In this study, threephenetically id

In this study, three
phenetically identical Penicillium isolates, collected recently
during a project conducted to investigate the bioaerosol in
a restoration laboratory in Italy, which morphologically
resemble Penicillium raistrickii but can be distinguished
from the latter on the basis of macro- and microscopic
characteristics, were subjected to a phylogenetic investigation
to obtain a better taxonomic resolution and to gather
information on their evolutionary relationships. As molecular
markers related to the rRNA genes, we used the
internal transcribed spacers (ITS1, ITS2) including the 5.8S
In addition, cmd gene sequences (approx. 600 bp) were
obtained for P. simile sp. nov. (holotype; Supplementary
Table S1) and for the P. raistrickii strains A2a–8 and 3Ba–
AP–1 (Supplementary Table S1). The introns were bounded
by GT–AG splice sites; the two isolates of P. raistrickii
yielded identical cmd sequences. A BLAST analysis showed
that the cmd gene sequences of P. simile displayed 86%
sequence similarity with the cmd gene from strains of
P. scabrosum. In the cmd region we examined, P. simile
displayed unique cmd gene sequences that distinguished it
from P. raistrickii. In particular, the P. simile and P. raistrickii
strains (Supplementary Table S1) had different nucleotides
(sequence divergence value of approx. 6.5 %) in the intron
regions (the third and the fourth intron were slightly
different in length due to the presence of indels)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษานี้ 3phenetically เหมือน Penicillium ล รวบรวมล่าสุดในระหว่างดำเนินการตรวจสอบ bioaerosol ในโครงการห้องปฏิบัติการฟื้นฟูในอิตาลี ซึ่ง morphologicallyมีลักษณะ Penicillium raistrickii แต่อาจแตกต่างหลังโดยใช้แมโคร - และกล้องจุลทรรศน์ลักษณะ ถูกต้องสอบสวน phylogeneticได้รับความดีอนุกรมวิธานละเอียด และรวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการ เป็นโมเลกุลเครื่องหมายที่เกี่ยวข้องกับยีนใน rRNA เราใช้การภายในการทับศัพท์ spacers (ITS1, ITS2) รวมถึงการ 5.8Sนอกจากนี้ ยีนคำสั่งลำดับ (ประมาณ 600 bp) ได้ได้เปรียบ P. sp. nov (holotype ส่งเสริมการขายตาราง S1) และสายพันธุ์ P. raistrickii A2a – 8 และ 3Ba –AP – 1 (ตารางเสริม S1) Introns ถูกล้อมรอบโดย GT – AG ตัดต่อไซต์ แยกสองของ P. raistrickiiหาลำดับคำสั่งเหมือนกัน วิเคราะห์ระเบิดที่พบว่า ลำดับยีน cmd ของ P. เปรียบแสดง 86%ลำดับคล้ายกับยีนคำสั่งจากสายพันธุ์ของP. scabrosum ในคำสั่งเราตรวจสอบ P. เปรียบแสดงลำดับยีนคำสั่งเฉพาะที่แตกต่างนั้นจาก P. raistrickii ในเฉพาะ เปรียบเทียบ P. P. raistrickiiสายพันธุ์ (เสริมตาราง S1) มีนิวคลีโอไทด์แตกต่างกัน(ลำดับ divergence มูลค่าประมาณ 6.5%) ใน intronภูมิภาค (ที่สามและ intron สี่ได้เล็กน้อยแตกต่างกันในระยะเนื่องจาก indels)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษานี้สาม
เหมือน phenetically Penicillium แยกเก็บเมื่อเร็ว ๆ นี้
ในระหว่างการดำเนินการโครงการในการตรวจสอบ bioaerosol ใน
ห้องปฏิบัติการฟื้นฟูในอิตาลีซึ่งสัณฐาน
คล้าย Penicillium raistrickii แต่จะแตกต่าง
จากสมัยที่อยู่บนพื้นฐานของแมโครและกล้องจุลทรรศน์
ลักษณะเป็น ภายใต้การตรวจสอบสายวิวัฒนาการ
เพื่อให้ได้ความละเอียดของการจัดหมวดหมู่ที่ดีขึ้นและการรวบรวม
ข้อมูลเกี่ยวกับความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของพวกเขา เป็นโมเลกุล
เครื่องหมายที่เกี่ยวข้องกับยีน rRNA เราใช้
Spacers ภายในคัดลอก (ITS1, ITS2) รวมทั้ง 5.8S
นอกจากนี้ลำดับยีน cmd. (ประมาณ 600 bp) ได้
รับสำหรับการเปรียบเทียบ P. SP พฤศจิกายน (holotype; เสริม
ตาราง S1) และสายพันธุ์ P. raistrickii A2a-8 และ 3Ba-
AP-1 (ตารางที่เสริม S1) introns ถูก จำกัด
โดย GT-AG เว็บไซต์ประกบกัน; สองสายพันธุ์ของพี raistrickii
ผลลำดับคำสั่งเหมือนกัน การวิเคราะห์ระเบิดแสดงให้เห็น
ว่าลำดับยีน cmd ของพีแสดงการเปรียบเทียบ 86%
ลำดับที่มีความคล้ายคลึงกันของยีน cmd จากสายพันธุ์ของ
P. scabrosum ในภูมิภาค cmd เราตรวจสอบ, P. เปรียบเทียบ
แสดงลำดับยีน cmd เป็นเอกลักษณ์ที่โดดเด่น
จาก P. raistrickii โดยเฉพาะอย่างยิ่งการเปรียบเทียบพีและพี raistrickii
สายพันธุ์ (S1 ตารางเสริม) มีนิวคลีโอที่แตกต่างกัน
(ค่าความแตกต่างของลำดับประมาณ. 6.5%) ใน Intron
ภูมิภาค (ที่สามและสี่ Intron เล็กน้อย
ที่แตกต่างกันมีความยาวเพราะการปรากฏตัว ของ indels)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในการศึกษานี้ , 3
phenetically เหมือนกัน Penicillium สายพันธุ์ที่รวบรวมล่าสุด
ในโครงการการศึกษาละอองลอยชีวภาพใน
บูรณะห้องปฏิบัติการในอิตาลี ซึ่งจาก
คล้าย Penicillium raistrickii แต่สามารถแยกแยะ
จากหลังบนพื้นฐานของแมโครและลักษณะทางกล้องจุลทรรศน์

ถูกสอบสวน ซึ่งเป็นเพื่อให้ได้ความละเอียดทางที่ดีและเพื่อรวบรวม
ข้อมูลความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของพวกเขา เป็นโมเลกุลเครื่องหมาย
เกี่ยวข้องกับ rRNA ยีน เราใช้
ภายใน ( its1 spacers , และ its2 ) รวมทั้ง 5.8s
นอกจากนี้ CMD ยีน ลำดับ ( ประมาณ 600 คู่เบส )
รับได้หน้าใช้ sp . ( ตัวอย่างต้นแบบแรก ; เสริม
ตาราง S1 ) และสำหรับหน้า raistrickii สายพันธุ์ A2A – 8 และ 3ba -
AP - 1 ( เสริมตาราง S1 ) ที่ถูกล้อมรอบด้วย GT introns
–โดยเว็บไซต์ดาม ; สองสายพันธุ์ของหน้า raistrickii
ให้ผลลำดับ cmd เหมือนกัน การวิเคราะห์ระเบิดพบว่าลำดับของยีน CMD

ลำดับการแสดงหน้า 86 % ความเหมือนกับสายพันธุ์ของยีนจาก CMD
P scabrosum . ใน cmd เขตเราตรวจสอบ , หน้าอุปมา
แสดงเฉพาะ CMD ที่แตกต่างมัน
ลำดับยีนจากหน้า raistrickii . โดยเฉพาะหน้า ลักษณะหน้า raistrickii
สายพันธุ์ ( เสริมตาราง S1 ) ที่แตกต่างกันมีนิวคลีโอไทด์
( ลำดับความแตกต่างมูลค่าประมาณ 6.5 % ) ในภูมิภาค iNtRON
( ที่สามและสี่เล็กน้อย
iNtRON แตกต่างกันในความยาว จากการ indels )