DNA extraction
All the samples were grounded and
homogenized with an electric mill (IKA m20
WERKE). DNA extraction was carried out from
100 mg of ground and homogenized foodstuff
based on the CTAB method (1, 15). This method
includes the following steps: first, 300 µL of
sterile deionized water was added to the sample
and mixed. To the mixture, 500 µL of CTAB
extraction buffer (20 g/L CTAB, 1.4 M NaCl,
0.1 M Tris-HCl, 20 mM Na2
EDTA) was added
and mixed. Then, 20 µL Proteinase K (20 mg/
mL) was added, mixed and incubated at 65°C
for 90 min. Then, 20 µL of RNase A (10 mg/
mL) was added, mixed, incubated at 65°C for
5-10 min and centrifuged for 10 min at 16000 g.
Afterwards, the supernatant was transferred to a
new tube containing 500 µL chloroform, mixed
for 30 sec and centrifuged for 10 min at 16000
g until phase separation occurred. Later, 500 µL
of the upper layer was transferred into a new
tube containing 500 µL chloroform, mixed and
centrifuged for 5 min at 16000 g. The upper layer
was transferred to a new tube and 2 volumes of
CTAB precipitation solution (5 g/L CTAB, 0.04
M NaCl) was added, mixed by pipetting and
incubated for 60 min at room temperature. Then,
it was centrifuged for 5 min at 16000 g and the
supernatant was discarded. The precipitate was
dissolved in 350 µL NaCl (1.2 M) and 350 µL of
chloroform was added; the mix was shaken for 30
sec. and then centrifuged for 10 min at 16000 g
until phase separation occurred. The upper layer
was transferred to a new tube and 0.6 volumes of
isopropanol was added, mixed and centrifuged
for 10 min at 16000 g. The supernatant was
discarded and 500 µL of 70% ethanol solution
was added, mixed and centrifuged for 10 min at
16000 g. Then, the supernatant was discarded
and the pellets were dried and re-dissolved in
100 µL sterile deionized water.
การสกัดดีเอ็นเอตัวอย่างทั้งหมดถูกกักบริเวณและโฮโมกับโรงงานผลิตไฟฟ้า ( Ika M20werke ) การสกัดดีเอ็นเอถูกหามออกมาจาก100 มิลลิกรัมของพื้นดินและบดอาหารตาม ctab วิธี ( 1 , 15 ) วิธีนี้รวมถึงขั้นตอนต่อไปนี้ : 1 , 300 µล.เป็นหมันคล้ายเนื้อเยื่อประสานน้ำเพิ่มตัวอย่างและการผสม การผสม , 500 µ ctab ล.สารสกัด ( / l ctab 1.4 M ขนาด 20 กรัม0.1 M HCl หรือ 20 มม. ๆEDTA ) คือเพิ่มและการผสม แล้ว 20 µ K ( 20 มิลลิกรัมต่อลิตรโปรตีนมล. ) เพิ่มผสมบ่มที่อุณหภูมิ 65 องศา C และสำหรับ 90 นาทีแล้ว µเลส 20 ลิตร ( 10 มิลลิกรัมต่อลิตรมิลลิลิตรเติม , ผสม , อุณหภูมิ 65 องศา C สำหรับ5-10 นาที ไฟฟ้าสำหรับ 10 นาทีที่ 16 , 000 กรัมหลังจากนั้น , นำถูกส่งไปใหม่หลอดบรรจุ 500 µลิตร ( ผสม30 วินาที และไฟฟ้าสำหรับ 10 นาทีที่ ,กรัมจนแยกเฟสที่เกิดขึ้น ต่อมา µ 500 ล.ของชั้นบนถูกย้ายเข้าใหม่หลอดบรรจุ 500 µลิตร ( ผสมและไฟฟ้าสำหรับ 5 นาทีที่ 16 , 000 กรัมชั้นบนถูกย้ายไปที่หลอดใหม่ 2 เล่มctab ตกตะกอนสารละลาย ( 5 กรัม / ลิตร ctab 0.04M NaCl ) เข้ามาผสมด้วย pipetting และบ่มนาน 60 นาที ที่อุณหภูมิห้อง จากนั้นมันเป็นระดับ 5 นาทีที่ 16 , 000 กรัมและน่านถูกทิ้ง ที่ คือละลายใน 350 µ L NaCl ( 1.2 เมตร ) และ 350 µล.คลอโรฟอร์มได้เพิ่มส่วนผสมที่ถูกเขย่า 30วินาที แล้วระดับ 10 นาทีที่ 16 ก.จนแยกเฟสที่เกิดขึ้น ชั้นบนถูกย้ายไปที่หลอดใหม่และ 0.6 เล่มไอโซโพรพานอล เข้ามาผสมไฟฟ้าสำหรับ 10 นาทีที่ 16 , 000 กรัมสูงคือการยกเลิกและ 500 µ L ของสารละลายเอทานอล 70%เพิ่มผสมไฟฟ้าสำหรับ 10 นาทีที่16 , 000 กรัม จากนั้นนำทิ้ง ,และเม็ดแห้งและละลายใน100 µผมเป็นหมันคล้ายเนื้อเยื่อประสานน้ำ
การแปล กรุณารอสักครู่..
