The primers and probe were designed with the Primer Express
software (version 2.1, Applied Biosystems, Foster, California) inside
the TMS1 fragment to amplify a 142 bp amplicon. The forward primer
was degenerate because of the polymorphism observed in the
region of pTi Bo542 (Accession number DQ058764.1). The DNA
plant quality was checked with universal plant universal primers
(Taberlet, Gielly, Pautou, & Bouvet, 1991). In the present study,
new primers and probes were also newly designed targeting
regions present in the Agrobacterium sp. and present in different
GMO events, namely: the P-mas, T-Tr7 and T-mas (Table 1). The
real-time PCR experiments were performed on an ABI 7900 with
the software upgrade for nonfluorescent quencher probe support.
The qPCR reactions were also run using the Power SYBR Green
PCR Master Mix (Applied Biosystems) and the appropriate PCR
primers. Bacterial standards ranging in dilution from 1 107 to
1 10CFU/ml were run on each plate. Melting temperature
(Tm) was measured for each qPCR reaction. If the measured Tm
was outside the prespecified range (determined from the standards)
for each specific organism then the resulting concentration
was considered not detected.
ไพรเมอร์และการสอบสวนได้รับการออกแบบด้วยไพรเมอร์เอ็กซ์เพรสซอฟแวร์ (รุ่น 2.1, Applied Biosystems, ฟอสเตอร์, แคลิฟอร์เนีย) ภายในส่วนTMS1 เพื่อขยาย 142 bp amplicon ไพรเมอร์ไปข้างหน้าเป็นคนเลวเพราะความแตกต่างที่สังเกตได้ในพื้นที่ของPTI Bo542 (หมายเลขภาคยานุวัติ DQ058764.1) ดีเอ็นเอที่มีคุณภาพได้รับการตรวจสอบโรงงานที่มีไพรเมอร์สากลพืชสากล(Taberlet, Gielly, Pautou และบูเวต, 1991) ในการศึกษาปัจจุบัน, ไพรเมอร์โพรบใหม่และยังได้รับการออกแบบใหม่กำหนดเป้าหมายภูมิภาคในปัจจุบันเอสพี Agrobacterium และนำเสนอในที่แตกต่างกันเหตุการณ์จีเอ็มโอคือ: P-Mas T-TR7 และ T-Mas (ตารางที่ 1) แบบ real-time PCR ทดลองได้ดำเนินการใน ABI 7900 ที่มีการอัพเกรดซอฟต์แวร์สำหรับnonfluorescent ดับสนับสนุนการสอบสวน. ปฏิกิริยา qPCR ยังทำงานโดยใช้พลังงาน SYBR? สีเขียวPCR โทผสม (Applied Biosystems) และ PCR ที่เหมาะสมไพรเมอร์ มาตรฐานแบคทีเรียหลากหลายในการลดสัดส่วนตั้งแต่วันที่ 1? ที่จะ 107 1 10 CFU / ml วิ่งในแต่ละจาน จุดหลอมเหลว(TM) วัดสำหรับแต่ละปฏิกิริยา qPCR ถ้าวัด Tm อยู่นอกช่วง prespecified (กำหนดจากมาตรฐาน) สำหรับแต่ละสิ่งมีชีวิตที่เฉพาะเจาะจงแล้วความเข้มข้นที่เกิดขึ้นได้รับการพิจารณาตรวจไม่พบ
การแปล กรุณารอสักครู่..
