Statistical analyses of DNA sequenc

Statistical analyses of DNA sequences of globin genes (beta A, beta C, and gamma) from goat and sheep (including new sequence information for the second intron of sheep beta A and gamma, kindly provided by A. Davis and A. W. Nienhuis) indicate that the rates of nonsynonymous substitution in these genes have been greatly accelerated following the gene duplication separating gamma and the ancestor of beta A and beta C and the gene duplication separating beta A and beta C. In both cases the acceleration was apparently due to relaxation of purifying selection (functional constraints) rather than advantageous mutations because acceleration occurred only in less important parts of the beta globin chain. The rates of nonsynonymous substitution in these genes are estimated to be about 2.3 x 10(-9) per site per year, which is three times higher than that for the divergence between human beta and mouse beta major globin genes. Our analyses further suggest that the rate of synonymous substitution in functional genes and the rate of substitution in pseudogenes are approximately equal and are between 2.8 x 10(-9) and 5.0 x 10(-9) and that the rate of substitution in introns is about 3.0 x 10(-9). The divergence time between beta A and beta C and that between gamma and the beta A-beta C pair are about 12 and 30 million years, respectively. The proportion of transition mutations is estimated to be 64%, two times higher than expected under random mutation but considerably lower than the 96% estimated for animal mitochondrial DNA.

Articles citing this article

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ทางสถิติของลำดับดีเอ็นเอของยีนโกลบิน (เบต้าเบต้า C และแกมมา) จากแพะและแกะ (รวมถึงข้อมูลลำดับใหม่สำหรับ intron ที่สองของการแกะเบต้าและแกมมาให้ความกรุณาโดยกเดวิสและ AW Nienhuis) แสดงให้เห็นว่า อัตราของการทดแทน nonsynonymous ในยีนเหล่านี้ได้รับเร่งมากต่อไปนี้การทำสำเนายีนแยกแกมมาและบรรพบุรุษของเบต้าและเบต้า C และการทำสำเนาของยีนเบต้าแยกและเบต้าซีในทั้งสองกรณีเร่งเห็นได้ชัดเนื่องจากการผ่อนคลายของบริสุทธิ์ เลือก (ข้อ จำกัด การทำงาน) มากกว่าการกลายพันธุ์ที่ได้เปรียบเพราะการเร่งความเร็วเกิดขึ้นเฉพาะในส่วนที่สำคัญน้อยของห่วงโซ่ globin เบต้า อัตราของการทดแทน nonsynonymous ในยีนเหล่านี้คาดว่าจะอยู่ที่ประมาณ 2.3 x 10 (-9) ต่อเว็บไซต์ต่อปีซึ่งเป็นสามครั้งสูงกว่าสำหรับความแตกต่างระหว่างมนุษย์และเบต้าเมาส์ยีนเบต้า globin ที่สำคัญ การวิเคราะห์ของเราต่อไปแสดงให้เห็นว่าอัตราการทดแทนความหมายเหมือนกันในยีนทำงานและอัตราของการทดแทนใน pseudogenes ประมาณเท่ากันและอยู่ระหว่าง 2.8 x 10 (-9) และ 5.0 x 10 (-9) และอัตราการทดแทนใน introns คือ เกี่ยวกับ 3.0 x 10 (-9) ความแตกต่างระหว่างเวลาเบต้าและเบต้าซีและว่าระหว่างแกมมาและเบต้าเบต้าคู่ C ประมาณ 12 และ 30 ล้านปีตามลำดับ สัดส่วนของการกลายพันธุ์การเปลี่ยนแปลงที่คาดว่าจะเป็น 64% สองครั้งสูงกว่าที่คาดไว้ภายใต้การกลายพันธุ์แบบสุ่ม แต่ต่ำกว่า 96% โดยประมาณสำหรับยลดีเอ็นเอสัตว์. บทความที่อ้างถึงในบทความนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สถิติการวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอของโกลบินยีน ( เบต้า , เบต้า และแกมม่า C ) จาก แพะ และแกะ ( รวมถึงข้อมูลลำดับใหม่สำหรับ iNtRON ที่สองของแกะเบต้าและแกมมา กรุณาให้โดย เดวิส และ เอดับบลิวnienhuis ) บ่งชี้ว่า อัตรา nonsynonymous ทดแทนในยีนเหล่านี้มีอย่างมากเร่งตามสำเนาแยกยีนแกมมา และบรรพบุรุษของเบต้าและเบต้า C และยีนซ้ำซ้อนแยกเบต้าและเบต้า Cในทั้งสองกรณีความเร่งเป็น apparently เนื่องจากการผ่อนคลายของบริสุทธิ์เลือก ( ข้อจำกัดการทำงาน ) แทนที่จะได้ประโยชน์ เพราะการเกิดการกลายพันธุ์ในส่วน สำคัญน้อยกว่าของเบต้าโกลบินโซ่ อัตรา nonsynonymous ทดแทนในยีนเหล่านี้มีประมาณ 2.3 x 10 ( - 9 ) ต่อเว็บไซต์ ต่อปีซึ่งเป็นสามครั้งสูงกว่าที่ความแตกต่างระหว่างมนุษย์และเมาส์เบต้าเบต้าโกลบินยีนหลัก . การวิเคราะห์ของเราเพิ่มเติมว่าอัตราพ้องใช้ยีนที่ทํางานและอัตราการใช้ pseudogenes ประมาณเท่ากัน และอยู่ระหว่าง 2.8 x 10 ( - 9 ) และ 5.0 x 10 ( - 9 ) และอัตราการทดแทนใน introns ประมาณ 3.0 x 10 ( - 9 )ความแตกต่างระหว่างเบต้าและเบต้า C และระหว่างตัวเบต้า a-beta C คู่ที่ 12 และ 30 ล้านปี ตามลำดับ สัดส่วนของการเปลี่ยนแปลงการกลายพันธุ์ที่คาดว่าจะอยู่ที่ 64 , 2 ครั้งสูงกว่าที่คาดไว้ในสุ่มการกลายพันธุ์ แต่ต่ำกว่า 96 % ประมาณ สัตว์ดีเอ็นเอ .

บทความที่อ้างถึงบทความนี้