RxLR effectors represent one of the

RxLR effectors represent one of the largest and most diverse effector families in oomycete plant pathogens. These effectors have attracted enormous attention since they can be delivered inside the plant cell and manipulates host immunity. With the exceptions of a signal peptide and the following RxLR-dEER and C-terminal W/Y/L motifs identified from the sequences themselves, nearly no functional domains have been found. Recently, protein structures of several RxLRs were revealed to comprise alpha-helical bundle repeats. However, approximately half of all RxLRs lack obvious W/Y/L motifs, which are associated with helical structures. In this study, secondary structure prediction of the putative RxLR proteins was performed. We found that the C-terminus of the majority of these RxLR proteins, irrespective of the presence of W/Y/L motifs, contains abundant short alpha-helices. Since a large-scale experimental determination of protein structures has been difficult to date, results of the current study extend our understanding on the oomycete RxLR effectors in protein secondary structures from individual members to the entire family. Moreover, we identified less alpha-helix-rich proteins from secretomes of several oomycete and fungal organisms in which RxLRs have not been identified, providing additional evidence that these organisms are unlikely to harbor RxLR-like proteins. Therefore, these results provide additional information that will aid further studies on the evolution and functional mechanisms of RxLR effectors.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

RxLR เบสแทนครอบครัว effector ที่ใหญ่ที่สุด และหลากหลายที่สุดในโรคพืช oomycete อย่างใดอย่างหนึ่ง เบสเหล่านี้ได้ดึงดูดความสนใจอย่างมากเนื่องจากสามารถจัดส่งได้ภายในเซลล์พืช และควบคุมภูมิคุ้มกันของโฮสต์ มีข้อยกเว้นเพปไทด์ส่งสัญญาณต่อไปนี้ RxLR-เดียร์ และลงสถานี C W/Y/L ที่ระบุจากลำดับตัวเอง เกือบไม่มีโดเมนที่ทำงานพบ ล่าสุด โครงสร้างโปรตีนของ RxLRs หลายถูกเปิดเผยจะประกอบด้วยกลุ่มอักษร helical ซ้ำ อย่างไรก็ตาม ประมาณครึ่งหนึ่งของ RxLRs ทั้งหมดขาดแคลนชัดเจน W/Y/L ลง ที่เกี่ยวข้องกับโครงสร้าง helical ในการศึกษานี้ ทำนายโครงสร้างรองของโปรตีน RxLR putative ที่ดำเนินการ เราพบว่า C-นัสส่วนใหญ่ของโปรตีนเหล่านี้ RxLR ไม่ก็ W/Y/L ลง ประกอบด้วยมากมายสั้นอัลฟา-helices เนื่องจากกำหนดการทดลองขนาดใหญ่โครงสร้างโปรตีนได้ยากวัน ผลของการศึกษาปัจจุบันขยายเราเข้าใจใน oomycete เบส RxLR ในโปรตีนโครงสร้างรองจากสมาชิกแต่ละครอบครัวทั้งหมด นอกจากนี้ เราระบุโปรตีนน้อยคนรวยเกลียวอัลฟาจาก secretomes หลาย oomycete และสิ่งมีชีวิตเชื้อราที่ RxLRs ไม่ได้ระบุ ให้หลักฐานเพิ่มเติมว่า สิ่งมีชีวิตเหล่านี้ไม่น่าจะท่า RxLR เหมือนโปรตีน ดังนั้น ผลลัพธ์เหล่านี้ให้ข้อมูลเพิ่มเติมที่จะช่วยเพิ่มเติมการศึกษาวิวัฒนาการและกลไกการทำงานของเบส RxLR

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เอฟเฟค RxLR เป็นตัวแทนหนึ่งที่ใหญ่ที่สุดและมีความหลากหลายมากที่สุดในครอบครัว effector เชื้อสาเหตุโรคพืช oomycete เอฟเฟคเหล่านี้ได้รับความสนใจอย่างมากเนื่องจากพวกเขาสามารถส่งภายในเซลล์พืชและปรุงแต่งภูมิคุ้มกันโฮสต์ มีข้อยกเว้นของเปปไทด์สัญญาณและต่อไปนี้ RxLR กวางและ C ขั้ว W / Y / L ลวดลายระบุจากลำดับที่ตัวเองเกือบไม่มีโดเมนการทำงานมีการตรวจพบ เมื่อเร็ว ๆ นี้โครงสร้างของโปรตีน RxLRs หลายคนเผยให้เห็นถึงประกอบด้วยมัดอัลฟาขดลวดซ้ำ อย่างไรก็ตามประมาณครึ่งหนึ่งของทั้งหมด RxLRs ขาดที่เห็นได้ชัด W / Y / L ลวดลายซึ่งมีความเกี่ยวข้องกับโครงสร้างขดลวด ในการศึกษานี้ทำนายโครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีน RxLR สมมุติที่ได้ดำเนินการ เราพบว่า C-ปลายทางของคนส่วนใหญ่ของโปรตีน RxLR เหล่านี้โดยไม่คำนึงถึงการปรากฏตัวของ W / Y / ลวดลาย L, มีความอุดมสมบูรณ์เอนริเก้อัลฟาสั้น ตั้งแต่การกำหนดทดลองขนาดใหญ่ของโครงสร้างโปรตีนได้ยากที่จะวันที่ผลการศึกษาในปัจจุบันขยายความเข้าใจของเราเกี่ยวกับเอฟเฟค RxLR oomycete โปรตีนโครงสร้างทุติยภูมิจากสมาชิกแต่ละคนในครอบครัว นอกจากนี้เรายังระบุน้อยโปรตีนอัลฟาเกลียวที่อุดมไปด้วยจาก secretomes ของสิ่งมีชีวิตหลาย oomycete และเชื้อราที่ RxLRs ยังไม่ได้รับการระบุให้หลักฐานเพิ่มเติมที่มีชีวิตเหล่านี้ไม่น่าจะปิดบังโปรตีน RxLR เหมือน ดังนั้นผลลัพธ์เหล่านี้ให้ข้อมูลเพิ่มเติมที่จะช่วยให้การศึกษาเพิ่มเติมเกี่ยวกับวิวัฒนาการและกลไกการทำงานของเอฟเฟค RxLR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

rxlr อีกครั้งหนึ่งเป็นหนึ่งในที่ใหญ่ที่สุดและหลากหลายที่สุดในครอบครัวโต้งเชื้อโรคพืชโอไมซีต . ได้ดึงดูดความสนใจอย่างมากอีกครั้งหนึ่งเหล่านี้เนื่องจากพวกเขาสามารถจัดส่งภายในเซลล์พืชและการจัดการภูมิคุ้มกันของโฮสต์ ด้วยข้อยกเว้นของเปปไทด์สัญญาณและกวาง rxlr ซึ่ง W / Y / L และลวดลายที่ระบุจากลำดับตัวเองดังต่อไปนี้เกือบไม่มีฟังก์ชันโดเมนได้ถูกพบแล้ว เมื่อเร็วๆ นี้ โครงสร้างของโปรตีนหลาย rxlrs ถูกเปิดเผย ( Alpha 5 มัดซ้ำ . อย่างไรก็ตาม ประมาณครึ่งหนึ่งของทั้งหมด rxlrs ขาดความชัดเจน w / Y / l ที่สำคัญซึ่งเกี่ยวข้องกับโครงสร้างลาน ในการศึกษานี้ คำทำนายโครงสร้างทุติยภูมิของโปรตีน คือ กรดอะมิโน rxlr แสดงเราจะพบว่า c-terminus ของส่วนใหญ่ของโปรตีน rxlr เหล่านี้ โดยไม่คำนึงถึงสถานะของ W / Y / L ลวดลายที่มีมากมายสั้นอัลฟา helices . ตั้งแต่การกำหนดทดลองขนาดใหญ่ของโครงสร้างโปรตีนได้ยากเสมอผลการศึกษาปัจจุบันขยายความเข้าใจของเราเกี่ยวกับโอไมซีต rxlr อีกครั้งหนึ่งในโครงสร้างโปรตีนระดับสมาชิกแต่ละคนในครอบครัว นอกจากนี้ เราระบุน้อยกว่าเป็นเกลียวอัลฟาที่อุดมไปด้วยโปรตีนจาก secretomes หลายโอไมซีตและเชื้อราสิ่งมีชีวิตที่ rxlrs ไม่ได้ระบุไว้ให้หลักฐานเพิ่มเติมว่าสิ่งมีชีวิตเหล่านี้จะน่าท่าเรือ rxlr เช่นโปรตีน ดังนั้น ผลลัพธ์เหล่านี้ให้ข้อมูลเพิ่มเติมว่า จะช่วยเหลือการศึกษาต่อไปในวิวัฒนาการและกลไกการทำงานของ rxlr อีกครั้งหนึ่ง .