The percentage profiles of abundant

The percentage profiles of abundant OTUs for each day of storage and oyster species are reported in Table 1, together with the closest phylogenetic classification by NCBI nucleotide BLAST. These abundant OTUs represent the 10 highest contributing OTUs in terms of sequence reads for each replicate sample from both oyster species on Days 0, 3 and 7. Some OTUs were amongst the 10 highest in more than one sample. The total percentage reads from these abundant OTUs in each sample ranged from 68.1 to 91.7% of total reads indicating that these sequences dominated the overall bacterial communities in each sample. At the OTU level, the bacterial profile of fresh Pacific oysters was dominated by OTUs that were most closely related to Prosthecomicrobium, Mycoplasma, Helicobacter and Terasakiella representing 28.1, 28.8, 10.1 and 9.4% of the sequence reads respectively ( Table 1). At Day 7, Pacific oysters were dominated by OTUs that were most closely related to Vibrio, Arcobacter, and Pseudoalteromonas representing 15.1, 13.7 and 6.9% of sequence reads respectively ( Table 1). The microbial profile of fresh Sydney rock oysters was dominated by OTUs that were most closely related to Mycoplasma, Spirochaeta and Haloplasmarepresenting 33.4, 13.9 and 23.6% of sequence reads respectively ( Table 1). The microbial profile of spoiled Sydney rock oysters (Day 7) was dominated by OTUs that were most closely related to Pseudoalteromonas,Vibrio and Colwellia representing 37.2, 15.1 and 5.0% of sequence reads respectively ( Table 1). The OTUs identified as Pseudoalteromonas (615) and Vibrio (3918) were the same OTUs for both Pacific and Sydney Rock oysters.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ค่าเปอร์เซ็นต์ของ OTUs มากมายสำหรับแต่ละวันของการจัดเก็บและหอยนางรมพันธุ์มีรายงานในตารางที่ 1 กับการจัดประเภท phylogenetic ใกล้เคียงที่สุดโดยนิวคลีโอไทด์ NCBI ระเบิด OTUs อุดมสมบูรณ์เหล่านี้แสดงถึง 10 ที่สูงที่สุดจากสนับสนุน OTUs ในลำดับการอ่านสำหรับแต่ละตัวอย่าง replicate จากทั้งสองพันธุ์หอยในวันที่ 0, 3 และ 7 OTUs บางหมู่ 10 สูงสุดในตัวอย่างหนึ่งได้ ผลรวมเปอร์เซ็นต์อ่านจาก OTUs เหล่านี้มากมายในแต่ละตัวอย่างอยู่ในช่วงจาก 68.1 91.7% ของผู้อ่านรวมที่บ่งชี้ว่า ลำดับเหล่านี้ครอบงำชุมชนแบคทีเรียรวมในตัวอย่างแต่ละ ระดับ OTU โพแบคทีเรียของหอยแปซิฟิกถูกครอบงำ โดย OTUs ที่สุดเกี่ยวข้องกับ Prosthecomicrobium, Mycoplasma กระเพาะ และ Terasakiella แทน 28.1, 28.8, 10.1 และ 9.4% ของอ่านลำดับตามลำดับ (ตารางที่ 1) 7 วัน หอยนางรมแปซิฟิกถูกครอบงำ โดย OTUs ที่สุดเกี่ยวข้องกับผล Arcobacter และ Pseudoalteromonas แทน 15.1, 13.7 และ 6.9% ของลำดับการอ่านตามลำดับ (ตารางที่ 1) โพรไฟล์จุลินทรีย์ของหอยหินซิดนีย์ถูกครอบงำ โดย OTUs ที่สุดเกี่ยวข้องกับ Mycoplasma, Spirochaeta และ Haloplasmarepresenting 33.4, 23.6% อ่านลำดับและ 13.9 ตามลำดับ (ตารางที่ 1) โพรไฟล์จุลินทรีย์ของบูดซิดนีย์หินหอยนางรม (7 วัน) ถูกครอบงำ โดย OTUs ที่สุดเกี่ยวข้องกับ Pseudoalteromonas ผล และ Colwellia แสดง ถึง 37.2, 15.1 5.0% อ่านลำดับตามลำดับ (ตารางที่ 1) OTUs ที่ระบุเป็น Pseudoalteromonas (615) และต่อ (3918) ถูก OTUs เดียวสำหรับหอยนางรมแปซิฟิกและร็อคซิดนีย์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ร้อยละโปรไฟล์ของมากมายในแต่ละวันของการเก็บและชนิด หอยนางรมมีรายงานตารางที่ 1 ร่วมกับใกล้ระเบิด ncbi phylogenetic หมวดหมู่โดยเบื่อหน่าย . เหล่านี้มากมายในแสดง 10 สูงสุดในแง่ของการบริจาคในแต่ละลำดับอ่านเลียนแบบตัวอย่างจากทั้งหอยนางรมชนิดในวันที่ 0 , 3 และ 7บางในเป็นหมู่ 10 สูงสุดมากกว่าหนึ่งตัวอย่าง เปอร์เซ็นต์ทั้งหมดอ่านจากในเหล่านี้มากมายในแต่ละตัวอย่าง มีค่าร้อยละ 68.1 เพื่อ 91.7 ทั้งหมดอ่านแสดงว่าอนุกรมนี้ครอบงำชุมชนแบคทีเรียโดยรวมในแต่ละตัวอย่าง ที่ระดับ otu ,โปรไฟล์ของเชื้อแบคทีเรียในหอยนางรมแปซิฟิกสดในที่ถูกครอบงำโดยส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับ prosthecomicrobium , Mycoplasma , และเป็นตัวแทนของปัญหา terasakiella Helicobacter 28.1 , , 10.1 และ 9.4% ของลำดับอ่านตามลำดับ ( ตารางที่ 1 ) วันที่ 7 , หอยนางรมแปซิฟิกถูกครอบงำโดยในที่ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับจำนวน arcobacter , และ pseudoalteromonas แทน 15.1 , 13 .7 และ 6.9 ตามลำดับลำดับอ่านตามลำดับ ( ตาราง 1 ) โปรไฟล์ของจุลินทรีย์ในหอยนางรมซิดนีย์ร็อคสดถูกครอบงำโดยในที่ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับไมโคพลาสม่า spirochaeta haloplasmarepresenting ลลาและ 13.9 และร้อยละ 23.6 , ลำดับอ่านตามลำดับ ( ตาราง 1 )โปรไฟล์ของจุลินทรีย์ในซิดนีย์หอยนางรมหินเน่า ( 7 วัน ) ถูกครอบงำโดยในที่ส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับ pseudoalteromonas จำนวน colwellia 37.2 และแทน , และร้อยละ 5.0 ( ลำดับอ่านตามลำดับ ( ตาราง 1 ) ในการระบุว่าเป็น pseudoalteromonas ( 615 ) และวิบริโอ ( 3918 ) เหมือนกันในทั้งมหาสมุทรแปซิฟิกและซิดนีย์ร็อคหอยนางรม