Microarray expression analysis comp

Microarray expression analysis comparing mRNA levels
between wild-type and 6S RNA null cells (ssrS3) demonstrated
that expression of many genes was altered in a 6S
RNA-dependent manner (A. T. Cavanagh & K. M.
Wassarman, unpublished data). One mRNA that increased
in the absence of 6S RNA was relA, which encodes ppGpp
synthase I. Specifically, in cells lacking 6S RNA, relA mRNA
was increased 2.3-fold relative to wild-type cells in late
stationary phase (16 h of growth in RDM). Given the
importance of ppGpp in regulating gene expression in
response to nutrient limitation, a time when 6S RNA
function is also important, we examined the relationship
between 6S RNA function, relA expression and ppGpp
levels. Expression of spoT, which encodes the bifunctional
SpoT enzyme that can synthesize and degrade ppGpp
(Magnusson et al., 2005; Potrykus & Cashel, 2008), was relatively unchanged (0.85 in cells lacking 6S RNA
compared with wild-type cells).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เปรียบเทียบระดับ mRNA Microarray วิเคราะห์การแสดงระหว่าง 6S และป่าชนิด RNA null เซลล์ (ssrS3) แสดงมีการเปลี่ยนแปลงที่แสดงออกของยีนจำนวนมากในแบบ 6Sอาร์เอ็นเอขึ้นอยู่กับลักษณะ (A. T. Cavanagh & K. MWassarman ยกเลิกประกาศข้อมูล) MRNA หนึ่งที่เพิ่มขึ้นในการขาดงานของ 6S RNA เป็นเบ ซึ่งเข้ารหัส ppGppI. เฉพาะ ในเซลล์ขาด 6S RNA เบ synthase mRNAแก้ไข 2.3-fold สัมพันธ์กับป่าชนิดเซลล์เพิ่มขึ้นในช่วงปลายแบบเฟส (16 ชม.ของการเติบโตใน RDM) ได้รับการความสำคัญของ ppGpp ในการควบคุมการแสดงออกของยีนตอบสนองต่อการจำกัดสารอาหาร ครั้งเมื่อ 6S RNAฟังก์ชั่นก็มีความสำคัญ เราตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างฟังก์ชัน RNA 6S นิพจน์เบ และ ppGppระดับ นิพจน์ของจุด ซึ่ง encodes bifunctionalเอนไซม์ที่สามารถสังเคราะห์ และลดลง ppGpp จุด(Magnusson et al. 2005 Potrykus & แคชเชล 2008), แก้ไขค่อนข้างไม่เปลี่ยนแปลง (0.85 ในเซลล์ขาด 6S RNAเทียบกับป่าชนิดเซลล์)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การวิเคราะห์การแสดงออก microarray เปรียบเทียบระดับ mRNA
ระหว่างชนิดป่าและ 6S RNA เซลล์ null (ssrS3) แสดงให้เห็น
ว่าการแสดงออกของยีนหลายมีการเปลี่ยนแปลงใน 6S
ลักษณะขึ้นอยู่กับอาร์เอ็นเอ (AT & Cavanagh KM
Wassarman ข้อมูลที่ไม่ถูกเผยแพร่) หนึ่ง mRNA ที่เพิ่มขึ้น
ในกรณีที่ไม่มี 6S RNA เป็นจริงซึ่ง encodes ppGpp
เทสครั้งที่หนึ่งโดยเฉพาะในเซลล์ขาด 6S อาร์เอ็นเอ Rela mRNA
ถูกเพิ่มขึ้นเมื่อเทียบ 2.3 เท่าเป็นเซลล์ชนิดป่าในช่วงปลาย
เฟส (16 ชั่วโมงของการเติบโตใน RDM) ที่ได้รับ
ความสำคัญของการ ppGpp ในการควบคุมการแสดงออกของยีนใน
การตอบสนองต่อข้อ จำกัด สารอาหารเวลาเมื่ออาร์เอ็นเอ 6S
ฟังก์ชั่นยังเป็นสิ่งสำคัญที่เราตรวจสอบความสัมพันธ์
ระหว่างฟังก์ชั่นอาร์เอ็นเอ 6S แสดงออกจริงและ ppGpp
ระดับ การแสดงออกของจุดซึ่ง encodes bifunctional
เอนไซม์จุดที่สามารถสังเคราะห์และย่อยสลาย ppGpp
(แมกนัส et al, 2005;. Potrykus และเชล 2008) เป็นค่อนข้างคงที่ (0.85 ในเซลล์ขาด 6S RNA
เมื่อเทียบกับเซลล์ชนิดป่า)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การวิเคราะห์เปรียบเทียบระดับการแสดงออกของ mRNA microarrayระหว่างความเหมือนกับ 6S RNA null เซลล์ ( ssrs3 ) แสดงการแสดงออกของยีนใน 6s ได้เปลี่ยนแปลงหลายซึ่งขึ้นอยู่กับลักษณะ ( A . T . แคเวินแน็ก & K . mwassarman ข้อมูลเผยแพร่ ) หนึ่งของ ที่เพิ่มขึ้นในการขาดของ 6S RNA ถูกจริงซึ่ง encodes ppgppและฉันเฉพาะในเซลล์ขาด 6S RNA ของจริง ,เพิ่มขึ้น 2.3-fold สัมพัทธ์ของเซลล์ในปลายเฟสอยู่กับที่ ( 16 ชม. ของการเจริญเติบโตใน rdm ) ให้ความสำคัญของ ppgpp ในการควบคุมการแสดงออกของยีนในการจำกัดอาหารเวลา 6s .หน้าที่เป็นสําคัญ เราตรวจสอบความสัมพันธ์ระหว่างฟังก์ชัน RNA 6S , การแสดงออก ppgpp จริงและระดับ การแสดงออกของจุดซึ่ง encodes bifunctionalจุดที่สามารถสังเคราะห์และย่อยสลาย ppgpp เอนไซม์( แมกนัส น et al . , 2005 ; Potrykus & คาเชล , 2008 ) ได้ค่อนข้างไม่เปลี่ยนแปลง ( 0.85 ในเซลล์ขาด 6S .เมื่อเทียบกับของ เซลล์ )