3.3. Protein identification by mass

3.3. Protein identification by mass spectrometry
The protein spots that were excised from the gels were analyzed
after proteolysis by LC–MS/MS. The calibration was external, and
the data were collected in linear mode. The empirical peptide mass
values were matched with the theoretical digested mass and
database sequence information by a Mascot search. The results
showed that the closest homologues of the six proteins found only
in Br no. 19 were a hypothetical protein [O. sativa Japonica Group]
(spot S1), NBS-LRR-like protein A [O. sativa Indica Group] (spot S2),
a putative isoleucine-tRNA ligase [O. sativa Japonica Group] (spot S3),
a hydroxyproline-rich glycoprotein-like protein [O. sativa Japonica
Group] (spot S4), a hypothetical protein [O. sativa Japonica Group]
(spot S5) and hypothetical protein OsJ_04608 [O. sativa Japonica
Group] (spot S6). In addition, the closest homologues of the proteins
that accumulated at higher levels in Br no. 19 than in RD 6 were
hypothetical protein OsJ_02230 [O. sativa Japonica Group] (spot M1),
a hypothetical protein [O. sativa Japonica Group] (spot M2),
OSJNBa0052O21.10 [O. sativa Japonica Group] (spot M3), hypothetical
protein OsI_12770 [O. sativa Japonica Group] (spot M4), a hypothetical
protein [O. sativa Japonica Group] (spot M5) and OSJ

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.3 รหัสโปรตีน โดยรเมทจุดโปรตีนที่ถูก excised จากเจได้วิเคราะห์หลังจาก proteolysis โดย LC – MS/MS การปรับเทียบภายนอก และข้อมูลถูกรวบรวมในมุมมองเชิง เพปไทด์รวมมวลค่าถูกจับคู่กับที่ทฤษฎีย่อยจำนวนมาก และรายละเอียดลำดับฐานข้อมูล โดยการค้นหาแมสคอท ผลลัพธ์พบว่า homologues ใกล้เคียงที่สุดของโปรตีน 6 พบเท่านั้นห้องหมายเลข 19 ได้โปรตีนสมมุติ [โอซา Japonica กลุ่ม](จุด S1), โปรตีนเช่นไซด์ LRR เป็น [โอซา กลุ่ม Indica] (สปอ S2),ligase putative isoleucine-tRNA [โอซา กลุ่ม Japonica] (สปอ S3),มีโปรตีนไกลโคโปรตีนเช่น hydroxyproline ริช [โอซา Japonicaกลุ่ม] (จุด S4), โปรตีนสมมุติ [โอซา Japonica กลุ่ม](สปอ S5) และโปรตีนสมมุติ OsJ_04608 [โอซา Japonicaกลุ่ม] (จุด S6) นอกจากนี้ homologues ใกล้เคียงที่สุดของโปรตีนที่สะสมที่ 19 หมายเลขห้องระดับสูงกว่าใน RD 6สมมุติโปรตีน OsJ_02230 [โอซา กลุ่ม Japonica] (จุด M1),โปรตีนสมมุติ [โอซา กลุ่ม Japonica] (สปอ M2),OSJNBa0052O21.10 [โอซา กลุ่ม Japonica] (สปอ M3), สมมุติโปรตีน OsI_12770 [โอซา กลุ่ม Japonica] (สปอ M4), การสมมุติโปรตีน [โอซา กลุ่ม Japonica] (สปอ M5) และ OSJ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.3 การระบุโปรตีนโดยมวลสาร
จุดโปรตีนที่ได้จากพอร์เจลที่ได้มาวิเคราะห์
โดยหลังจาก proteolysis LC-MS / MS การสอบเทียบเป็นภายนอกและ
ข้อมูลที่ถูกเก็บไว้ในโหมดการเชิงเส้น เปปไทด์มวลเชิงประจักษ์
ค่าถูกจับคู่กับมวลย่อยในทางทฤษฎีและ
ข้อมูลลำดับฐานข้อมูลโดยค้นหามิ่งขวัญ ผล
การศึกษาพบว่าใกล้เคียงที่สุดของ homologues หกโปรตีนพบเฉพาะ
ในสาขาที่ไม่มี 19 เป็นโปรตีนการประมาณการ [ทุม sativa Japonica กลุ่ม]
(จุด S1) โปรตีน NBS-LRR เหมือน [ทุม sativa Indica กลุ่ม] (จุด S2),
ไอโซลิวซีน-tRNA ลิกาเซสมมุติ [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด S3),
ไกลโคโปรตีนโปรตีนเหมือน hydroxyproline ที่อุดมไปด้วย [ทุม sativa Japonica
กลุ่ม] (จุด S4), การโปรตีนการประมาณการ [ทุม sativa Japonica กลุ่ม]
(จุด S5) และโปรตีน OsJ_04608 การประมาณการ [ทุม sativa Japonica
กลุ่ม] (จุด S6) นอกจากนี้ homologues ที่ใกล้เคียงที่สุดของโปรตีน
ที่สะสมในระดับที่สูงขึ้นในสาขาที่ไม่มี 19 กว่าใน RD ที่ 6 มี
โปรตีน OsJ_02230 การประมาณการ [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด M1),
โปรตีนการประมาณการ [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด M2)
OSJNBa0052O21.10 [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด M3) สมมุติ
โปรตีน OsI_12770 [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด M4) สมมุติ
โปรตีน [ทุม sativa Japonica กลุ่ม] (จุด M5) และ OSJ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.3 . โปรตีน โดยมวลสาร
โปรตีนจุดที่ถูกตัดจากเจลวิเคราะห์
หลังจากโปรตีโ ลซิสโดย LC MS / นางสาว–สอบเทียบอยู่ภายนอกและ
ข้อมูลในโหมดการเชิงเส้น เปปไทด์เชิงมวล
ค่าตรงกับทฤษฎีย่อยมวลและ
ข้อมูลลำดับฐานข้อมูล โดยสำหรับการค้นหา ผลลัพธ์
พบว่าในใกล้ของโปรตีนที่พบเฉพาะในหก
br ฉบับที่ 19 เป็นสมมุติโปรตีน [ ญี่ปุ่น ]
( O . sativa กลุ่มจุด S1 ) , NBS lrr เหมือนกับโปรตีน [ กลุ่ม ] ( O . sativa indica จุด S2
เป็น isoleucine ) ซึ่งการเมารถไลเกส [ กลุ่ม ] ( O . sativa จาปจุด S3 ) เป็นไกลโคโปรตีน เช่น ไฮดรอกซิโพรลีน , อุดมไปด้วยโปรตีน
[ ]
( O . sativa ญี่ปุ่นกลุ่มจุด S4 ) สมมุติโปรตีน [ Oกลุ่ม : การศึกษา ]
( จุดสมมุติ S5 ) และโปรตีน osj_04608 [ ญี่ปุ่น ] ( O . sativa
กลุ่มจุด s6 ) นอกจากนี้ ในที่ใกล้ที่สุดของโปรตีนที่สะสมในระดับที่สูงขึ้นใน
br ฉบับที่ 19 กว่า กข 6 มี
สมมุติโปรตีน osj_02230 [ กลุ่ม ] ( O . sativa จาปจุด M1 )
สมมติฐานโปรตีน [ ญี่ปุ่น ] ( O . sativa กลุ่มจุดตารางเมตร ) ,
osjnba0052o21.10 [ Oกลุ่ม , การศึกษา ] ( จุดสมมุติ
M3 ) , โปรตีน osi_12770 [ ญี่ปุ่น ] ( O . sativa กลุ่มจุด M4 ) สมมุติ
โปรตีน [ ญี่ปุ่น ] ( O . sativa กลุ่มจุด osj M5 ) และ