4. DiscussionThe phenylpropanoid pa

4. Discussion
The phenylpropanoid pathway is a key pathway
for plant secondary metabolism. Plants synthesize
a wide array of products from intermediates on
this pathway: lignin, flavonoids, phytoalexins, pigments,
[36]. One phenylpropanoid intermediate,
ferulic acid, is the precursor for capsaicinoids. In this report we demonstrated that transcript levels
for three enzymes on the phenylpropanoid branch
of the capsaicinoid pathway were positively correlated
with the accumulation of capsacinoids in
chile placental tissue. These results suggest that the
degree of pungency in the fruit may be controlled
in part by transcription of the structural genes on
this pathway. Using differential expression as a
screening criterion, two novel genes predicted to
encode additional enzymatic steps on the capsaicinoid
pathway were identified.
To monitor expression of the phenylpropanoid
pathway, cDNA forms of Pal, Ca4h and Comt
were isolated from a library of placental transcripts
from immature haban˜ero fruit. DNA sequence
analysis demonstrated that the clones
selected by hybridization to heterologous probes
did in fact encode genes for Pal, Ca4h and Comt.
There are many plant Pal sequences, Ca4h sequences
[37], and Comt sequences [38] deposited in
GenBank. The predicted translation products for
the chile cDNA clones all had greater than 85%
sequence identity with other plant genes for these
sequences.
Genomic Southern analyses suggest that Pal,
Ca4h, and Comt are represented as small gene
families in Capsicum. The Pal gene family has
been described in a number of Solanaceous plants.
In tobacco and tomato, Pal is encoded by approximately
four genes [14,16]; in potato, over 40 genes
encode Pal [13]. Ca4h is a cytochrome P450-dependent
monooxygenase, and as such may be considered
a member of a superfamily of genes; its
subfamily is designated CYP73A [37]. The specific
member of the superfamily, Ca4h is a single gene
in Arabidopsis thaliana [39], but a small gene family
in alfalfa and Populus [17,19]. Comt is also a
member of a superfamily of genes, the O-methyltransferase
superfamily [38]. Comt belongs to the
sub-group of o-diphenol-O-methyltransferases
(EC 2.1.1.6). Comt is encoded by a small gene
family, two members in tobacco and possibly in
Capsicum annuum [23,24]. Based on our Southern
blot analysis we predict that Pal, Ca4h, and Comt
are encoded by small gene families, approximately
three members in Capsicum chinense. These gene
family sizes are similar to the sizes of the gene
families for these genes in other plants.
Using the chile cDNA clones as probes, expression
patterns for Pal, Ca4h, and Comt were measured
in chile fruit of differing pungency class and at different developmental stages. Expression of
phenylpropanoid genes in placental tissue varied
both developmentally and as a function of pungency.
For all fruit types, and for all three genes,
transcript levels were higher in the immature fruit
tissues: fruit wall, placental or seed. In placenta
from immature fruit, transcript levels for all three
genes were positively correlated with fruit pungency
levels. These patterns of expression are consistent
with the proposed capsaicinoid pathway. If
capsacinoids are synthesized as proposed in Fig. 1,
then transcript levels for Pal, Ca4h and Comt
should be elevated early in placental development.
Capsaicinoids start to accumulate early in fruit
maturation, 20 days after pollination or approximately
during the last 2:3 of fruit development
[4,5,9]. Maximal transcript accumulation should
precede maximal capsaicinoid accumulation. Similarly,
those fruit types that accumulate large quantities
of capsaicinoids should have maximal
transcript levels for Pal, Ca4h, and Comt. The
patterns of transcript accumulation observed for
Pal, Ca4h, and Comt in chile placental tissue were
essentially as predicted, maximal accumulations
early in development and maximal accumulations
in the most pungent fruit (Figs. 3 and 4). The high
level of expression of Pal and Ca4h in immature
seed (Fig. 4) is consistent with the role of these
enzymes in the extensive lignification that occurs
in seed development. The differences in transcript
levels for these two genes in immature seed from
different cultivars, however is not understood.
Small amounts of placental tissue contamination
in the dissected immature seeds may account for
some of the high levels of expression in the habanero
seed preparations.
The patterns of expression of Pal, Ca4h and
Comt were used as predictors of expression patterns
for unknown capsaicinoid biosynthetic
genes. A differential screen of the haban˜ero library
was performed and two differentially expressed
clones have been examined in detail so far. Transcript
accumulation for these genes was determined
to be both placental-specific and correlated
with the degree of pungency in the fruit. DNA
sequence analysis predicted the gene products to
be a 3-keto-acyl-ACP synthase [32] and an aminotransferase
[34]. Capsaicinoid biosynthesis is a placental-
unique pathway and transcripts for enzymes
involved in capsaicinoid biosynthesis can be expected
to accumulate only in this organ.
Biosynthesis of capsaicinoids is likely to require
aminotransferase activities to aminate vanillin to
vanillylamine and to deaminate the branchedchain
amino acid used for fatty acid synthesis
(Fig. 1). No sequence similarity was found between
pAmt and over 20 sequences for branchedchain
aminotransferases in GenBank. Instead,
sequence similarity with class III pyridoxal phosphate
dependent aminotransferases was observed.
These sequence similarity results coupled with the
placental-specific pattern of expression are the basis
for the hypothesis that pAmt encodes a vanillin
aminotransferase. This hypothesis needs to be
tested with biochemical assays.
Biosynthesis of capsaicinoids is likely to require
a 3-keto-acyl-ACP synthase activity to elongate
branched-chain fatty acids (Fig. 1). Among the
different classes of Kas (I–IV) [40], the chile clone
has the highest degree of amino acid sequence
similarity to KAS class I proteins. This class of
3-keto-acyl-ACP synthase is specific for elongation
of short to medium chain (4–16 carbons) fatty
acids [40], the size range relevant for capsaicinoid
fatty acids. Again, these sequence similarity results
coupled with the placental-specific pattern of expression
support the hypothesis that Kas encodes
an activity to elongate branched-chain fatty acids.
Again, this hypothesis needs to be tested with
biochemical assays.
Differential screening of a specialized cDNA
library has produced very promising results. Using
mutants unable to accumulate and:or synthesize
capsaicinoids as the indicators of the differentially
accumulated transcripts, we were able to isolate
and characterize genes for capsaicinoid biosynthetic
activities. We will continue to pursue this
approach as a way to rapidly identify genes on this
pathway.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

4. สนทนาทางเดิน phenylpropanoid เป็นทางเดินหลักสำหรับพืชรองเผาผลาญ พืชสังเคราะห์ผลิตภัณฑ์จาก intermediates ในหลากหลายทางเดินนี้: lignin, flavonoids, phytoalexins สี[36] . phenylpropanoid กลาง หนึ่งกรด ferulic เป็นสารตั้งต้นสำหรับ capsaicinoids ในรายงานนี้ว่าเสียงบรรยายที่ระดับสำหรับเอนไซม์ที่สามในสาขา phenylpropanoidของทางเดิน capsaicinoid ถูกบวก correlatedมีการสะสมของ capsacinoids ในเนื้อเยื่อรกลอกชิลี ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำที่สามารถควบคุมระดับของ pungency ในผลไม้บางส่วน โดย transcription ของยีนโครงสร้างบนทางเดินนี้ ใช้นิพจน์แตกต่างเป็นการเกณฑ์การคัดกรอง นวนิยายยีนสองคาดว่า จะขั้นตอนที่เอนไซม์ในระบบเพิ่มเติมใน capsaicinoid การเข้ารหัสทางเดินที่ระบุการตรวจสอบค่าของ phenylpropanoidทางเดิน ฟอร์ม cDNA ของ Pal, Ca4h และ Comtถูกแยกจากไลบรารีของรกลอกใบแสดงผลจาก immature haban˜ero ผลไม้ ลำดับดีเอ็นเอวิเคราะห์แสดงที่โคลนเลือก โดยการคลิปปากตะเข้ heterologous hybridizationในความเป็นจริงไม่ได้เข้ารหัสยีนสำหรับ Pal, Ca4h และ Comtมีหลายโรงงานที่ Pal ลำดับ ลำดับ Ca4h[37], และ Comt ลำดับ [38] ฝากในGenBank ผลิตภัณฑ์แปลคาดการณ์โคลน cDNA ชิลีมีทั้งหมดมีมากกว่า 85%ลำดับรหัสประจำตัวกับยีนพืชอื่น ๆ เหล่านี้ลำดับนั้นแนะนำภาคใต้วิเคราะห์ genomic ที่ PalCa4h และ Comt จะแสดงเป็นยีนขนาดเล็กครอบครัวในพริกหวาน ครอบครัวยีนพาลได้ได้อธิบายไว้ในจำนวนพืช Solanaceousยาสูบและมะเขือเทศ Pal จะถูกเข้ารหัสโดยประมาณยีนที่ 4 [14,16]; ในมันฝรั่ง ผ่านยีน 40เข้ารหัส Pal [13] Ca4h เป็น cytochrome P450 ขึ้นอยู่กับmonooxygenase และเป็นเช่นอาจพิจารณาสมาชิกของ superfamily ของยีน ของsubfamily จะกำหนด CYP73A [37] เฉพาะสมาชิก superfamily, Ca4h มียีนเดียวใน Arabidopsis thaliana [39], แต่ครอบครัวยีนขนาดเล็กใน alfalfa และ Populus [17,19] Comt ก็เป็นสมาชิกของ superfamily ของยีน O-methyltransferasesuperfamily [38] Comt อยู่กลุ่มย่อยของ o-diphenol-O-methyltransferases(EC 2.1.1.6) Comt ถูกเข้ารหัส โดยยีนขนาดเล็กครอบครัว สมาชิกทั้งสอง ในยาสูบ และอาจรวมถึงในAnnuum พริกหวาน [23,24] ตามภาคใต้ของเราblot วิเคราะห์ทายผลที่ Pal, Ca4h และ Comtจะถูกเข้ารหัส โดยที่ครอบครัวยีนขนาดเล็ก ประมาณสมาชิก 3 ใน chinense พริกหวาน ยีนเหล่านี้ขนาดครอบครัวมีลักษณะขนาดของยีนครอบครัวสำหรับยีนเหล่านี้ในพืชอื่น ๆใช้ cDNA ชิลี clones เป็นคลิปปากตะเข้ นิพจน์รูปแบบ Pal, Ca4h และ Comt ถูกวัดในประเทศชิลีผลไม้ ของคลาส pungency แตกต่างกัน และ ในขั้นตอนการพัฒนาที่แตกต่างกัน ค่าของยีน phenylpropanoid ในรกลอกเนื้อเยื่อแตกต่างกันทั้ง developmentally และ เป็นฟังก์ชันของ pungencyสำหรับผลไม้ทุกชนิด และ ยีนที่สามระดับเสียงบรรยายได้สูงในผลไม้ immatureเนื้อเยื่อ: ผนังผลไม้ รกลอก หรือเมล็ด ในรกจากผลไม้ immature ระดับเสียงบรรยายทั้งสามยีนมีบวก correlated กับผลไม้ pungencyระดับการ รูปแบบของนิพจน์เหล่านี้จะสอดคล้องกันมีทางเดิน capsaicinoid นำเสนอ หากcapsacinoids จะสังเคราะห์เป็นการนำเสนอใน Fig. 1จากนั้นเสียงบรรยายระดับ Pal, Ca4h และ Comtควรยกระดับในการพัฒนาที่รกลอกก่อนกำหนดCapsaicinoids เริ่มสะสมตั้งแต่อยู่ในผลไม้พ่อแม่ หลัง pollination หรือประมาณ 20 วันช่วง 2:3 สุดท้ายของการพัฒนาผลไม้[4,5,9] การสะสมเสียงบรรยายสูงสุดควรหน้าสะสมสูงสุด capsaicinoid ในทำนองเดียวกันชนิดผลไม้ผู้ที่สะสมจำนวนมากcapsaicinoids ควรได้สูงสุดระดับเสียงบรรยายสำหรับ Pal, Ca4h และ Comt ที่รูปแบบของเสียงบรรยายสะสมสังเกตสำหรับPal, Ca4h และ Comt ในชิลีรกลอกเนื้อเยื่อได้เป็นที่คาดการณ์ สูงสุด accumulationsในช่วงพัฒนาและสูงสุด accumulationsในที่สุดหอมฉุนผล (Figs. 3 และ 4) สูงระดับของค่าของ Pal และ Ca4h ใน immatureเมล็ด (Fig. 4) มีความสอดคล้องกับบทบาทนี้เอนไซม์ใน lignification มากมายที่เกิดขึ้นในการพัฒนาเมล็ด ความแตกต่างในเสียงบรรยายระดับยีนเหล่านี้สองในเมล็ด immature จากพันธุ์แตกต่างกัน แต่ไม่เป็นที่เข้าใจเงินการปนเปื้อนของเนื้อเยื่อรกลอกในเมล็ด immature dissected อาจบัญชีสำหรับระดับสูงของนิพจน์ใน habanero บางการเตรียมเมล็ดพันธุ์รูปแบบของนิพจน์ของ Pal, Ca4h และใช้เป็น predictors ของร่าย Comtสำหรับ capsaicinoid biosynthetic ไม่รู้จักยีน หน้าจอส่วนของไลบรารี haban˜eroมีดำเนินการ และสอง differentially แสดงโคลนได้ถูกตรวจสอบในรายละเอียดมาก เสียงบรรยายกำหนดสะสมสำหรับยีนเหล่านี้รกลอกเฉพาะ และ correlatedกับระดับ pungency ในผลไม้ ดีเอ็นเอการวิเคราะห์คาดการณ์ผลิตภัณฑ์ยีนsynthase 3-keto-acyl-ACP [32] และ aminotransferase เป็น[34] การสังเคราะห์ Capsaicinoid เป็นที่รกลอก-ทางเดินเฉพาะและใบแสดงผลสำหรับเอนไซม์capsaicinoid ที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์สามารถคาดหวังการสะสมในอวัยวะส่วนนี้เท่านั้นการสังเคราะห์ capsaicinoids จะต้องกิจกรรม aminotransferase วานิลลิน aminate การvanillylamine และ deaminate branchedchainกรดอะมิโนที่ใช้ในการสังเคราะห์กรดไขมัน(Fig. 1) ลำดับคล้ายไม่พบระหว่างลำดับ 20 กว่าสำหรับ branchedchain และ pAmtaminotransferases ใน GenBank แทนลำดับคล้ายกับคลาส III pyridoxal ฟอสเฟตaminotransferases อิสระถูกตรวจสอบผลคล้ายลำดับเหล่านี้ควบคู่กับการรกลอกเฉพาะรูปแบบของนิพจน์เป็นพื้นฐานสำหรับทฤษฏีที่ pAmt จแมปวานิลลินaminotransferase สมมติฐานนี้จำเป็นต้องทดสอบกับ assays ชีวเคมีการสังเคราะห์ capsaicinoids จะต้องกิจกรรม 3-keto-acyl-ACP synthase จะ elongatebranched โซ่ไขมันกรด (Fig. 1) ระหว่างประเภทต่าง ๆ ของ Kas (I – IV) [40], โคลนชิลีมีกรดอะมิโนลำดับระดับสูงสุดคล้ายคลึงกับ KAS คลาผมโปรตีน ชั้นนี้3-keto-acyl-ACP synthase จะเฉพาะเจาะจงสำหรับ elongationของสั้นไปปานกลาง (4-16 carbons) ไขมันกรด [40], ช่วงขนาดเกี่ยวข้องกับ capsaicinoidกรดไขมัน อีก ผลลัพธ์เหล่านี้ลำดับความคล้ายคลึงกันควบคู่กับรกลอกเฉพาะรูปแบบของนิพจน์สนับสนุนสมมติฐานที่ Kas จแมปกิจกรรม elongate กรดไขมันห่วงโซ่ branchedอีกครั้ง ต้องทดสอบกับสมมติฐานนี้assays ชีวเคมีคัดกรองที่แตกต่างของ cDNA ที่เฉพาะไลบรารีได้ผลิตผลแนวโน้มมาก โดยใช้สายพันธุ์ไม่สามารถสะสม และ: หรือสังเคราะห์capsaicinoids เป็นตัวบ่งชี้ของการ differentiallyใบแสดงผลสะสม เราไม่สามารถแยกและลักษณะของยีน capsaicinoid biosyntheticกิจกรรม เราจะไล่นี้วิธีเป็นวิธีการระบุยีนนี้อย่างรวดเร็วทางเดิน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

4.
การอภิปรายทางเดินphenylpropanoid
เป็นทางเดินที่สำคัญสำหรับการเผาผลาญรองพืช พืชสังเคราะห์หลากหลายของผลิตภัณฑ์จากตัวกลางในทางเดินนี้: ลิกนิน, flavonoids, phytoalexins สี, [36] หนึ่ง phenylpropanoid กลางกรดferulic เป็นสารตั้งต้นสำหรับ capsaicinoids ในรายงานนี้เราแสดงให้เห็นถึงระดับหลักฐานที่สามเอนไซม์ในสาขา phenylpropanoid ของทางเดิน capsaicinoid มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับการสะสมของcapsacinoids ในเนื้อเยื่อรกชิลี ผลการศึกษานี้แสดงให้เห็นว่าระดับของความรุนแรงในผลไม้อาจมีการควบคุมในส่วนของการถอดรหัสของยีนโครงสร้างบนทางเดินนี้ ใช้การแสดงออกที่แตกต่างกันเป็นเกณฑ์คัดกรองสองยีนนวนิยายคาดว่าจะเข้ารหัสขั้นตอนเอนไซม์เพิ่มเติมเกี่ยวกับแคปไซทางเดินที่ถูกระบุ. ในการตรวจสอบการแสดงออกของ phenylpropanoid ทางเดินในรูปแบบยีนของ Pal, Ca4h และ COMT ที่แยกได้จากห้องสมุดของยีนที่รกจากที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะhaban~ero ผลไม้ ลำดับดีเอ็นเอการวิเคราะห์แสดงให้เห็นว่าโคลนเลือกโดยการผสมข้ามพันธุ์เพื่อฟิวส์heterologous ได้ในความเป็นจริงการเข้ารหัสยีนสำหรับ Pal, Ca4h และ COMT. มีโรงงานจำนวนมากลำดับ Pal ลำดับ Ca4h [37], และลำดับ COMT [38] ฝากในGenBank ที่คาดการณ์ผลิตภัณฑ์การแปลสำหรับโคลนยีนชิลีทั้งหมดมีมากกว่า 85% ลำดับบัตรที่มียีนพืชอื่น ๆ เหล่านี้วนเวียน. จีโนมภาคใต้วิเคราะห์แนะนำเพื่อนที่Ca4h และ COMT จะแสดงเป็นยีนที่มีขนาดเล็กครอบครัวในพริก ครอบครัวเพื่อนของยีนที่ได้รับการอธิบายในจำนวนของพืช solanaceous. ในยาสูบและมะเขือเทศ Pal ถูกเข้ารหัสโดยประมาณสี่ยีน[14,16]; ในมันฝรั่งกว่า 40 ยีนเข้ารหัสPal [13] Ca4h เป็น cytochrome P450 ขึ้นอยู่กับmonooxygenase และเป็นเช่นนี้อาจได้รับการพิจารณาเป็นสมาชิกของsuperfamily ของยีน; ของอนุวงศ์ถูกกำหนด CYP73A [37] เฉพาะสมาชิกของ superfamily ที่ Ca4h เป็นยีนเดียวในArabidopsis thaliana [39] แต่ครอบครัวของยีนที่มีขนาดเล็กในหญ้าชนิตและPopulus [17,19] COMT ยังเป็นสมาชิกของsuperfamily ของยีนที่ O-methyltransferase superfamily [38] COMT อยู่ในกลุ่มย่อยของo-diphenol-O-methyltransferases (EC 2.1.1.6) COMT ถูกเข้ารหัสโดยยีนเล็ก ๆครอบครัวของสองสมาชิกในยาสูบและอาจจะในพริก annuum [23,24] ขึ้นอยู่กับภาคใต้ของเราวิเคราะห์ blot เราคาดการณ์ว่า Pal, Ca4h และ COMT จะถูกเข้ารหัสโดยยีนครอบครัวขนาดเล็กประมาณสามสมาชิกในพริก chinense ยีนเหล่านี้ขนาดครอบครัวที่มีความคล้ายคลึงกับขนาดของยีนครอบครัวยีนเหล่านี้ในพืชอื่นๆ . การใช้โคลนยีนชิลีเป็นยานสำรวจการแสดงออกรูปแบบสำหรับ Pal, Ca4h และ COMT วัดในผลไม้ชิลีต่างกันระดับความเผ็ดและที่แตกต่างกันในการพัฒนาขั้นตอน การแสดงออกของยีน phenylpropanoid ในเนื้อเยื่อของรกที่แตกต่างกันทั้งในการพัฒนาและเป็นหน้าที่ของความรุนแรงได้. สำหรับทุกประเภทผลไม้และสำหรับทั้งสามยีนระดับหลักฐานสูงขึ้นในผลไม้ที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะเนื้อเยื่อผนังไม้รกหรือเมล็ด ในรกจากผลไม้ที่ยังไม่บรรลุนิติภาวะระดับหลักฐานสำหรับทั้งสามยีนมีความสัมพันธ์เชิงบวกกับผลไม้ที่รุนแรงระดับ รูปแบบของการแสดงออกเหล่านี้มีความสอดคล้องกับการเดินแคปไซเสนอ หากcapsacinoids มีการสังเคราะห์ตามที่เสนอในรูป 1 แล้วระดับหลักฐานสำหรับ Pal, Ca4h และ COMT. ควรได้รับการยกระดับต้นในการพัฒนารกcapsaicinoids เริ่มสะสมในช่วงต้นผลไม้ที่เจริญเติบโต, 20 วันหลังจากการผสมเกสรหรือประมาณช่วง2: 3 ของการพัฒนาผลไม้[4,5,9] . หลักฐานการสะสมสูงสุดควรนำหน้าการสะสมแคปไซสูงสุด ในทำนองเดียวกันชนิดผลไม้ที่สะสมในปริมาณมากของcapsaicinoids ควรจะมีสูงสุดระดับหลักฐานสำหรับPal, Ca4h และ COMT รูปแบบของการสะสมหลักฐานสังเกตPal, Ca4h และ COMT ในเนื้อเยื่อของรกชิลีถูกเป็นหลักเป็นที่คาดการณ์สะสมสูงสุดในช่วงต้นของการพัฒนาและการสะสมสูงสุดในผลไม้ฉุนมากที่สุด(มะเดื่อ. 3 และ 4) สูงระดับของการแสดงออกของเพื่อนและ Ca4h อ่อนในเมล็ด(รูปที่. 4) มีความสอดคล้องกับบทบาทของเหล่านี้เอนไซม์ในlignification มากมายที่เกิดขึ้นในการพัฒนาเมล็ดพันธุ์ ความแตกต่างในหลักฐานระดับสำหรับทั้งสองยีนในเมล็ดอ่อนจากสายพันธุ์ที่แตกต่างกันแต่ไม่เข้าใจ. จำนวนเล็ก ๆ ของการปนเปื้อนเนื้อเยื่อรกในเมล็ดอ่อนชำแหละอาจบัญชีสำหรับบางส่วนของระดับสูงของการแสดงออกในHabanero การเตรียมเมล็ดพันธุ์. รูปแบบ การแสดงออกของ Pal, Ca4h และCOMT ถูกนำมาใช้เป็นตัวทำนายของรูปแบบการแสดงออกสำหรับชีวสังเคราะห์ที่ไม่รู้จักแคปไซยีน หน้าจอความแตกต่างของห้องสมุด haban~ero ได้ดำเนินการและสองแสดงออกแตกต่างกันโคลนได้รับการตรวจสอบในรายละเอียดเพื่อให้ห่างไกล Transcript สะสมสำหรับยีนเหล่านี้ถูกกำหนดให้ทั้งรกที่เฉพาะเจาะจงและมีความสัมพันธ์กับระดับของความรุนแรงในผลไม้ ดีเอ็นเอวิเคราะห์ลำดับคาดการณ์ผลิตภัณฑ์ยีนจะเป็นเทส3-Keto-acyl-ACP [32] และ aminotransferase [34] การสังเคราะห์ capsaicinoid เป็น placental- ทางเดินที่ไม่ซ้ำกันและจิตบำบัดเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการสังเคราะห์ capsaicinoid สามารถคาดหวังที่จะสะสมเฉพาะในอวัยวะนี้. การสังเคราะห์ของ capsaicinoids มีแนวโน้มที่จะต้องมีการจัดกิจกรรมเพื่อaminotransferase aminate vanillin จะvanillylamine และ deaminate branchedchain กรดอะมิโนที่ใช้สำหรับไขมัน การสังเคราะห์กรด(รูปที่ 1). ความคล้ายคลึงกันตามลำดับไม่พบระหว่างpAmt และกว่า 20 ลำดับสำหรับ branchedchain aminotransferases ใน GenBank แต่ความคล้ายคลึงกันกับลำดับชั้นที่สามฟอสเฟต pyridoxal ขึ้น aminotransferases ก็สังเกตเห็น. เหล่านี้ส่งผลคล้ายคลึงกันตามลำดับประกอบกับรูปแบบรกที่เฉพาะเจาะจงในการแสดงออกเป็นพื้นฐานสำหรับสมมติฐานที่ว่าpAmt เข้ารหัส vanillin aminotransferase สมมติฐานนี้จะต้องมีการทดสอบกับการวิเคราะห์ทางชีวเคมี. การสังเคราะห์ของ capsaicinoids มีแนวโน้มที่จะต้องเป็นกิจกรรมที่เทส3-Keto-acyl-ACP จะยาวกรดไขมันโซ่กิ่ง(รูปที่ 1). ในระหว่างที่เรียนแตกต่างกันของ Kas (I-IV) [40] โคลนชิลีมีระดับสูงสุดของลำดับกรดอะมิโนที่คล้ายคลึงกันในชั้นเรียนKAS ผมโปรตีน ชั้นนี้เทส 3-Keto-acyl-ACP เป็นที่เฉพาะเจาะจงสำหรับการยืดตัวของห่วงโซ่สั้นกลาง(4-16 ก๊อบปี้) ไขมันกรด[40] ช่วงขนาดที่เกี่ยวข้องกับแคปไซกรดไขมัน อีกครั้งเหล่านี้ผลการคล้ายคลึงกันตามลำดับประกอบกับรูปแบบรกที่เฉพาะเจาะจงในการแสดงออกสนับสนุนสมมติฐานที่ว่าKas encodes กิจกรรมเพื่อยืดโซ่กิ่งกรดไขมัน. อีกครั้งสมมติฐานนี้จะต้องมีการทดสอบกับการวิเคราะห์ทางชีวเคมี. การตรวจคัดกรองที่แตกต่างกันของยีนเฉพาะห้องสมุดมีการผลิตที่มีแนวโน้มมากผล ใช้การกลายพันธุ์ไม่สามารถที่จะสะสมและหรือสังเคราะห์capsaicinoids เป็นตัวชี้วัดของการแตกต่างกันใบรับรองผลการเรียนสะสมเราก็สามารถที่จะแยกและลักษณะของยีนสำหรับชีวสังเคราะห์แคปไซกิจกรรม เราจะยังคงที่จะไล่ตามนี้วิธีการเป็นวิธีการอย่างรวดเร็วระบุยีนเกี่ยวกับเรื่องนี้ทางเดิน