RFLP-PCR of the 16S rRNA gene (Ruiz

RFLP-PCR of the 16S rRNA gene (Ruiz et al., 2000) was used to
differentiate bacterial species. Amplicons were analyzed by elec-trophoresis in 1.0% (w/v) agarose gels, and digested with three
restriction enzymes:TaqI, AluI and BccI (Roche Diagnostics GmBh,
Germany) (González et al., 2006; Ruiz et al., 2000; Torija et al.,
2010). Restriction fragments were detected and analyzed by elec-trophoresis on a 3% (w/v) agarose gel. The length of the amplifi-cation products and restriction fragments were determined by
comparison with a 100 bp DNA ladder (Gibco-BRL, Eggenstein,
Germany). The 16S rRNA gene amplicons representative of the
different genotypes were purified and sequenced by Macrogen, Inc.
(Seoul, South Korea), using an ABI3730 XL automated DNA
sequencer. DNA sequences were compared with those in the Gen-Bank databases. The identity was established by 100% sequence
homologywith the available sequences in all the cases, except with
Acetobacter syzygiiwhose sequence homology was only 99.1% and
this sequence was deposited in the GenBank database under the
accession number JF951749

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

RFLP-PCR ของยีน 16s rRNA (Ruiz et al. 2000) ถูกใช้ในการแยกความแตกต่าง
แบคทีเรียสายพันธุ์ amplicons ถูกวิเคราะห์โดยการถูกไฟฟ้า trophoresis-1.0% (w / v) เจล agarose และย่อยด้วยเอนไซม์
สามข้อ จำกัด :. taqi, alui และ BCCI (โรชวินิจฉัย GmbH, เยอรมนี
) (González, et al, 2006; Ruiz et al, ., 2000; Torija et al,,
2010).เศษ จำกัด ถูกตรวจพบและวิเคราะห์โดยถูกไฟฟ้า trophoresis บน 3% (w / v) agarose เจล ความยาวของผลิตภัณฑ์ amplifi ไอออนบวกและเศษ จำกัด ได้รับการพิจารณาโดยเปรียบเทียบกับ
100 บันไดดีเอ็นเอ bp (GIBCO-BRL, Eggenstein, เยอรมนี
) ยีน 16S rRNA amplicons ตัวแทนของยีนที่แตกต่างกัน
ทำให้บริสุทธิ์และติดใจโดย macrogen, Inc.
(โซล, เกาหลีใต้)โดยใช้ดีเอ็นเอ abi3730 XL อัตโนมัติซีเควน
ดีเอ็นเอถูกเมื่อเทียบกับผู้ที่อยู่ในฐานข้อมูล GEN-ธนาคาร ตัวตนที่จัดตั้งขึ้นตามลำดับ 100%
homologywith ลำดับใช้ได้ในทุกกรณียกเว้นที่มีความคล้ายคลึงกัน
Acetobacter ลำดับ syzygiiwhose เป็นเพียง 99.1% และ
ลำดับนี้ถูกวางลงในฐานข้อมูลของ GenBank ภายใต้หมายเลขภาคยานุวัติ
jf951749

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PCR RFLP ของ 16S rRNA ยีน (รูอิซและ al., 2000) ได้ใช้
แตกสายพันธุ์แบคทีเรีย Amplicons ถูกวิเคราะห์ โดย elec-trophoresis ในเจ agarose 1.0% (w/v) และต้อง มีสาม
จำกัดเอนไซม์: TaqI, AluI และ BccI (Roche วินิจฉัย GmBh,
เยอรมนี) (González และ al., 2006 รูอิซและ al., 2000 Torija et al.,
2010) บางส่วนของข้อจำกัดถูกตรวจพบ และวิเคราะห์ โดย elec-trophoresis บนวุ้น agarose 3% (w/v) ความยาวของผลิตภัณฑ์ amplifi cation และบางส่วนของข้อจำกัดถูกกำหนดโดย
เปรียบเทียบกับดีเอ็นเอ 100 bp บันได (Gibco BRL, Eggenstein,
เยอรมนี) 16S rRNA ยีน amplicons ตัวแทนของการ
บริสุทธิ์ศึกษาจีโนไทป์ที่แตกต่างกัน และเรียงลำดับตาม Macrogen, Inc.
(โซล เกาหลีใต้), โดยใช้การ ABI3730 XL อัตโนมัติดีเอ็นเอ
sequencer การ ลำดับดีเอ็นเอถูกเปรียบเทียบกับผู้ที่อยู่ในฐานข้อมูลธนาคาร Gen ตัวก่อตั้งขึ้น โดยลำดับ 100%
homologywith ที่มีลำดับในทุกกรณี ยกเว้นกับ
Acetobacter syzygiiwhose ลำดับ homology ถูกเพียง 99.1% และ
ลำดับนี้ได้ฝากใน GenBank ฐานข้อมูลภายใต้การ
accession หมายเลข JF951749

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

rflp - pcr rrna ยีนของ 16 S ( Ruiz et al . 2000 )ก็นำมาใช้ในการ
ซึ่งจะช่วยสร้างความแตกต่างให้กับสายพันธุ์เกิดจากเชื้อแบคทีเรีย amplicons ก็วิเคราะห์โดยข้อกำหนด - trophoresis ใน 1.0% ( w / v ) agarose ผลิตภัณฑ์ ประเภท แวกซ์,เจล,และย่อยพร้อมด้วยสาม
การจำกัดด้วยเอนไซม์: taqi , alui และ bcci ( Roche Diagnostics GmbH ,
เยอรมนี)(รัฐอัวฮากากล่าวว่า et al ., 2006 ; Ruiz et al ., 2000 ; torija et al .,
2010 )เรียนรู้การจำกัดถูกตรวจพบและวิเคราะห์โดยข้อกำหนด - trophoresis บน 3% ( v w /)เจล agarose ที่ ความยาวของตัวสินค้า amplifi - ประจุลบและเศษมีการจำกัดมีกำหนดโดย
ซึ่งจะช่วยการเปรียบเทียบกับดีเอ็นเอ 100 บันได BP ( gibco - BRL )บราซิล,เรียล eggenstein
เยอรมัน) ตัวแทน amplicons 16 S rrna ยีนที่แตกต่างกันของ
genotypes ที่บริสุทธิ์และมีอักษรเรียงลำดับ\โดย macrogen , Inc .
(กรุงโซลเกาหลีใต้)การใช้ ABI 3730 ขนาด XL ได้โดยอัตโนมัติโดยดีเอ็นเอ
ในฐานะที่ ซีเควนซ์ของดีเอ็นเอได้เมื่อเทียบกับผู้ที่อยู่ในฐานข้อมูล gen-bank ได้ รหัสประจำตัวที่ได้ถูกสร้างขึ้นตามลำดับ 100%
homologywith ลำดับที่จัดให้บริการในกรณีที่ทั้งหมดยกเว้นพร้อมด้วย syzygiiwhose
acetobacter ลักษณะซึ่งเทียบเคียงกันได้ตามลำดับเป็นเพียง 99.1% และ
ลำดับนี้มาฝากไว้ในฐานข้อมูลเลี้ยงดูตาม
ภาค ยานุวัติหมายเลข jf 951749 ได้