Initially, we investigated the tech

Initially, we investigated the technical reproducibility of
T-RFLP patterns. PCR, enzyme digestions and T-RFLP
analysis were performed on three vaginal samples. After
3 weeks, the procedures were repeated using the same
DNA, which had been stored at –20 uC. Comparison of
corresponding T-RFLP patterns demonstrated excellent
reproducibility, confirming the observations of Osborn
et al. (2000). The mean difference between T-RFs was
,1 bp. The peak heights displayed a higher level of variation;
however, this had no impact on species identification
(data not shown).
Differences between observed and predicted T-RF sizes
usually were within –2 to+2 bp of the predicted T-RF size.
However, the differences grew larger for T-RFs .500 bp
(data not shown). This T-RF drift has been reported
previously and appears to be affected by subtle differences
in molecular mass, from either purine content or dye label
(Kaplan & Kitts, 2003). We observed 109 distinct T-RFs
from 50 to 500 bp, which could be attributed to a total of
23 identifiable T-RF patterns. The mean difference between
maximum and minimum values of all T-RFs was 1.29 bp,
demonstrating the very low variability among observed TRF
sizes corresponding to distinct species or phylotypes
from different samples (as a representative example, see
Table 1 for a detailed analysis of MspI-generated T-RFs).
These data suggested that T-RF length variation due to
strain-to-strain differences was negligible and that overall
reproducibility, defined as technical and biological reproducibility
combined, could be regarded as sufficiently high.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เริ่มแรก เราตรวจสอบการทำเทคนิครูปแบบ T RFLP PCR เอนไซม์ digestions และ T RFLPวิเคราะห์ได้ดำเนินการในสามช่องคลอดตัวอย่าง หลังจาก3 สัปดาห์ ขั้นตอนซ้ำกันใช้เหมือนกันDNA ซึ่งได้ถูกเก็บไว้ที่ –20 uC เปรียบเทียบแสดงให้เห็นรูปแบบ T RFLP ที่สอดคล้องกันดีทำสำเนา การยืนยันข้อสังเกตของออสบอร์et al. (2000) ความแตกต่างเฉลี่ยระหว่าง T-โรงพยาบาลเอกชล, 1 bp ความสูงสูงสุดแสดงระดับสูงขึ้นของการเปลี่ยนแปลงอย่างไรก็ตาม นี้มีผลไม่ชนิด(ข้อมูลไม่แสดง)ความแตกต่างระหว่างสังเกต และคาดการณ์ขนาด T-RFปกติได้ภายในตั้งแต่-ถึง + 2 bp ของ T-RF ขนาดคาดการณ์อย่างไรก็ตาม ความแตกต่างเติบโตขนาด T-โรงพยาบาลเอกชล.500 bp(ข้อมูลไม่แสดง) มีการรายงานนี้ดริฟท์ T-RFก่อนหน้านี้ และจะได้รับผลกระทบ โดยแตกต่างกันในมวลโมเลกุล จากป้ายชื่อเนื้อหาหรือย้อมทั้ง purine(Kaplan & คิตส์ 2003) เราสังเกตเห็น 109 แตกการ T-การโรงพยาบาลเอกชลได้เพื่อป้องกันตั้งแต่ 50 ถึง 500 bp ซึ่งอาจเกิดจากการรวมรูปแบบ T-RF บุคคล 23 ความแตกต่างเฉลี่ยระหว่างค่าสูงสุด และต่ำสุดของทั้งหมดทีโรงพยาบาลเอกชลได้ 1.29 bpแสดงให้เห็นถึงความแปรปรวนระหว่างเมธีสังเกตต่ำมากขนาดที่สอดคล้องกับชนิดหรือ phylotypesจากตัวอย่างที่แตกต่างกัน (เป็นตัวอย่าง ดูตาราง 1 การวิเคราะห์รายละเอียดของ MspI สร้าง T-โรงพยาบาลเอกชล)แนะนำข้อมูลเหล่านี้ที่เปลี่ยนแปลงความยาว T RF เนื่องจากความแตกต่างของสายพันธุ์พันธุ์แก้ไขเล็กน้อย และโดยรวมนั้นแสดง กำหนดเป็นแสดงทางเทคนิค และทางชีวภาพรวม ถือเป็นอย่างสูง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ขั้นแรกเราตรวจสอบการทำสำเนาทางเทคนิคของ
รูปแบบ T-RFLP PCR, การย่อยของเอนไซม์และ T-RFLP
วิเคราะห์ได้ดำเนินการในสามตัวอย่างในช่องคลอด หลังจาก
3 สัปดาห์ที่ผ่านขั้นตอนที่ถูกทำซ้ำโดยใช้เดียวกัน
ดีเอ็นเอซึ่งได้รับการจัดเก็บไว้ที่อุณหภูมิ -20 UC เปรียบเทียบ
สอดคล้องรูปแบบ T-RFLP แสดงให้เห็นที่ดีเยี่ยม
ในการทำซ้ำเพื่อยืนยันการสังเกตของออสบอร์
et al, (2000) ความแตกต่างระหว่างค่าเฉลี่ย T-RFs เป็น
1 bp ความสูงสูงสุดแสดงระดับที่สูงขึ้นของการเปลี่ยนแปลง;
แต่นี้มีผลกระทบต่อบัตรประจำตัวสายพันธุ์
. (ไม่ได้แสดงข้อมูล)
ความแตกต่างระหว่างการสังเกตและคาดการณ์ขนาด T-RF
มักจะเป็นคนที่อยู่ใน -2 ถึง +2 bp ขนาด T-RF ที่คาดการณ์ไว้ .
แต่ความแตกต่างใหญ่ขึ้นสำหรับ t-RFs 500 bp
(ไม่ได้แสดงข้อมูล) ดริฟท์นี้ T-RF ได้รับการรายงาน
ก่อนหน้านี้และดูเหมือนจะได้รับผลกระทบจากความแตกต่างที่ลึกซึ้ง
ในมวลโมเลกุลจากทั้งเนื้อหา purine หรือฉลากสีย้อม
(Kaplan & คิตส์, 2003) เราสังเกตเห็นที่แตกต่างกัน 109 T-RFs
50-500 BP ซึ่งอาจจะประกอบไปทั้งหมด
23 รูปแบบที่สามารถระบุตัว T-RF ความแตกต่างของค่าเฉลี่ยระหว่าง
ค่าสูงสุดและต่ำสุดของ T-RFs เป็น 1.29 BP,
แสดงให้เห็นถึงความแปรปรวนที่ต่ำมากในหมู่สกวสังเกต
ขนาดที่สอดคล้องกับสายพันธุ์ที่แตกต่างกันหรือ phylotypes
จากตัวอย่างที่แตกต่างกัน (เป็นตัวอย่างที่เป็นตัวแทนให้ดู
ตารางที่ 1 สำหรับการวิเคราะห์รายละเอียดของ MspI -generated T-RFs).
ข้อมูลเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า T-RF ระยะเวลาในการเปลี่ยนแปลงอันเนื่องมาจาก
ความแตกต่างของสายพันธุ์ต่อความเครียดได้เล็กน้อยโดยรวมและ
การทำสำเนาหมายถึงการทำซ้ำทางเทคนิคและทางชีวภาพ
รวมกันอาจจะถือได้ว่าเป็นที่สูงพอสมควร

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในขั้นต้น เราทำการตรวจสอบทางด้านเทคนิคของรูปแบบ t-rflp . ตรวจ digestions เอนไซม์และ t-rflpการวิเคราะห์จำนวน 3 ตัวอย่างที่เกี่ยวกับโยนี หลังจาก3 สัปดาห์ ขั้นตอนที่ใช้เหมือนกันซ้ำดีเอ็นเอซึ่งถูกเก็บไว้ที่ - 20 เป็นต้น . การเปรียบเทียบของt-rflp รูปแบบแสดงที่ยอดเยี่ยมตรวจสอบ , การยืนยันการสังเกตของออสบอร์นet al . ( 2000 ) ความแตกต่างของคะแนนเฉลี่ยระหว่าง t-rfs คือ1 BP . ยอดเขาสูงที่แสดงระดับที่สูงขึ้นของการเปลี่ยนแปลง ;อย่างไรก็ตาม เรื่องนี้ไม่มีผลกระทบต่อการจำแนกชนิด( ข้อมูลไม่แสดง )ความแตกต่างระหว่างการตรวจสอบและคาดการณ์ t-rf ขนาดมักจะเป็นภายใน ( 2 + 2 BP ของคาดการณ์ t-rf ขนาดอย่างไรก็ตาม ความแตกต่างที่ใหญ่ขึ้นสำหรับ t-rfs 500 BP .( ข้อมูลไม่แสดง ) นี้ t-rf ดริฟท์ มีรายงานก่อนหน้านี้จะได้รับผลกระทบ โดยความแตกต่างของสีสันในระดับโมเลกุล มวล จาก พิวรีน เนื้อหาหรือสีป้าย( Kaplan & คิตส์ , 2003 ) เราพบ 109 t-rfs แตกต่างตั้งแต่ 50 ถึง 500 BP ซึ่งอาจจะเกิดจากการรวมของ23 บุคคล t-rf รูปแบบ หมายถึง ความแตกต่างระหว่างสูงสุดและค่าต่ำสุดของ t-rfs เป็น 1.29 BP ,แสดงให้เห็นถึงความมากน้อยของสังเกตสกว.ขนาดสอดคล้องกับชนิดที่แตกต่างกันหรือ phylotypesจากตัวอย่างที่แตกต่างกัน ( เช่น ตัวแทน เช่น เห็นตารางที่ 1 สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลโดยใช้ที่สร้างขึ้น t-rfs )ข้อมูลเหล่านี้ชี้ให้เห็นว่า t-rf ความยาวการเปลี่ยนแปลงเนื่องจากเมื่อยเมื่อย ความแตกต่างสำคัญ และโดยรวมตรวจสอบทางชีวภาพเช่นยา ,รวมกันก็ถือว่าสูงพอสมควร