Freshwater fishes in India are poor

Freshwater fishes in India are poorly known and plagued by many unresolved cryptic species complexes that masks some latent and endemic species. Limitations in traditional taxonomy have resulted in this crypticism. Hence, molecular approaches like DNA barcoding, are needed to diagnose these latent species. We have analyzed 1383 barcode sequences of 175 Indian freshwater fish species available in the databases, of which 172 sequences of 70 species were generated. The congeneric and conspecific genetic divergences were calculated using Kimura's 2 parameter distance model followed by the construction of a Neighbor Joining tree using the MEGA 5.1. DNA barcoding principle at its first hand approach, led to the straightforward identification of 82% of the studied species with 2.9% (S.E = 0.2) divergence between the nearest congeners. However, after validating some cases of synonymy and mislabeled sequences, 5% more species were found to be valid. Sequences submitted to the database under different names were found to represent single species. On the other hand, some sequences of the species like Barilius barna, Barilius bendelisis and Labeo bata were submitted to the database under a single name but were found to represent either some unexplored species or latent species. Overall, 87% of the available Indian freshwater fish barcodes were diagnosed as true species in parity with the existing checklist and can act as reference barcode for the particular taxa. For the remaining 13% (21 species) the correct species name was difficult to assign as they depicted some erroneous identification and cryptic species complex. Thus, these barcodes will need further assay and inclusion of barcodes of more specimens from same and sister species.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ปลาน้ำจืดในประเทศอินเดียเป็นที่รู้จัก และเลือก โดยหลายพันธุ์ยังระทมคอมเพล็กซ์ที่มาสก์บางชนิดแฝงอยู่ และตรวจงาน ข้อจำกัดในระบบดั้งเดิมทำให้ crypticism นี้ ดังนั้น วิธีโมเลกุลเช่นซอฟต์แวร์ดีเอ็นเอ จะต้องวินิจฉัยชนิดเหล่านี้แฝงอยู่ เราได้วิเคราะห์ลำดับโค้ด 1383 175 อินเดียปลาชนิดในฐานข้อมูล ซึ่งมีสร้างลำดับ 172 70 พันธุ์ Divergences พันธุ congeneric และ conspecific มีคำนวณโดยใช้ของคิมุระโย 2 พารามิเตอร์จากแบบจำลองตาม ด้วยการก่อสร้างของต้นไม้เพื่อนบ้านรวมที่ใช้ 5.1 ร็อค หลักโค้ดีเอ็นเอที่วิธีของมือแรก นำไปสู่รหัสตรง 82% ของสปีชีส์ studied 2.9% (S.E = 0.2) divergence ระหว่าง congeners ที่ใกล้ที่สุด อย่างไรก็ตาม หลังจากการตรวจบางกรณีของ synonymy และ mislabeled ลำดับ ชนิด 5% พบถูกต้อง พบลำดับที่ส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อที่แตกต่างกันถึงชนิดเดียว ในทางกลับกัน ลำดับบางพันธุ์ชอบ Barilius barna, Barilius bendelisis และปลา bata ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อใดชื่อหนึ่ง แต่พบถึงบาง unexplored พันธุ์หรือสายพันธุ์ที่แฝงอยู่ โดยรวม 87% ของบาร์โค้ดมีอินเดียปลาถูกวินิจฉัยว่าเป็นพันธุ์แท้ในพาริตี้กับรายการตรวจสอบที่มีอยู่ และสามารถทำหน้าที่เป็นบาร์โค้ดสำหรับ taxa เฉพาะอ้างอิง ชื่อถูกต้องได้ไม่ยากที่จะกำหนดให้แสดงรหัสข้อผิดพลาดและชนิดซับซ้อนคลุมเครือบางเหลือ 13% (21 พันธุ์) ดังนั้น บาร์โค้ดเหล่านี้จะต้องเพิ่มเติมวิเคราะห์และรวมบาร์โค้ดไว้เป็นตัวอย่างเพิ่มเติมจากสายพันธุ์เดียวกัน และน้องสาว

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ปลาน้ำจืดในประเทศอินเดียเป็นที่รู้จักกันได้ไม่ดีและเต็มไปด้วยความเชิงซ้อนหลายสายพันธุ์ที่คลุมเครือได้รับการแก้ไขที่มาสก์บางสายพันธุ์ที่แฝงและถิ่น ข้อ จำกัด ในอนุกรมวิธานแบบดั้งเดิมที่มีผลใน crypticism นี้ ดังนั้นวิธีการเช่นโมเลกุลดีเอ็นเอบาร์โค้ด, มีความจำเป็นที่จะวินิจฉัยสายพันธุ์ที่แฝงเหล่านี้ เรามีการวิเคราะห์ลำดับ 1383 บาร์โค้ดจาก 175 สายพันธุ์ปลาน้ำจืดที่มีอยู่ในอินเดียฐานข้อมูลของที่ 172 ลำดับของ 70 ชนิดถูกสร้างขึ้น ความแตกต่างทางพันธุกรรม congeneric และชนิดเดียวกันนี้จะถูกคำนวณโดยใช้คิมูระ 2 พารามิเตอร์แบบระยะตามด้วยการก่อสร้างของเพื่อนบ้านเข้าร่วมต้นไม้โดยใช้ MEGA 5.1 หลักการดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่วิธีการที่มือแรกที่นำไปสู่​​การระบุตัวตนตรงไปตรงมาของ 82% ของการศึกษาสายพันธุ์ที่มี 2.9% (SE = 0.2) ความแตกต่างระหว่าง congeners ที่ใกล้ที่สุด อย่างไรก็ตามหลังจากการตรวจสอบบางกรณีของคำพ้องและลำดับการเรียกไม่ถูก, 5% สายพันธุ์อื่น ๆ พบว่ามีที่ถูกต้อง ลำดับส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อที่แตกต่างกันพบว่าเป็นตัวแทนของสายพันธุ์เดียว ในทางตรงกันข้ามลำดับบางสายพันธุ์เช่น Barilius สีน้ำตาล, Barilius bendelisis และ Labeo Bata ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อเดียว แต่พบว่าเป็นตัวแทนของทั้งบางสายพันธุ์ที่ยังมิได้สำรวจหรือสปีชีส์ที่แฝงอยู่ โดยรวม 87% ของผู้ที่มีบาร์โค้ดปลาน้ำจืดอินเดียได้รับการวินิจฉัยว่าเ​​ป็นสายพันธุ์ที่แท้จริงในความเท่าเทียมกันด้วยรายการตรวจสอบที่มีอยู่และสามารถทำหน้าที่เป็นบาร์โค้ดอ้างอิงสำหรับแท็กซ่าโดยเฉพาะอย่างยิ่ง สำหรับส่วนที่เหลืออีก 13% (21 ชนิด) ชื่อสปีชีส์ที่ถูกต้องเป็นเรื่องยากที่จะกำหนดตามที่พวกเขาเห็นภาพบางอย่างผิดพลาดและการระบุสายพันธุ์ที่คลุมเครือซับซ้อน ดังนั้นบาร์โค้ดเหล่านี้จะต้องมีการทดสอบต่อไปและรวมของบาร์โค้ดของตัวอย่างเพิ่มเติมจากสายพันธุ์เดียวกันและน้องสาว

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปลาในอินเดียได้รู้จักและ plagued โดยมากไม่ได้ตั้งใจแปลงชนิดเชิงซ้อนหน้ากากบางชนิดที่แฝงเร้น และถิ่น ข้อจำกัดในอนุกรมวิธานดั้งเดิมมีผลใน crypticism นี้ ดังนั้น แนวทาง barcoding ดีเอ็นเอโมเลกุล เช่น จะต้องวินิจฉัยชนิดแฝงเหล่านี้เรามี 1213 บาร์โค้ดข้อมูลลำดับ 175 อินเดียชนิดปลาน้ำจืดที่มีอยู่ในฐานข้อมูล ซึ่งเป็นลำดับ 70 ชนิดถูกสร้างขึ้น การ eneric conspecific ความแตกต่างทางพันธุกรรมและคำนวณโดยใช้คิมูระ 2 ระยะทางตามพารามิเตอร์รูปแบบการก่อสร้างของต้นไม้เพื่อนบ้านร่วมใช้ Mega 5.1 ดีเอ็นเอ barcoding หลักการที่เข้าหามือแรกของนำไปสู่การตรงไปตรงมาของ 82% ของการศึกษาชนิด 2.9% ( s.e = 0.2 ) ความแตกต่างระหว่าง congeners ที่ใกล้ที่สุด อย่างไรก็ตาม หลังจากการตรวจสอบบางกรณีของการมีความหมายเหมือนกัน และติดฉลากผิดลำดับ 5 % มากกว่าสายพันธุ์ที่พบเป็นใช้ได้ ลําดับที่ส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อที่แตกต่างกัน พบว่าเป็นชนิดเดียว บนมืออื่น ๆบางชนิด เช่น ลำดับของ barilius สีน barilius bendelisis สมัยจาโคเบียน , และเด็กที่ถูกส่งไปยังฐานข้อมูลภายใต้ชื่อเดียว แต่พบว่าเป็นตัวแทนของทั้งสปีชีส์ unexplored หรือแฝงบางชนิด โดยรวม87% ของของอินเดียปลาน้ำจืดบาร์โค้ดได้รับจริงชนิดในความเท่าเทียมกันกับรายการที่มีอยู่ และสามารถทำหน้าที่เป็นข้อมูลอ้างอิงบาร์โค้ดสำหรับซ่าโดยเฉพาะ สำหรับส่วนที่เหลืออีก 13% ( 22 ชนิด ) ชื่อสายพันธุ์ที่ถูกต้องคือยากที่จะกำหนดเป็นภาพบางส่วนที่ผิดพลาดและการระบุชนิดคลุมเครือซับซ้อน ดังนั้นบาร์โค้ดเหล่านี้จะต้องมีการทดสอบเพิ่มเติมและรวมบาร์โค้ดตัวอย่างเพิ่มเติมจากเดิม และน้องสาว ชนิด