The vast majority and most abundant

The vast majority and most abundantly conserved miRNAs were present in both libraries, and the number of miRNAs detectable only in one of the two libraries was low (Table S2). 1605 miRNAs belonging to 62 families were detected in both libraries. 1083 miRNAs belonging to 56 families were detected only in the library from P. indica-colonized roots. 101 miRNAs belonging to 31 families were detected only in the library from control roots. The miRNAs specifically detected in the library from P. indicacolonized roots were mir158a (t0035494; 41 reads), mir166l (t0039545; 36 reads) and mir528 (t0043631; 33 reads). The read number of those miRNAs specifically expressed in P. indicacolonized roots suggests that their accumulation is low (Table S2).
Thus, miRNAs specifically expressed in the library of P. indicacolonized roots are difficult to detect and may not have significant impact on conserved miRNAs analysis. These results are similar to those reported from the plant pathogenic fungus Sclerotinia sclerotiorum [54], in which the number of low expressed conserved and specific miRNAs was also low. Furthermore, the number of conserved miRNAs in the control library was much lower than that in the library derived from P. indica–colonized roots. They were miRNA 397 (CK0328724; 6 reads), miRNA 171 (CK0347435; 6 reads) and miRNA 169 (CK0450655; 5 reads). On the other hand, the number of reads of conserved miRNA families commonly occurring in both libraries showed significant differences between the two libraries. For example, the most abundant family mir528 generated 21287.27 TPM (times per million) in the P. indica-colonized library and only 3587.79 TPM in the control library. The top 20 miRNA families, including miR156 and miR528, were all significantly up-regulated in the P. indicacolonized library (Table 2). In contrast, a few miRNA families such as miR169, miR396, miR319, mir160, and mir5648 were down-regulated in the P. indica-colonized library, when compared to the control library (Table 2).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใหญ่และ miRNAs นำมากที่สุดอยู่ในไลบรารีทั้งสอง และจำนวนของ miRNAs ที่ตรวจพบได้เฉพาะในไลบรารีสองอย่างใดอย่างหนึ่งต่ำ (ตาราง S2) ตรวจพบ 1605 miRNAs อยู่ 62 ครอบครัวในไลบรารีทั้งสอง 1083 miRNAs ที่อยู่ 56 ครอบครัวพบเฉพาะในไลบรารีจากราก P. indica colonized 101 miRNAs เป็นของครอบครัว 31 พบเฉพาะในไลบรารีจากรากควบคุม MiRNAs ตรวจพบเฉพาะในไลบรารีจากราก P. indicacolonized มี mir158a (t0035494 อ่าน 41), mir166l (t0039545 อ่าน 36) และ mir528 (t0043631; 33 อ่าน) MiRNAs เหล่านั้นโดยเฉพาะแสดงราก P. indicacolonized จำนวนอ่านแนะนำของสะสมต่ำ (ตาราง S2)ดังนั้น แสดงเฉพาะในไลบรารีของราก P. indicacolonized miRNAs ยากต่อการตรวจสอบ และอาจไม่มีผลการวิเคราะห์นำ miRNAs ผลลัพธ์เหล่านี้จะคล้ายกับที่รายงานจากพืชเชื้อราก่อโรค Sclerotinia sclerotiorum [54], ซึ่งจำนวนแสดงนำ และเฉพาะ miRNAs ต่ำก็ต่ำ นอกจากนี้ จำนวน miRNAs นำในไลบรารีตัวควบคุมถูกมากต่ำกว่าที่ในไลบรารีจากราก P. indica – colonized พวกเขาก็เที่ยว 397 (CK0328724 อ่าน 6), เที่ยว 171 (CK0347435; 6 อ่าน) และเที่ยว 169 (CK0450655 อ่าน 5) บนมืออื่น ๆ จำนวนอ่านครอบครัวเที่ยวเมืองเก่าที่มักเกิดขึ้นในไลบรารีทั้งสองแสดงให้เห็นว่าระบบปฏิบัติการไลบรารีสอง เช่น mir528 ครอบครัวมากที่สุดสร้าง 21287.27 TPM (ครั้งต่อล้าน) ในไลบรารีการ indica colonized P. และ TPM เท่านั้น 3587.79 ในไลบรารีตัวควบคุม ด้านบน 20 เที่ยวครอบครัว miR156 และ miR528 ถูกกำหนดขึ้นอย่างมีนัยสำคัญทั้งหมดในไลบรารี P. indicacolonized (ตาราง 2) คมชัด กี่เที่ยวครอบครัวเช่น miR169, miR396, miR319, mir160 และ mir5648 ได้ลงกำกับใน P. indica colonized ไลบรารี เมื่อเทียบกับไลบรารีตัวควบคุม (ตารางที่ 2)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ส่วนใหญ่และส่วนใหญ่พรืด miRNAs อนุรักษ์อยู่ในปัจจุบันทั้งในห้องสมุดและจำนวนของ miRNAs ตรวจพบเพียงหนึ่งในสองห้องสมุดต่ำ (ตารางที่ S2) 1605 miRNAs ที่อยู่ใน 62 ครอบครัวที่ถูกตรวจพบในห้องสมุดทั้ง 1083 miRNAs ที่อยู่ 56 ครอบครัวได้รับการตรวจพบในห้องสมุดจากพีราก indica-อาณานิคม 101 miRNAs ที่อยู่ 31 ครอบครัวได้รับการตรวจพบในห้องสมุดจากรากควบคุม miRNAs ที่ตรวจพบเฉพาะในห้องสมุดจากพี indicacolonized ราก mir158a (t0035494 41 อ่าน) mir166l (t0039545 36 อ่าน) และ mir528 (t0043631 33 อ่าน) จำนวนการอ่านของ miRNAs ที่แสดงเฉพาะในพี indicacolonized รากแสดงให้เห็นว่าการสะสมของพวกเขาอยู่ในระดับต่ำ (ตารางที่ S2).
ดังนั้น miRNAs แสดงเฉพาะในห้องสมุดของพี indicacolonized รากเป็นเรื่องยากที่จะตรวจสอบและอาจจะไม่ได้มีผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญในการอนุรักษ์ miRNAs การวิเคราะห์ ผลลัพธ์เหล่านี้มีความคล้ายคลึงกับรายงานจาก sclerotiorum พืชที่ทำให้เกิดโรคเชื้อรา Sclerotinia [54] ซึ่งในจำนวน miRNAs อนุรักษ์และเฉพาะเจาะจงแสดงต่ำก็ยังต่ำ นอกจากนี้จำนวน miRNAs อนุรักษ์ในห้องสมุดควบคุมได้มากต่ำกว่าในห้องสมุดที่ได้มาจากรากพี indica อาณานิคม พวกเขา miRNA 397 (CK0328724 6 อ่าน) miRNA 171 (CK0347435 6 อ่าน) และ miRNA 169 (CK0450655 5 อ่าน) บนมืออื่น ๆ จำนวนอ่านของครอบครัว miRNA อนุรักษ์ทั่วไปที่เกิดขึ้นในห้องสมุดทั้งแสดงให้เห็นความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญระหว่างสองห้องสมุด ยกตัวอย่างเช่น mir528 ครอบครัวที่มีมากที่สุดที่สร้าง 21,287.27 TPM (ครั้งต่อล้านบาท) ในห้องสมุด indica อาณานิคมพีและมีเพียง 3,587.79 TPM ในห้องสมุดควบคุม Top 20 ครอบครัว miRNA รวมทั้ง miR156 และ miR528, ทุกอย่างมีนัยสำคัญขึ้นควบคุมในพี indicacolonized ห้องสมุด (ตารางที่ 2) ในทางตรงกันข้ามไม่กี่ครอบครัว miRNA เช่น miR169, miR396, miR319, mir160 และ mir5648 ถูกควบคุมลงในห้องสมุด indica อาณานิคมพีเมื่อเทียบกับห้องสมุดควบคุม (ตารางที่ 2)