The nucleotide sequence of the 5.8S

The nucleotide sequence of the 5.8S rRNA gene and the flanked internal transcribed spacer (ITS) regions of six Trichomonas vaginalis isolates with different metronidazole sensitivity and geographic origin were genotyped. A multiple sequence alignment was performed with different sequences of other isolates available at the GenBank/EMBL/DDBJ databases, which revealed 5 different sequence patterns. Although a stablemutation in position 66 of the ITS1 (C66T)was observed in 26% (9/34) of the T. vaginalis sequences analyzed, therewas 99.7% ITS nucleotide sequence identity among isolates for this sequence. The nucleotide sequence variation among other species of the genus Trichomonas ranged from 3.4% to 9.1%. Surprisingly, the % identity between T. vaginalis and Pentatrichomonas hominis was ~83%. There was N40% divergence in the ITS sequence between T. vaginalis
and Tritrichomonas spp., including Tritrichomonas augusta, Tritrichomonasmuris, and Tritrichomonas nonconforma
and with Tetratrichomonas prowazeki. Dendrograms grouped the trichomonadid sequences in robust clades according
to their genera. The absence of nucleotide divergence in the hypervariable ITS regions between
T. vaginalis isolates suggests the early divergence of the parasite. Importantly, these data show this ITS1-5.8S
rRNA-ITS2 region suitable for inter-species differentiation.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับนิวคลีโอไทด์ของ 5.8S ยีนใน rRNA และแคว้นเขียดแยกกับ metronidazole ต่าง ๆ ความไวและความเป็นมาทางภูมิศาสตร์ Trichomonas หกหลักภายในทับเป็นตัวเว้นวรรค (ของ) genotyped แบบจัดลำดับหลายที่ดำเนินการ มีลำดับที่แตกต่างกันของอื่น ๆ ที่แยกได้ฐานข้อมูล GenBank/EMBL/DDBJ ซึ่งเปิดเผยรูปแบบลำดับแตกต่างกัน 5 แม้ว่า stablemutation ในตำแหน่ง 66 ITS1 (C66T) ถูกพบใน 26% (9/34) ของเขียดต. ลำดับวิเคราะห์ therewas 99.7% ของนิวคลีโอไทด์ลำดับรหัสประจำตัวระหว่างแยกในลำดับนี้ เปลี่ยนแปลงลำดับนิวคลีโอไทด์ในสายพันธุ์อื่น ๆ ของตระกูลนี้อยู่ในช่วงจาก 3.4% เป็น 9.1% Trichomonas จู่ ๆ รหัสประจำตัว%ระหว่างต.เขียดและ Pentatrichomonas hominis เป็น ~ 83% มี N40% divergence ในลำดับของระหว่างต.เขียดTritrichomonas โอ ออกัส ต้า Tritrichomonas, Tritrichomonasmuris และ Tritrichomonas และ nonconformaและ Tetratrichomonas prowazeki ลำดับที่ trichomonadid ใน clades แข็งแกร่งตามการจัดกลุ่ม Dendrogramsกับสกุลของพวกเขา การขาดงานของนิวคลีโอไทด์ divergence ในภูมิภาคของ hypervariable ระหว่างต.เขียดแยกแนะนำ divergence ต้นของเชื้อมาลาเรีย สำคัญ ข้อมูลเหล่านี้แสดง ITS1 นี้-5.8SrRNA ITS2 ภูมิภาคเหมาะสำหรับสร้างความแตกต่างระหว่างพันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 5.8s rRNA และขนาบข้างภายใน และ spacer ( ITS ) ของภูมิภาคที่ 6 ไอโซเลทที่มีทริโคโมแนสทําโซลไวและภูมิศาสตร์ที่มาเป็น genotyped . หลายลำดับการจัดลําดับที่แตกต่างกันของอื่น ๆจากของที่พบ / สัตว / ddbj ฐานข้อมูล ซึ่งพบ 5 แบบแผนลำดับต่าง ๆแม้ว่า stablemutation ในตำแหน่ง 66 ของ its1 ( c66t ) พบว่าใน 26 % ( 9 / 34 ) ของ ต. ทําลําดับวิเคราะห์และ 99.7% ของลำดับนิวคลีโอไทด์ในอัตลักษณ์แยกลำดับนี้ การเปลี่ยนแปลงลำดับนิวคลีโอไทด์ของชนิดอื่น ๆของ จีนัสทริโคโมแนสระหว่าง 3.4% ถึง 9.1% จู่ ๆ ซึ่งมีความเหมือนระหว่าง ต.ทํา และ pentatrichomonas hominis ~ 83 % มี n40 % ความแตกต่างในการลำดับระหว่าง ต. ทํา
tritrichomonas spp . และรวมทั้ง tritrichomonas ออกัสตา , tritrichomonasmuris และ tritrichomonas nonconforma
และ tetratrichomonas prowazeki . dendrograms การจัดกลุ่มลำดับ trichomonadid ในเสถียรภาพ clades ตาม
สกุลของตนไม่มีความแตกต่างในลำดับเบสออกภูมิภาคระหว่าง
T . ทําเลทชี้ให้เห็นความแตกต่างในช่วงต้นของปรสิต ที่สำคัญ ข้อมูลเหล่านี้แสดง its1-5.8s
rrna-its2 เขตเหมาะสำหรับอินเตอร์ชนิดความแตกต่าง .