By using Seq. Ed computer software.

By using Seq. Ed computer software. The nucleotide sequemces of TYLCV-DNA components A and B were compared with other reported geminivirus DNA sequences using the DNASIS program (Hitachi, Co.Ltd.).
RESULTS AND DISCUSSION
Nucleotide sequence of TYLCV-THL genomes
The sequence of both viral genomes in pTYLCA and pTYLCB are shown in Figuer 1. The component A comprises 2751 nucleotides and component B comprises 2737 nucleotides. The first base of the 5’ end of the intergenic non-coding region (Lazarowitz, 1987) was designed as nucleotide 1. This region occupied 326 nucleotides,in which a conserved 29 base-hairpin structure was detected (Figure 2). The results of Harr Plot construction showed that TYLCV-THL component A is most similar to the component A-DNA of tomato leaf curl virus –Australia isolate (TLCV-AUS) (Dry et al., 1993) and tomato yellow leaf curl virus-Israel isolate (TYLCV-ISR) (Navot et al., 1991) with 74% and 69% total nucleotide similarity respectively (Figure 3), despite that both latter geminiviruses had been reported to possess only one component which correspond to the component A of TYLCV-THL.
Alignment of the sequence of TYLCV-THL component B with those of bipartite geminiviruses showed that the B component of TYLCV-THL and tomato golden mosaic virus (TGMV) (Hamilton et al., 1984) as well as squash leaf curl virus (SqLCV-e) (Lazarowitz and Lazdins, 1991) were about 55% nucleotide homology. In addition, the conserved hairpin loop structure of component B of the latter showed only two bases differences from that of TYLCV-THL as following ; GGCCATCCGTA-TAATATTACCGGATGGCC.C-A

Coding region and putative translation products
The viral strands of both components A and B of TYLCV-THL have two opem reading frames (ORFs) with coding potential for proteins of molecular weight more than 10,000 daltons (Da). All ORFa are described in Table l and their organization along the genomes are depicted in Figure 4.

Direct comparison of individual ORFs of TYLCV-THL with those of other mono-and bi-partite geminivirus genomes showed a striking high degree of homology to TLCV-AUS and TYLCV-ISR, especially an ORF V1 which is the viral coat protein (Table 2). The only exception is that an ORF V2 of 10,730 Da of TYLCV-THL is moer closely related (86% homology) to an ORF V2 of 13.101 Da of cassava latent virus tomato-infected geminiviruses.

The presence of four ORFs in the complementary strand of component A is very similar to those observed for whitefly transmitted bipartite geminiviruses except for bean golen mosaic virus,BGMV (Howarth et al., 1985), mungbean yellow mosaic virus, MYMV and TGMV. The largest ORF (CI) encoded for protein molecular weight of 40,789 Da which located on the complementary strand of the A component showed 89% and 88% amino acid homology with CI ORF of TLCV-AUS and TYLCV-ISR, respectively. This CI polypeptide is believed to be a protein involving the replication of each viarl genomic components (Elmer et al., 1988).

ACKNOWLEDGEMENT
This work was financially supported by STDB. The authors sincerely thank Prof. Dr. Mlkegami for his excellent advice on computer analysis of DNA sequences. An automated DNA sequncer is the special donation of KU-JAPAN Phase II Projecs

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โดยใช้ซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ลำดับ Ed Sequemces นิวคลีโอไทด์ของดีเอ็นเอ TYLCV ส่วน A และ B ถูกเปรียบเทียบกับ geminivirus อื่น ๆ รายงานลำดับดีเอ็นเอโดยใช้โปรแกรม DNASIS (ฮิตาชิ Co.Ltd)ผลและการสนทนาลำดับของนิวคลีโอไทด์ของ TYLCV THL genomes แสดงลำดับของ genomes ไวรัสทั้งใน pTYLCA และ pTYLCB ใน Figuer 1 2751 นิวคลีโอไทด์ประกอบด้วย A ส่วนประกอบ และส่วนผสม B ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ 2737 ฐานแรกของปลาย 5' ของ intergenic ไม่ใช่รหัสภูมิภาค (Lazarowitz, 1987) ถูกออกแบบมาเป็นนิวคลีโอไทด์ 1 นี้ครอบครองพื้นที่ 326 นิวคลีโอไทด์ นำโครงสร้างพื้นฐานกิ๊บ 29 ถูกตรวจพบ (รูปที่ 2) ผลลัพธ์ของ Harr แผนก่อสร้างพบว่า TYLCV THL ส่วนประกอบเป็นส่วนใหญ่คล้ายกับคอมโพเนนต์ A-DNA ของไวรัสขดใบมะเขือเทศ – ออสเตรเลียแยก (TLCV-AUS) (แห้ง et al., 1993) และมะเขือเทศสีเหลืองใบม้วนไวรัสอิสราเอลแยก (TYLCV-ISR) (Navot et al., 1991) มีความคล้ายกันนิวคลีโอไทด์ทั้งหมด 74% และ 69% ตามลำดับ (รูปที่ 3), ทั้ง ๆ ที่ geminiviruses ทั้งหลังได้รับรายงานมีส่วนประกอบเดียวซึ่งสอดคล้องกับส่วนประกอบ A ของ TYLCV-THL จัดลำดับของส่วนประกอบของ TYLCV THL B กับ geminiviruses สองส่วนพบว่า B ส่วนประกอบของ TYLCV THL และมะเขือเทศโมเสกทองไวรัส (TGMV) (แฮมิลตัน et al., 1984) เป็นสควอชใบไม้ม้วนไวรัส (SqLCV-e) (Lazarowitz และ Lazdins, 1991) มีประมาณ 55% homology นิวคลีโอไทด์ นอกจากนี้ โครงสร้างการวนรอบกิ๊บนำประกอบ B ของหลังพบเพียงสองฐานแตกต่างจากของ TYLCV THL ดังต่อไปนี้ GGCCATCCGTA-TAATATTACCGGATGGCC C-Aรหัสภูมิภาคและผลิตภัณฑ์แปล putative Strands ไวรัสของชิ้นส่วน A และ B ของ TYLCV-THL มีสอง opem อ่านเฟรม (ORFs) กับรหัสศักยภาพสำหรับโปรตีนของน้ำหนักโมเลกุลมากกว่า 10000 daltons (ดา) ORFa ทั้งหมดไว้ในตาราง l และองค์กรของพวกเขาตาม genomes จะแสดงในรูปที่ 4 ตรงเปรียบเทียบของแต่ละ ORFs ของ TYLCV-THL กับพิมพ์อื่น ๆ - และ geminivirus bi ฟุตบอล genomes แสดงให้เห็นระดับสูงที่โดดเด่นของ homology TYLCV ISR โดยเฉพาะอย่างยิ่ง V1 ORF และภาค TLCV ซึ่งเป็นโปรตีนไวรัสตรา (ตารางที่ 2) ข้อยกเว้นเดียวคือ ว่ามี ORF V2 ของ 10,730 ดาของ TYLCV-THL moer สัมพันธ์ (homology 86%) การมี ORF V2 ของ 13.101 ดาของ geminiviruses ติดมะเขือเทศมันสำปะหลังไวรัสแฝงอยู่ ของ ORFs สี่ในสาระเพิ่มเติมของ A ส่วนประกอบคล้ายคลึงกับผู้สังเกตสำหรับ geminiviruses สองส่วน whitefly ส่งยกเว้นไวรัสโมเสกถั่ว golen, BGMV (Howarth et al., 1985), ถั่วเหลืองไวรัสโมเสก MYMV และ TGMV ได้ เข้าใหญ่ที่สุด ORF (CI) สำหรับน้ำหนักโมเลกุลโปรตีนของดา 40,789 ที่อยู่สแตรนด์เสริมประกอบ A พบว่า 88% กรดอะมิโน homology กับ CI ORF ของ TLCV-ต. TYLCV ISR และ 89% ตามลำดับ Polypeptide CI นี้ถือเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบของส่วนประกอบแต่ละ viarl genomic (เอลเมอ et al., 1988)ยอมรับ งานนี้รับการสนับสนุนทางการเงินจาก STDB ผู้เขียนขอขอบคุณรศ.ดร. Mlkegami สำหรับคำแนะนำของเขายอดเยี่ยมบนคอมพิวเตอร์การวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเออย่างจริงใจ Sequncer มีดีเอ็นเออัตโนมัติเป็นเงินบริจาคพิเศษของญี่ปุ่นมก.ระยะ II Projecs

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดยใช้ชื่อเรื่องชื่อเรื่อง ซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์เอ็ด เบื่อหน่าย sequemces ขององค์ประกอบ TYLCV ดีเอ็นเอ A และ B ถูกนำมาเปรียบเทียบกับคนอื่น ๆ รายงานเจมิลำดับดีเอ็นเอโดยใช้โปรแกรม DNASIS (ฮิตาชิ, Co.Ltd.).
ผลการอภิปรายและเบสลำดับของ TYLCV-THL จีโนมลำดับของจีโนมของไวรัสทั้งในpTYLCA และ pTYLCB ที่แสดงอยู่ใน Figuer 1. ส่วนประกอบประกอบด้วยนิวคลีโอ 2751 และส่วนประกอบ B ประกอบด้วยนิวคลีโอ 2737 ฐานแรกของปลาย 5 'ของภูมิภาค intergenic ที่ไม่ได้เข้ารหัส (Lazarowitz, 1987) ได้รับการออกแบบเป็นเบื่อหน่าย 1. ภาคนี้ครอบครอง 326 นิวคลีโอซึ่งในการอนุรักษ์โครงสร้าง 29 กิ๊บฐานที่ตรวจพบ (รูปที่ 2) ผลของการก่อสร้างแปลง Harr แสดงให้เห็นว่าองค์ประกอบ TYLCV-THL เป็นส่วนใหญ่คล้ายกับองค์ประกอบ A-ดีเอ็นเอของเชื้อไวรัสใบมะเขือเทศขด -Australia แยก (TLCV-AUS) (แห้ง et al., 1993) และมะเขือเทศใบเหลืองขด virus- อิสราเอลแยก (TYLCV-ISR) (Navot et al., 1991) กับ 74% และ 69% คล้ายคลึงกันเบื่อหน่ายรวมตามลำดับ (รูปที่ 3) แม้จะมีเจมินีว่าทั้งสองหลังได้รับรายงานว่าจะมีเพียงองค์ประกอบหนึ่งซึ่งสอดคล้องกับส่วนประกอบของ TYLCV-THL. การจัดลำดับของ TYLCV-THL ส่วนประกอบ B กับบรรดาเจมิฝ่ายแสดงให้เห็นว่าองค์ประกอบ B ของ TYLCV-THL และมะเขือเทศไวรัสกระเบื้องโมเสคสีทอง (TGMV) (แฮมิลตัน et al., 1984) เช่นเดียวกับสควอชขดใบ ไวรัส (SqLCV อี) (Lazarowitz และ Lazdins, 1991) ประมาณ 55% ที่คล้ายคลึงกันเบื่อหน่าย นอกจากนี้โครงสร้างห่วงกิ๊บอนุรักษ์ขององค์ประกอบ B ของหลังแสดงให้เห็นความแตกต่างเพียงสองฐานจากที่ของ TYLCV-THL ดังต่อไปนี้ GGCCATCCGTA-TAATATTACCGGATGGCC.CA เข้ารหัสภูมิภาคและผลิตภัณฑ์แปลสมมุติเส้นไวรัสของทั้งสองชิ้นส่วน A และ B ของ TYLCV-THL มีสองเฟรมอ่าน opem (ORFs) ที่มีการเข้ารหัสที่มีศักยภาพสำหรับโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลมากกว่า 10,000 ดาลตัน (ดา) ทั้งหมด Orfa อธิบายไว้ในตารางต่อลิตรและองค์กรของพวกเขาพร้อมจีโนมจะปรากฎในรูปที่ 4 การเปรียบเทียบโดยตรงของ ORFs บุคคลของ TYLCV-THL กับผู้เดียวและสอง partite จีโนมของเจมิอื่น ๆ ที่แสดงให้เห็นในระดับสูงที่โดดเด่นของที่คล้ายคลึงกันเพื่อ TLCV- ออสเตรเลียและ TYLCV-ISR โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ORF V1 ซึ่งเป็นโปรตีนหุ้มไวรัส (ตารางที่ 2) ยกเว้นอย่างเดียวคือว่า ORF V2 ของ 10730 ดาของ TYLCV-THL เป็น moer เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด (คล้ายคลึงกัน 86%) เพื่อ ORF V2 ของ 13.101 ดามันสำปะหลังไวรัสแฝงเจมิมะเขือเทศที่ติดเชื้อ. การปรากฏตัวของสี่ ORFs ในสาระที่สมบูรณ์ของ ส่วนประกอบจะคล้ายกับที่พบแมลงหวี่ขาวสำหรับส่งเจมิฝ่ายยกเว้นไวรัสถั่ว golen, BGMV (Howarth et al., 1985), ถั่วเขียวไวรัสกระเบื้องโมเสคสีเหลือง MYMV และ TGMV ORF ที่ใหญ่ที่สุด (CI) เข้ารหัสโปรตีนน้ำหนักโมเลกุล 40,789 ดาซึ่งตั้งอยู่บนฝั่งที่สมบูรณ์ขององค์ประกอบที่แสดงให้เห็นว่า 89% และ 88% ที่คล้ายคลึงกันกรดอะมิโนที่มี CI ORF ของ TLCV-AUS และ TYLCV-ISR ตามลำดับ polypeptide CI นี้เชื่อว่าจะเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการจำลองแบบของส่วนประกอบแต่ละ viarl จีโนม (ที่เอลเมอ et al., 1988). รับทราบผลงานชิ้นนี้ได้รับการสนับสนุนทางการเงินจาก STDB ผู้เขียนขอขอบคุณดร Mlkegami สำหรับคำแนะนำที่ยอดเยี่ยมของเขาในการวิเคราะห์คอมพิวเตอร์ของลำดับดีเอ็นเอ sequncer ดีเอ็นเออัตโนมัติบริจาคพิเศษ KU-JAPAN ระยะที่สอง Projecs

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดยการใช้ seq . เอ็ด ซอฟต์แวร์คอมพิวเตอร์ ยีนที่ sequemces ของ tylcv-dna ชิ้นส่วน A และ B เปรียบเทียบกับอื่น ๆรายงาน geminivirus ลำดับดีเอ็นเอโดยใช้โปรแกรม dnasis ( ประเทศไทยจำกัด )

ลำดับนิวคลีโอไทด์ของผลลัพธ์และการอภิปราย tylcv-thl จีโนมลำดับจีโนมของไวรัส
ทั้งในและ ptylca ptylcb แสดงใน figuer 1ส่วนประกอบที่ประกอบด้วยความเป็นมาองค์ประกอบ B ประกอบด้วยนิวคลีโอไทด์ นิวคลีโอไทด์ และ 2737 . ฐานแรกของ 5 ' ปลายส่าไม่ใช่ภาคนะครับ ( lazarowitz , 1987 ) ถูกออกแบบมาเป็นเบส 1 ภาคนี้ครอบครอง 326 นิวคลีโอไทด์ ซึ่งศึกษา 29 กิ๊บฐานโครงสร้างที่ตรวจพบ ( รูปที่ 2 )ผลของการสร้างพล็อต แฮร์ พบว่าเป็นส่วนประกอบ tylcv-thl คล้ายกันมากที่สุด ส่วนเอ ดีเ นเอของไวรัสใบหงิกมะเขือเทศ–ออสเตรเลียแยก ( tlcv-aus ) ( บริการ et al . , 1993 ) และไวรัสใบหงิกเหลืองมะเขือเทศอิสราเอลแยก ( tylcv-isr ) ( navot et al . , 1991 ) 74% และ 69% คล้ายคลึงกันทั้งหมด เบส ตามลำดับ ( รูปที่ 3 )แม้จะมีทั้งหลัง geminiviruses ได้รับรายงานมีเพียงองค์ประกอบหนึ่งที่สอดคล้องกับองค์ประกอบของ tylcv-thl .
การเรียงตัวของลำดับ tylcv-thl ส่วน B นั้นแยกเป็นสองส่วน geminiviruses พบว่าส่วนประกอบของ tylcv-thl B และมะเขือเทศทอง mosaic virus ( tgmv ) ( แฮมิลตัน et al . , 1984 ) เป็นใบฟักทอง ม้วนไวรัส ( sqlcv-e ) ( lazarowitz lazdins และ ,1991 ) มีประมาณ 55% ซึ่งเบส . นอกจากนี้ โครงสร้างของส่วนอนุรักษ์กิ๊บวง B หลังพบว่ามีเพียงสองฐานความแตกต่างจากที่ของ tylcv-thl ดังนี้ ggccatccgta-taatattaccggatggcc . c-a นะครับ

) และผลิตภัณฑ์เส้นใย
แปลถักแบบทั้งชิ้นส่วน A และ B ของ tylcv-thl ได้สองเฟรม ( อ่าน opem orfs ) ด้วยการเข้ารหัสโปรตีนที่มีน้ำหนักโมเลกุลมากกว่า 10 , 000 ดาลตัน ( Da ) ทั้งหมด orfa อธิบายไว้ในโต๊ะผมและองค์กรของพวกเขาตามหาจะกล่าวถึงใน

รูปที่ 4การเปรียบเทียบโดยตรงของบุคคล orfs ของ tylcv-thl กับของอื่น ๆโมโน และบีซึ่งแบ่งออกเป็นส่วนๆ geminivirus จีโนมพบระดับสูงที่โดดเด่นของตัว tlcv-aus tylcv-isr และโดยเฉพาะอย่างยิ่งมี ORF V1 ซึ่งเป็นโปรตีนที่หุ้มไวรัส ( ตารางที่ 2 ) ยกเว้นว่า ORF V2 ของ 10730 ดาของ tylcv-thl Moer จะเกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด ( ร้อยละ 86 เป็น ) กับ ORF V2 ของ 13101 ดาของมะเขือเทศ มันสำปะหลังแฝงไวรัสที่ติดเชื้อ geminiviruses

มี 4 orfs ในสาระเสริมส่วนประกอบเป็นคล้ายกันมากกับผู้ที่พบในแมลงหวี่ขาวสัมพันธ์ทวิภาคี geminiviruses ยกเว้นถั่วทอง mosaic virus , bgmv ( โฮวาร์ต et al . , 1985 ) , ถั่วเขียวสีเหลืองฝังไวรัส mymv และ tgmv . ที่ใหญ่ที่สุดและ ORF ( CI ) เข้ารหัสโปรตีนน้ำหนักโมเลกุล 40ท่านดา ซึ่งตั้งอยู่บนชายหาด เรื่องขององค์ประกอบที่พบ 89 % และ 88% ซึ่งมีกรดอะมิโนและ ORF ของ tlcv-aus และ tylcv-isr ตามลำดับ นี้สายพอลิเพปไทด์ที่เชื่อว่าเป็นโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างส่วนประกอบแต่ละ viarl ( เอลเมอร์ et al . , 1988 )

ขอบคุณ
งานนี้ก็ยังมีการสนับสนุนโดย stdb . ผู้เขียนอย่างจริงใจขอบคุณดร.mlkegami สำหรับคำแนะนำที่ยอดเยี่ยมของเขาในคอมพิวเตอร์วิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอ . ดีเอ็นเอแบบอัตโนมัติ sequncer เป็นบริจาคพิเศษของ ku-japan ระยะที่ 2 projecs