concentration of spiked internal st

concentration of spiked internal standards. Mass spectral matching was performed with the
Samuel Roberts Noble Foundation metabolite library [28]. MetaboAnalyst 2.0 was used to for
multivariate and univariate statistical analyses [29]. Data were log transformed then meancentered
and divided by the standard deviation of each variable to highlight relative changes in
metabolite profiles across treatments. Data were analyzed by a Fisher’s LSD post-hoc analysis
of variance (ANOVA) with α equal to 0.05 and a principle components analysis with 95% confidence
threshold. Dendrograms were constructed using the Spearman distance measure and
Ward clustering algorithm.
Evaluation of selected carbohydrates on growth rate of P. capsici
Carbohydrate plates were prepared by autoclaving 12 g agar per L and 1% (w.v.) glucose, sucrose,
melezitose, galactose, trehalose, raffinose, sorbitol, or glycerol with 10 mL of media
poured in each plate. A single two mm plug from the edge of a P. capsici colony growing on
water agar, was transferred to each plate with four replicates of each sugar. Plates were sealed
with parafilm and incubated at 28°C for 5 days. The experiment was repeated with independently
prepared plates at a separate time point and two measurements were taken for the diameter
of each colony. Data were analyzed by a student’s t test with α equal to 0.05 to determine
significant differences in growth rate on selected sugars compared to water agar and graphed
using Microsoft Excel for Mac 2011.
Supporting Information
S1 Text. Data table containing metabolite concentrations used for Figs 5, 6, 7 and 8. Data
were normalized to tissue weight and relative concentration of spiked internal standards and
were then log transformed, mean-centered and divided by the standard deviation of each variable
to highlight relative changes in metabolite profiles across treatments.
(XLSX)
Acknowledgments
The authors would like to thank Dr. Lloyd W. Sumner for generously providing the Samuel
Roberts Noble Foundation metabolite library and the New Mexico State Agricultural Experimental
Station, the NMSU Center for Animal Health and Food Safety and the New Mexico
Chile Association for research funding.
Author Contributions
Conceived and designed the experiments: RAS JJR OH TS SS NG. Performed the experiments:
RAS BD. Analyzed the data: RAS BD. Contributed reagents/materials/analysis tools: JJR TS
OH. Wrote the paper: RAS OH TS BD NG SS JJR.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ความเข้มข้นมาตรฐานภายในถูกแทง จับคู่มวลสเปกตรัมทำด้วยการมูลนิธิโนเบลโรเบิตส์ Samuel metabolite ไลบ [28] MetaboAnalyst 2.0 ใช้สำหรับmultivariate และอย่างไร univariate สถิติวิเคราะห์ [29] ข้อมูลถูกบันทึกแล้วเปลี่ยน meancenteredและถูกแบ่ง โดยส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของแต่ละตัวแปรจะเน้นเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์โพรไฟล์ metabolite ในการรักษา มีวิเคราะห์ข้อมูล โดยการวิเคราะห์แบบเฉพาะกิจลง LSD ของฟิชเชอร์ผลต่าง (การวิเคราะห์ความแปรปรวน) พร้อมด้วยกองทัพเท่ากับ 0.05 และการวิเคราะห์ส่วนประกอบหลักที่ มีความเชื่อมั่น 95%ขีดจำกัดการ Dendrograms ถูกสร้างขึ้นโดยใช้หน่วยวัดระยะทาง Spearman และอัลกอริทึมที่ระบบคลัสเตอร์การ Wardการประเมินเลือกคาร์โบไฮเดรตในอัตราการเติบโตของ P. capsiciแผ่นคาร์โบไฮเดรตถูกเตรียม โดย autoclaving agar 12 กรัมต่อ L และกลูโคส 1% (w.v.) ซูโครสmelezitose กาแล็กโทส trehalose, raffinose ซอร์บิทอล หรือกลีเซอรกับ 10 mL ของสื่อpoured ในแต่ละแผ่น มม. 2 ตัวเดียวต่อจากขอบของโคโลนี P. capsici ที่เติบโตในน้ำ agar ถูกโอนย้ายไปแต่ละจานด้วยเหมือนกับสี่น้ำตาลแต่ละ แผ่นถูกปิดผนึกมี parafilm และ incubated ที่ 28° C 5 วัน ทดลองถูกทำซ้ำด้วยต่างหากแผ่นที่เตรียมไว้ที่จุดเวลาที่แยกต่างหากและวัดที่สองที่ถ่ายสำหรับเส้นผ่าศูนย์กลางของแต่ละโคโลนี มีวิเคราะห์ข้อมูล โดยการทดสอบ t ของนักเรียนเท่ากับ 0.05 เมื่อต้องการกำหนดด้วยกองทัพความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในอัตราการเติบโตในน้ำตาลเลือกเปรียบเทียบกับน้ำ agar และใช้สร้างกราฟการใช้ Microsoft Excel สำหรับ Mac 2011ข้อมูลสนับสนุนข้อความ S1 ตารางข้อมูลที่ประกอบด้วยความเข้มข้นของ metabolite ที่ใช้มะเดื่อ 5, 6, 7 และ 8 ข้อมูลได้ตามปกติน้ำหนักเนื้อเยื่อและสัมพันธ์กับความเข้มข้นของมาตรฐานภายในถูกแทง และถูกแล้วล็อกแปลง เฉลี่ยกึ่งกลาง และถูกแบ่ง โดยส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของแต่ละตัวแปรเน้นการเปลี่ยนแปลงในโพรไฟล์ metabolite ญาติข้ามรักษา(XLSX)ตอบผู้เขียนต้องขอขอบคุณดร.ลอยด์ W. ซัมเนอร์ให้ Samuel กว้างมูลนิธิโนเบลโรเบิตส์ metabolite ไลบรารีและนิวเม็กซิโกรัฐเกษตรทดลองสถานี ศูนย์ NMSU สัตว์ และความปลอดภัยของอาหารนิวเม็กซิโกเชื่อมโยงประเทศชิลีสำหรับทุนวิจัยผลงานผู้เขียนรู้สึก และออกแบบการทดลอง: รา JJR OH TS SS NG ดำเนินการทดลอง:รา Analyzed bd.ข้อมูล: Contributed bd.รา reagents/วัสดุ/วิเคราะห์: JJR TSโอ้ เขียนกระดาษ: รา OH TS BD JJR NG SS

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ความเข้มข้นของมาตรฐานภายในถูกแทง การจับคู่สเปกตรัมมวลได้รับการดำเนินการกับซามูเอลโรเบิร์ตห้องสมุด metabolite มูลนิธิโนเบิล [28]
MetaboAnalyst 2.0
ได้ถูกใช้ในสำหรับการวิเคราะห์ทางสถิติหลายตัวแปรและunivariate [29] ข้อมูลเข้าสู่ระบบเปลี่ยน meancentered
แล้วหารด้วยค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของตัวแปรแต่ละที่จะเน้นการเปลี่ยนแปลงเมื่อเทียบกับในโปรไฟล์
metabolite ข้ามการรักษา วิเคราะห์ข้อมูลโดยการโพสต์-hoc LSD
ฟิชเชอร์การวิเคราะห์ความแปรปรวน(ANOVA) กับαเท่ากับ 0.05 และการวิเคราะห์องค์ประกอบหลักการมีความเชื่อมั่น 95%
เกณฑ์ Dendrograms
ถูกสร้างขึ้นโดยใช้การวัดระยะทางสเปียร์แมนและขั้นตอนวิธีการจัดกลุ่มวอร์ด.
การประเมินผลของคาร์โบไฮเดรตที่เลือกอยู่กับอัตราการเจริญเติบโตของพี capsici
แผ่นคาร์โบไฮเดรตที่ถูกจัดทำขึ้นโดยนึ่งฆ่าเชื้อ 12 กรัมวุ้นต่อลิตรและ 1% (เวสต์เวอร์จิเนีย) กลูโคสซูโครส
melezitose, กาแลคโต, ทรีฮาโล , raffinose, ซอร์บิทอหรือกลีเซอรอล 10
มิลลิลิตรของสื่อเทในแต่ละจาน เดียวเสียบสองมิลลิเมตรจากขอบของอาณานิคมพี capsici
การเจริญเติบโตในอาหารเลี้ยงเชื้อน้ำถูกย้ายไปแต่ละจานที่มีสี่ซ้ำของแต่ละน้ำตาล แผ่นถูกปิดผนึกด้วย parafilm และบ่มที่ 28 องศาเซลเซียสเป็นเวลา 5 วัน การทดลองซ้ำกับอิสระจานที่เตรียมไว้ที่จุดเวลาที่แยกต่างหากและสองวัดที่ถูกนำสำหรับเส้นผ่าศูนย์กลางของแต่ละกลุ่ม วิเคราะห์ข้อมูลโดยการทดสอบค่าทีของนักเรียนที่มีαเท่ากับ 0.05 เพื่อตรวจสอบความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในอัตราการเจริญเติบโตในน้ำตาลที่เลือกเมื่อเทียบกับวุ้นน้ำและกราฟใช้โปรแกรมMicrosoft Excel สำหรับ Mac 2011 สนับสนุนข้อมูลS1 ข้อความ ตารางข้อมูลที่มีความเข้มข้นของสารที่ใช้ในการมะเดื่อ 5, 6, 7 และ 8 ข้อมูลเป็นปกติน้ำหนักเนื้อเยื่อและความเข้มข้นของญาติของมาตรฐานภายในถูกแทงและถูกบันทึกแล้วเปลี่ยนหมายถึงเป็นศูนย์กลางและหารด้วยค่าเบี่ยงเบนมาตรฐานของตัวแปรแต่ละที่จะเน้นญาติการเปลี่ยนแปลงในรูปแบบการรักษาทั่ว metabolite. (XLSX) กิตติกรรมประกาศผู้เขียนอยากจะขอขอบคุณดร. ลอยด์ดับบลิว Sumner สำหรับเห็นแก่ตัวให้ซามูเอลโรเบิร์ตโนเบิลmetabolite ห้องสมุดมูลนิธิและรัฐนิวเม็กซิโกทดลองเกษตรสถานีศูนย์NMSU สำหรับสุขภาพสัตว์และอาหาร ความปลอดภัยและการนิวเม็กซิโก. สมาคมชิลีทุนวิจัยผู้เขียนมีส่วนร่วมรู้สึกและการออกแบบการทดลอง: RAS JJR โอทีเอสเอสเอสเอ็นจี ดำเนินการทดลอง: RAS BD วิเคราะห์ข้อมูล: RAS BD สนับสนุนน้ำยา / วัสดุ / เครื่องมือวิเคราะห์: JJR TS OH เขียนกระดาษ: RAS โอทีเอสเอสเอส BD NG JJR

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ความเข้มข้นของมาตรฐานภายในได้ถูกแทง มวลสเปกตรัมจับคู่แสดงกับโรเบิร์ต โนเบิลไลท์
ซามูเอลมูลนิธิห้องสมุด [ 28 ] metaboanalyst 2.0 ที่ใช้สำหรับการวิเคราะห์ทางสถิติหลายตัวแปร และกลุ่ม
[ 29 ] ข้อมูลเข้าสู่ระบบและเปลี่ยนแล้ว meancentered
หารด้วยส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของแต่ละตัวแปร ที่จะเน้นการเปลี่ยนแปลงสัมพัทธ์
เพียงโปรไฟล์ในการรักษา วิเคราะห์ข้อมูลโดยการวิเคราะห์ของฟิชเชอร์คน Post Hoc
ของความแปรปรวน ( ANOVA ) αเท่ากับ 0.05 และวิเคราะห์ด้วยหลักการองค์ประกอบเกณฑ์ความมั่นใจ
95% dendrograms ถูกสร้างโดยใช้ Spearman วัดระยะห่างและ

ประสบการณ์การจัดกลุ่มขั้นตอนวิธีการประเมินเลือกคาร์โบไฮเดรตต่ออัตราการ เจริญเติบโตของเชื้อรา
Pคาร์โบไฮเดรตจานเตรียมโดยอัตราส่วนโฟกัส 12 กรัมต่อลิตรและวุ้น 1 % ( w.v. ) กลูโคส ซูโครส
เมเลไซโทส , galactose การแรฟฟิโนส , , ซอร์บิทอล , หรือกลีเซอรอลกับ 10 ml ของสื่อ
เทในแต่ละจาน เดียวเสียบ 2 มม. จากขอบของหน้าเชื้อราเติบโตในอาณานิคม
น้ำวุ้น ถูกย้ายไปยังแต่ละจานมี 4 ซ้ำแต่ละน้ำตาล แผ่นปิดผนึก
คือกับพาราฟิล์ม และ บ่มที่ 28 ° C เป็นเวลา 5 วัน และทำการทดลองซ้ำ กับอิสระ
เตรียมจานที่จุดเวลาที่แยกต่างหากและการวัดสำหรับเส้นผ่าศูนย์กลาง
ของแต่ละอาณาจักร วิเคราะห์ข้อมูลโดยทดสอบกับนักเรียนαเท่ากับ 0.05 เพื่อตรวจสอบความแตกต่างในอัตราการเติบโตบน
เลือกน้ำตาลเทียบกับน้ำวุ้นและกราฟ
การใช้ Microsoft Excel สำหรับ Mac 2011

s1 ข้อมูลสนับสนุนข้อความ ข้อมูลตารางที่มีระดับความเข้มข้นที่ใช้สำหรับมะเดื่อ 5 , 6 , 7 และ 8 ข้อมูล
เป็นปกติน้ำหนักและปริมาณสัมพัทธ์ของมาตรฐานภายในเนื้อเยื่อถูกแทงและ
แล้วเข้าสู่ระบบเปลี่ยน หมายถึงตรงกลาง และหารด้วยส่วนเบี่ยงเบนมาตรฐานของแต่ละตัวแปร
ที่จะเน้นการเปลี่ยนแปลงที่สัมพันธ์กันในระดับโปรไฟล์ผ่านการบําบัด .
( เปิดไฟล์ )

ขอบคุณผู้เขียนขอขอบคุณ ดร. ลอยด์ดับบลิว ซัมเนอร์สำหรับพลั่กให้ซามูเอลโรเบิร์ตส์มูลนิธิโนเบิลไลท์
ห้องสมุดและนิวเม็กซิโกสถานีทดลองเกษตร
, nmsu ศูนย์สุขภาพสัตว์และอาหารปลอดภัยและเม็กซิโก
ชิลีสมาคม สำหรับทุนวิจัย .
ผลงานผู้เขียน
รู้สึกและการออกแบบการทดลอง : ราส jjr โอ TS SS ng ดำเนินการโดย :
ราส Bd วิเคราะห์ข้อมูล : ราส Bd ส่วนสารเคมี / วัสดุ / เครื่องมือ : jjr TS
โอ้ . เขียนกระดาษ : ราสโอ TS BD ของ SS jjr .