The PCR was performed using a PTC-1

The PCR was performed using a PTC-100 Programmable
Thermal Cycler (MJ Research, Watertown, MA). Ten replicates
were conducted for each sample as well as a negative control. The
PCR products were checked by 1.2% agarose gel electrophoresis. All
PCR products for each sample were pooled and purified using a PCR
clean-up kit (Axygen) according to the manufacturer's instructions.
The purified PCR product from each sample was then
sequenced on an Illumina Miseq PE250 platform by Majorbio Biopharm
Technology Co., Ltd. (Shanghai, China), and the raw
pyrosequencing data were processed as described by Zhao et al.
(2014) and Tian et al. (2015). Only sequences >150 bp in length
with an average quality score >25 and without ambiguous base
calls were included in subsequent analyses. The reads for each
sample were aligned using the fast, secondary-structure aware

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทำ PCR ใช้โปรแกรม PTC-100Cycler ความร้อน (MJ วิจัย Watertown, MA) เหมือนกับ 10ได้ดำเนินการแต่ละอย่างเป็นตัวควบคุมค่าลบ ที่ผลิตภัณฑ์ PCR ถูกตรวจสอบ โดย 1.2% agarose เจ electrophoresis ทั้งหมดผลิตภัณฑ์ PCR สำหรับแต่ละตัวอย่างถูกทางถูกพู และบริสุทธิ์โดยใช้ PCRชุดทำความสะอาด (Axygen) ตามคำแนะนำของผู้ผลิตผลิตภัณฑ์ PCR บริสุทธิ์จากตัวอย่างแต่ละถูกแล้วเรียงลำดับบนแพลตฟอร์มโดย Majorbio Biopharm Illumina Miseq PE250 การเทคโนโลยี Co., Ltd. (เซี่ยงไฮ้ ประเทศจีน), และแบบดิบpyrosequencing ข้อมูลถูกประมวลผลตามที่อธิบายไว้โดยเจียว et al(2014) และ al. et เทียน (2015) เฉพาะ ลำดับ > 150 bp ความยาวมีคะแนนเฉลี่ยคุณภาพ > 25 และไม่ มีฐานไม่ชัดเจนเรียกถูกรวมในการวิเคราะห์ต่อไป อ่านแต่ละตัวอย่างถูกจัดใช้อย่างรวดเร็ว รองทราบถึงโครงสร้าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

PCR ได้รับการดำเนินการโดยใช้โปรแกรมได้ PTC-100
Thermal Cycler (MJ วิจัยทาวน์ MA) สิบซ้ำได้ดำเนินการสำหรับแต่ละตัวอย่างเช่นเดียวกับการควบคุมเชิงลบ ผลิตภัณฑ์ PCR ถูกตรวจสอบ 1.2% ข่าวคราว agarose ทุกผลิตภัณฑ์ PCR สำหรับแต่ละตัวอย่างถูกรวบรวมและบริสุทธิ์โดยใช้วิธี PCR ชุดทำความสะอาด (Axygen) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต. ผลิตภัณฑ์ PCR บริสุทธิ์จากแต่ละตัวอย่างแล้วก็ติดใจบนแพลตฟอร์มIllumina Miseq PE250 โดย Majorbio Biopharm เทคโนโลยี จำกัด . (เซี่ยงไฮ้) และดิบข้อมูลpyrosequencing ถูกประมวลผลตามที่อธิบาย Zhao et al. (2014) และเทียน et al, (2015) ลำดับเฉพาะ> 150 bp ในความยาวที่มีคะแนนคุณภาพเฉลี่ย> 25 และไม่มีฐานคลุมเครือโทรถูกรวมอยู่ในการวิเคราะห์ที่ตามมา อ่านแต่ละตัวอย่างถูกจัดชิดอย่างรวดเร็วโดยใช้โครงสร้างมัธยมศึกษาตระหนัก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ร่วมแสดงโดยใช้โปรแกรม ptc-100
ความร้อนรอบ ( การวิจัย MJ Watertown MA ) สิบนาที
จำนวนสำหรับแต่ละตัวอย่าง ตลอดจนควบคุมลบ ผลิตภัณฑ์ทั้งหมดจะถูกตรวจสอบโดย
1.2% , เจล ทั้งหมดผลิตภัณฑ์
PCR แต่ละจำนวนรวมและทำให้บริสุทธิ์ การใช้ PCR
ล้าง Kit ( axygen ) ตามคำแนะนำของผู้ผลิต
นำดีเอ็นเอผลิตภัณฑ์จากแต่ละตัวอย่างถูก
ลำดับบน Illumina miseq pe250 แพลตฟอร์มโดย majorbio งาน
Technology Co . , Ltd . ( จีน ) , และวัตถุดิบ
ไพโรซีเควนซิงมีการประมวลผลข้อมูลตามที่อธิบายไว้โดยจ้าว et al .
( 2014 ) และเทียน et al . ( 2015 ) เฉพาะลำดับ > 150 BP ในความยาว
เฉลี่ยคะแนนคุณภาพ > 25 และไม่มี
ฐานกำกวมโทรถูกรวมอยู่ในการวิเคราะห์ที่ตามมา ที่อ่านแต่ละ
ตัวอย่างชิดโดยใช้โครงสร้างตระหนักรองอย่างรวดเร็ว