Tuesday, November 12, 2013Staphyloc

Tuesday, November 12, 2013
Staphylococcus aureus continues to evolve: MRSA without mec edition

I just returned from a wonderful MRSA conference this past week where I enjoyed learning about how European countries are handling antimicrobial use in livestock and the emergence of potential human pathogens like livestock-associated MRSA. Perhaps I will post further thoughts on the conference later in the week. However, I just saw this new report in JAC on a novel resistance mechanism in S. aureus, so first things first.

It is known that hyper beta-lactamase producing strains of S. aureus exist and that some strains have chromosomal mutations and resultant modified penicillin binding proteins. These strains can have phenotypic methicillin resistance while lacking the mecA (or mec C) gene. Thus, they can evade detection by genotypic methods and the underlying mechanisms can be missed by phenotypic methods, as Dan nicely described here.

There is now a report by Xiaoliang Ba and colleagues that describes four clinical S. aureus isolates that were found to be MRSA but lacked mec A or mec C. The strains were from clinical wound infections and deposited in the Scottish MRSA Reference Lab. They belonged to sequence types 1, 15 (two isolates) and 8. Three strains were resistant to oxacillin, cefoxitin and PCN by ETest and disc diffusion and the fourth isolate was at the oxacillin Etest breakpoint, while three were beta-lactamase producers. Whole genome sequencing confirmed that none contained a mec-like sequence and that beta-lactamase production was not mediating the resistance. Interestingly they found similar single amino acid substitutions across sequence types in PBP1, PBP2 and PBP3 suggesting independent evolution of the same trait (homoplasy).

The authors acknowledge that their targeted search of the genomes could have missed other possible mechanisms of resistance in these isolates. I would add that this was in four isolates out of an unreported denominator, so we don't know the magnitude of the clinical impact yet. What we can say is that our surveillance techniques had better keep up with S. aureus. Unfortunately, it seems to be just as good at evolving away from our prevention methods as it does our antibiotics.

Obligatory S. aureus image courtesy of wikipedia

Addendum: For further insight, scroll down to read Dan's comment on this study

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วันอังคาร 12 พฤศจิกายน 2013หมอเทศข้างลาย staphylococcus ยังคงคาย: MRSA โดยรุ่น mecฉันเพียงกลับจากประชุม MRSA ยอดเยี่ยมนี้เลยสัปดาห์ที่ฉันชอบเรียนรู้เกี่ยวกับประเทศยุโรปว่าจะจัดการใช้ต้านจุลชีพในปศุสัตว์ และเกิดโรคมนุษย์มีศักยภาพเช่นปศุสัตว์สัมพันธ์ MRSA บางทีฉันจะลงรายการบัญชีเพิ่มเติมความคิดในการประชุมในสัปดาห์ต่อมา อย่างไรก็ตาม เพียงเห็นรายงานนี้ใหม่ใน JAC กลไกต้านทานนวนิยายใน S. หมอเทศข้างลาย สิ่งแรกดังนั้นก่อนการเป็นที่รู้จักกันว่า สายพันธุ์ไฮเปอร์เบต้า-lactamase ผลิตของ S. หมอเทศข้างลายมีอยู่ และว่า บางสายพันธุ์มีการกลายพันธุ์ของโครโมโซมและ resultant แก้ไขยาเพนนิซิลลินผูกโปรตีน สายพันธุ์เหล่านี้มีความต้านทานต่อ methicillin ไทป์ขณะขาด mecA (หรือ mec C) ยีนได้ ดังนั้น พวกเขาสามารถหนีการตรวจสอบ โดยวิธีจีโนไทป์ และกลไกพื้นฐานสามารถพลาด โดยวิธีไทป์ แดนดีอธิบายไว้ที่นี่ ขณะนี้มีรายงาน โดยบา Xiaoliang และเพื่อนร่วมงานที่อธิบาย 4 คลินิก S. หมอเทศข้างลายแยกที่พบเป็น MRSA แต่ขาด mec A หรือ c. mec สายพันธุ์ได้จากการติดเชื้อแผลทางคลินิก และฝากในสกอตแลนด์ MRSA อ้างอิง พวกเขาอยู่กับชนิดลำดับที่ 1, 15 (แยก 2) และ 8 สามสายพันธุ์ทนต่อ oxacillin, cefoxitin และ PCN โดย ETest และแพร่ดิสก์และแยกสี่เป็นที่เบรกพอยต์ oxacillin Etest ในขณะที่สามผู้ผลิตเบต้า-lactamase ลำดับกลุ่มทั้งหมดยืนยันว่า ไม่ประกอบด้วยลำดับเช่น mec และผลิตเบต้า-lactamase ที่ได้เป็นสื่อกลางต่อต้าน เรื่องน่าสนใจจะพบคล้ายเดียวแทนกรดอะมิโนในลำดับชนิดใน PBP1, PBP2 และ PBP3 เสนอขึ้นอยู่กับวิวัฒนาการของติดกัน (homoplasy)ผู้เขียนยอมรับว่า การค้นหาเป้าหมายของ genomes อาจมีพลาดกลไกอื่น ๆ เป็นไปได้ของความต้านทานในการแยกเหล่านี้ ฉันจะเพิ่มที่ นี้อยู่สี่แยกออกจากตัวส่วนที่ไม่ถูกรายงาน ดังนั้นเรายังไม่รู้ขนาดของผลกระทบทางคลินิก สิ่งที่เราสามารถพูดได้ว่า เทคนิคการเฝ้าระวังของเราได้ดีติดตาม S. หมอเทศข้างลาย อับ มันน่าจะสวยที่พัฒนาจากวิธีป้องกันเป็นยาของเรารูปหมอเทศข้างลาย S. บังคับความวิกิพีเดียภาคผนวก: การเพิ่มเติมความเข้าใจ เลื่อนลงไปอ่านข้อคิดเห็นของด่านในการศึกษานี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

อังคาร 12 พฤศจิกายน, 2013
Staphylococcus aureus ยังคงมีวิวัฒนาการ: MRSA โดยไม่ต้องรุ่น MEC ฉันเพิ่งกลับมาจากการประชุม MRSA ที่ยอดเยี่ยมนี้สัปดาห์ที่ผ่านมาที่ผมสนุกกับการเรียนรู้เกี่ยวกับวิธีการที่ประเทศในยุโรปมีการจัดการการใช้ยาต้านจุลชีพในการเลี้ยงปศุสัตว์และการเกิดขึ้นของเชื้อโรคของมนุษย์ที่มีศักยภาพเช่นปศุสัตว์ MRSA -associated บางทีผมอาจจะโพสต์ความคิดเพิ่มเติมเกี่ยวกับการประชุมต่อไปในสัปดาห์ แต่ผมเพิ่งเห็นนี้รายงานใหม่ใน JAC ในกลไกใหม่ในการต้านทานเชื้อ S. aureus ดังนั้นสิ่งแรกแรก. เป็นที่รู้จักกันว่าไฮเปอร์เบต้า lactamase ผลิตสายพันธุ์ของเชื้อ S. aureus อยู่และบางสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ของโครโมโซมและผลการแก้ไข ยาปฏิชีวนะที่มีผลผูกพันโปรตีน สายพันธุ์เหล่านี้สามารถมีความต้านทาน methicillin ฟีโนไทป์ในขณะที่ขาด Meca (หรือ MEC C) ของยีน ดังนั้นพวกเขาสามารถหลบเลี่ยงการตรวจสอบโดยวิธีทางพันธุกรรมและกลไกควรพลาดโดยวิธีการฟีโนไทป์เป็นแดนอธิบายอย่างที่นี่. ขณะนี้มีรายงานจาก Xiaoliang บาและเพื่อนร่วมงานที่อธิบายถึงสี่แยกทางคลินิกเชื้อ S. aureus ที่พบว่ามีเชื้อ MRSA แต่ขาด MEC หรือ MEC ซีสายพันธุ์ที่ได้จากการติดเชื้อแผลทางคลินิกและฝากไว้ในสก็อต MRSA อ้างอิงแล็บ พวกเขาเป็นลำดับประเภทที่ 1, 15 (สองสายพันธุ์) และ 8 สามสายพันธุ์ที่มีความทนทานต่อการ oxacillin, cefoxitin และ PCN โดย Etest และการกระจายแผ่นดิสก์และแยกสี่คือที่จุดพัก oxacillin Etest ในขณะที่สามผู้ผลิตเบต้า lactamase ลำดับจีโนมทั้งหมดได้รับการยืนยันว่าไม่มีใครที่มีลำดับ MEC เหมือนและว่าการผลิตเบต้า lactamase ไม่ได้ไกล่เกลี่ยความต้านทาน ที่น่าสนใจพวกเขาพบว่าใกล้เคียงกันแทนกรดอะมิโนชนิดเดียวในลำดับ PBP1, PBP2 และ PBP3 บอกวิวัฒนาการเป็นอิสระจากลักษณะเดียวกัน (homoplasy). ผู้เขียนยอมรับว่าเป้าหมายของพวกเขาค้นหาของจีโนมจะไม่ได้รับความเป็นไปได้อื่น ๆ กลไกของความต้านทานในสายพันธุ์เหล่านี้ ฉันจะเพิ่มว่านี่คือสี่แยกออกจากส่วนรายงานดังนั้นเราจึงไม่ทราบขนาดของผลกระทบทางคลินิกยัง สิ่งที่เราสามารถพูดได้ว่าเทคนิคการเฝ้าระวังของเราได้ดียิ่งขึ้นให้ทันกับเชื้อ S. aureus แต่น่าเสียดายที่มันน่าจะเป็นเช่นเดียวกับที่ดีในการพัฒนาออกไปจากวิธีการป้องกันของเราเช่นเดียวกับยาปฏิชีวนะของเรา. บังคับเชื้อ S. aureus มารยาทภาพของวิกิพีเดียภาคผนวก: สำหรับข้อมูลเชิงลึกเพิ่มเติมเลื่อนลงไปอ่านความคิดเห็นของแดนในการศึกษาครั้งนี้

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วันอังคาร , พฤศจิกายน 12 , 2013
Staphylococcus aureus ยังคงมีวิวัฒนาการ : MRSA โดย MEC รุ่น

ผมเพิ่งกลับจากการประชุมเมื่อสัปดาห์ที่ 1 ยอดเยี่ยมผมสนุกกับการเรียนรู้เกี่ยวกับวิธีการที่ประเทศในยุโรปมีการจัดการที่ใช้ในการปศุสัตว์และการเกิดขึ้นของเชื้อโรคที่มีศักยภาพของมนุษย์เช่น MRSA เกี่ยวข้องปศุสัตว์บางทีผมอาจจะโพสต์ความคิดเพิ่มเติมเกี่ยวกับการประชุมในภายหลังในสัปดาห์ แต่ผมเพิ่งเห็นข่าวใน JAC บนกลไกต้านทานนวนิยายใน S . aureus ดังนั้นสิ่งแรกแรก

มันเป็นที่รู้จักกันว่า ไฮเปอร์ เบต้าแลคตาเมสการผลิตเชื้อ S . aureus อยู่ และบางสายพันธุ์มีการกลายพันธุ์ของโครโมโซมซึ่งดัดแปลงและเพนนิซิลินผูกพันโปรตีนสายพันธุ์เหล่านี้สามารถมีความต้านทานเมทิซิลลินคุณสมบัติในขณะที่ขาด MECA ( หรือ เม็คซี ) ยีน ดังนั้น พวกเขาสามารถหลบเลี่ยงการตรวจจับ โดยวิธีการทางพันธุกรรมและกลไกสามารถพลาดโดยวิธีการคุณสมบัติ เป็น ดัน อย่างที่อธิบายไว้ที่นี่

มีตอนนี้รายงานโดย xiaoliang BA และเพื่อนร่วมงานอธิบายสี่ทางคลินิก .aureus สายพันธุ์ที่พบเป็นเชื้อ แต่ขาด MEC หรือ เม็คซีสายพันธุ์ จากการติดเชื้อที่แผลผ่าตัดที่คลินิก และฝากในสกอตแลนด์ MRSA อ้างอิงแล็ป พวกเขาเป็นของลำดับประเภท 1 , 15 ( 2 สายพันธุ์ ) และ 8 . 3 สายพันธุ์ที่ทนต่อความไวมาต PCN จากทางเลือกหลาย , และแผ่นกระจายและที่สี่แยกในที่ต่อทางเลือกหลาย ,ในขณะที่ทั้งสามคนด้วยความร้อนผู้ผลิต เบต้า ลำดับจีโนมทั้งหมด ยืนยันว่า ไม่มีมี MEC เหมือนดับการศึกษาและการผลิตเบต้าไม่ไกล่เกลี่ย กลุ่มต่อต้าน แต่พวกเขาเจอกันเดียวแทนข้ามลำดับกรดอะมิโนชนิดใน pbp1 pbp2 , pbp3 แนะนำวิวัฒนาการและความเป็นอิสระของลักษณะเหมือนกัน (

homoplasy )ผู้เขียนยอมรับว่าเป้าหมายการค้นหาของจีโนมอาจพลาดกลไกที่เป็นไปได้อื่น ๆของความต้านทานในเชื้อ ฉันจะเพิ่มที่ว่านี้คือ 4 แยกออกจากตัวส่วนแต่เราไม่รู้ว่าขนาดของผลกระทบทางคลินิกเลย สิ่งที่เราสามารถพูดได้ว่าเทคนิคการเฝ้าระวังของเราดีขึ้นได้ทันกับ S . aureus . ขออภัยมันดูเหมือนว่าจะเหมือนกับที่พัฒนาไปจากวิธีการป้องกันของเราเป็นยาปฏิชีวนะของเรา

S . aureus บังคับภาพมารยาทของวิกิพีเดีย

บทเสริม : สำหรับข้อมูลเชิงลึกเพิ่มเติมให้เลื่อนลงไปอ่านคอมเม้นในแดนการศึกษา