In up to 30 % of patients with colo

In up to 30 % of patients with colorectal adenomatous
polyposis, no germline mutation in the known
genes APC, causing familial adenomatous polyposis,
MUTYH, causing MUTYH-associated polyposis, and POLE
or POLD1, causing Polymerase-Proofreading-associated
polyposis can be identified, although a hereditary etiology
is likely. To uncover new causative genes, exome
sequencing was performed using DNA from leukocytes
and a total of 12 colorectal adenomas from seven unrelated
patients with unexplained sporadic adenomatous polyposis.
For data analysis and variant filtering, an established
bioinformatics pipeline including in-house tools was
applied. Variants were filtered for rare truncating point
mutations and copy-number variants assuming a dominant,
recessive, or tumor suppressor model of inheritance. Subsequently,
targeted sequence analysis of the most promising
candidate genes was performed in a validation cohort
of 191 unrelated patients. All relevant variants were validated
by Sanger sequencing. The analysis of exome
sequencing data resulted in the identification of rare lossof-
function germline mutations in three promising candidate
genes (DSC2, PIEZO1, ZSWIM7). In the validation
cohort, further variants predicted to be pathogenic were
identified in DSC2 and PIEZO1. According to the somatic
mutation spectra, the adenomas in this patient cohort follow
the classical pathways of colorectal tumorigenesis. Thepresent study identified three candidate genes which might
represent rare causes for a predisposition to colorectal
adenoma formation. Especially PIEZO1 (FAM38A) and
ZSWIM7 (SWS1) warrant further exploration. To evaluate
the clinical relevance of these genes, investigation of larger
patient cohorts and functional studies are required

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในผู้ป่วยลำไส้ใหญ่ adenomatous ถึง 30%polyposis ไม่กลายพันธุ์ germline ในรู้จักกันยีนก่อให้เกิดภาวะ adenomatous polyposis APCMUTYH ก่อให้เกิดการเชื่อมโยง MUTYH polyposis และขั้วหรือก่อให้เกิดการพอลิเมอเรสพิสูจน์อักษรสัมพันธ์ POLD1polyposis สามารถระบุ แม้ว่ามีสาเหตุทางพันธุกรรมมีแนวโน้ม ค้นพบยีนใหม่สาเหตุ exomeลำดับดำเนินการโดยใช้ดีเอ็นเอจากเม็ดเลือดขาวและทั้งหมด 12 ลำไส้ใหญ่ adenomas จากเจ็ดไม่เกี่ยวผู้ป่วยที่ มีไม่คาดหมายของประปราย adenomatous polyposisสำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลและตัวแปรการการกรอง การก่อตั้งbioinformatics ไปป์ไลน์รวมทั้งเครื่องมือในบ้านได้นำไปใช้ กรองตัวแปรสำหรับจุดตัดทอนหายากการกลายพันธุ์และจำนวนตัวแปรที่สมมติว่าเป็นที่โดดเด่นแก่นสานต์ หรือเนื้องอกตัวเกินรุ่นของการสืบทอด ต่อมาวิเคราะห์เป้าหมายของสัญญามากที่สุดดำเนินการในการศึกษาตรวจสอบยีนผู้สมัครของผู้ป่วยเกี่ยวข้อง 191 ตัวแปรที่เกี่ยวข้องทั้งหมดผ่านการตรวจสอบโดย Sanger ลำดับ การวิเคราะห์ของ exomeส่งผลให้ข้อมูลลำดับรหัสของหายาก lossof-ฟังก์ชัน germline กลายพันธุ์ในสามสัญญาผู้สมัครยีน (DSC2, PIEZO1, ZSWIM7) ในการตรวจสอบศึกษา ตัวแปรเพิ่มเติมคาดว่า จะทำให้เกิดโรคได้ระบุไว้ใน DSC2 และ PIEZO1 ตามที่ร่างกายทำตามสเปกตรัมกลายพันธุ์ adenomas ในการศึกษานี้ผู้ป่วยเส้นทางคลาสสิกของ tumorigenesis ลำไส้ใหญ่ Thepresent ศึกษาระบุสามสมัครยีนซึ่งอาจแสดงสาเหตุที่หายากพอ ๆ กับลำไส้ใหญ่เนื้องอกต่อมการก่อ โดยเฉพาะ PIEZO1 (FAM38A) และZSWIM7 (SWS1) สิทธิสำรวจเพิ่มเติม ในการประเมินเกี่ยวข้องทางคลินิกของยีนเหล่านี้ การตรวจสอบใหญ่ผองเพื่อนผู้ป่วยและศึกษาการทำงานจำเป็น

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ได้ถึง 30% ของผู้ป่วยที่มี adenomatous ลำไส้ใหญ่
polyposis ไม่มีการกลายพันธุ์ germline ในที่รู้จักกัน
ยีน APC ก่อให้เกิดครอบครัว adenomatous polyposis,
MUTYH ก่อให้เกิด polyposis MUTYH ที่เกี่ยวข้องและ POLE
หรือ POLD1 ก่อให้เกิด Polymerase-พิสูจน์อักษรที่เกี่ยวข้อง
polyposis สามารถระบุ แม้จะเป็นสาเหตุทางพันธุกรรม
อาจเป็นไปได้ การค้นพบยีนที่ก่อให้เกิดใหม่ exome
ลำดับถูกดำเนินการโดยใช้ดีเอ็นเอจากเซลล์เม็ดเลือดขาว
และรวมเป็น 12 เนื้องอกลำไส้ใหญ่ที่ไม่เกี่ยวข้องจากเจ็ด
ผู้ป่วยที่มีไม่ได้อธิบาย polyposis adenomatous เป็นระยะ ๆ .
สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลและการกรองตัวแปรที่จัดตั้งขึ้น
ชีวสารสนเทศท่อรวมทั้งเครื่องมือในบ้านที่ถูก
นำมาใช้ สายพันธุ์ที่ถูกกรองสำหรับจุดตัดทอนหายาก
กลายพันธุ์และสำเนาจำนวนสายพันธุ์สมมติเด่น,
ถอยหรือเนื้องอกต้านรูปแบบของการถ่ายทอดทางพันธุกรรม ต่อจากนั้น
การวิเคราะห์ลำดับที่กำหนดเป้าหมายในแนวโน้มมากที่สุด
ยีนที่ได้ดำเนินการในการศึกษาการตรวจสอบ
ของผู้ป่วยที่ไม่เกี่ยวข้อง 191 ตัวแปรที่เกี่ยวข้องทั้งหมดได้รับการตรวจสอบ
โดยแซงเจอร์ลำดับ การวิเคราะห์ exome
ข้อมูลลำดับส่งผลให้ในตัวของหายาก lossof-
การกลายพันธุ์ของฟังก์ชั่น germline ในสามสัญญาว่าผู้สมัคร
ยีน (DSC2, PIEZO1, ZSWIM7) ในการตรวจสอบ
การศึกษาสายพันธุ์ต่อไปคาดว่าจะก่อให้เกิดโรคที่ถูก
ระบุไว้ใน DSC2 และ PIEZO1 ตามที่ร่างกาย
สเปกตรัมการกลายพันธุ์เนื้องอกในหมู่ผู้ป่วยรายนี้เป็นไปตาม
ทางเดินคลาสสิกของ tumorigenesis ลำไส้ใหญ่ การศึกษา Thepresent ระบุสามยีนซึ่งอาจ
หมายถึงสาเหตุที่หายากสำหรับจูงใจที่จะลำไส้ใหญ่
ก่อ adenoma โดยเฉพาะอย่างยิ่ง PIEZO1 (FAM38A) และ
ZSWIM7 (SWS1) รับประกันการสำรวจต่อไป เพื่อประเมิน
ความเกี่ยวข้องทางคลินิกของยีนเหล่านี้มีขนาดใหญ่การสอบสวนของ
ผองเพื่อนผู้ป่วยและการศึกษาการทำงานจะต้อง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ถึง 30% ของผู้ป่วยลำไส้ใหญ่ adenomatouspolyposis ไม่เจิร์มไลน์การกลายพันธุ์ในรู้จักเป็นกรรมพันธุ์ adenomatous polyposis ยีน APC , ก่อให้เกิด ,mutyh ก่อให้เกิด polyposis เกี่ยวข้อง mutyh และเสาหรือ pold1 ก่อให้เกิดการตรวจทานที่เกี่ยวข้องpolyposis สามารถระบุถึงสาเหตุจากพันธุกรรมจะเป็นไปได้ การค้นพบยีนที่เป็นสาเหตุ exome ใหม่ลำดับการใช้ดีเอ็นเอจากเม็ดเลือดขาวและรวมเป็น 12 จากเจ็ดดีโนมัสและไม่เกี่ยวข้องกันผู้ป่วยที่ไม่สามารถอธิบายเป็นระยะ adenomatous polyposis .สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลและตัวแปรการกรอง , การก่อตั้งรวมถึงเครื่องมือในบ้าน เป็นท่อรสนประยุกต์ สายพันธุ์ที่ถูกกรองเพื่อหายากตัดจุดการกลายพันธุ์และคัดลอกหมายเลขตัวแปรสมมติว่าผู้นำลักษณะด้อย , เนื้องอกหรือเครื่องห้ามรูปแบบการถ่ายทอด ต่อมาเป้าหมายลำดับการวิเคราะห์ศักยภาพมากที่สุดยีนที่แสดงในการตรวจสอบผู้สมัครเข้าศึกษาของ 191 กับผู้ป่วย ทั้งหมด ตัวแปรที่เกี่ยวข้องได้ตรวจสอบโดยแซงเจอร์ลำดับ . การวิเคราะห์ exomeข้อมูลการจัดลำดับผลในการจัดเก็บ - หายากฟังก์ชันเยอร์มไลน์การกลายพันธุ์ใน 3 สัญญา ผู้สมัครยีน ( dsc2 piezo1 zswim7 , , ) ในการตรวจสอบความถูกต้องศึกษาตัวแปรทำนาย , เพิ่มเติมเป็นเชื้อโรคคือและระบุใน dsc2 piezo1 . ผลทางกายการกลายพันธุ์ spectra , ดีโนมัสในผู้ป่วยที่ศึกษาตามเส้นทางที่คลาสสิกของลำไส้ใหญ่ tumorigenesis . ปัจจุบันการศึกษาระบุสามผู้สมัครยีนซึ่งอาจแสดงสาเหตุที่หายากสำหรับโอนเอียงลําไส้ใหญ่การเกิดเนื้องอกต่อม . โดยเฉพาะอย่างยิ่ง piezo1 ( fam38a ) และzswim7 ( sws1 ) หมายสำรวจเพิ่มเติม เพื่อประเมินความเกี่ยวข้องทางคลินิกของยีนเหล่านี้ , การตรวจสอบขนาดใหญ่เพื่อนของผู้ป่วยและการทำงานจะต้องศึกษา