Fungi play important roles in soil ecosystem as major decomposers of plant residues, releasing nutrients that sustain and stimulate plant growth in the process [1], [2]. Besides, the phylogenetic diversity of microorganisms can act as natural antagonists of various plant pathogens [3]. A well-developed and diverse rhizosphere community is thought to be critical in the suppression of pathogens [4], [5]. Knowledge of the structure and diversity of the fungal community in the plant rhizosphere will lead to a better understanding of pathogen-antagonist interactions [6].
It is suggested that only 17% of the known fungi can be readily grown in culture [7]. As traditional methods have many pitfalls, culture-independent methods show great potential in monitoring shifts or diversity of microbial community in a variety of environmental samples, such as Phospholipid Fatty Acid analysis (PLFA), Fatty Acid Methyl Ester profile (FAME), Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP), Ribosomal Intergenic Spacer Analysis (RISA), Denaturing/Temperature Gradient Gel Electrophoresis (DGGE/TGGE), Single Strand Configuration Polymorphism (SSCP), Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA), etc. Among these, T-RFLP and DGGE are two most widely used and effective methods in analyzing the spatial and temporal shifts of microbial community. T-RFLP method takes advantage in high throughputs, reproducible and web-based RDP database [8], while DGGE has high resolution by separating the same size fragments and sequencing each band[9]. Thus, in this study, the combination of the two methods would give a better understanding of the soil fungal community in cucumber rhizosphere.
เชื้อราเล่นบทบาทสำคัญในระบบนิเวศดินเป็นผู้ย่อยสลายที่สำคัญของพืชตก ปล่อยสารอาหารที่รักษา และกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืชในกระบวนการ [1], [2] นอกจาก phylogenetic ความหลากหลายของจุลินทรีย์สามารถทำหน้าที่เป็นตัวธรรมชาติของโรคพืชต่าง ๆ [3] ชุมชนพัฒนาดี และหลากหลายไรโซสเฟียร์เป็นความคิดสำคัญในการปราบปรามโรค [4], [5] ความรู้โครงสร้างและความหลากหลายของเชื้อราในไรโซสเฟียร์พืชจะนำไปสู่ความเข้าใจด้านการศึกษาเป็นศัตรูโต้ตอบ [6]ขอแนะนำว่า เพียง 17% ของเชื้อราที่รู้จักสามารถจะพร้อมเติบโตในวัฒนธรรม [7] เป็นวิธีการแบบเดิมมีข้อผิดพลาดใน วัฒนธรรมอิสระวิธีแสดงศักยภาพที่ดีในการตรวจสอบกะหรือความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์หลายอย่างสิ่งแวดล้อม เช่นการวิเคราะห์กรดไขมันฟอสโฟลิพิด (PLFA), กรดไขมัน Methyl เอสโพรไฟล์ (ชื่อเสียง), เทอร์มินัลจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (T-RFLP), Ribosomal Intergenic เป็นตัวเว้นวรรควิเคราะห์ (สะ), Electrophoresis เจลไล่ระดับ Denaturing/อุณหภูมิ (DGGE TGGE) เดียวสาระโครงโพลีมอร์ฟิซึม (SSCP) ขยาย Ribosomal ดีเอ็นเอจำกัดวิเคราะห์ (ARDRA) เป็นต้น ในหมู่เหล่านี้ T-RFLP และ DGGE มีสองใช้กันอย่างแพร่หลายมากที่สุด และวิธีที่มีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์ปริภูมิ และขมับกะชุมชนจุลินทรีย์ วิธี T RFLP ใช้ใน throughputs สูง จำลองและเว็บ RDP ฐานข้อมูล [8], ในขณะที่ DGGE มีความละเอียดสูง โดยแยกชิ้นส่วนขนาดเดียวกัน และลำดับเบสแต่ละวง [9] ดังนั้น ในการศึกษานี้ ทั้งสองวิธีจะให้ความเข้าใจของชุมชนเชื้อราดินในไรโซสเฟียร์แตงกวา
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)
เชื้อรา มีบทบาทสำคัญในระบบนิเวศในดินย่อยสลายของเศษซากพืชเป็นหลักปล่อยสารอาหารที่หล่อเลี้ยงและกระตุ้นการเจริญเติบโตของพืชในกระบวนการ [ 1 ] [ 2 ] นอกจากนี้ ความหลากหลายของจุลินทรีย์ที่เป็นเชื้อโรคประเภทตามธรรมชาติของพืชต่างๆ [ 3 ]เต่ง และหลากหลายเขตชุมชนเป็นความคิดที่สำคัญในการปราบปรามเชื้อโรค [ 4 ] , [ 5 ] เกี่ยวกับโครงสร้างและความหลากหลายของชุมชนราในรากพืชจะนำไปสู่ความเข้าใจที่ดีขึ้นของเชื้อปฏิปักษ์ของ [ 6 ] .
พบว่ามีเพียงร้อยละ 17 หรือ เชื้อราสามารถพร้อมเพาะ [ 7 ]เป็นวิธีแบบดั้งเดิมมีข้อผิดพลาดหลายวัฒนธรรมอิสระวิธีการแสดงศักยภาพที่ดีในการเปลี่ยนแปลงหรือความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ในความหลากหลายของตัวอย่างสิ่งแวดล้อม เช่น การวิเคราะห์กรดไขมันฟอสโฟลิพิด ( plfa ) , กรดไขมันเมทิลเอสเทอร์ โปรไฟล์ ( ชื่อเสียง ) , เทอร์มินัลจำกัด fragment length polymorphism ( t-rflp ) , การวิเคราะห์ spacer ribosomal ส่า ( ลิซ่า )ี่อุณหภูมิลาด gel electrophoresis ( การทดลอง / tgge ) , การปรับแต่งเส้นเดียว - ( จำนวนจำกัด ) , การวิเคราะห์ดีเอ็นเอของไรโบโซม ( ardra ) , ฯลฯ ในหมู่เหล่านี้ t-rflp และการทดลองเป็นสองส่วนใหญ่ใช้กันอย่างแพร่หลายและวิธีที่มีประสิทธิภาพในการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงพื้นที่และเวลาของชุมชนจุลินทรีย์ วิธี t-rflp ใช้ประโยชน์ใน throughputs สูงการหาเว็บฐานข้อมูล RDP [ 8 ] , ในขณะที่การทดลองมีความละเอียดสูง โดยการแบ่งชิ้นส่วนขนาดเดียวกันและลำดับแต่ละวง [ 9 ] ดังนั้นในการศึกษานี้ การรวมกันของทั้งสองวิธีจะให้ความเข้าใจที่ดีขึ้นของเชื้อราในดินบริเวณรากแตงกวาชุมชน
.
การแปล กรุณารอสักครู่..
![](//thimg.ilovetranslation.com/pic/loading_3.gif?v=b9814dd30c1d7c59_8619)