tics, pharmacogenetics, and sequenc

tics, pharmacogenetics, and sequencing by hybridization
as well as gene-expression analysis.
Fabrication of oligonucleotide chips by photolithography
is theoretically simple but technically
complex [29,30]. The light from a high-intensity
mercury lamp is directed through a photolithographic
mask onto the silica surface, resulting in
deprotection of the terminal nucleotides in the illuminated
regions. The entire chip is then reacted with
the desired free nucleotide, resulting in selected chain
elongation. This process requires only 4n cycles
(where n = oligonucleotide length in bases) to synthesize
a vast number of unique oligos, the total number
of which is limited only by the complexity of the
photolithographic mask and the chip size [29,31,32].
Sample preparation involves the generation of
double-stranded cDNA from cellular poly(A)+ RNA
followed by antisense RNA synthesis in an in vitro
transcription reaction with biotinylated or fluortagged
nucleotides. The RNA probe is then fragmented
to facilitate hybridization. If the indirect
visualization method is used, the chips are incubated
with fluor-linked streptavidin (e.g., phycoerythrin)
after hybridization [12,33]. The signal is detected with
a custom confocal scanner [34]. This method has
been applied successfully to the mapping of genomic
library clones [35], to de novo sequencing by hybridization
[28,36], and to evolutionary sequence comparison
of the BRCA1 gene [37]. In addition,
mutations in the cystic fibrosis [38] and BRCA1 [39]
gene products and polymorphisms in the human immunodeficiency
virus-1 clade B protease gene [40]
have been detected by this method. Oligonucleotide
chips are also useful for expression monitoring [33]
as has been demonstrated by the simultaneous evaluation
of gene-expression patterns in nearly all open
reading frames of the yeast strain S. cerevisiae [12].
More recently, oligonucleotide chips have been used
to help identify single nucleotide polymorphisms in
the human [41] and yeast [42] genomes.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

tics เภสัชพันธุศาสตร์ และการจัดลำดับ โดย hybridizationรวมทั้งการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนผลิตของชิป oligonucleotide โดยสร้างลายวงจรด้วยแสงเป็นเรื่องง่ายในทางทฤษฎีแต่ในทางเทคนิคคอมเพล็กซ์ [29,30] แสงความเข้มสูงจากนำปรอทโคมไฟผ่านการ photolithographicรูปแบบบนพื้นผิวซิลิกา ในdeprotection นิวคลีโอไทด์ที่เทอร์มินัลในความสว่างขอบเขตการ แล้วมีปฏิกิริยาชิกับต้องการฟรีนิวคลีโอไทด์ ผลเลือกโซ่ยืดตัว กระบวนการนี้ต้องเฉพาะ 4n รอบ(ซึ่ง n =ความยาวฐาน oligonucleotide) การสังเคราะห์เป็น oligos เฉพาะ จำนวนจำนวนของที่ถูกจำกัดโดยความซับซ้อนของการหน้ากาก photolithographic และขนาดของชิพ [29,31,32]รุ่นที่เกี่ยวข้องกับการเตรียมตัวอย่างสองครั้งที่ควั่น cDNA จากมือถือ poly(A) + RNAตาม ด้วย antisense RNA สังเคราะห์ในการในหลอดทดลองปฏิกิริยาการถอดรหัส ด้วย biotinylated หรือ fluortaggedนิวคลีโอไทด์ โพรบ RNA เป็นมากแล้วเพื่ออำนวยความสะดวกการ hybridization ถ้าในทางอ้อมใช้วิธีการแสดงภาพประกอบเพลง ได้รับการกกเบี้ยมีลิงค์ฟลูออ streptavidin (เช่น phycoerythrin)หลังจากการ hybridization [12,33] มีการตรวจพบสัญญาณด้วยสแกนเนอร์โฟคอที่กำหนดเองแบบ [34] วิธีนี้มีการใช้เรียบร้อยแล้วกับการแมปของจีโนมของไลบรารีโคลน [35], การจัดลำดับ novo de โดย hybridization[28,36], และ การเปรียบเทียบลำดับวิวัฒนาการของยีน BRCA1 [37] นอกจากนี้พันธุ์ BRCA1 และรซิ [38] [39]ยีนและ polymorphisms ในกลับมนุษย์1 ไวรัส clade B รติเอสยีน [40]มีการตรวจพบ โดยวิธีนี้ Oligonucleotideชิจะยังมีประโยชน์สำหรับนิพจน์ตรวจสอบ [33]เป็นการแสดง โดยการประเมินพร้อมกันรูปแบบการแสดงออกของยีนในเปิดเกือบทั้งหมดอ่านเฟรมภาพยีสต์สายพันธุ์ S. cerevisiae [12]เมื่อเร็ว ๆ นี้ มีการใช้ชิป oligonucleotideเพื่อช่วยระบุหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่ายในมนุษย์ [41] และ genomes ยีสต์ [42]

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สำบัดสำนวน Pharmacogenetics และลำดับโดยการผสมข้ามพันธุ์
รวมทั้งการวิเคราะห์ยีนแสดงออก.
ประดิษฐ์ของชิป oligonucleotide โดย photolithography
เป็นทฤษฎีที่เรียบง่าย แต่ในทางเทคนิค
ที่ซับซ้อน [29,30] แสงจากความเข้มสูง
ปรอทโคมไฟเป็นผู้กำกับที่ผ่าน photolithographic
หน้ากากลงบนพื้นผิวซิลิกาที่มีผลใน
deprotection ของนิวคลีโอมินัลในอร่าม
ภูมิภาค ชิปทั้งหมดจะมีปฏิกิริยาตอบสนองแล้วกับ
เบื่อหน่ายฟรีที่ต้องการส่งผลให้ในห่วงโซ่เลือก
การยืดตัว กระบวนการนี้ต้องใช้เพียงรอบ 4n
(ที่ n = ความยาว oligonucleotide ในฐาน) ในการสังเคราะห์
จำนวนมากมายของ oligos ที่ไม่ซ้ำกันจำนวนรวม
ที่ถูก จำกัด ด้วยความซับซ้อนของเพียง
หน้ากาก photolithographic และขนาดชิป [29,31,32] .
การเตรียมตัวอย่างที่เกี่ยวข้องกับรุ่นของ
เกลียวคู่ยีนโพลีจากโทรศัพท์มือถือ (A) + RNA
ตามด้วยการสังเคราะห์สารแอนตี้ RNA ในในหลอดทดลอง
ปฏิกิริยากับถอดความ biotinylated หรือ fluortagged
นิวคลีโอ สอบสวน RNA มีการแยกส่วนแล้ว
เพื่ออำนวยความสะดวกการผสมพันธุ์ หากทางอ้อม
การแสดงผลภาพที่ใช้ชิปจะฟัก
กับสเต Fluor เชื่อมโยง (เช่น phycoerythrin)
หลังจากผสมพันธุ์ [12,33] สัญญาณจะถูกตรวจพบกับ
สแกนเนอร์ confocal กำหนดเอง [34] วิธีการนี้ได้
ถูกนำมาใช้ประสบความสำเร็จในการทำแผนที่จีโนม
โคลนห้องสมุด [35] ไปที่ลำดับ Novo โดยการผสมข้ามพันธุ์
[28,36] และวิวัฒนาการการเปรียบเทียบลำดับ
ของยีน BRCA 1 ม [37] นอกจากนี้ยังมี
การกลายพันธุ์ในโรคปอดเรื้อรัง [38] และ BRCA 1 [39]
ผลิตภัณฑ์ของยีนและความหลากหลายในเอดส์
ไวรัส 1 clade B น้ำย่อยยีน [40]
ได้รับการตรวจพบโดยวิธีนี้ oligonucleotide
ชิปยังมีประโยชน์สำหรับการแสดงออกการตรวจสอบ [33]
เมื่อได้มีการแสดงให้เห็นถึงการประเมินผลพร้อมกัน
ของรูปแบบการแสดงออกของยีนในเกือบทุกเปิด
เฟรมอ่านของสายพันธุ์ยีสต์ S. cerevisiae [12].
เมื่อเร็ว ๆ นี้ชิป oligonucleotide ได้ถูกนำมาใช้
ในการ ช่วยระบุหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่ายใน
มนุษย์ [41] และยีสต์ [42] จีโนม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เภสัชพันธุศาสตร์และการ tics ชนิด , โดยรวมทั้งการวิเคราะห์การแสดงออกของยีนสร้าง 43 ซึ่งชิปโดยเป็นทฤษฎีง่าย แต่เทคนิคซับซ้อน [ ตกแต่งอย่างดี ] แสงจากสูงโคมไฟปรอทเป็นโดยตรงผ่าน photolithographicหน้ากากบนพื้นผิวซิลิกา ส่งผลให้หมู่ของขั้วคู่ในอร่ามภูมิภาค ชิปทั้งหมดแล้วมีปฏิกิริยากับยีนที่ทำให้โซ่เลือกฟรีที่ต้องการการยืดตัว . กระบวนการนี้ต้องใช้เพียง 5 รอบ( เมื่อ n = ซึ่งความยาวฐาน ) เพื่อสังเคราะห์จํานวนมากมายโอลิโกสา จํานวนรวมที่ จำกัด เท่านั้น โดยความซับซ้อนของหน้ากาก photolithographic และขนาด [ ชิป 29,31,32 ]การเตรียมสารตัวอย่างที่เกี่ยวข้องกับรุ่นของคู่ตีเกลียวยีนจากเซลล์ poly ( A ) + .antisense RNA ตามด้วยการสังเคราะห์ในในหลอดทดลองถอดความปฏิกิริยากับ fluortagged ไล หรือเบส . ยีนตัวนั้นกระจัดกระจายเพื่อความสะดวกในลูกผสม ถ้าอ้อมวิธี การ ใช้ ชิปจะบ่มกับ streptavidin Fluor เชื่อมโยง ( เช่นไฟโคอิริทริน )หลังทำ [ 12,33 ] สัญญาณที่ตรวจพบด้วยเองด้วยสแกนเนอร์ [ 34 ] วิธีนี้มีถูกใช้เรียบร้อยแล้วเพื่อทำแผนที่จีโนมห้องสมุดโคลน [ 35 ] , อีกครั้งการทำโดย[ 28,36 ] และเปรียบเทียบลำดับวิวัฒนาการของยีน BRCA1 [ 37 ] นอกจากนี้การกลายพันธุ์ใน Cystic Fibrosis [ 38 ] และ BRCA1 [ 39 ]ของผลิตภัณฑ์และความหลากหลายในงานvirus-1 clade B ยีนโปรติเอส [ 40 ]ได้รับการตรวจพบโดยวิธีนี้ ซึ่งชิปยังมีประโยชน์สำหรับการตรวจสอบ [ 33 ] นิพจน์ตามที่ได้แสดงผลพร้อมกันโดยการแสดงออกของยีนในรูปแบบเกือบทั้งหมดเปิดอ่านกรอบของยีสต์ S . cerevisiae สายพันธุ์ [ 12 ]เมื่อเร็วๆ นี้ ซึ่งมีการใช้ชิปเพื่อช่วยระบุความหลากหลายในยีนเดี่ยวมนุษย์ [ 41 ] และ [ 42 ] จีโนมยีสต์ .