2.4. Target gene selection and olig

2.4. Target gene selection and oligonucleotide primers
The species-specific oligonucleotide primers used in this work targeted mitochondrial genes of hare, rabbit, red deer and pork, previously reported in the literature (Table 1). For the identification of cow meat, new primers were designed on the basis of the mitochondrial cytb gene sequence from various animal and plant species available in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) Genbank database. The specific primers were designed using the software Primer3 output designing tool (http://frodo.wi.mit.edu/primer3/). The nucleotide sequence was submitted to a basic local alignment search tool BLAST (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi), which identifies regions of local similarity among homologue sequences of different species and calculates the statistical significance of the matches ( Altschul, Gish, Miller, Myers, & Lipman, 1990). Primer specificity was assessed using the Primer-BLAST tool that allows revealing homologies in relation to all sequences available in the database (Genbank).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 เลือกยีนเป้าหมายและ oligonucleotide primers
สายพันธุ์เฉพาะไพร oligonucleotide ที่ใช้ในงานนี้เป้าหมายยีนยลกระต่าย, กระต่าย, กวางแดงและเนื้อหมูรายงานก่อนหน้านี้ในวรรณคดี (ตารางที่ 1) เพื่อระบุตัวตนของเนื้อวัว, ไพรเมอร์ใหม่ได้รับการออกแบบบนพื้นฐานของยีน cytb ยลจากสัตว์และพืชชนิดต่างๆที่มีอยู่ใน NCBI (แห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ) ฐานข้อมูล Genbank ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงได้รับการออกแบบโดยใช้ซอฟแวร์ Primer3 เครื่องมือออกแบบเอาท์พุท (http://frodo.wi.mit.edu/primer3/) ลำดับเบสที่ถูกส่งไปยังระเบิดพื้นฐานเครื่องมือค้นหาการจัดตำแหน่งในท้องถิ่น (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) ซึ่งระบุพื้นที่ของความคล้ายคลึงกันในประเทศในลำดับที่คล้ายคลึงกันของสิ่งมีชีวิตที่แตกต่างกันและคำนวณนัยสำคัญทางสถิติ ของการจับคู่ (Altschul กิชมิลเลอร์ไมเออร์และลิปแมน, 1990) ความจำเพาะประถมศึกษาได้รับการประเมินโดยใช้เครื่องมือการศึกษาระเบิดที่ช่วยเผยให้เห็น homologies เกี่ยวกับลำดับทั้งหมดที่มีอยู่ในฐานข้อมูล (Genbank)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.4 . ยีนและดีเอ็นเอ ซึ่งการเลือกเป้าหมาย
เฉพาะ - ขยายพันธุ์ ซึ่งไพรเมอร์ที่ใช้ในงานนี้เป้าหมายของยีนไมโตคอนเดรียกระต่าย , กระต่าย , กวางแดง และหมู ที่ก่อนหน้านี้ ได้รายงานในวรรณคดี ( ตารางที่ 1 ) สำหรับตัวของเนื้อวัวไพรเมอร์ใหม่ถูกออกแบบบนพื้นฐานของการ cytb ลำดับยีนจากสัตว์และพืชชนิดต่าง ๆที่มีอยู่ใน ncbi ( ศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ ) ฐานข้อมูลขนาด . ไพร์เมอร์จำเพาะถูกออกแบบมาโดยใช้ซอฟต์แวร์ primer3 ออกแบบเครื่องมือ ( http : / / โฟรโด้ วี ที ฝ่าย primer3 / )การลำดับนิวคลีโอไทด์ถูกส่งไปยังเครื่องมือค้นหาการปรับพื้นฐานท้องถิ่นระเบิด ( http : / / ระเบิด ncbi . nlm . NIH . gov / ระเบิด CGI ) ซึ่งจะระบุขอบเขตของความคล้ายคลึงกันระหว่างผิวภายในลำดับของสายพันธุ์ที่แตกต่างกันและคำนวณสถิติของการแข่งขัน ( แอลเชิลกิช , มิลเลอร์ , ไมเออร์ , & ลิปแมน 2533 )ไพรเมอร์ที่เฉพาะเจาะจงและใช้ไพรเมอร์ระเบิดเครื่องมือที่ช่วยให้เปิดเผย homologies ในความสัมพันธ์กับลำดับทั้งหมดที่มีอยู่ในฐานข้อมูล ( 5% )