The reannotation excluded 608 codin

The reannotation excluded 608 coding sequences from the RefSeq annotation. Meanwhile, a total of 299 coding sequences were newly added, about one third of them are found in genomic island (GI) regions while more than one fifth of them are located in virulence related regions pathogenicity islands (PAIs). Furthermore, there are totally 341 genes were relocated with their translational initiation sites (TISs), which resulted in a high quality of gene start annotation. In addition, 94 pseudogenes annotated in RefSeq were thoroughly inspected and updated. The number of miscellaneous genes (sRNAs) has been updated from 6 in RefSeq to 46 in the reannotation. Based on the adjustment in the reannotation, subsequent analysis were conducted by both general and case studies on new virulence factors or new virulence-associated genes that are crucial during the urinary tract infections (UTIs) process, including invasion, colonization, nutrition uptaking and population density control. Furthermore, miscellaneous RNAs collected in the reannotation are believed to contribute to the virulence of strain CFT073. The reannotation including the nucleotide data, the original RefSeq annotation, and all reannotated results is freely available via http://mech.ctb.pku.edu.cn/CFT073/.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Reannotation การแยกลำดับรหัส 608 จากประกอบ RefSeq ในขณะเดียวกัน จำนวน 299 รหัสลำดับใหม่เพิ่ม ประมาณหนึ่งในสามของพวกเขาที่พบในภูมิภาคการเกาะ (GI) ในขณะที่มากกว่าหนึ่งในห้าของพวกเขาอยู่ใน virulence เกาะ pathogenicity อยู่ภูมิภาค (PAIs) ที่เกี่ยวข้อง นอกจากนี้ มีทั้งหมด 341 ยีนได้ย้ายกับเว็บไซต์ของพวกเขาเริ่มต้นไทหมิง (มอก.), ซึ่งมีคุณภาพสูงของยีนเริ่มต้นอธิบาย คำอธิบายประกอบใน RefSeq 94 pseudogenes ได้อย่างทั่วถึงตรวจสอบ และปรับปรุง จำนวนยีนเบ็ดเตล็ด (sRNAs) มีการปรับปรุงจาก 6 ใน RefSeq การ 46 ในการ reannotation วิเคราะห์ตามมาจากการปรับปรุงในการ reannotation ถูกดำเนิน โดยทั่วไปและกรณีศึกษาบนปัจจัย virulence ใหม่หรือเกี่ยวข้อง virulence ยีนใหม่ที่สำคัญระหว่างทางเดินปัสสาวะติดเชื้อ (รถตรงมายัง) รวมถึงการบุกรุก ล่าอาณานิคม ควบคุมโภชนาการ uptaking และประชากรหนาแน่น นอกจากนี้ RNAs เบ็ดเตล็ดที่รวบรวมไว้ใน reannotation ที่เชื่อว่าจะนำไปสู่ virulence ของสายพันธุ์ CFT073 Reannotation รวมข้อมูลนิวคลีโอไทด์ คำอธิบาย RefSeq เดิม และผล reannotated ทั้งหมดได้อย่างอิสระผ่าน http://mech.ctb.pku.edu.cn/CFT073/

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

reannotation ยกเว้น 608 ลำดับการถอดรหัสจากคำอธิบายประกอบ RefSeq ในขณะเดียวกันทั้งหมด 299 ลำดับการเข้ารหัสที่ถูกเพิ่มเข้ามาใหม่ประมาณหนึ่งในสามของพวกเขาจะพบในเกาะจีโนม (GI) ภูมิภาคในขณะที่มากกว่าหนึ่งในห้าของพวกเขาจะอยู่ในความรุนแรงที่เกี่ยวข้องกับการเกิดโรคเกาะภูมิภาค (Pais) นอกจากนี้ยังมีทั้งหมด 341 ยีนถูกย้ายกับเว็บไซต์ของพวกเขาเริ่มต้นการแปล (มอก) ซึ่งส่งผลให้มีคุณภาพสูงของยีนเริ่มต้นคำอธิบายประกอบ นอกจากนี้ 94 pseudogenes ข้อเขียนใน RefSeq ถูกตรวจสอบอย่างละเอียดและมีการปรับปรุง จำนวนของยีนเบ็ดเตล็ด (sRNAs) ได้รับการปรับปรุงจาก 6 ใน RefSeq ถึง 46 ใน reannotation ขึ้นอยู่กับการปรับตัวใน reannotation การวิเคราะห์ที่ตามมาได้ดำเนินการโดยการศึกษาทั้งทั่วไปและกรณีกับปัจจัยใหม่รุนแรงหรือยีนความรุนแรงที่เกี่ยวข้องใหม่ที่มีความสำคัญในช่วงการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ (อุทิศ) กระบวนการรวมทั้งการบุกรุกรกราก uptaking โภชนาการและประชากร การควบคุมความหนาแน่น นอกจากนี้ RNAs เบ็ดเตล็ดเก็บใน reannotation เชื่อว่าจะนำไปสู่​​ความรุนแรงของความเครียด CFT073 reannotation รวมทั้งข้อมูลเบื่อหน่ายเช่นหมายเหตุ RefSeq เดิมและผล reannotated ทั้งหมดสามารถใช้ได้อย่างอิสระผ่าน http://mech.ctb.pku.edu.cn/CFT073/

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ reannotation แยกออกพวกรหัสลำดับจาก refseq หมายเหตุ . โดยรวมแล้วนะครับ ลำดับ เพิ่มใหม่ ประมาณหนึ่งในสามของพวกเขาจะพบในเกาะจีโนม ( กี ) ภูมิภาคในขณะที่มากกว่าหนึ่งในห้าของพวกเขาอยู่ในความรุนแรงที่เกี่ยวข้องกับภูมิภาคเขตเกาะ ( ปา ) นอกจากนี้มีทั้งหมด 341 ยีนถูกกับเว็บไซต์เริ่มต้นการแปลของพวกเขา ( tiss ) ซึ่งส่งผลให้คุณภาพของบันทึกย่อเริ่มต้นของยีน นอกจากนี้ , 94 pseudogenes บันทึกย่อใน refseq ถูกตรวจสอบอย่างละเอียด และปรับปรุง จำนวนของยีนเบ็ดเตล็ด ( srnas ) ได้รับการปรับปรุงจาก 6 ใน refseq 46 ใน reannotation . ขึ้นอยู่กับการปรับตัวใน reannotation การวิเคราะห์ที่ตามมา มีวัตถุประสงค์โดยทั่วไปและกรณีศึกษาเกี่ยวกับโรคหรือโรคใหม่ ปัจจัยใหม่ที่ยีนที่สำคัญในระหว่างการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ ( UTIs ) กระบวนการ รวมทั้งการบุกรุก , การล่าอาณานิคม uptaking โภชนาการและการควบคุมประชากรหนาแน่น นอกจากนี้ RNAs เบ็ดเตล็ดเก็บใน reannotation เชื่อว่าจะส่งผลให้ความรุนแรงของ cft073 สายพันธุ์ การ reannotation รวมทั้งข้อมูลลำดับเบส , หมายเหตุ refseq ต้นฉบับ และ reannotated ผลสามารถใช้ได้อย่างอิสระผ่านทาง http : / / mech . ctb . PKU . edu cn / cft073 /