The 16S rDNA sequences of the RYD p

The 16S rDNA sequences of the RYD phytoplasmas and related phytoplasmas in the RYD 16S-group (RYD-J, RYD- Th, BGWL-Th, BGWL-KK, BraWL-KK and SCWL-Ud) were compared with sequences from phytoplasmas of other groups. The base positions were numbered as described previously (Namba et al., 1993a). Sequence analysis of the phytoplasmas of the RYD 16S-group indicated that there are several signature sequences unique to this group: 59-AACACTG-39 (positions 604–610) and 59-GCAA-39 (999–1002) are not found in any other phytoplasmas belonging to other 16S-groups. In the RYD 16S-group, 59-TATCAGACTA-39 (626–635) is also conserved, with just two exceptions: SCWL and BVK phytoplasmas have T instead of C (629). Additionally, 59-AAATCTTCGGA- TTTT-39 (61–75) is conserved, except in the RYD isolates; both RYD-J and RYD-Th have T instead of C at position 65. Interestingly, this sequence alteration clearly distinguishes the RYD phytoplasmas from other RYD 16S-group isolates. The RYD phytoplasmas also possessed other unique ‘signature’ nucleotide alterations not found in any other phytoplasmas, including RYD 16S-group isolates. For example, single bases of RYD phytoplasma 16S rDNA differed from the corresponding sequences in all other phytoplasmas at positions 149 (G to A), 181 (C to T), 263 (A/C to T), 1148 (G to A), 1409 (A to G) and 1447 (G to A). The presence of these RYD-specific signature sequences in the 16S rDNA provides evidence for the genetic divergence of this pathogen from other phytoplasmas.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับ rDNA 16S RYD phytoplasmas และ phytoplasmas ที่เกี่ยวข้องใน RYD 16S-กลุ่ม (เจ RYD, RYD - Th, BGWL Th, BGWL-เคเค เค เคทะเลาะกัน และ อุด SCWL) ได้เปรียบเทียบกับลำดับจาก phytoplasmas ของกลุ่มอื่น ๆ ตำแหน่งฐานมีหมายเลขตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ (นัมบะ et al., 1993a) การวิเคราะห์ของ phytoplasmas RYD 16S-กลุ่มระบุว่า มีหลายลายเซ็นลำดับเฉพาะกลุ่มนี้: 59-AACACTG-39 (ตำแหน่ง 604 – 610) และ 59-GCAA-39 (999 – 1002) ไม่มีอยู่ใน phytoplasmas อื่น ๆ ที่เป็นสมาชิกของกลุ่ม 16S อื่น ๆ ใน RYD 16S-กลุ่ม 59-TATCAGACTA-39 (626-635) จะยังอยู่ มีข้อยกเว้นเพียงสอง: phytoplasmas SCWL และ BVK มี T แทน C (629) นอกจากนี้ 59-AAATCTTCGGA-TTTT-39 (61-75) มีอยู่ ยกเว้นในการ RYD แยก RYD J และ RYD-Th มี T แทน C ที่ตำแหน่ง 65 เป็นเรื่องน่าสนใจ แก้ไขลำดับนี้ชัดเจนแตกต่าง RYD phytoplasmas จากแยกกลุ่ม 16S RYD อื่น ๆ RYD phytoplasmas ยังต้องเปลี่ยนแปลงนิวคลีโอไทด์เฉพาะ 'ลายเซ็น' อื่น ๆ ไม่พบใด ๆ อื่น ๆ phytoplasmas รวม RYD แยกกลุ่ม 16S ตัวอย่าง ฐานเดียวของ RYD phytoplasma 16S rDNA แตกต่างจากลำดับที่สอดคล้องกันใน phytoplasmas อื่น ๆ ทั้งหมดที่ตำแหน่ง 149 (G กับ A), 181 (C กับ T), 263 (พักไป T, 1148 (G กับ A), 1409 (A ถึง G) และ 1447 (G กับ A) สถานะของลำดับเหล่านี้ลายเซ็น RYD specific ในการ 16S rDNA แสดงหลักฐานการ divergence ทางพันธุกรรมของการศึกษานี้จาก phytoplasmas อื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

16S rDNA ลำดับของไฟโตพลาสมา Ryd และไฟโตพลาสมาที่เกี่ยวข้องกันใน Ryd 16S กลุ่ม (Ryd-J, RYD- Th, BGWL-Th, BGWL-KK, การทะเลาะวิวาทและ-KK-SCWL Ud) เปรียบเทียบกับลำดับจากไฟโตพลาสมาอื่น ๆ กลุ่ม ตำแหน่งฐานมีเลขดังอธิบายไว้ก่อนหน้า (Namba et al., 1993a) การวิเคราะห์ลำดับของไฟโตพลาสมาของ Ryd 16S กลุ่มที่ระบุว่ามีหลายลายเซ็นลำดับที่ไม่ซ้ำกันไปยังกลุ่มนี้: 59-AACACTG-39 (ตำแหน่งที่ 604-610) และ 59 GCAA-39 (999-1002) จะไม่พบในที่ใด ๆ ไฟโตพลาสมาอื่น ๆ ที่เป็นกลุ่มอื่น ๆ -16S ใน Ryd 16S ในกลุ่ม 59 TATCAGACTA-39 (626-635) เป็นป่าสงวนยังมีเพียงสองข้อยกเว้น: SCWL และไฟโตพลาสมา BVK มี T แทน C (629) นอกจากนี้ 59 AAATCTTCGGA- TTTT-39 (61-75) เป็นป่าสงวนยกเว้นในแยก Ryd; ทั้ง Ryd-J และ Ryd-Th มี T แทน C ที่ 65 ตำแหน่งที่น่าสนใจการเปลี่ยนแปลงลำดับนี้แตกต่างอย่างเห็นได้ชัด Ryd ไฟโตพลาสมาจากคนอื่น ๆ Ryd 16S กลุ่มแยก ไฟโตพลาสมา Ryd ยังมีอื่น ๆ ที่ไม่ซ้ำกัน "ลายเซ็น" การเปลี่ยนแปลงเบื่อหน่ายไม่พบในไฟโตพลาสมาอื่น ๆ รวมทั้ง Ryd 16S กลุ่มแยก ยกตัวอย่างเช่นฐานเดียวของ Ryd phytoplasma 16S rDNA แตกต่างไปจากลำดับที่สอดคล้องกันในไฟโตพลาสมาอื่น ๆ ที่ตำแหน่ง 149 (G เพื่อ A) 181 (C ถึง T), 263 (A / C เพื่อ T), 1148 (G เพื่อ A) , 1409 (A ถึง G) และ 1447 (G เพื่อ A) การปรากฏตัวของเหล่านี้สาย Ryd-speci ลำดับคลายเซ็นใน 16S rDNA มีหลักฐานสำหรับความแตกต่างทางพันธุกรรมของเชื้อโรคจากไฟโตพลาสมาอื่น ๆ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การใช้ชนิดของ ryd phytoplasmas และที่เกี่ยวข้อง phytoplasmas ใน ryd ( กลุ่ม ( ryd-j ryd , - th bgwl th , bgwl-kk วิวาท , และธนาคาร scwl UD ) เทียบเป็นลำดับจาก phytoplasmas ของกลุ่มอื่น ๆ ฐานตำแหน่งมีจำนวนตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ( นัมบะ et al . , 1993a )การวิเคราะห์ลำดับของ phytoplasmas ของ ryd ( กลุ่ม พบว่า มีหลายลำดับลายมือชื่อเฉพาะในกลุ่มนี้ : 59-aacactg-39 ( ตำแหน่ง 604 ( 610 ) และ 59-gcaa-39 ( 999 ) 1002 ) ไม่พบในใด ๆของกลุ่มอื่น ๆ phytoplasmas ใช้อื่น ๆ ใน ryd ( กลุ่ม 59-tatcagacta-39 ( 626 ) 635 ) ยังสามารถมีเพียงสองข้อยกเว้น :และมี scwl bvk phytoplasmas T แทน C ( 629 ) นอกจากนี้ 59-aaatcttcgga - tttt-39 ( 61 - 75 ) เป็นป่าสงวน ยกเว้นใน ryd สายพันธุ์ ทั้ง ryd-j ryd th และมี t แทน C ที่ตำแหน่ง 65 . ที่น่าสนใจนี้ลำดับการเปลี่ยนแปลงชัดเจน แตกต่างจากกลุ่มอื่น ๆ ryd phytoplasmas ( ryd เชื้อการ ryd phytoplasmas ยังครอบครองลายเซ็น ' เอกลักษณ์ ' อื่น ๆไม่พบการเปลี่ยนแปลงนิวคลีโอไทด์ในอื่น ๆ phytoplasmas รวมทั้งกลุ่ม 16S ryd เชื้อ ตัวอย่างเช่นเดียวฐานของเชื้อไฟโตพลาสมา ryd 16S rDNA แตกต่างจากอื่น ๆทั้งหมดที่เกี่ยวข้องในลำดับ phytoplasmas ตำแหน่ง 149 ( G ) , 181 ( C t ) , 263 ( C / T ) , ผม ( G ) , 1 , 409 ( g ) เป็น ( G ) และ .การปรากฏตัวของเหล่านี้ ryd speci จึง C ลายเซ็นลำดับใน 16S rDNA มีหลักฐานทางพันธุกรรมของเชื้อนี้ phytoplasmas แตกต่างจากอื่น ๆ