Dengue viruses (DEN) are classified

Dengue viruses (DEN) are classified into four serotypes (DEN1-DEN4) exhibiting high sequence and structural similarities, and infections by multiple serotypes can lead to the deadly dengue hemorrhagic fever. Here, we aim at characterizing the thermodynamic stability of DEN envelope protein domain III (ED3) during its evolution, and we report a structural analysis of DEN4wt ED3 combined with a systematic mutational analysis of residues 310 and 387. Molecular modeling based on our DEN3 and DEN4 ED3 structures indicated that the side-chains of residues 310/387, which are Val310/Ile387 and Met310/Leu387 in DEN3wt and DEN4wt, respectively, could be structurally compensated, and that a “size switch type repacking” might have occurred at these sites during the evolution of DEN into its four serotypes. This was experimentally confirmed by a 10 °C and 5 °C decrease in the thermal stability of, respectively, DEN3 ED3 variants with Met310/Ile387 and Val310/Leu387, whereas the variant with Met310/Leu387, which contains a double mutation, had the same stability as the wild type DEN3. Namely, the Met310Val mutation should have preceded the Leu387Ile mutation in order to maintain the tight internal packing of ED3 and thus its thermodynamic stability. This view was confirmed by a phylogenetic reconstruction indicating that a common DEN ancestor would have Met310/Leu387, and the intermediate node protein, Val310/Leu387, which then mutated to the Val310/Ile387 pair found in the present DEN3. The hypothesis was further confirmed by the observation that all of the present DEN viruses exhibit only stabilizing amino acid pairs at the 310/387 sites.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ไวรัสไข้เลือดออก (DEN) จะแบ่งเป็น 4 serotypes (DEN1 DEN4) อย่างมีระดับสูงลำดับและความเหมือนโครงสร้าง และการติดเชื้อ โดยหลาย serotypes สามารถนำโรคไข้เลือดออกอันตราย ที่นี่ เราจุดมุ่งหมายที่กำหนดลักษณะของเสถียรภาพทางอุณหพลศาสตร์ของโดเมนโปรตีนซองจดหมายเดน III (ED3) ในระหว่างการวิวัฒนาการ และเรารายงานวิเคราะห์โครงสร้างของ ED3 DEN4wt ร่วมกับการวิเคราะห์ระบบ mutational ของตก 310 และ 387 สร้างแบบจำลองโมเลกุลตามโครงสร้างของเรา DEN3 และ DEN4 ED3 ระบุว่า โซ่ข้างของตก 310/387 ซึ่งมี Val310/Ile387 และ Met310/Leu387 DEN3wt และ DEN4wt ตามลำดับ สามารถ structurally ชดเชย และที่เป็น "ขนาดสลับชนิดวิเคราะห์" อาจเกิดขึ้นในเว็บไซต์เหล่านี้ในระหว่างวิวัฒนาการของเดนใน serotypes สี่ นี้ experimentally ยืนยันการรับลดลง 5 ° C และ 10 ° C ในความมั่นคงความร้อนของ ตามลำดับ DEN3 ED3 ย่อยกับ Met310/Ile387 Val310/Leu387 ในขณะที่ตัวแปร ด้วย Met310/Leu387 ซึ่งประกอบด้วยการกลายพันธุ์คู่ มีความมั่นคงเหมือนกันเป็นชนิดป่า DEN3 คือ การกลายพันธุ์ Met310Val ควรมีก่อนหน้าการกลายพันธุ์ Leu387Ile รักษาบันทึกภายในแน่น ED3 และดังนั้นเสถียรภาพทางอุณหพลศาสตร์ มุมมองนี้ได้รับการยืนยัน โดยฟื้นฟู phylogenetic ที่บ่งชี้ว่า บรรพบุรุษเดนทั่วไปจะมี Met310/Leu387 และโปรตีนปานกลางโหน Val310/Leu387 ที่แล้วกลายไปคู่ Val310/Ile387 ที่พบใน DEN3 ปัจจุบัน สมมติฐานได้รับการยืนยันเพิ่มเติม โดยการสังเกตการแสดงปัจจุบันของไวรัสเดน stabilizing เฉพาะ กรดอะมิโนทั้งหมดจับคู่ในอเมริกา 310/387

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไวรัสไข้เลือดออก (DEN) จะถูกแบ่งออกเป็นสี่สายพันธุ์ (DEN1-DEN4) แสดงลำดับที่สูงและความคล้ายคลึงกันของโครงสร้างและการติดเชื้อโดยสายพันธุ์หลายคนสามารถนำไปสู่​​โรคไข้เลือดออกร้ายแรง ที่นี่เรามีจุดมุ่งหมายที่พัฒนาการความมั่นคงทางอุณหพลศาสตร์ของ DEN โดเมนโปรตีนซองจดหมาย iii (ED3) ในระหว่างการวิวัฒนาการของตนและที่เรารายงานการวิเคราะห์โครงสร้างของ DEN4wt ED3 รวมกับการวิเคราะห์ mutational ระบบของสารตกค้างที่ 310 และ 387 การสร้างแบบจำลองโมเลกุลขึ้นอยู่กับกี -3 และโครงสร้าง DEN4 ED3 ของเราแสดงให้เห็นว่าทางด้านเครือข่ายของสารตกค้างที่ 310/387 ซึ่งเป็น Val310/Ile387 และ Met310/Leu387 ใน DEN3wt และ DEN4wt ตามลำดับจะได้รับการชดเชยการก่อสร้างและที่ "ชนิดสวิทช์ขนาด แบ่งบรรจุ "ที่อาจจะเกิดขึ้นในเว็บไซต์เหล่านี้ในระหว่างการวิวัฒนาการของ DEN เป็นสี่สายพันธุ์ของ นี้ได้รับการยืนยันโดยการทดลอง 10 ° C และ 5 ° C ในการลดความร้อนของตามลำดับกี -3 ED3 พันธุ์ด้วย Met310/Ile387 Val310/Leu387 และในขณะที่ความแตกต่างด้วย Met310/Leu387 ที่มีการกลายพันธุ์คู่มี ความมั่นคงเช่นเดียวกับประเภทกี -3 ป่า คือการกลายพันธุ์ Met310Val ควรจะนำหน้าการกลายพันธุ์ Leu387Ile เพื่อรักษาภายในบรรจุแน่นของ ED3 และทำให้เสถียรภาพทางอุณหพลศาสตร์ของ มุมมองนี้จะได้รับการยืนยันโดยการฟื้นฟูสายวิวัฒนาการแสดงให้เห็นว่าบรรพบุรุษ DEN ทั่วไปจะมี Met310/Leu387 และโปรตีนกลางโหนด Val310/Leu387 ซึ่งจะกลายพันธุ์ไปยังคู่ Val310/Ile387 พบในกี -3 ปัจจุบัน สมมติฐานที่ได้รับการยืนยันต่อไปโดยการสังเกตว่าทั้งหมดของไวรัส DEN ปัจจุบันแสดงให้เพียงเสถียรภาพคู่กรดอะมิโนที่ 310/387 เว็บไซต์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไข้เลือดออก ( DEN ) จะแบ่งเป็นสี่ 3 ( den1-den4 ) แสดงลำดับสูงและโครงสร้างคล้ายคลึงกัน และการติดเชื้อจากหลายภูมิสามารถนำไปสู่อันตรายไข้เลือดออก ที่นี่ เรามุ่งที่ลักษณะของความมั่นคงทางเดนโลปโปรตีนโดเมน III ( ed3 ) ในช่วงของการวิวัฒนาการและเราจะรายงานการวิเคราะห์โครงสร้างของ den4wt ed3 รวมกับการวิเคราะห์เกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงระบบของที่ตกค้างแล้ว 387 . แบบจำลองโมเลกุลตาม den3 ของเราและ den4 โครงสร้าง ed3 พบว่าโซ่ข้างของที่ตกค้าง 310 / 387 , ซึ่ง val310 / ile387 met310 / และ leu387 และใน den3wt den4wt ตามลำดับ อาจจะมีโครงสร้างค่าชดเชยและ " ขนาดสลับชนิดแบ่งบรรจุ " อาจเกิดขึ้นที่เว็บไซต์เหล่านี้ในช่วงวิวัฒนาการของเดนเป็นสี่ 3 . นี้ได้รับการยืนยันโดยผล 10 ° C และ 5 ° C ลดลงเสถียรภาพต่อความร้อนของตามลำดับ den3 ed3 สายพันธุ์และ met310 / ile387 val310 / leu387 ซึ่งแตกต่างกับ met310 / leu387 ซึ่งมีการกลายพันธุ์คู่มีเสถียรภาพ เช่นเดียวกับ den3 ชนิดป่า คือการกลายพันธุ์ met310val ควรจะนำหน้า leu387ile การกลายพันธุ์เพื่อรักษาแน่นภายในบรรจุ ed3 และทำให้เสถียรภาพทางอุณหพลศาสตร์ของ มุมมองนี้ได้รับการยืนยันโดยการยืนยันระบุว่าบรรพบุรุษถ้ำทั่วไปจะ met310 / leu387 และโหนดกลาง / leu387 val310 , โปรตีนซึ่งกลายพันธุ์ไป val310 / ile387 คู่ที่พบใน den3 ปัจจุบัน การวิจัยยืนยันเพิ่มเติมโดยการสังเกตทั้งหมดของไวรัสเดนปัจจุบันแสดงเพียงเสถียรภาพกรดอะมิโนคู่ที่ 310 / 387 แห่ง