All the three new cases, C61, C64,

All the three new cases, C61, C64, and C65, showed a normal
78,XX karyotype in all the observed metaphases, and PCR
analyses confirmed the absence of the SRY gene (not shown).
Moreover, the histological analyses revealed the presence of
testicular tissue in all the three cases, indicating that the male
pathway was active during the fetal period in the absence of SRY.
The testes of Case 61 are composed of testicular parenchyma with
absence of the germline. In Cases 64 and 65 the right and left
gonads are ovotestes (Figure 1a, b, c, d).
The results of array-CGH in the seven cases analyzed are listed
in Table 1.
In cases C10 and C44, the array-CGH analysis detected an
interstitial heterozygous duplication of chromosome 9, of 577 Kb
(from 11,016,965 to 11,593,933; all data are referred to CanFam2
genome assembly) (Figure 2). The duplication contained the SOX9
gene. This was confirmed by reverse transcriptase (RT)-PCR
(Figure 3) and it was never described as copy number variations
(CNVs) in different dog breeds [29–33]. The duplicated region
was flanked by small, 168 bp, directly oriented repeats of .97,6%
sequence identity, suggesting that non-allelic homologous recombination
(NAHR) might have mediated these duplications.
Furthermore, array-CGH identified several CNVs (data not shown) in our cases; all of them were described as polymorphic in
previous dog aCGH reports [29–33]. The complex CNV region
on CFA9:19,761,852–21,600,512 has been observed, and reported
with slightly different boundaries depending on the array platform
used, in multiple studies [29–33]. Several CNV patterns have been
described: gains or losses across the whole region, gains or losses of
only a part of the region or alternate gains and losses within a
single individual. The desert region between 20,115,306 and
21,119,179 is orthologous (61.9% of bases, 84.0% of span; http://
genome.ucsc.edu/index.html) to the human region
chr17:68,723,331–69,717,418 (genome assembly Hg19), located
500–600 Kb upstream of SOX9, which is suggested to be the
human regulatory region critical for gonadal SOX9 expression
[20]. It is particularly interesting because, taking into account that
the Dog Genome Assembly is a working progress and contains
many assembly errors (Rossi E. personal communication), the
actual distance between SOX9 and this region within the dog
genome could be the same of the human one. A more stable and
defined dog assembly will demonstrate the actual distance between the two regions and will help to clarify the related effects. As shown
in Table 1, in our cases the CNV from CFA9:19,761,852–
21,600,512 has different patterns: complex in cases 2, 9, 10, 61,
64, 65 and simple as a deletion in case 44.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

และทั้งหมดสามกรณีใหม่ C61, C64, C65 แสดงให้เห็นเป็นปกติ78, karyotype XX ในทั้งหมดที่พบ metaphases, PCRวิเคราะห์ยืนยันของยีน SRY (ไม่แสดง)นอกจากนี้ วิเคราะห์สรีรวิทยาเปิดเผยสถานะของเนื้อเยื่อ testicular ในทั้งหมดสามกรณี ระบุที่ชายทางเดินใช้งานอยู่ระหว่างช่วงครรภ์ในการขาดงานของ SRYพาเรงไคมา testicular ด้วยประกอบลิ้มของกรณี 61การขาดงาน germline ในกรณี 64 และ 65 ขวาและซ้ายต่อมบ่งเพศเป็น ovotestes (รูปที่ 1a, b, c, d)แสดงผลลัพธ์ของเรย์-CGH ในกรณี 7 วิเคราะห์ในตารางที่ 1ในกรณี C10 และ C44, CGH เรย์วิเคราะห์ตรวจพบการทำซ้ำ heterozygous หลากโครโมโซม 9, 577 Kb(จาก 11,016,965 เพื่อ 11,593,933 ข้อมูลทั้งหมดจะเรียกว่า CanFam2แอสเซมบลีจีโนม) (รูปที่ 2) การทำซ้ำมีอยู่ SOX9ยีน นี้ได้รับการยืนยัน โดย transcriptase กลับ (RT) -PCR(รูป 3) และไม่เคยถูกอธิบายเป็นรูปแบบหมายเลขสำเนา(CNVs) ในสายพันธุ์สุนัขต่าง ๆ [29 – 33] ภูมิภาคซ้ำกันมีนักขนาดเล็ก การ 168 bp ทำซ้ำตรงแนวของ.97,6%ลำดับรหัสประจำตัว recombination ที่ homologous allelic ไม่แนะนำ(NAHR) อาจมี mediated duplications เหล่านี้นอกจากนี้ CGH เรย์ระบุหลาย CNVs (ข้อมูลไม่แสดง) ในกรณีของเรา ทั้งหมดของพวกเขาได้อธิบายว่า polymorphic ในก่อนหน้านี้สุนัข aCGH รายงาน [29-33] ภูมิภาค CNV ซับซ้อนon CFA9:19,761,852–21,600,512 has been observed, and reportedwith slightly different boundaries depending on the array platformused, in multiple studies [29–33]. Several CNV patterns have beendescribed: gains or losses across the whole region, gains or losses ofonly a part of the region or alternate gains and losses within asingle individual. The desert region between 20,115,306 and21,119,179 is orthologous (61.9% of bases, 84.0% of span; http://genome.ucsc.edu/index.html) to the human regionchr17:68,723,331–69,717,418 (genome assembly Hg19), located500–600 Kb upstream of SOX9, which is suggested to be thehuman regulatory region critical for gonadal SOX9 expression[20]. It is particularly interesting because, taking into account thatthe Dog Genome Assembly is a working progress and containsmany assembly errors (Rossi E. personal communication), theactual distance between SOX9 and this region within the doggenome could be the same of the human one. A more stable anddefined dog assembly will demonstrate the actual distance between the two regions and will help to clarify the related effects. As shownin Table 1, in our cases the CNV from CFA9:19,761,852–21,600,512 has different patterns: complex in cases 2, 9, 10, 61,64, 65 and simple as a deletion in case 44.

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทั้งสามรายใหม่ c61 C64 , , , และขนาด C65 , แสดงให้เห็นว่าปกติ
78 , XXX ในทั้งหมดสังเกต metaphases และ PCR
วิเคราะห์ยืนยันการขาดยีน Sry ( ไม่แสดง ) .
นอกจากนี้ การวิเคราะห์ผลพบว่ามีเนื้อเยื่ออัณฑะ
ทั้งสามคดี ระบุว่า ทางเดินชาย
ถูกใช้งานในช่วงระยะเวลาการในการขาดงานของ sry .
ที่อัณฑะของกรณี 61 ประกอบด้วยอัณฑะมีการขาดงานของเยอร์มไลน์ด้วย
. ในกรณี 64 และ 65 ขวาและซ้ายเป็น ovotestes อยู่หมัด
( รูปที่ 1A , B , C , D )
ผลลัพธ์ของเรย์ cgh ในเจ็ดกรณีข้อมูลแสดงในตารางที่ 1
.
และในกรณีล้าง c44 , เรย์ cgh การวิเคราะห์ตรวจพบว่ามีการสร้างสำเนาของโครโมโซมคู่ที่ 9
interstitial , ของ แต่บางครั้ง
( จากการ 11593 11016965 ,แต่ ข้อมูลทั้งหมดจะเรียกว่า canfam2
ประกอบจีโนม ) ( รูปที่ 2 ) การทำสำเนาที่มี sox9
ยีน นี้ได้รับการยืนยันโดย reverse transcriptase ( RT - PCR )
( รูปที่ 3 ) และมันก็ไม่เคยอธิบายเป็นจำนวนสำเนาการเปลี่ยนแปลง
( cnvs ) ในสายพันธุ์สุนัขที่แตกต่างกัน [ 29 - 33 ] ซ้ำเขต
ถูกขนาบข้างด้วยขนาดเล็ก 168 BP โดยตรงเน้นย้ำ . 97,6 %
ดับตัวตนแนะนำว่า การเปรียบเทียบไม่ใช่ยาฆ่าแมลง
( nahr ) อาจจะผ่านการเหล่านี้ .
นอกจากนี้ เรย์ cgh ระบุหลาย cnvs ( ข้อมูลไม่แสดง ) ในกรณีของเรา ทั้งหมดของพวกเขาถูกอธิบายเป็น polymorphic ใน
รายงานก่อนหน้านี้ acgh 29 –สุนัข [ 33 ]
cnv เขตซับซ้อนใน cfa9:19761852 – 21600512 ได้รับการตรวจสอบ และรายงาน
ที่มีขอบเขตที่แตกต่างกันเล็กน้อย ขึ้นอยู่กับแพลตฟอร์ม
เรย์ใช้ในการศึกษาหลาย [ 29 - 33 ] รูปแบบ cnv หลายคนได้รับ
อธิบาย : กําไรหรือขาดทุนของทั่วทั้งภูมิภาค กำไรหรือขาดทุนของ
เพียงส่วนหนึ่งของภูมิภาคหรือผลประโยชน์อื่นและการสูญเสียภายใน
บุคคลเดียว ทะเลทรายภูมิภาคระหว่าง 20115306 และ
21119179 เป็น orthologous ( 61.9 % ของฐาน ร้อยละ 84.0 ( http : / /
;จีโนม . ucsc . edu / index . html ) มนุษย์เขต
chr17:68723331 – 69717418 ( genome ประกอบ hg19 ) ตั้งอยู่
500 – 600 KB เหนือ sox9 ซึ่งควรเป็น
มนุษย์บังคับเขตวิกฤตสำหรับการแสดงออกของ sox9
[ 20 ] มันเป็นที่น่าสนใจโดยเฉพาะอย่างยิ่งเนื่องจากการเข้าบัญชี
สุนัขจีโนมประกอบเป็นความคืบหน้าการทำงานและมีข้อผิดพลาดมากมาย ( รอสซี่ E .
ประกอบการสื่อสารส่วนบุคคล ) ,
ระยะทางจริงระหว่าง sox9 และภูมิภาคภายในจีโนมสุนัข
สามารถเดียวกันของมนุษย์คนหนึ่ง มีเสถียรภาพมากขึ้นและ
กำหนดประกอบสุนัขจะแสดงระยะทางจริงระหว่างสองภูมิภาค และจะช่วยชี้แจงเกี่ยวกับผล ดังแสดงในตารางที่ 1
, ในกรณีของเรา cnv จาก cfa9:19761852 –
21600512 มีรูปแบบที่แตกต่างกัน : ซับซ้อนในกรณี 2