Identification of AAB based only on

Identification of AAB based only on morphological, biochemical, and physiological characteristics is not reliable and, therefore, is insufficient because of the poor reproducibility and discriminatory power of these phenotypic tests . For this reason, nucleic acid-based molecular methods are now used to characterize and identify isolates of AAB from wine and vinegar ecosystems .These have included Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus-PCR (ERIC-PCR), Repetitive Extragenic Palindromic-PCR (REP-PCR) (González et al.,, (GTG) 5 -rep-PCR fingerprinting and RAPD-PCR A reliable taxonomic identification is obtained when these techniques are combined with the sequencing of 16S rDNA genes and internal transcribed spacer sequences(ITS) of the 16S–23S rDNA genes. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis of the ribosomal genes or their spacer regions has also been used for the identification of AAB present in food-related ecosystems
The combination of culture-independent methods with culture-dependent methods in a polyphasic system is recommended as an effective approach to overcome the difficulties regarding the isolation and cultivation of AAB strains . In the last decade, several studies using the culture-independent DGGE and Temporal Tempera-ture Gradient Gel Electrophoresis (TTGE) techniques were reported for the characterization of the microbial community in vinegar and the determination of population dynamics of AAB during fermentation In addition, the real-time PCR technique has also been proposed for culture-independent detection of different genera, or species, of AAB. Recently,the intercalating dye-based real-time PCR analysis involved in specific melting temperature (Tm) and high-resolution melting analysis were applied as a highly promising new approach for confirming the identification and grouping of the culturable strains belonging to different bacterial species,but not yet to AAB. These new approaches provide a rapid and reliable tool for the detection of small differences in the target DNA sequences of closely related species.
The identification of indigenous AAB has critical importance to improve the process control, overcome unpredictable fermentation problems and select the most suitable strains as the potential starter culture. Therefore, in this study, we aimed to detect and compare AAB populations in grape and apple vinegar and in mother of vinegar samples obtained from different regions of Turkey. Thus the culture-independent PCR-DGGE technique was combined with culture-dependent molecular techniques, including (GTG) 5 -rep-PCR and sequence analysis of the 16S rRNA gene, 16S–23S rRNA internal transcribed sequences (ITS) region and tuf gene for identification and characterization of AAB isolated from analyzed samples. Furthermore, real-time PCR intercalating dye-based analysis was applied to AAB isolates to obtain species-level discrimination.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รหัส aab โดยเฉพาะตามลักษณะสัณฐาน ชีวเคมี และสรีรวิทยาไม่น่าเชื่อถือ และ ดังนั้น ไม่เพียงพอจน reproducibility และโจ่งแจ้งอำนาจของการทดสอบเหล่านี้ไทป์ ด้วยเหตุนี้ ใช้กรดนิวคลีอิกโมเลกุลขณะนี้ใช้วิธีลักษณะ และแยกจากระบบนิเวศไวน์และน้ำส้มสายชูของ aab โดยระบุ เหล่านี้ได้รวม Enterobacterial ซ้ำ Intergenic มติ-PCR (เอริค-PCR), ซ้ำ Extragenic Palindromic-PCR (ตัวแทน-PCR) (González et al.,, (GTG) แทน 5--ลายพิมพ์ PCR และการอาร์เอพีดี-PCR รหัสอนุกรมวิธานที่เชื่อถือได้ได้รับเทคนิคเหล่านี้จะรวมกับลำดับ ของยีน 16S rDNA และภายใน sequences(ITS) เป็นตัวเว้นวรรคของยีน rDNA 16S – 23S ทับศัพท์ ข้อจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (RFLP) วิเคราะห์ยีน ribosomal หรือภูมิภาคของตนเป็นตัวเว้นวรรคยังถูกใช้สำหรับการระบุของ aab โดยอยู่ในระบบนิเวศที่เกี่ยวข้องกับอาหาร ชุดวัฒนธรรมอิสระวิธีวิธีขึ้นอยู่กับวัฒนธรรมในระบบ polyphasic จะแนะนำเป็นวิธีมีประสิทธิภาพให้เอาชนะความยากลำบากเกี่ยวกับการแยกและการเพาะปลูกของ aab โดยสายพันธุ์ ในทศวรรษที่ผ่านมา ใช้เทคนิค DGGE และขมับ ture อุณหภูมิไล่ระดับเจ Electrophoresis (TTGE) การอิสระวัฒนธรรมศึกษาต่าง ๆ มีรายงานสำหรับคุณลักษณะของจุลินทรีย์ในน้ำส้มสายชูและกำหนดแปลงประชากร aab โดยในระหว่างการหมักนอกจากนี้ ยังได้เสนอเทคนิค PCR แบบเรียลไทม์ตรวจสกุลอื่น หรือพันธุ์ aab โดยไม่ขึ้นกับวัฒนธรรม ล่าสุด intercalating ใช้ย้อมแบบเรียลไทม์ PCR วิเคราะห์เกี่ยวข้องเฉพาะละลายอุณหภูมิ (Tm) และวิเคราะห์ละเอียดละลายถูกนำไปใช้เป็นวิธีการใหม่สูงสัญญายืนยันการระบุ และจัดกลุ่มของสายพันธุ์ culturable ที่เป็นสายพันธุ์แบคทีเรียที่แตกต่างกัน แต่ยังไม่ได้ aab โดย ใหม่ ๆ เหล่านี้ให้เครื่องมืออย่างรวดเร็ว และเชื่อถือได้สำหรับการตรวจพบความแตกต่างเล็ก ๆ ในลำดับดีเอ็นเอเป้าหมายชนิดที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด รหัส aab โดยคนพื้นเมืองมีความสำคัญสำคัญเพื่อปรับปรุงการควบคุมกระบวนการ เอาชนะปัญหาหมักไม่แน่นอน และเลือกสายพันธุ์ที่เหมาะสมที่สุดเป็นวัฒนธรรมเริ่มต้นเป็นไปได้ ดังนั้น ในการศึกษานี้ ที่เรามุ่งการตรวจสอบ และเปรียบเทียบประชากร aab โดยน้ำส้มองุ่นและแอปเปิ้ล และแม่ตัวอย่างน้ำส้มสายชูที่ได้จากภูมิภาคต่าง ๆ ของตุรกี ดังนั้น เทคนิค PCR DGGE วัฒนธรรมอิสระถูกรวมกับเทคนิคโมเลกุลขึ้นอยู่กับวัฒนธรรม (GTG) รวมทั้งตัวแทน 5--วิเคราะห์ PCR และลำดับของยีน 16S rRNA, 16S – 23S rRNA ภายในทับศัพท์ลำดับยีน (ของ) ภูมิภาคและ tuf สำหรับการระบุ และจำแนก aab โดยแยกต่างหากจากตัวอย่างที่วิเคราะห์ นอกจากนี้ PCR เพิ่มแบบเรียลไทม์ที่ intercalating ใช้ย้อมวิเคราะห์นำมาใช้ที่ aab โดยแยกสามารถแบ่งแยกชนิดระดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บัตรประจำตัวของ AAB ขึ้นอยู่เฉพาะในลักษณะทางสัณฐานวิทยาชีวเคมีและสรีรวิทยาไม่น่าเชื่อถือและมีไม่เพียงพอเพราะการทำสำเนาและการใช้พลังงานที่ไม่ดีการเลือกปฏิบัติของการทดสอบฟีโนไทป์เหล่านี้ ด้วยเหตุนี้กรดนิวคลีอิกที่ใช้วิธีการโมเลกุลที่ใช้ตอนนี้จะอธิบายลักษณะและระบุสายพันธุ์ของ AAB จากระบบนิเวศและน้ำส้มสายชูไวน์เหล่านี้ได้รวม Enterobacterial ซ้ำ intergenic ฉันทามติ-PCR (ERIC-PCR) ซ้ำ Extragenic palindromic-PCR (REP-PCR ) (González, et al ,,. (GTG) 5 พิมพ์ลายนิ้วมือ -rep-PCR และ RAPD-PCR การระบุการจัดหมวดหมู่ที่น่าเชื่อถือที่ได้รับเมื่อเทคนิคเหล่านี้จะรวมกันกับลำดับของยีน 16S rDNA และคัดลอกภายในลำดับ spacer นี้ (ITS) ของ 16S -23S ยีน rDNA. ความแตกต่างส่วนระยะเวลาในการ จำกัด (RFLP) การวิเคราะห์ยีนของไรโบโซมหรือภูมิภาค spacer ของพวกเขายังถูกนำมาใช้เพื่อระบุตัวตนของ AAB
อยู่ในระบบนิเวศอาหารที่เกี่ยวข้องกับการรวมกันของวิธีการวัฒนธรรมอิสระด้วยวิธีการขึ้นอยู่กับวัฒนธรรมในระบบ polyphasic แนะนำเป็นวิธีการที่มีประสิทธิภาพในการเอาชนะความยากลำบากเกี่ยวกับการแยกและการเพาะปลูกของสายพันธุ์ AAB. ในทศวรรษที่ผ่านมาการศึกษาหลายแห่งโดยใช้วัฒนธรรมเป็นอิสระ DGGE และชั่วขณะฝุ่น-ture ไล่โทนสีเจล Electrophoresis (TTGE) เทคนิคที่ได้รับรายงานสำหรับ ลักษณะของชุมชนจุลินทรีย์ในน้ำส้มสายชูและความมุ่งมั่นของการเปลี่ยนแปลงประชากร AAB ในระหว่างการหมักนอกจากนี้ในเวลาจริงวิธี PCR ยังได้รับการเสนอวัฒนธรรมสำหรับการตรวจสอบที่เป็นอิสระของจำพวกที่แตกต่างกันหรือชนิดของ AAB เมื่อเร็ว ๆ นี้ intercalating ย้อมตามเวลาจริงการวิเคราะห์ที่เกี่ยวข้องกับวิธี PCR ในอุณหภูมิหลอมเหลวเฉพาะ (TM) และความละเอียดสูงวิเคราะห์ละลายถูกนำไปใช้เป็นวิธีการใหม่ที่มีแนวโน้มสูงสำหรับยืนยันการระบุและการจัดกลุ่มของสายพันธุ์ culturable ที่เป็นแบคทีเรียชนิดที่แตกต่างกัน แต่ยังไม่ถึง AAB เหล่านี้วิธีการใหม่ให้เป็นเครื่องมืออย่างรวดเร็วและเชื่อถือได้สำหรับการตรวจสอบความแตกต่างเล็ก ๆ ในลำดับดีเอ็นเอเป้าหมายของสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด.
บัตรประจำตัวของ AAB พื้นเมืองที่มีความสำคัญในการปรับปรุงการควบคุมกระบวนการแก้ไขปัญหาการหมักคาดเดาไม่ได้และเลือกสายพันธุ์ที่เหมาะสมที่สุดเป็น วัฒนธรรมเริ่มต้นที่อาจเกิดขึ้น ดังนั้นในการศึกษาครั้งนี้เรามีวัตถุประสงค์เพื่อตรวจสอบและเปรียบเทียบประชากร AAB ในน้ำส้มสายชูแอปเปิ้ลองุ่นและและแม่ของกลุ่มตัวอย่างน้ำส้มสายชูที่ได้รับจากภูมิภาคต่าง ๆ ของประเทศตุรกี ดังนั้นวัฒนธรรมอิสระเทคนิค PCR-DGGE ถูกรวมกับเทคนิคโมเลกุลขึ้นอยู่กับวัฒนธรรมรวมทั้ง (GTG) 5 -rep-PCR และการวิเคราะห์ลำดับของยีน 16S rRNA, 16S-23S rRNA ลำดับคัดลอกภายใน (ITS) ภูมิภาคและยีน TUF สำหรับการระบุและลักษณะของ AAB ที่แยกได้จากตัวอย่างการวิเคราะห์ นอกจากนี้แบบ real-time PCR วิเคราะห์ intercalating สีย้อมที่ใช้ถูกนำไปใช้ AAB แยกที่จะได้รับการเลือกปฏิบัติในระดับสปีชีส์