Sequence analysis of the region D1/

Sequence analysis of the region D1/D2 of the 26S rRNA gene: Representative
strains of each PCR-RFLP profile obtained were treated to
perform sequence analysis of the domains D1 and D2 of the 26S rRNA
gene. PCR amplification of the referred region in the 26S rRNA gene
with the primers NL1 (5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′) and
NL4 (5′-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3′) (Kurtzman & Robnett, 1998)
were performed. The amplification reaction and PCR conditions
were identical to those described above for ITS 5.8 rRNA region
except for the primers used (NL1 and NL4). Amplified products
were sequenced by LGC Genomics (Germany) and sequences
were compared to those available in GenBank database at the
National Center for Biotechnology Information (NCBI) using
BLAST (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/) to be identified by
sequence homology with described species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับของภูมิภาค D1/D2 ยีน 26S rRNA: ตัวแทนสายพันธุ์ของแต่ละโพรไฟล์ PCR-RFLP ที่ได้รับการดูแลในทำการวิเคราะห์ลำดับของโดเมน D1 และ D2 ของ 26S rRNAยีน ปลักของภูมิภาคอ้างในยีน 26S rRNAด้วยไพรเมอร์ NL1 (5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′) และNL4 (5′-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3′) (Kurtzman & Robnett, 1998)ดำเนินการ ขยายปฏิกิริยาและเงื่อนไข PCRได้เหมือนกับที่อธิบายไว้ข้างต้นสำหรับภูมิภาค 5.8 ของ rRNAยกเว้นสังกะสี วัสดุที่ใช้ (NL1 และ NL4) ขยายผลิตภัณฑ์มีการเรียงลำดับตามลำดับและ Genomics LGC (เยอรมนี)เทียบได้กับที่มีอยู่ในฐานข้อมูลของ GenBank ที่การศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI) ใช้ระเบิด (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/) ที่จะระบุโดยลำดับ homology กับสายพันธุ์อธิบาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์ลำดับของภูมิภาค D1 / D2 ของยีน 26S rRNA: ตัวแทน
สายพันธุ์ของแต่ละรายละเอียด PCR-RFLP ได้รับได้รับการรักษา
ดำเนินการวิเคราะห์ลำดับของโดเมน D1 และ D2 ของ 26S rRNA
ยีน ขยาย PCR ของภูมิภาคเรียกในยีน 26S rRNA
กับไพรเมอร์ NL1 (5'-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3) และ
NL4 (5'-GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3 ') (เคิร์ทซ์และ Robnett, 1998)
ได้ดำเนินการ ขยายการเกิดปฏิกิริยาและ PCR เงื่อนไข
เหมือนกับที่อธิบายไว้ข้างต้นสำหรับภูมิภาค 5.8 rRNA
ยกเว้นไพรเมอร์ที่ใช้ (NL1 และ NL4) ผลิตภัณฑ์ขยาย
มีลำดับขั้นตอนโดย LGC ฟังก์ชั่น (เยอรมนี) และลำดับ
ถูกเมื่อเทียบกับผู้ที่อยู่ในฐานข้อมูลของ GenBank ที่
ศูนย์แห่งชาติเทคโนโลยีชีวภาพสำหรับข้อมูล (NCBI) โดยใช้
ระเบิด (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/) จะได้รับการระบุ
ลำดับที่คล้ายคลึงกันกับสายพันธุ์อธิบาย