Additionalsequences used in the ana

Additional
sequences used in the analyses were downloaded from
Treefam [121]. Multiple alignments of predicted proteins
were generated with MUSCLE using the default settings
[122] and were subsequently inspected and corrected by
eye. Full alignments were trimmed using G-blocks [123]
and were run through ProtTest using the default settings
to determine the optimum evolutionary model for phylogenetic analyses [124]. Neighbor joining trees were constructed using MEGA [125] and maximum likelihood
analyses were conducted using PhyML [126] with the
amino acid substitution models specified from ProtTest.
Phylogenetic trees are available in Additional file 2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เพิ่มเติมลำดับใช้ในการวิเคราะห์ที่ถูกดาวน์โหลดจาก
Treefam [121]
การจัดแนวหลายที่คาดการณ์โปรตีนที่ถูกสร้างขึ้นด้วยกล้ามเนื้อใช้การตั้งค่าเริ่มต้น
[122]
และได้รับการตรวจสอบในภายหลังและแก้ไขโดยตา การจัดแนวแบบเต็มถูกตัดโดยใช้ G-บล็อก [123]
และได้รับการเรียกใช้ผ่าน ProtTest
ใช้การตั้งค่าเริ่มต้นในการกำหนดรูปแบบวิวัฒนาการที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ[124] เพื่อนบ้านมาร่วมงานกับต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ MEGA [125]
และความน่าจะเป็นสูงสุดวิเคราะห์ถูกดำเนินการโดยใช้PhyML [126]
ที่มีกรดอะมิโนทดแทนรุ่นที่ระบุจากProtTest.
ต้นไม้ที่มีอยู่ในแฟ้มเพิ่มเติม 2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เทคนิคที่ใช้ในการวิเคราะห์คือเพิ่มเติม

treefam ดาวน์โหลดได้จาก [ 121 ] หลาย การพบว่าโปรตีน
ขึ้นกับกล้ามเนื้อโดยใช้การตั้งค่าเริ่มต้น
[ 122 ] และภายหลังการตรวจสอบและแก้ไขโดย
ตา การใช้ g-blocks เต็มถูกตัด [ 123 ]
และวิ่งผ่าน prottest ใช้ตั้งค่าเริ่มต้น
เพื่อกำหนดรูปแบบวิวัฒนาการที่เหมาะสมสำหรับการวิเคราะห์ phylogenetic [ 124 ] เพื่อนบ้านร่วมต้นไม้สร้างขึ้นโดยใช้ร็อค [ 125 ] และวิเคราะห์ความเป็นไปได้สูงสุด การใช้ phyml

[ 126 ] กับกรดอะมิโนทดแทนรุ่นที่ระบุจาก prottest .
ต้นไม้ ซึ่งมีอยู่ในแฟ้มเพิ่มเติม 2