Using structure-guided library desi

Using structure-guided library design combined with an innovative ultrahigh throughput antibiotic screen,we have successfully engineered hLYZ variants that evade the E.coli inhibitory protein Ivyc. Surprisingly, however, the topperforming engineered enzymes acquired an unexpected sensitivity to the E. coli MliC inhibitor, the P. aeruginosa Ivyp
inhibitor, or both. Efforts to rationalize these observations via molecular modeling of the various enzyme−inhibitor complexes proved inconclusive, and in general these results
highlight the complexity of molecular determinants that underlie lysozyme recognition by proteinaceous inhibitors.Thus, it will be a challenge to develop hLYZ variants that are broadly evasive toward different classes of inhibitors or even similar orthologs from different pathogens. However, the diversity of our current Ivyc-resistant variants suggests that there are many alternative solutions to this general molecular engineering problem. Alternative library designs and appropriate application of high throughput screening technologies should enable efficient mining of higher performance enzymes.For example, one reasonable next step would be construction of an error-prone PCR library and more aggressive screening against cocktails of inhibitory proteins. Regardless, the results reported here represent an important proof-of-concept for developing inhibitor-resistant lysozyme variants. We anticipate that future efforts will capitalize on the lessons learned to produce highly active enzymes able to more efficiently attack and kill pathogens that currently subvert nature’s repertoire of
lysozyme antibiotics

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้ออกแบบตัวโครงสร้างไลบรารีรวมกับหน้าจอยาปฏิชีวนะสูงนวัตกรรม ultrahigh เรามีสำเร็จวิศวกรรมย่อย hLYZ ที่หนีระบบโปรตีนลิปกลอสไข Ivyc จู่ ๆ ไร เอนไซม์ topperforming วิศวกรรมมาไวการคาดการผล MliC E. coli, P. aeruginosa Ivypสารยับยั้ง หรือทั้งสองอย่าง พยายาม rationalize สังเกตเหล่านี้ผ่านโมเลกุลแบบจำลอง ของคอมเพล็กซ์ enzyme−inhibitor ต่าง ๆ ที่พิสูจน์ inconclusive และโดยทั่วไปผลลัพธ์เหล่านี้เน้นความซับซ้อนของดีเทอร์มิแนนต์โมเลกุลที่อยู่ภายใต้การรับรู้ของ lysozyme โดย proteinaceous inhibitors ดังนั้น มันจะเป็นความท้าทายเพื่อพัฒนาตัวแปร hLYZ ที่ว่าไปทางประเภทต่าง ๆ inhibitors หรือ orthologs ได้คล้ายโรคต่าง ๆ อย่างกว้างขวาง อย่างไรก็ตาม ความหลากหลายของตัวแปร Ivyc ทนของเราปัจจุบันแนะนำว่า มีหลายทางเลือกปัญหาทั่วไปโมเลกุลวิศวกรรม ออกแบบไลบรารีอื่นและโปรแกรมประยุกต์ที่เหมาะสมของอัตราความเร็วสูงเทคโนโลยีตรวจคัดกรองควรเปิดทำเหมืองที่มีประสิทธิภาพของเอนไซม์ประสิทธิภาพสูง ตัวอย่าง หนึ่งขั้นตอนต่อไปเหมาะสมจะก่อสร้างเป็นหอสมุด PCR ข้อผิดพลาดเสี่ยงและคัดกรองเชิงรุกมากขึ้นกับค็อกเทลของลิปกลอสไขโปรตีน ไม่คำนึงถึง ผลรายงานที่นี่แทนสำคัญพิสูจน์ของแนวคิดการพัฒนาตัวแปรผลทน lysozyme เราคาดหวังว่า ความพยายามในอนาคตจะใช้ประโยชน์จากการเรียนรู้ในการผลิตเอนไซม์สามารถโจมตีได้อย่างมีประสิทธิภาพ และฆ่าโรคที่ subvert ละครธรรมชาติของกำลังงานสูงยาปฏิชีวนะ lysozyme

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ใช้การออกแบบโครงสร้างห้องสมุดแนะนำรวมกับยูเอชทีผ่านนวัตกรรมหน้าจอยาปฏิชีวนะที่เราได้ประสบความสำเร็จในการออกแบบสายพันธุ์ hLYZ ที่หลบเลี่ยงโปรตีนยับยั้ง E.coli Ivyc ที่น่าแปลกใจ แต่เอนไซม์วิศวกรรม topperforming ได้รับความไวที่ไม่คาดคิดที่จะยับยั้ง E. coli MliC, P. aeruginosa Ivyp
ยับยั้งหรือทั้งสองอย่าง ความพยายามที่จะหาเหตุผลเข้าข้างตนเองสังเกตเหล่านี้ผ่านการสร้างแบบจำลองโมเลกุลเชิงซ้อนยับยั้งเอนไซม์ต่าง ๆ ได้รับการพิสูจน์สรุปไม่ได้และโดยทั่วไปผลลัพธ์เหล่านี้
เน้นความซับซ้อนของปัจจัยโมเลกุลที่รองรับการรับรู้โดยโปรตีนไลโซไซม์ inhibitors.Thus ก็จะเป็นสิ่งที่ท้าทายในการพัฒนาสายพันธุ์ที่มี hLYZ ข้อแก้ตัวในวงกว้างไปสู่การเรียนแตกต่างกันของสารยับยั้งหรือแม้กระทั่ง orthologs ที่คล้ายกันจากเชื้อโรคที่แตกต่างกัน แต่ความหลากหลายของสายพันธุ์ปัจจุบันทน Ivyc ของเราแสดงให้เห็นว่ามีโซลูชั่นหลายทางเลือกในการแก้ไขปัญหาด้านวิศวกรรมโมเลกุลทั่วไป การออกแบบห้องสมุดทางเลือกและการประยุกต์ใช้เทคโนโลยีที่เหมาะสมในการตรวจคัดกรองผ่านสูงจะช่วยให้การทำเหมืองแร่ที่มีประสิทธิภาพของตัวอย่างที่มีประสิทธิภาพสูง enzymes.For หนึ่งขั้นตอนต่อไปที่เหมาะสมจะมีการก่อสร้างห้องสมุด PCR ผิดพลาดได้ง่ายและการคัดกรองเชิงรุกมากขึ้นกับเครื่องดื่มค็อกเทลของโปรตีนยับยั้ง โดยไม่คำนึงถึงผลการรายงานที่นี่เป็นตัวแทนของหลักฐานของแนวคิดที่สำคัญในการพัฒนาสายพันธุ์ไลโซไซม์ยับยั้งทน เราคาดหวังว่าในอนาคตจะพยายามใช้ประโยชน์จากบทเรียนที่ได้เรียนรู้ในการผลิตเอนไซม์ที่ใช้งานสูงสามารถที่จะมีประสิทธิภาพมากขึ้นโจมตีและฆ่าเชื้อโรคที่กำลังล้มล้างละครธรรมชาติของการ
ใช้ยาปฏิชีวนะไลโซไซม์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การใช้โครงสร้างแนะนำห้องสมุดออกแบบบวกกับนวัตกรรมคลื่นวิทยุ throughput ยาปฏิชีวนะที่หน้าจอเราได้ออกแบบเรียบร้อยแล้ว hlyz สายพันธุ์ที่หลบเลี่ยงชนิดยับยั้งโปรตีน ivyc . จู่ ๆ อย่างไรก็ตาม topperforming วิศวกรรมเอนไซม์ได้มาไวไม่คาดคิดกับ E . coli mlic ซึ่ง P . aeruginosa ivyp
ยับยั้ง หรือทั้งสองอย่างความพยายามที่จะอธิบายการสังเกตเหล่านี้ผ่านทางแบบจำลองโมเลกุลของสารประกอบเชิงซ้อนเอนไซม์ต่าง ๆซึ่งพิสูจน์ไม่ได้ บริษัท เวสเทิร์น และโดยทั่วไปผลลัพธ์เหล่านี้
เน้นความซับซ้อนของโมเลกุลตัวกำหนดที่รับรู้โดยการ proteinaceous ไลโซไซม์ต่างๆ ดังนั้นมันจะเป็นสิ่งที่ท้าทายที่จะพัฒนา hlyz สายพันธุ์ที่กว้างแบบต่อชั้นเรียนที่แตกต่างกันของโปรตีน หรือแม้แต่ที่คล้ายกัน orthologs จากเชื้อโรคต่างๆ อย่างไรก็ตาม ความหลากหลายของปัจจุบันของเรา ivyc ป้องกันสายพันธุ์พบว่ามีโซลูชั่นทางเลือกมากมายเพื่อมันทั่วไปโมเลกุลทางปัญหาการออกแบบห้องสมุดทางเลือกและการประยุกต์ใช้ที่เหมาะสมสูง throughput เทคโนโลยีการตรวจคัดกรองควรเปิดเหมืองแร่ที่มีประสิทธิภาพสูง เอนไซม์ ตัวอย่างเช่น ขั้นตอนต่อไปที่เหมาะสมจะสร้างข้อผิดพลาดได้ง่ายจากห้องสมุดและการก้าวร้าวมากขึ้นกับค็อกเทลของโปรตีนยับยั้ง . ไม่ผลรายงานที่นี่เป็นตัวแทนที่สำคัญหลักฐานการแนวคิดการพัฒนาตัวยับยั้งทนไลโซไซม์พันธุ์ เราคาดหวังว่า ความพยายามในอนาคตจะใช้ประโยชน์จากบทเรียนที่ผลิตเอนไซม์ที่ใช้งานสูงสามารถที่จะมีประสิทธิภาพมากขึ้นโจมตีและฆ่าเชื้อโรคที่กำลังทำลายความเป็นธรรมชาติของ
ไลโซไซม์ ยาปฏิชีวนะ