกิริยา
ควรดำเนินการในระดับเพียงพอ . เกณฑ์ที่สามคือ
ธรรมชาติของเหล็กปลาย ) .เหล่านี้มีทั้งแบบ ( ฮิสติดีน
ไซยาไนด์ น้ำ / 5-coordinate ) [ 20 ] หรือยับยั้ง ( O2 และไม่บวกก็ไม่แสดงข้อมูล
; Co ) [ 21,26 ] ที่ยับยั้งการลิแกนด์มีช้า
อัตราคงที่ และอิเล็กตรอนถอนทรัพย์สินสันนิษฐาน
รับผิดชอบต่อการยับยั้ง ใน glbn , ลิแกนด์ผูกพันและมี nottightly ปล่อยปละละเลย หรืออาจได้รับการปล่อยตัวก่อน
โปรตอนและพฤติกรรม attackthe nucleophilic ของ ctrhb ตัวแปรนำข้อมูลเชิงลึกใหม่เข้าสู่
กลไกและข้อจำกัดของฮิสติดีนเพิ่มเติม ferrouswt ctrhb
ที่เป็นกลาง PH มีรายงานที่จะเป็นส่วนผสมของ 4 , 5 , และ 6-coordinate
ชนิดสมดุลเป็นใจ 5-coordinate สูงหมุนซับซ้อน
[ 29 ] ในการทดลองเบื้องต้น โปรตีนนี้พบเสียฮีม
อย่างรวดเร็ว apomyoglobin ( ครึ่งชีวิต - ~ 8 นาทีที่ pH 7.7 , ข้อมูลไม่
แสดง ) แสงสเปกตรัมที่แนะนำแบบผสมชนิดลดลง
ctrhb t111h และเพิ่มขึ้นเล็กน้อยในประชากรของ 6-coordinate
ชนิด l75h ctrhb ( สนับสนุนข้อมูลรูป s1b ) ความล้มเหลวของ
t111h เหล็กและ l75h ctrhbs โต้กลับจึงปรากฏการ ขาด ลา หรืออารมณ์ชั่ววูบ–โปรตีนฮีม

ติดต่อ .การเปลี่ยนแปลงที่เกิดขึ้นเมื่อลดแล้วพับ cyanomet
รัฐ a priori , เอ ( เช่นถูกต้องที่นั่งของ heme ) , ไฟฟ้าสถิต
หรือนี่ปัจจัยอิเล็กทรอนิกส์สามารถทั้งหมดสนับสนุนการ . ความพยายาม
กับพันธะข้ามในการแสดงตนของไซด์เป็น
ลิแกนด์และทางเลือกไม่สําเร็จ สนับสนุนข้อมูลภาพและ s21
) อิมิดาโซลประสานงานนำเพียงบางส่วน ( สนับสนุนการเชื่อมข้อมูล
รูป S22 ) เป็นไปได้ว่า ไซยาไนด์ ส่งเสริม covalentmodification
โดยการรักษาเสถียรภาพ protonated ไวนิลดูเหมือนว่าไม่น่าที่ได้รับการจับลิแกนด์แอน
นี้ไม่คาดว่าจะทำให้ไม่สบายใจอย่างมาก การกระจายของอิเล็กตรอน
heme เหล็ก [ 54 ] ดังนั้น ข้อมูลที่ชี้ไปยังเอ
ผลเป็นปัจจัยสําคัญของการขาดการยับยั้ง
ลิแกนด์ .
โปรตีนโครงสร้างประกาศใช้เมื่อไซยาไนด์ถูกผูกไว้จะมีผลต่อปฏิกิริยาทาง
ผลที่ลึกซึ้งเกี่ยวกับไวนิลกลุ่ม เราพบ
ข้างบนใน cyanomet ซับซ้อน เมเจอร์นี่ orientational
ไอโซเมอร์ของ WT ctrhb มี 2-vinyl กลุ่มออกไปจากนี่เครื่องบิน และในการ CIS เช่นการปฐมนิเทศส่วน t111h ctrhb ทนี้ใหม่
เพื่อข้ามเหมือนปฐมนิเทศ ( ข้อมูลประกอบรูปที่ S11 )
สเตอริโอเคมิสตรีของผลิตภัณฑ์พบว่าปฏิกิริยาอยู่ใน atrans ไวนิลเช่นโครงสร้าง โครงสร้างนี้มีระดับสูงของ
) กับแหวนพอร์ไฟรินมากกว่า CIS เช่นโครงสร้าง [ 55 ]
และอาจเจอโปรตอนมากขึ้นพร้อม . ไม่ว่า
ไวนิลทรานปรับแต่งโดยทั่วไปเป็นเงื่อนไขที่จำเป็นสำหรับปฏิกิริยาไม่
ชัดเจน ไม่ ไม่มีปฏิกิริยาระหว่าง h111 และ 2-vinyl
( สาขาเซ็นเตอร์ ) ใน t111h ctrhb แสดงว่าใกล้ Trans ไวนิลีน
เป็นคุณลักษณะที่ไม่เพียงพอสำหรับการเกิดปฏิกิริยา านที่เกี่ยวข้องกับฮีม reorientation
lowheme ภายนอก ) และความสัมพันธ์ในรัฐเสนอ
เหล็กh111 กับกลุ่ม 4-vinyl เป็นทางเลือกหนึ่งของการแข่งขันในกลุ่ม 2-vinyl

ดังนั้น ผลผลิตของ t111h ctrhb-a4 เกินเนื้อหาไอโซเมอร์
เล็กน้อยใน cyanomet เริ่มตั้งแต่วัสดุ อนึ่ง ผลผลิตของ l75h
ctrhb-b เกินกว่าเริ่มต้นเนื้อหาเซ็นเตอร์หลัก ตามที่คาดการณ์ไว้ ฮีม
reorientation ในเวลาค่อนข้างรวดเร็วขนาดนี้เป็นประโยชน์อย่างมาก

สำหรับปฏิกิริยาโปรตีนฮีม ธรรมชาติ , ไวนิลกลุ่มมักจะล้อมรอบ
โดย ) ด้านโซ่ ในก่อนทำงาน เราสำรวจมากกว่า 300
โครงสร้างสำหรับการปรากฏตัวของ leucines กับ C αอะตอมภายใน 7 กริพเพนของ
ไวนิลαอะตอม C และ C บีตาอะตอมภายใน 6 กริพเพนของเดียวกันไวนิล C αอะตอม
[ 22 ] เกณฑ์ที่ระบุใน glbn l79 และเป็นผู้สมัครใน ctrhb l75
ีนและปรับเปลี่ยนทดแทนมากกว่า
มากมาย