With the prevalence of drug resistance in bacteria, the need for
new antibiotics and new antibiotic targets is urgent and growing.
Bacterial Peptidyl-tRNA hydrolase (Pth1) is emerging as a promising
antibiotic target [1e4]. In bacteria, Pth1 performs the essential
function of hydrolyzing peptidyl-tRNA generated from premature
termination of protein biosynthesis and the expression of minigenes
or short ORFs [5e7]. Accumulation of peptidyl-tRNA is lethal
[8]. In the absence of Pth function, sequestration of tRNA as
peptidyl-tRNA leads to tRNA starvation and inhibition of protein
biosynthesis [9,10].
Though Pth activity is ubiquitous in all domains of life, most
bacteria contain only one highly conserved Pth1 enzyme. Select
strains have acquired a structurally unrelated Pth2 enzyme
[11], however functional redundancy has not been established.
The bacterial system differs greatly from the multicomponent
eukaryotic Pth systems. A Pth1 ortholog is present in eukaryotes,
however it is not essential. Similarly, the other well-characterized
Pth in eukaryotes, Pth2, is also not essential. Knockout of Pth1,
Pth2, or even both simultaneously do not affect viability in yeast
[12]. Thus, essential Pth1 activity in bacteria is only part of a more
complex and functionally redundant system in eukaryotes. While
contributing to the attractiveness of Pth1 as a new target for antibiotic
development, this also demonstrates the lack of understanding
regarding the eukaryotic Pth system.
Better understanding of the multi-component eukaryotic Pth
system is warranted to further validate and advance Pth1 as an
antibiotic target. From amino acid sequence alignment, PTRHD1,
or C2orf79, was identified as a human peptidyl-tRNA hydrolase.
Herein, we report the cloning, recombinant expression in bacteria,
purification, buffer solubility optimization, and nucleotide
binding of human PTRHD1. Expressed under control of a T7
promoter, over 60 mg of purified protein were produced per
liter of minimal media. PTRHD1 was purified to greater than 90%
in one chromatography step as determined from Coomassie
stained SDS-PAGE. To extend the usable lifetime, storage buffer
conditions that optimized long-term solubility were also
determined.
ที่มีความชุกของการดื้อยาในเชื้อแบคทีเรียที่จำเป็นในการ
ใช้ยาปฏิชีวนะใหม่และเป้าหมายใหม่ของยาปฏิชีวนะเป็นเรื่องเร่งด่วนและการเจริญเติบโต.
แบคทีเรีย peptidyl-tRNA hydrolase (Pth1) ที่เกิดขึ้นเป็นแนวโน้ม
เป้าหมายยาปฏิชีวนะ [1e4] ในแบคทีเรีย Pth1 ดำเนินการที่สำคัญ
การทำงานของไฮโดรไลซ์ peptidyl-tRNA ที่เกิดจากการคลอดก่อนกำหนด
สิ้นสุดของการสังเคราะห์โปรตีนและการแสดงออกของ minigenes
หรือ ORFs สั้น [5e7] การสะสมของ peptidyl-tRNA เป็นตาย
[8] ในกรณีที่ไม่มีฟังก์ชั่น Pth ที่อายัดของ tRNA เป็น
peptidyl-tRNA นำไปสู่การ tRNA ความอดอยากและการยับยั้งของโปรตีน
สังเคราะห์ [9,10].
แม้ว่ากิจกรรม Pth แพร่หลายในโดเมนทั้งหมดของชีวิตส่วนใหญ่
เชื้อแบคทีเรียที่มีเพียงหนึ่งเอนไซม์ Pth1 ป่าสงวน เลือก
สายพันธุ์ที่ได้มา Pth2 เอนไซม์ที่ไม่เกี่ยวข้องกับการก่อสร้าง
[11] แต่ความซ้ำซ้อนการทำงานยังไม่ได้รับการจัดตั้งขึ้น.
ระบบแบคทีเรียแตกต่างอย่างมากจากหลายองค์ประกอบ
ระบบ Pth eukaryotic ortholog Pth1 มีอยู่ในยูคาริโอ,
แต่มันไม่จำเป็น ในทำนองเดียวกันที่อื่น ๆ ที่มีลักษณะดี
Pth ในยูคาริโอ, Pth2 ยังไม่จำเป็น สิ่งที่น่าพิศวงของ Pth1,
Pth2 หรือแม้กระทั่งทั้งสองพร้อมกันไม่ได้ส่งผลกระทบต่อการมีชีวิตในยีสต์
[12] ดังนั้นกิจกรรม Pth1 สำคัญในเชื้อแบคทีเรียที่เป็นเพียงส่วนหนึ่งของการขึ้น
ระบบที่ซับซ้อนและซ้ำซ้อนหน้าที่ในยูคาริโอ ในขณะที่
เอื้อต่อความน่าสนใจของ Pth1 เป็นเป้าหมายใหม่สำหรับยาปฏิชีวนะ
พัฒนานี้ยังแสดงให้เห็นถึงการขาดความเข้าใจ
เกี่ยวกับระบบ Pth eukaryotic.
ความเข้าใจที่ดีขึ้นของ multi-component Pth eukaryotic
ระบบการรับประกันเพื่อตรวจสอบและล่วงหน้า Pth1 เป็น
เป้าหมายของยาปฏิชีวนะ . จากการจัดตำแหน่งกรดอะมิโนลำดับ PTRHD1,
หรือ C2orf79 ถูกระบุว่าเป็นมนุษย์ peptidyl-tRNA hydrolase.
ที่นี้เรารายงานการโคลนแสดงออก recombinant ในแบคทีเรีย
บริสุทธิ์, การเพิ่มประสิทธิภาพการละลายบัฟเฟอร์และเบื่อหน่าย
ที่มีผลผูกพันของมนุษย์ PTRHD1 แสดงภายใต้การควบคุมของ T7
ก่อการกว่า 60 mg ของโปรตีนบริสุทธิ์ที่ผลิตต่อ
ลิตรของสื่อน้อยที่สุด PTRHD1 บริสุทธิ์ไปมากกว่า 90%
ในขั้นตอนที่โครมาโตหนึ่งตามที่กำหนดจาก Coomassie
เปื้อน SDS-PAGE ที่จะขยายอายุการใช้งานสามารถใช้งานได้การจัดเก็บบัฟเฟอร์
เงื่อนไขที่ดีที่สุดที่สามารถในการละลายในระยะยาวนอกจากนี้ยัง
กำหนด
การแปล กรุณารอสักครู่..

ที่มีความชุกของการดื้อยาของแบคทีเรีย ความต้องการยาปฏิชีวนะยาปฏิชีวนะใหม่และเป้าหมายใหม่ ด่วน และการเติบโตแบคทีเรีย peptidyl ทีอาร์เอ็นเอไฮโดรเลส ( pth1 ) เป็นสัญญาใหม่ยาปฏิชีวนะกลุ่มเป้าหมาย [ 1e4 ] ในแบคทีเรีย pth1 การจำเป็นฟังก์ชันที่สร้างขึ้นจากการย่อย peptidyl ทีอาร์เอ็นเอ ก่อนกำหนดการสิ้นสุดของการสังเคราะห์โปรตีน และการแสดงออก minigenesหรือสั้น orfs [ 5e7 ] การสะสมของ peptidyl การเมารถคือตาย[ 8 ] ในการขาดของฟังก์ชันการเมารถ PTH , การเป็นpeptidyl ทีอาร์เอ็นเอนำไปสู่ความอดอยากการเมารถ และการยับยั้งโปรตีนทฤษฎีออโตมาตา [ 9,10 ]แม้ว่ากิจกรรม PTH เป็นที่แพร่หลายในโดเมนทั้งหมดของชีวิตมากที่สุดแบคทีเรียมีเพียงหนึ่งที่มีการอนุรักษ์ pth1 เอนไซม์ เลือกสายพันธุ์ที่ได้รับเอนไซม์ pth2 ซึ่งไม่เกี่ยวข้องกัน[ 11 ] แต่การทำงานซ้ำซ้อนไม่ได้รับการจัดตั้งขึ้นระบบแบคทีเรียแตกต่างอย่างมากจากองค์ประกอบระบบ PTH ยูคาริโอติก เป็น pth1 ortholog ยูแคริโอตคือปัจจุบัน ,แต่มันไม่จําเป็น ส่วนอื่น ๆ ด้วยลักษณะยูแคริโอต pth2 / , , ยังไม่สรุป ของ pth1 พิศวง ,pth2 หรือทั้งสองอย่างพร้อมกันไม่ได้มีผลต่อความมีชีวิตในยีสต์[ 12 ] ดังนั้น กิจกรรม pth1 จำเป็นในแบคทีเรีย เป็นเพียงส่วนหนึ่งของเพิ่มเติมที่ซับซ้อนและการทำงานที่ซ้ำซ้อนในระบบ ยูแคริโอต . ในขณะที่เกิดความน่าดึงดูดใจของ pth1 เป็นเป้าหมายใหม่สำหรับยาปฏิชีวนะการพัฒนานี้ยังแสดงให้เห็นถึงการขาดความเข้าใจเกี่ยวกับระบบ PTH ยูคาริโอติกความเข้าใจที่ดีขึ้นของ PTH โดย eukaryoticระบบการรับประกันเพิ่มเติมตรวจสอบล่วงหน้า pth1 เป็นยาปฏิชีวนะกลุ่มเป้าหมาย . จากลำดับกรดอะมิโน ptrhd1 , จัดหรือ c2orf79 ถูกระบุว่าเป็นมนุษย์การเมารถ peptidyl ไฮโดรเลส .ในที่นี้ เรารายงานการโคลนยีนการแสดงออกในแบคทีเรียการเพิ่มประสิทธิภาพการละลาย บัฟเฟอร์ และเบสptrhd1 ผูกพันของมนุษย์ แสดงภายใต้การควบคุมของขี้น.โปรโมเตอร์ กว่า 60 มิลลิกรัม โปรตีนที่ถูกผลิตต่อลิตรสื่อน้อยที่สุด ptrhd1 บริสุทธิ์ให้มากกว่า 90 %หนึ่งในขั้นตอนเหล่านี้น่าจะเป็นวิธีตามที่กำหนดจากย้อมสีเอนไซม์ . เพื่อยืดอายุการใช้งานที่สามารถใช้งานได้ , กระเป๋าบัฟเฟอร์เงื่อนไขที่เหมาะสมในระยะยาวยังมุ่งมั่น
การแปล กรุณารอสักครู่..
