CG Model. We considered a Au144(SR)

CG Model. We considered a Au144(SR)60 NP, R being either a hydrophobic octanethiol ligand (OT) or an anionic 11-mercaptoundecanesulfonate (MUS). The diameter of the Au core is about 2 nm (Supporting Figure S1), while the monolayer-protected NP has an overall diameter of about 4 nm. We modeled the Au–Au and Au–S interactions using an elastic network, while we developed a CG model of the ligands based on the popular Martini force field(20) (Figure 1). At CG level, the OT ligands are modeled as a chain of two hydrophobic (type C1) beads. The MUS ligands are described by three hydrophobic beads (Martini type C1) and one negatively charged terminal bead (type Qda). The details of the parametrization can be found in the Supporting Information. We remark here that our CG description does not distinguish between, e.g., mercaptoundecanoic acid and mercaptoundecanesulfonate, allowing for the direct comparison with several independent previous computational (AA) and experimental works.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รุ่น CG เราถือว่าเป็น Au144 (SR) 60 NP, R มีลิแกนด์ hydrophobic octanethiol (OT) หรือการย้อม 11-mercaptoundecanesulfonate (บรรยากาศเป็นกัน) เส้นผ่าศูนย์กลางแกน Au คือ ประมาณ 2 nm (สนับสนุนรูป S1), ในขณะที่ NP monolayer ป้องกันมีเส้นผ่าศูนย์กลางโดยรวมประมาณ 4 nm เราจำลอง Au – Au และโต้ตอบอู – S โดยใช้เครือข่ายยืดหยุ่น ในขณะที่เราพัฒนาแบบ CG ของ ligands ตามมาร์ตินี่นิยมบังคับ field(20) (1 รูป) ระดับ CG OT ligands จะจำลองเป็นโซ่ลูกปัดสอง hydrophobic (ชนิด C1) อธิบาย ligands บรรยากาศเป็นกัน โดยสามเม็ด hydrophobic (มาร์ตินี่ชนิด C1) และหนึ่งคิดส่งลูกปัดเทอร์มินัล (ชนิด Qda) รายละเอียดของ parametrization สามารถพบได้ในข้อมูลสนับสนุน เรารีนี่ว่า คำอธิบายของ CG ไม่แยกความแตกต่างระหว่าง เช่น การทำงานของกรด mercaptoundecanoic และ mercaptoundecanesulfonate ช่วยให้การเปรียบเทียบโดยตรงกับหลายอิสระก่อนหน้านี้คำนวณ (AA) และทดลอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

CG รุ่น เราถือว่าเป็น Au144 (อาร์) 60 NP วิจัยเป็นทั้งแกนด์ octanethiol ชอบน้ำ (OT) หรือประจุลบ 11 mercaptoundecanesulfonate (MUS) เส้นผ่าศูนย์กลางของแกน Au ประมาณ 2 นาโนเมตร (สนับสนุนรูป S1) ในขณะที่เอ็นพี monolayer มีการป้องกันโดยรวมของขนาดเส้นผ่าศูนย์กลางประมาณ 4 นาโนเมตร เราย่อม Au-Au และการมีปฏิสัมพันธ์ Au-S โดยใช้เครือข่ายที่มีความยืดหยุ่นในขณะที่เราพัฒนารูปแบบการกำกับดูแลกิจการของแกนด์อยู่บนพื้นฐานของสนามแรง Martini นิยม (20) (รูปที่ 1) ในระดับการกำกับดูแลกิจการที่แกนด์ OT ย่อมเป็นห่วงโซ่ของทั้งสองไม่ชอบน้ำ (ชนิด C1) ลูกปัด แกนด์ MUS อธิบายไว้โดยสามลูกปัดชอบน้ำ (มาร์ติประเภท C1) และลูกปัดที่มีประจุลบขั้ว (พิมพ์ QDA) รายละเอียดของตัวแปรที่สามารถพบได้ในข้อมูลสนับสนุน เราสังเกตว่าที่นี่คำอธิบายการกำกับดูแลกิจการของเราไม่ได้เห็นความแตกต่างระหว่างเช่นกรด mercaptoundecanoic และ mercaptoundecanesulfonate เพื่อให้สามารถเปรียบเทียบโดยตรงกับการคำนวณก่อนหน้าอิสระหลาย (AA) และผลงานการทดลอง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รุ่น CG . เราถือว่าเป็น au144 ( SR ) 60 , NP , R เป็นทั้งระบบ octanethiol ไฮโดรโฟบิก ( OT ) หรือประจุลบ 11 mercaptoundecanesulfonate ( มัส ) เส้นผ่าศูนย์กลางของแกน หรือ ประมาณ 2 นาโนเมตร ( สนับสนุนรูป S1 ) ส่วนชั้นที่ป้องกัน NP มีเส้นผ่านศูนย์กลางประมาณ 4 นาโนเมตร เราจำลอง AU ( AU และ AU ของการโต้ตอบและใช้เครือข่ายที่ยืดหยุ่นในขณะที่เราพัฒนา CG แบบของลิแกนด์ขึ้นอยู่กับความนิยม มาร์ตินี่สนามพลัง ( 20 ) ( รูปที่ 1 ) ระดับ CG , OT ลิแกนด์เป็นแบบลูกโซ่ ( ประเภทสอง ) C1 ) ลูกปัด เมาส์อะตอม ( 3 เม็ด ) ( มาร์ตินี่ประเภท C1 ) และหนึ่งซึ่งมีประจุลบ ) ลูกปัด ( ประเภท qda ) รายละเอียดของ parametrization สามารถพบได้ในข้อมูลประกอบเรากล่าวที่นี่รายละเอียด CG ของเราไม่แยกแยะระหว่าง เช่น กรด mercaptoundecanoic mercaptoundecanesulfonate และช่วยให้สำหรับการเปรียบเทียบโดยตรงมีหลายอิสระก่อนหน้านี้คอมพิวเตอร์ ( AA ) และงานทดลอง