The presence of HM-associated genes

The presence of HM-associated genes in the AGB-1 isolate was
examined via PCR amplification of selected HM marker genes, and
each expected PCR band was sequenced to confirm detection of the
target gene. AGB-1 carried the ArsB, ACR3(1), aoxB, and bmtA
genes, whereas PCR failed to amplify ArsC and cadR genes. Arsenate
reductase (ArsC gene) reduces arsenate As(V) to arsenite As(III),
which is extruded from cells by the membrane efflux pump ArsB/
ACR3(1) (Mukhopadhyay et al., 2002). The aox gene encodes periplasmic
As(III) oxidase that transforms As(III) to As(V) (Silver and
Phung, 2005). Sequence comparison showed 91, 100, and 100%
similarly to ArsB, ACR3(1) and aoxB genes of Pseudomonas putida,
Pseudomonas fluorescens, and Pseudomonas sp., respectively. Metallothioneins
are ubiquitous metal-binding, cysteine-rich small
proteins known to bind essential HMs (such as Zn, Cu and Ni) and
toxic HMs (such as Cd, Hg and Pb), and provide protection against
metal stress (Sauge-Merle et al., 2012). The amplified MT gene
sequence of AGB-1 exhibited 99% similarity to the MT gene
sequence of Pseudomonas sp. Thus the isolate contains HM marker
genes that may confer HM resistance. Detection of these genes also
provides presumptive evidence of their roles in metalcontaminated
environments. HM-resistance genes ArsB, ACR3(1),
aoxB and bmtA have been identified in several bacterial spp.
(Mukhopadhyay et al., 2002; Sauge-Merle et al., 2012). The cadR
(cobalt, zinc and cadmium resistance) and ArsC (As reductase)
genes could not be amplified from DNA of the AGB-1 isolate, indicating
variations in the gene that decreased the homology of our
primer sets, thermal cycling conditions, and in the composition of
buffers or agents in a PCR.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ของยีนที่เกี่ยวข้อง HM ใน 1 ข้อตกลงทั้งหมดแยกเป็นตรวจสอบผ่านขยาย PCR ของเลือก HM เครื่องหมายยีน และคาดว่า แต่ละวง PCR ถูกเรียงลำดับเพื่อยืนยันตรวจสอบการยีนเป้าหมาย ทำข้อตกลงทั้งหมด-1 ArsB, ACR3(1), aoxB และ bmtAยีน ในขณะที่ไม่สามารถขยายยีน ArsC และ cadR PCR Arsenatereductase (ArsC ยีน) ลด arsenate As(V) การ arsenite As(III)ซึ่งเป็น extruded จากเซลล์ โดยเยื่อ efflux ปั๊ม ArsB /ACR3(1) (Mukhopadhyay และ al., 2002) ยีน aox จแมป periplasmicAs(III) oxidase ที่ As(III) กับ As(V) (เงิน และผึ้ง 2005) เปรียบเทียบลำดับพบ 91, 100 และ 100%คล้ายกับยีน ArsB, ACR3(1) และ aoxB ของ Pseudomonas putidaPseudomonas fluorescens และ Pseudomonas sp. ตามลำดับ Metallothioneinsเป็นโลหะผูก cysteine ริชเล็กสมบูรณ์โปรตีนที่เรียกว่าผูกเฮชเอ็มเอ็สจำเป็น (เช่น Zn, Cu และ Ni) และเฮชเอ็มเอ็สพิษ (เช่นซีดี Hg และ Pb), และป้องกันโลหะความเครียด (ทำ Sauge et al., 2012) ยีน MT เอาต์99% คล้ายกับยีน MT จัดแสดงลำดับของ AGB-1ลำดับของ Pseudomonas sp จึง แยกประกอบด้วยเครื่องหมาย HMยีนที่อาจประสาทต้านทาน HM ตรวจยีนเหล่านี้ยังแสดงหลักฐาน presumptive บทบาทของพวกเขาใน metalcontaminatedสภาพแวดล้อม ยีนต้านทาน HM ArsB, ACR3(1)aoxB และ bmtA ได้รับการระบุในหลายโอแบคทีเรีย(Mukhopadhyay et al., 2002 Sauge-Merle et al., 2012) CadR(โคบอลต์ สังกะสี และแคดเมียมต้านทาน) และ ArsC (เป็น reductase)ไม่ขยายยีนจากดีเอ็นเอของ 1 ข้อตกลงทั้งหมดแยก แสดงเปลี่ยนแปลงในยีนที่ลดลง homology ของของเราตั้งพื้น ความร้อนสภาพขี่จักรยาน และองค์ประกอบของบัฟเฟอร์หรือตัวแทนในการ PCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การปรากฏตัวของยีน HM-ร่วมใน AGB-1 แยกที่ได้รับการ
ตรวจสอบผ่านทางขยาย PCR ที่เลือกยีนเครื่องหมาย HM และ
คาดว่าแต่ละวง PCR ถูกติดใจที่จะยืนยันการตรวจสอบ
ยีนเป้าหมาย AGB-1 ดำเนิน Arsb, ACR3 (1), aoxB และขสมก
ยีน PCR ในขณะที่ล้มเหลวในการขยาย ARSC และยีน CADR สารหนู
reductase (ยีน ARSC) ลดสารหนูในฐานะที่เป็น (V) เพื่อ arsenite ฐานะ (III),
ซึ่งเป็น extruded จากเซลล์เมมเบรนโดยไหลปั๊ม Arsb /
ACR3 (1) (Mukhopadhyay et al., 2002) ยีน AOX encodes periplasmic
ฐานะ (III) oxidase ที่เปลี่ยนแปลงในขณะที่ (III) เป็น (V) (สีเงินและ
ผึ้ง, 2005) การเปรียบเทียบลำดับแสดงให้เห็นว่า 91, 100, และ 100%
เช่นเดียวกับ Arsb, ACR3 (1) และยีน aoxB ของ Pseudomonas putida,
Pseudomonas fluorescens และ Pseudomonas sp. ตามลำดับ Metallothioneins
ที่แพร่หลายโลหะผูกพัน cysteine ​​เล็ก ๆ ที่อุดมไปด้วย
โปรตีนที่รู้จักกันที่จะผูกสืบที่สำคัญ (เช่นสังกะสีทองแดงและ Ni) และ
เป็นพิษสืบ (เช่นแคดเมียมปรอทและตะกั่ว) และให้ความคุ้มครองกับ
ความเครียดโลหะ (Sauge-เมิร์ลและ al., 2012) ขยาย MT ยีน
ลำดับของ AGB-1 แสดงความคล้ายคลึงกัน 99% ถึงยีน MT
ลำดับของ SP Pseudomonas ดังนั้นแยกมีเครื่องหมาย HM
ยีนที่อาจหารือต้านทาน HM การตรวจหายีนเหล่านี้ยัง
มีหลักฐานสันนิษฐานบทบาทของพวกเขาใน metalcontaminated
สภาพแวดล้อม ยีน HM-ต้านทาน Arsb, ACR3 (1),
aoxB และขสมกได้รับการระบุในแบคทีเรียหลาย spp.
(Mukhopadhyay et al, 2002;.. Sauge-เมิร์ลและคณะ, 2012) CADR
(โคบอลต์สังกะสีและแคดเมียมต้านทาน) และ ARSC (ณ reductase)
ยีนที่ไม่สามารถขยายจากดีเอ็นเอของ AGB-1 แยกแสดงให้เห็น
การเปลี่ยนแปลงในยีนที่ลดลงที่คล้ายคลึงกันของเรา
ชุดไพรเงื่อนไขการขี่จักรยานความร้อนและใน องค์ประกอบของ
บัฟเฟอร์หรือตัวแทนใน PCR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การปรากฏตัวของพระบาทสมเด็จพระเจ้าอยู่หัวที่เกี่ยวข้องยีนใน agb-1 แยกตรวจทาง PCR คือ
แบบคัดสรรหาเครื่องหมายยีนและดีเอ็นเอแต่ละคาดว่าวงนี้

เพื่อยืนยันการตรวจหายีนเป้าหมาย agb-1 แบก arsb acr3 ( , 1 ) , aoxb และขสมก.
ยีนส่วน PCR ล้มเหลวในการขยายและ arsc cadr ยีน สารหนู
รีดักเทส ( ยีน arsc ) ลดอาร์เซเนตเป็น ( V ) อาซีไนท์ ( III )
ซึ่งถูกอัดจากเซลล์โดยการปั๊มแผ่น arsb /
acr3 ( 1 ) ( mukhopadhyay et al . , 2002 ) ยีนชนิดเข้ารหัส periplasmic
( III ) เอนไซม์ที่แปลงร่างเป็น ( III ) ( V ) ( เงินและ
ฟุง , 2005 ) การเปรียบเทียบลำดับพบ 91 , 100 และ 100 %
3 arsb acr3 ( , 1 ) และ aoxb ยีนของ Pseudomonas enrichment
, Pseudomonas fluorescens และ Pseudomonas sp . ตามลำดับ metallothioneins
มีอยู่ทั่วไปโลหะผูก กรดอะมิโนโปรตีนรวยเล็ก
รู้จักผูกจำเป็น HMS ( เช่นสังกะสี , ทองแดงและนิกเกิล ) และ
HMS เป็นพิษ ( เช่น CD , ปรอทและตะกั่ว ) และป้องกันความเครียด
โลหะ ( ๆ sauge เมอล et al . , 2012 ) การขยายยีนและลำดับของ )
agb-1 99% เหมือน MT ยีน
ลำดับดังนั้น Pseudomonas sp . จึงแยกมีเครื่องหมาย
ฮึ่มยีนที่อาจปรึกษาฮือต่อต้าน การตรวจหายีนเหล่านี้ยัง
มีหลักฐานความเป็นไปได้ของบทบาทใน metalcontaminated
สภาพแวดล้อม หืม ยีนต้านทาน arsb acr3 ( , 1 ) ,
aoxb และ ขสมก. ได้รับการระบุ
spp . แบคทีเรีย ( หลาย mukhopadhyay et al . , 2002 ; ๆ sauge เมอล et al . , 2012 ) การ cadr
( โคบอลต์ สังกะสีและแคดเมียมต้านทาน ) และ arsc ( เทส )
ยีนอาจจะขยายจากดีเอ็นเอของ agb-1 แยกระบุ
รูปแบบยีนที่ทำให้เป็นชุด
รองพื้นของเรา เงื่อนไขการขี่จักรยานการระบายความร้อน และในส่วนประกอบของ
บัฟเฟอร์หรือตัวแทนใน PCR