Figure 5. Sequence comparison of FL

Figure 5. Sequence comparison of FLO/LFY-like proteins.
The deduced amino-acid sequence of the tomato TOFL was compared with FLO/LFY-like proteins in Antirrhinum (FLO, Coen et al. 1990 ), Arabidopsis(LFY, Weigel et al. 1992 ), tobacco (NFL1, Kelly et al. 1995 ), Petunia (ALF,Souer et al. 1998 ), pea (UNI, Hofer et al. 1997 ), Brassica (BOF, Anthony et al. 1996) and rice (RFL, Kyozuka et al. 1998 ). Black boxes indicate identical residues to TOFL sequence.
Compared with the wild type, the TOFL cDNA of fa plants showed two changes. One of these was an insertion of 3 bp (TAG) at position 479 where intron 1 is spliced out. This would be expected to give rise to a protein with an additional valine residue at position 158 ( Fig. 4). The second change detected in TOFL cDNA of fa, and surely the most important one, was a deletion of 16 bp in position 517 (exon 2) resulting in a frameshift mutation ( Fig. 4). The mutated allele is expected to encode a truncated protein of 187 amino acids because a stop codon in the new reading frame, 15 codons downstream from the deletion, is generated. In order to investigate whether this mutation is the cause of the fa phenotype, we analysed the presence of the deletion in 240 plants from an F2 population segregating for the famutation. DNA from each individual plant was subjected to PCR with a set of TOFL-specific primers that amplify the region surrounding the deletion. The PCR product of all the fa/fa plants analysed was 360 bp, 16 bp shorter than that obtained from homozygous plants for the wild-type allele (376 bp), as expected if the deletion were associated with the fa mutation. The heterozygous +/fa plants, identified by their selfed progeny, showed the two PCR products ( Fig. 6). Since no recombinant gametes were observed, these data indicate that the TOFLgene is tightly linked to the FA locus at a genetic distance of less than 0.21 c M.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รูปที่ 5 เปรียบเทียบลำดับของโปรตีน โฟล/LFY-เหมือนลำดับกรดอะมิโน deduced ของมะเขือเทศที่ TOFL ถูกเปรียบเทียบกับโปรตีน โฟล/LFY-เหมือนใน Antirrhinum (โฟล Coen et al. 1990), Arabidopsis (LFY, Weigel et al. 1992), ยาสูบ (NFL1, Kelly et al. 1995), Petunia (ALF, Souer et al. 1998) ดอกอัญชัญ (UNI, Hofer et al. 1997), ผัก (BOF, Anthony et al. 1996) และข้าว (RFL, Kyozuka และ al. ปี 1998) กล่องดำระบุตกเหมือนกับ TOFL ลำดับเมื่อเทียบกับป่าชนิด cDNA TOFL ฟ้าพืชแสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงที่สอง หนึ่งถูกแทรก 3 bp (แท็ก) ที่ตำแหน่ง 479 ซึ่ง spliced intron 1 ออก นี้จะต้องขึ้นให้โปรตีนกับสารตกค้างเป็นวาลีนเพิ่มเติมในตำแหน่ง 158 (Fig. 4) การเปลี่ยนแปลงที่สองที่พบใน TOFL cDNA ของฟ้า และแน่นอนที่สำคัญหนึ่ง มีการลบ 16 bp ในตำแหน่ง 517 (exon 2) เกิดการกลายพันธุ์แบบ frameshift (Fig. 4) Allele กลายเป็นต้องเข้ารหัสโปรตีนที่ตัดกรดอะมิโน 187 เนื่องจากสร้างรหัสพันธุกรรมหยุดในกรอบอ่านใหม่ codons ที่ 15 น้ำจากการลบ เพื่อตรวจสอบว่าการกลายพันธุ์นี้สาเหตุของ phenotype ฟ้า เรา analysed ของการลบในพืช 240 จากประชากร F2 การเอ็กซ์ปอร์ตสำหรับการ famutation ดีเอ็นเอจากพืชแต่ละแต่ละถูกยัดเยียดให้ PCR ด้วยชุดไพรเมอร์ TOFL เฉพาะที่ขยายการลบรอบภูมิภาค ผลิตภัณฑ์ PCR ทั้งหมดที่ analysed โรงฟ้า/ฟ้าเป็น 360 bp, 16 bp สั้นกว่าที่ได้รับจากพืช homozygous allele ชนิดป่า (376 bp), ตามที่คาดไว้ถ้าการลบมีความเกี่ยวข้องกับการกลายพันธุ์ฟ้า แบบ heterozygous + /mts ฟ้าพืช ระบุ โดยลูกหลานของพวกเขา selfed แสดงให้เห็นว่าผลิตภัณฑ์ PCR 2 (Fig. 6) เนื่องจากไม่ gametes recombinant สุภัค ข้อมูลเหล่านี้บ่งชี้ว่า TOFLgene ที่แน่นได้เชื่อมโยงกับโลกัสโพล FA ในระยะทางพันธุกรรมน้อยกว่า 0.21 c M

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รูปที่ 5 การเปรียบเทียบลำดับของ Flo / lfy เช่น โปรตีน กรดอะมิโน
ได้ลำดับของมะเขือเทศ tofl เทียบกับ Flo / lfy เช่นโปรตีนในลิ้นมังกร ( Flo Coen et al . 1990 ) , Arabidopsis ( lfy เจิล , et al . 1992 ) , ใบยาสูบ ( nfl1 , เคลลี่ et al . 1995 ) พิทูเนีย ( อัลฟ์ souer , et al . 2541 ) , ถั่ว ( ยูนิ โฮเฟอร์ et al . 1997 ) ผักกาด ( BOF , แอนโทนี et al . 1996 ) และข้าว ( rfl kyozuka , et al .1998 ) กล่องสีดำ พบสารตกค้างเหมือนกันกับลำดับ tofl .
เมื่อเทียบกับประเภทของป่า tofl cDNA ของเอฟเอ พืชให้เปลี่ยนแปลง หนึ่งเหล่านี้เป็นแทรกของ 3 BP ( Tag ) ที่ตำแหน่งที่ 1 คือที่ iNtRON ไมออก นี้จะถูกคาดว่าจะก่อให้เกิดโปรตีนที่มีการเพิ่มเติมวาลีนตกค้างที่ตำแหน่ง 158 ( รูปที่ 4 ) สองการเปลี่ยนแปลงที่พบใน tofl cDNA ของฟ้า ,และแน่นอน ที่สำคัญที่สุดคือการลบ 16 BP ในตำแหน่ง 517 ( exon 2 ) ส่งผลให้ เมการกลายพันธุ์ ( รูปที่ 4 ) ยีนกลายพันธุ์ที่คาดว่าจะเข้ารหัสแบบตัดโปรตีน 187 กรดอะมิโนเพราะรหัสหยุดในเฟรมใหม่อ่าน 15 ซิสล่องจากการลบ , จะถูกสร้างขึ้น เพื่อตรวจสอบว่า การกลายพันธุ์ที่เป็นสาเหตุของเอฟเอ ฟีโนไทป์ ,เราได้วิเคราะห์สถานะของการลบ 240 พืชจาก F2 ประชากรแยกสำหรับ famutation . ดีเอ็นเอจากพืชแต่ละบุคคลก็ต้องตรวจด้วยชุด tofl เฉพาะชนิดที่ขยายพื้นที่โดยการลบ pcr ผลิตภัณฑ์ทุกตัวฟ้า / ฟ้า พืชที่วิเคราะห์ได้ 360 / 16 BP สั้นกว่าที่ได้รับยีนจากพืชของอัลลีล ( 376 bp )คาดว่าถ้าการลบมีความสัมพันธ์กับ เอฟเอ กลายพันธุ์ พืชสร้าง / เอฟเอ ระบุตน selfed ลูกหลานแสดงโดยสองผลิตภัณฑ์ ( ภาพที่ 6 ) เนื่องจากไม่มี gametes recombinant พบข้อมูลเหล่านี้บ่งชี้ว่า toflgene เธอเชื่อมโยงกับเอฟเอ ความเชื่อที่ระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่าง C M .
น้อยกว่า