2. Results
2.1. Leaf proteins respond to Spd under normal condition and salt
stress
To explore the effects of exogenous Spd on proteomic changes
under normal condition and salt stress in cucumber leaves, we
analyzed the protein expression patterns using 2-DE. By using the
modified TCA/acetone extraction protocol and CBB staining, the
average number of detectable spots reached about 500 on each 2-
DE gel (Fig. 1). Sixty three differentially expressed protein spots
were successfully identified by MALDI-TOF/TOF MS. The MS and
MS/MS data searched against the cucumber genomics database
(cucumber.genomics.org.cn) successfully, only spot 47 was
searched successfully in NCBInr database. Identified spots were
presented in (Table 1), which includes accession numbers, protein
names, Mass, score and up/down. For most of the identified proteins,
there were functional annotations in the databases, whereas
one protein (spot 55) has no functional annotations.
Among the 63 differentially expressed spots, 28 up-regulated
spots and 16 down-regulated spots in response to salt stress, 5
up-regulated spots and 10 down-regulated spots in response to
exogenous Spd under normal condition, while 6 up-regulated spots
and 13 down-regulated spots in response to Spd under salt stress.
Four spots (19, 40, 48 and 49) were influenced by both salt stress
and Spd under normal condition. Seven spots (4, 6, 13, 37, 40, 55
and 57) changed by salt stress were also detected in Spd under salt
stress. Five spots (40, 44, 53, 58 and 62) showed the same
expression pattern in response to Spd under normal condition and
salt stress (Table 1).
2.2. Functional classification and clustering analysis of differentially
expressed proteins
The proteins identified in the present study were functionally
grouped into four categories according to their cellular function: (1)
energy and metabolic pathways; (2) protein metabolic; (3) stress
defense proteins; (4) others.
For salt stress induced proteins (Fig. 2), the most highly enriched
categories were energy and metabolism proteins (68%) including
Calvin cycle and metabolism, and the secondly enriched categories
were protein metabolic (14%). As for Spd regulated proteins under
Fig. 1. A 2-DE protein profiles in cucumber leaves in normal condition and salt stress with and without exogenous Spd; proteins from control (A), control with 1 mM Spd (B), 75 mM
2. ผลลัพธ์2.1. ลีฟโปรตีนตอบ Spd ภายใต้เงื่อนไขปกติและเกลือความเครียดการสำรวจผลกระทบของ Spd บ่อย proteomic การเปลี่ยนแปลงภายใต้เงื่อนไขปกติและความเครียดเกลือในแตงกวาใบ เราวิเคราะห์รูปแบบนิพจน์โปรตีนใช้เดอ 2 โดยTCA/อะ ซีโตนแยกโพรโทคอลและ CBB ย้อมสี การปรับเปลี่ยนการจำนวนจุดที่สามารถตรวจสอบได้โดยเฉลี่ยถึงประมาณ 500 2 ละ-เจเด (Fig. 1) สามหก differentially แสดงจุดโปรตีนได้สำเร็จระบุ MALDI-TOF/TOF MS MS และค้นหาจากฐานข้อมูลของ genomics แตงกวาข้อมูล MS/MS(ส่วน cucumber.genomics.org.cn) สำเร็จ เฉพาะจุด 47 ได้ค้นหาเรียบร้อยแล้วในฐานข้อมูล NCBInr จุดที่ระบุได้แสดงใน (ตารางที่ 1), ซึ่งรวมถึงหมายเลขทะเบียน โปรตีนชื่อ มวล คะแนน และขึ้น/ลง สำหรับส่วนมากของโปรตีนที่ระบุมีคำอธิบายการทำงานในฐานข้อมูล ในขณะที่โปรตีนหนึ่ง (จุด 55) มีคำอธิบายประกอบไม่ทำงานระหว่างจุดแสดง differentially 63, 28 ที่กำหนดขึ้นจุดและจุดควบคุมลง 16 ตอบสนองต่อความเครียด 5 ใส่เกลือจุดที่กำหนดขึ้นและจุดควบคุมลง 10 ตอบSpd บ่อยภายใต้เงื่อนไขปกติ ในขณะที่จุดที่กำหนดขึ้น 6และจุดควบคุมลง 13 ตอบ Spd ภายใต้ความเครียดเกลือสี่จุด (19, 40, 48 และ 49) ได้รับอิทธิพลจากความเครียดทั้งเกลือและ Spd ภายใต้เงื่อนไขปกติ เจ็ดจุด (4, 6, 13, 37, 40, 55และ 57) เปลี่ยนแปลง โดยความเครียดเกลือแนะนำ Spd ที่ตรวจพบในภายใต้เกลือความเครียด ห้าจุด (40, 44, 53, 58 และ 62) พบว่ารูปแบบนิพจน์ใน Spd ภายใต้เงื่อนไขปกติ และเกลือความเครียด (ตาราง 1)2.2 การประเภทที่ทำงานและคลัสเตอร์ของ differentiallyแสดงโปรตีนมีโปรตีนที่ระบุในการศึกษาอยู่บริเวณแบ่งออกเป็น 4 ประเภทตามการทำงานของโทรศัพท์มือถือ: (1)พลังงานและเผาผลาญมนต์ (2) เผาผลาญโปรตีน (3) ความเครียดป้องกันโปรตีน (4) อื่น ๆสำหรับความเครียดเกลือเกิดจากโปรตีน (Fig. 2), สูงสุดที่อุดมไปหมวดหมู่ได้พลังงานและเผาผลาญโปรตีน (68%) รวมทั้งวงจรคาลวิน และเผาผลาญ และประเภทอุดมไปประการที่สองถูกเผาผลาญ (14%) โปรตีน สำหรับโปรตีน Spd ที่ควบคุมภายใต้Fig. 1 โปรตีน 2 เดโพรไฟล์ในแตงกวาใบในสภาพปกติและความเครียดเกลือมี และไม่ มี Spd บ่อย โปรตีนจากควบคุม (A) ควบคุม ด้วย 1 มม. Spd (B), 75 มม.
การแปล กรุณารอสักครู่..

2. ผล
2.1 โปรตีนใบตอบสนองต่อการ SPD
ภายใต้สภาพปกติและเกลือความเครียดเพื่อสำรวจผลกระทบของ
Spd
ภายนอกเกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงโปรตีนภายใต้สภาพปกติและความเครียดเกลือใบแตงกวาเราวิเคราะห์รูปแบบการแสดงออกของโปรตีนโดยใช้
2 DE โดยใช้การปรับเปลี่ยน TCA / โปรโตคอลสกัดอะซีโตนและการย้อมสี CBB ที่ค่าเฉลี่ยของจำนวนจุดที่ตรวจพบถึงประมาณ500 ในแต่ละ 2- เจล DE (รูปที่ 1). หกสิบสามแสดงออกแตกต่างกันจุดโปรตีนที่ถูกระบุว่าประสบความสำเร็จโดย MALDI-TOF / TOF MS นางสาวและMS / MS สืบค้นข้อมูลกับฐานข้อมูลจีโนมิกแตงกวา(cucumber.genomics.org.cn) ประสบความสำเร็จเพียง 47 จุดได้รับการค้นหาประสบความสำเร็จในฐานข้อมูลNCBInr ระบุจุดที่ถูกนำเสนอใน (ตารางที่ 1) ซึ่งรวมถึงหมายเลขภาคยานุวัติโปรตีนชื่อมวลคะแนนและขึ้น/ ลง สำหรับส่วนมากของโปรตีนระบุที่มีคำอธิบายประกอบการทำงานในฐานข้อมูลในขณะที่หนึ่งในโปรตีน(จุดที่ 55) ไม่มีคำอธิบายประกอบการทำงาน. หมู่ที่ 63 จุดแสดงออกแตกต่างกัน 28 ขึ้นควบคุมจุดและ16 จุดควบคุมลงในการตอบสนองต่อความเครียดเกลือ 5 จุดขึ้นควบคุมและ 10 จุดควบคุมลงในการตอบสนองจากภายนอกSpd ภายใต้สภาพปกติในขณะที่ 6 จุดขึ้นควบคุมและ13 ควบคุมลงจุดในการตอบสนอง Spd ภายใต้ความเครียดเกลือ. สี่จุด (19, 40, 48 และ 49) ได้รับอิทธิพลจากทั้งความเครียดเกลือและSpd ภายใต้สภาพปกติ เซเว่นสปอต (4, 6, 13, 37, 40, 55 และ 57) การเปลี่ยนแปลงจากความเครียดเกลือยังถูกตรวจพบในเกลือ Spd ภายใต้ความเครียด ห้าจุด (40, 44, 53, 58 และ 62) พบเดียวกันรูปแบบการแสดงออกในการตอบสนองSpd ภายใต้เงื่อนไขปกติและความเครียดเกลือ(ตารางที่ 1). 2.2 ฟังก์ชั่นการจัดหมวดหมู่และการวิเคราะห์การจัดกลุ่มของแตกต่างกันโปรตีนโปรตีนที่ระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้ได้รับการทำงานแบ่งออกเป็นสี่ประเภทตามฟังก์ชั่นมือถือของตน(1) พลังงานและการเผาผลาญเซลล์; (2) การเผาผลาญโปรตีน (3) ความเครียดโปรตีนป้องกันประเทศ (4) คนอื่น ๆ . สำหรับความเครียดเกลือโปรตีนเหนี่ยวนำ (รูปที่. 2) ที่อุดมมากที่สุดประเภทมีการใช้พลังงานและการเผาผลาญโปรตีน(68%) รวมทั้งวงจรและการเผาผลาญแคลวินและประเภทที่อุดมไปประการที่สองมีการเผาผลาญโปรตีน(14%) สำหรับ Spd ควบคุมโปรตีนภายใต้รูป 1. 2 DE โปรไฟล์โปรตีนในแตงกวาใบอยู่ในสภาพปกติและความเครียดเกลือที่มีและไม่มีภายนอก Spd; โปรตีนจากการควบคุม (A), การควบคุมที่มี 1 มิลลิ Spd (B), 75 มิลลิ
การแปล กรุณารอสักครู่..

2 . ผลลัพธ์
2.1 . โปรตีนในใบตอบกลับ SPD ภายใต้สภาวะปกติและความเครียดเกลือ
เพื่อศึกษาผลกระทบของการเปลี่ยนแปลงภายนอก SPD ในโปรตีน
ภายใต้เงื่อนไขปกติและความเครียด เกลือ ใบแตงกวาเรา
วิเคราะห์โปรตีนการแสดงออกรูปแบบการใช้ 2-de. โดยใช้
แก้ไข TCA / อะซิโตนการสกัดโปรโตคอลและ cbb การย้อมสี
อัตราเฉลี่ยของการตรวจพบจุดถึงประมาณ 500 ต่อ 2 -
เดเจล ( รูปที่ 1 ) หกสิบสามแสดงออกแตกต่างกันโปรตีนจุด
ถูกระบุ maldi-tof เรียบร้อยแล้ว / tof คุณ MS MS / MS และ
ข้อมูลในฐานข้อมูลที่ค้นหากับแตงกวา
( แตงกวา จีโนมิกส์ . org cn ) เรียบร้อยแล้ว เพียงแต่จุดที่ 47 ถูก
ค้นในฐานข้อมูล ncbinr เรียบร้อยแล้ว . ระบุจุดที่ถูก
( ตารางที่ 1 ) ที่นำเสนอในซึ่งรวมถึงตัวเลขเพิ่มขึ้น โปรตีน
ชื่อ สื่อมวลชน และคะแนน ขึ้น / ลง สำหรับส่วนใหญ่ของการระบุโปรตีน
มีหน้าที่บันทึกย่อในฐานข้อมูลโปรตีน ( จุดหนึ่ง )
55 ) ไม่มีบันทึกย่อหน้าที่ .
ระหว่าง 63 แสดงออกแตกต่างกันจุด 28 คา
จุดและ 16 ลงควบคุมจุดในการตอบสนองต่อความเครียดเกลือ 5
,สามารถลงจุด 10 จุดในการตอบสนองต่อการควบคุมจากภายนอก SPD
ภายใต้เงื่อนไขปกติ ในขณะที่ 6 คาปอ
13 ลงควบคุมจุดในการตอบสนองต่อ SPD ภายใต้ความเครียดเกลือ .
4 จุด ( 19 , 40 , 48 และ 49 ) ได้รับอิทธิพลจากทั้งเกลือและความเครียด
SPD ภายใต้สภาวะปกติ เจ็ดจุด ( 4 , 6 , 13 , 37 , 40 , 55 และ 57
) เปลี่ยนจากความเครียดเกลือ ยังตรวจพบใน SPD ใต้เกลือ
ความเครียด ห้าจุด ( 40 , 44 และ 53 , 58 , 62 ) พบเหมือนกัน
รูปแบบการแสดงออกในการตอบสนองต่อ SPD ภายใต้เงื่อนไขปกติและเค็ม ( ตารางที่ 1 )
.
2.2 . แบ่งตามหน้าที่และแบ่งกลุ่มข้อมูลการวิเคราะห์ต่างกัน
แสดงโปรตีนโปรตีนที่ระบุไว้ในการศึกษาครั้งนี้แบ่งออกเป็น 4 ประเภทคือ functionally
ตามฟังก์ชันมือถือของตน ( 1 )
พลังงาน และเส้นทางการเผาผลาญ ( 2 ) โปรตีนเมตาบอลิซึม ; ( 3 ) ความเครียด
โปรตีนป้องกัน ; ( 4 ) คนอื่น .
สำหรับความเครียดเกลือกระตุ้นโปรตีน ( รูปที่ 2 ) สูงที่สุดที่อุดมด้วยโปรตีน พลังงานและการเผาผลาญ
ได้แก่ ( 68% ) รวมทั้ง
วัฏจักรคัลวินและเมแทบอลิซึม และประการที่สอง อุดมหมวด
คือ การสลายโปรตีน ( 14% ) สำหรับ SPD ควบคุมโปรตีนภายใต้
รูปที่ 1เป็นแผ่นโปรตีนโปรไฟล์ในแตงกวา ใบ ในภาวะปกติ และเกลือ ความเครียดและไม่มีการควบคุมจากภายนอก SPD ; โปรตีน ( ) , ควบคุมด้วย 1 mM SPD ( B ) , 75 มม.
การแปล กรุณารอสักครู่..
