The lactic acid bacterium Streptoco

The lactic acid bacterium Streptococcus thermophilus is widely used as a starter culture for the production of dairy products. Whole-genome sequencing is expected to utilize the genetic basis behind the metabolic functioning of lactic acid bacterium (LAB), for development of their use in biotechnological and probiotic applications. We sequenced the whole genome of Streptococcus thermophilus MTCC 5461, the strain isolated from a curd source, by 454 GS-FLX titanium and Ion Torrent PGM. We performed comparative genome analysis using the local BLAST and RDP for 16S rDNA comparison and by the RAST server for functional comparison against the published genome sequence of Streptococcus thermophilus CNRZ 1066. The whole genome size of S. thermophilus MTCC 5461 is of 1.73Mb size with a GC content of 39.3%. Streptococcal virulence-related genes are either inactivated or absent in the strain. The genome possesses coding sequences for features important for a probiotic organism such as adhesion, acid tolerance, bacteriocin production, and lactose utilization, which was found to be conserved among the strains MTCC 5461 and CNRZ 1066. Biochemical analysis revealed the utilization of 17 sugars by the bacterium, where the presence of genes encoding enzymes involved in metabolism for 16 of these 17 sugars were confirmed in the genome. This study supports the facts that the strain MTCC 5461 is nonpathogenic and harbors essential features that can be exploited for its probiotic potential.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

กรดแลคติกแบคทีเรีย Streptococcus thermophilus ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางว่าเป็นวัฒนธรรมที่เริ่มต้นสำหรับการผลิตผลิตภัณฑ์ที่ทำจากนม ทั้งจีโนมลำดับที่คาดว่าจะใช้พื้นฐานทางพันธุกรรมที่อยู่เบื้องหลังการทำงานของการเผาผลาญอาหารของแบคทีเรียกรดแลคติก (ห้องปฏิบัติการ) สำหรับการพัฒนาในการใช้งานของพวกเขาในการใช้งานเทคโนโลยีชีวภาพและโปรไบโอติกเราติดใจทั้งจีโนมของ Streptococcus thermophilus Mtcc 5461 สา​​ยพันธุ์ที่แยกได้จากแหล่งเต้าหู้โดย 454 ไทเทเนียม GS-flx และฝนตกหนักไอออน PGM เราดำเนินการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบการใช้ระเบิดท้องถิ่นและ RDP สำหรับการเปรียบเทียบ 16s rDNA และโดยเซิร์ฟเวอร์ Rast สำหรับการเปรียบเทียบการทำงานกับลำดับจีโนมตีพิมพ์ Streptococcus thermophilus cnrz 1066ขนาดจีโนมทั้งหมดของ s thermophilus Mtcc 5461 มีขนาด 1.73mb มีเนื้อหา GC 39.3% streptococcal ยีนที่เกี่ยวข้องกับความรุนแรงมีทั้งยกเลิกหรือไม่อยู่ในสายพันธุ์ จีโนมมีลำดับการเข้ารหัสสำหรับคุณสมบัติที่สำคัญสำหรับชีวิตโปรไบโอติกเช่นการยึดเกาะทนกรดผลิต bacteriocin และการใช้แลคโตสซึ่งพบว่ามีการอนุรักษ์สายพันธุ์ในหมู่ Mtcc 5461 และ cnrz 1066 การวิเคราะห์ทางชีวเคมีพบว่าการใช้ประโยชน์จาก 17 น้ำตาลจากแบคทีเรียที่มียีนเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญ 16 ของทั้ง 17 น้ำตาลได้รับการยืนยันในจีโนมการศึกษานี้สนับสนุนข้อเท็จจริงที่ว่าสายพันธุ์ Mtcc 5461 เป็น nonpathogenic และสถิตคุณสมบัติที่สำคัญที่สามารถใช้ประโยชน์สำหรับศักยภาพของโปรไบโอติก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อย่างกว้างขวางแบคทีเรียกรดแลกติก thermophilus อุณหภูมิใช้เป็นวัฒนธรรมเริ่มต้นในการผลิตผลิตภัณฑ์นม ลำดับทั้งกลุ่มคาดว่าจะใช้พื้นฐานทางพันธุกรรมหลังการทำงานของแบคทีเรียกรดแลกติก (LAB), ที่มีการเผาผลาญสำหรับพัฒนาใช้ใน biotechnological และการประยุกต์ใช้โปรไบโอติกส์ เราเรียงลำดับกลุ่มทั้งหมดของอุณหภูมิ thermophilus MTCC 5461 สายพันธุ์ที่แยกต่างหากจากแหล่งซีอิ้ว 454 GS FLX ไทเทเนียมและไอออน Torrent PGM เราทำการวิเคราะห์เปรียบเทียบกลุ่มที่ใช้การระเบิดและ RDP 16S rDNA เปรียบเทียบ และ RAST เซิร์ฟเวอร์สำหรับการเปรียบเทียบฟังก์ชันกับลำดับกลุ่มเผยแพร่ของอุณหภูมิ thermophilus CNRZ 1066 ขนาดทั้งจีโนมของ S. thermophilus MTCC 5461 ได้ขนาด 1.73Mb กับ GC เป็นเนื้อหา 39.3% ยีนที่เกี่ยวข้องกับ virulence streptococcal อาจจะยกเลิก หรือ absent ในสายพันธุ์ กลุ่มมีลำดับรหัสสำหรับคุณลักษณะที่สำคัญสำหรับสิ่งมีชีวิตโปรไบโอติกส์เช่นยึดเกาะ ยอมรับกรด bacteriocin ผลิต และใช้ ประโยชน์ย่อยแลคโตส ที่พบจะอยู่ระหว่างสายพันธุ์ MTCC 5461 และ CNRZ 1066 วิเคราะห์เชิงชีวเคมีเปิดเผยใช้น้ำตาล 17 โดยแบคทีเรีย ที่อยู่ของยีนเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องในการเผาผลาญใน 16 ของน้ำตาลเหล่านี้ 17 เข้ารหัสถูกยืนยันในกลุ่ม การศึกษานี้สนับสนุนข้อเท็จจริงที่ว่าสายพันธุ์ MTCC 5461 nonpathogenic และคุณลักษณะสำคัญแผ่นดินใหญ่ที่สามารถนำไปสำหรับของโปรไบโอติกส์ให้เกิด

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แบคทีเรียชนิดตะกั่วกรดแบบซีล thermophilus streptococcus เกี่ยวกับนมที่ถูกนำไปใช้เป็นวัฒนธรรมอาหารเรียกน้ำย่อยในการผลิตของ ผลิตภัณฑ์ นมกันอย่างกว้างขวาง ทั้งการจัดลำดับเป็นยีนคาดว่าจะใช้เป็นพื้นฐานทางพันธุกรรมที่อยู่เบื้องหลังการทำงานที่กว้างขวางของกรดเกี่ยวกับนมแบคทีเรีย( LAB )สำหรับการพัฒนาการใช้งานของพวกเขาในแอปพลิเคชันและชีวนะ biotechnologicalเราจะเรียงซีเควนซ์ยีนทั้งหมดของ streptococcus thermophilus mtcc 5461 สายพันธุ์นี้ถูกแยกออกจากแหล่งน้ำเต้าหู้โดย 454 ไอออนไหลเชี่ยว pgm. และไทเทเนียม GS - flx เราได้ทำการวิเคราะห์ยีน, VNC , RDP และเปรียบเทียบการใช้ระเบิดในท้องถิ่นสำหรับ 16 S rdna และการเปรียบเทียบโดย rast เซิร์ฟเวอร์สำหรับการเปรียบเทียบประโยชน์ใช้สอยกับลำดับยีนที่เผยแพร่ของ streptococcus thermophilus cnrz 1066ขนาดยีนทั้งหมดของ S . thermophilus mtcc 5461 มีขนาด 1.73 MB พร้อมด้วยเนื้อหาเฉพาะรุ่น GC ของ 39.3% ร้ายกาจยีนที่เกี่ยวข้องกับ streptococcal เป็นป้อมปราการหรือไม่อยู่ในความตึงเครียดได้ ซีเควนซ์ของยีนที่มีการเข้ารหัสสำหรับคุณสมบัติที่สำคัญสำหรับสัตว์ชีวนะเช่น ภาค ยานุวัติ Fault Tolerance กรด bacteriocin การผลิตและการใช้กำลังการผลิตแลคโตสซึ่งเป็นพื้นที่อยู่ท่ามกลางความตึงเครียดที่ mtcc cnrz 5461 และ 1066 . การวิเคราะห์ทางชีวเคมีเผยให้เห็นการใช้กำลังการผลิตที่ 17 น้ำตาลโดยแบคทีเรียที่มียีนมีส่วนเกี่ยวข้องกับการเข้ารหัสด้วยเอนไซม์ในเจริญเติบโตสำหรับ 16 ของ 17 น้ำตาลเหล่านี้เป็นการยืนยันในยีนการศึกษานี้สนับสนุนความจริงที่ว่าความตึงเครียดที่ mtcc 5461 คือ nonpathogenic และท่าเรือโดดเด่นไปด้วยที่สำคัญที่สามารถนำมาตักตวงผลประโยชน์สำหรับ ศักยภาพ ของชีวนะ