About the PDB Archive and the RCSB

About the PDB Archive and the RCSB PDB

The Protein Data Bank (PDB) archive is the single worldwide repository of information about the 3D structures of large biological molecules, including proteins and nucleic acids. These are the molecules of life that are found in all organisms including bacteria, yeast, plants, flies, other animals, and humans. Understanding the shape of a molecule deduce a structure's role in human health and disease, and in drug development. The structures in the archive range from tiny proteins and bits of DNA to complex molecular machines like the ribosome.
The PDB archive is available at no cost to users. The PDB archive is updated weekly.
The PDB was established in 1971 at Brookhaven National Laboratory under the leadership of Walter Hamilton and originally contained 7 structures. After Hamilton's untimely death, Tom Koetzle began to lead the PDB in 1973, and then Joel Sussman in 1994. In 1998, the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) became responsible for the management of the PDB. In 2003, the wwPDB was formed to maintain a single PDB archive of macromolecular structural data that is freely and publicly available to the global community. It consists of organizations that act as deposition, data processing and distribution centers for PDB data.
In addition, the RCSB PDB supports a website where visitors can perform simple and complex queries on the data, analyze, and visualize the results. Details about the history, function, progress, and future goals of the RCSB PDB can be found in our Annual Reports and Newsletters.
The PDB Advisory Notice defines the conditions for using data from the PDB archive. Our Policies & References page describes copyright restrictions on RCSB PDB materials, our privacy policy, and citation information. Data deposition and release policies are available from deposit.pdb.org.
RCSB PDB staff are located at Rutgers, The State University of New Jersey and the University of California, San Diego. Job listings for open positions are posted online.
The Rutgers group has been featured on RU-tv and Biophysical Society TV.

RCSB PDB Users
The RCSB PDB has an international community of users, including biologists (in fields such as structural biology, biochemistry, genetics, pharmacology); other scientists (in fields such as bioinformatics, software developers for data analysis and visualization); students and educators (all levels); media writers, illustrators, textbook authors; and the general public.
The website (rcsb.org) is accessed by about 286,000 unique visitors per month from about 190 countries. Around 1.3 Terabytes of data are transferred each month from the website.
RCSB PDB Advisory Committee
The RCSB PDB Advisory Committee is made up of an international team of experts in X-ray crystallography, cryoEM, NMR, bioinformatics and education. RCSB PDB appreciates the valuable feedback they provide on an ongoing basis.
Worldwide PDB (wwPDB)

The RCSB PDB is a member of the wwPDB, a collaborative effort with PDBe (UK), PDBj (Japan), and BMRB (USA) to ensure the PDB archive is global and uniform.
As the wwPDB archive keeper, the RCSB PDB updates the PDB archive at ftp://ftp.wwpdb.org weekly. The structures included in each release are highlighted on the RCSB PDB home page and clearly defined on the FTP site. These sites are maintained 24 hours a day, seven days a week. A failover system automatically redirects internet traffic to a mirror site, if needed.
RCSB PDB History
Below is a time line of key PDB events and structural biology highlights, from 1971 to 2011. Left are the key events in the evolution of the PDB. Right are selected key structures in the field of structural biology. Taken from The Protein Data Bank at 40: Reflecting on the Past to Prepare for the Future.
RCSB PDB History

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เกี่ยวกับการเก็บถาวร PDB และ RCSB PDBเก็บข้อมูลธนาคารโปรตีน (PDB) เป็นเก็บข้อมูลทั่วโลกเดียวของข้อมูลเกี่ยวกับโครงสร้าง 3 มิติของโมเลกุลชีวภาพขนาดใหญ่ รวมทั้งโปรตีนและกรดนิวคลีอิก เหล่านี้เป็นโมเลกุลของสิ่งมีชีวิตที่พบในสิ่งมีชีวิตทั้งหมดรวมทั้งแบคทีเรีย ยีสต์ พืช แมลง สัตว์ และอื่น ๆ มนุษย์ ทำความเข้าใจเกี่ยวกับรูปร่างของโมเลกุลเดาบทบาทของโครงสร้างสุขภาพของมนุษย์และโรค และการพัฒนายาเสพติด โครงสร้างในการเก็บช่วงจากบิตของดีเอ็นเอและโปรตีนขนาดเล็กเครื่องจักรโมเลกุลที่ซับซ้อนเช่นไรโบโซมเก็บ PDB ต้นทุนไม่ให้ผู้ใช้ได้ เก็บ PDB มีการปรับปรุงทุกสัปดาห์PDB ที่ก่อตั้งขึ้นในปี 1971 ที่ Brookhaven ปฏิบัติแห่งชาติภายใต้การนำของฮามิลตัน Walter และเดิม ประกอบด้วยโครงสร้าง 7 หลังความตายหลังแฮมิลตัน Tom Koetzle เริ่มนำการ PDB ใน 1973 และ Joel Sussman ในปี 1994 ในปี 1998 วิจัย Collaboratory สำหรับโครงสร้าง Bioinformatics (RCSB) เป็นผู้รับผิดชอบการบริหาร PDB ใน 2003, wwPDB ถูกก่อตั้งขึ้นเพื่อรักษาเก็บ PDB เดียวของ macromolecular โครงสร้างข้อมูลที่มีได้อย่างอิสระ และอย่างเปิดเผยต่อสังคมโลก มันประกอบด้วยองค์กรที่ทำหน้าที่สะสม ประมวลผลข้อมูล และการกระจายศูนย์สำหรับข้อมูล PDBนอกจากนี้ RCSB PDB สนับสนุนเว็บไซต์ซึ่งผู้เยี่ยมชมสามารถทำแบบสอบถามที่ง่าย และซับซ้อนข้อมูล วิเคราะห์ และเห็นภาพผลลัพธ์ รายละเอียดเกี่ยวกับประวัติ ฟังก์ชัน ความก้าวหน้า และเป้าหมายในอนาคตของ RCSB PDB สามารถพบได้ในรายงานประจำปีจดหมายข่าวแจ้งปรึกษา PDB กำหนดเงื่อนไขสำหรับการใช้ข้อมูลจากเก็บถาวร PDB หน้านโยบายและข้อมูลอ้างอิงของเราอธิบายถึงข้อจำกัดทางลิขสิทธิ์ RCSB PDB วัสดุ ของนโยบายความเป็นส่วนตัว และอ้างอิงข้อมูล มีข้อมูลสะสมและนำนโยบายจาก deposit.pdb.orgพนักงาน RCSB PDB อยู่ที่ Rutgers มหาวิทยาลัย นิวเจอร์ซี่รัฐ และมหาวิทยาลัย แคลิฟอร์เนีย San Diego รายการงานสำหรับตำแหน่งที่เปิดลงรายการบัญชีออนไลน์กลุ่ม Rutgers RU-ทีวีและโทรทัศน์สังคม Biophysicalผู้ใช้ RCSB PDBRCSB PDB มีการประชาคมของผู้ใช้ รวมถึง biologists (ในโครงสร้างชีววิทยา ชีวเคมี พันธุศาสตร์ เภสัชวิทยา); นักวิทยาศาสตร์อื่น ๆ (ในฟิลด์ bioinformatics นักพัฒนาซอฟต์แวร์สำหรับการวิเคราะห์ข้อมูลและแสดงภาพประกอบเพลง); นักเรียนและนักการศึกษา (ทุกระดับ); สื่อเขียน วาด เขียนตำรา และประชาชนทั่วไปมีการเข้าถึงเว็บไซต์ (rcsb.org) นักท่องเที่ยวประมาณ 286,000 ไม่ซ้ำกันต่อเดือนจาก 190 ประเทศ ประมาณ 1.3 ไบต์ของข้อมูลจะถูกโอนย้ายแต่ละเดือนจากเว็บไซต์คณะกรรมการที่ปรึกษา RCSB PDBคณะกรรมการปรึกษา PDB RCSB ถูกสร้างขึ้นของทีมงานผู้เชี่ยวชาญในเอกซเรย์ผลิกศาสตร์ cryoEM, NMR, bioinformatics และการศึกษานานาชาติ RCSB PDB ชื่นชมมีผลป้อนกลับให้อย่างต่อเนื่องPDB ทั่วโลก (wwPDB)RCSB PDB เป็นสมาชิกของ wwPDB การ ความพยายามร่วม กับ PDBe (UK), PDBj (ญี่ปุ่น), BMRB (สหรัฐ อเมริกา) ให้เก็บ PDB อยู่สม่ำเสมอ และทั่วโลกเป็นผู้รักษาเก็บ wwPDB, RCSB PDB ปรับปรุงเก็บ PDB ที่ ftp://ftp.wwpdb.org ทุกสัปดาห์ โครงสร้างรวมอยู่ในแต่ละรุ่นจะเน้นบนโฮมเพจ RCSB PDB และกำหนดไว้อย่างชัดเจนบนไซต์ FTP เว็บไซต์เหล่านี้จะยังคงอยู่ตลอด 24 ชั่วโมงต่อวัน เจ็ดวันต่อสัปดาห์ ระบบล้มเปลี่ยนเส้นทางอินเทอร์เน็ตโดยอัตโนมัติไปยังไซต์กระจก ถ้าจำเป็นประวัติ RCSB PDBด้านล่างเป็นสายเวลาของเหตุการณ์สำคัญ PDB และชีววิทยาโครงสร้าง ไฮไลท์ จากปี 1971 ถึง 2554 เหตุการณ์สำคัญในวิวัฒนาการของ PDB ด้านซ้ายได้ ขวาเป็นโครงสร้างหลักที่เลือกในฟิลด์ของชีววิทยาโครงสร้าง นำมาจาก ธนาคารข้อมูลโปรตีน 40: บรรยากาศการเตรียมตัวสำหรับอนาคตที่ผ่านมาประวัติ RCSB PDB

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เกี่ยวกับเอกสารเก่า PDB และ PDB RCSB ธนาคารข้อมูลโปรตีน (PDB) เก็บเป็นพื้นที่เก็บข้อมูลทั่วโลกเดียวของข้อมูลเกี่ยวกับโครงสร้าง 3 มิติของทางชีววิทยาโมเลกุลขนาดใหญ่รวมทั้งโปรตีนและกรดนิวคลีอิก เหล่านี้เป็นโมเลกุลของสิ่งมีชีวิตที่พบในสิ่งมีชีวิตทั้งหมดรวมทั้งแบคทีเรียยีสต์พืชแมลงวันสัตว์อื่น ๆ และมนุษย์ ทำความเข้าใจเกี่ยวกับรูปร่างของโมเลกุลสรุปบทบาทของโครงสร้างในสุขภาพของมนุษย์และโรคและยาเสพติดในการพัฒนา โครงสร้างในช่วงที่เก็บจากโปรตีนขนาดเล็กและบิตของดีเอ็นเอของเครื่องโมเลกุลที่ซับซ้อนเช่นไรโบโซม. เก็บ PDB มีค่าใช้จ่ายให้กับผู้ใช้ไม่มี เก็บ PDB การปรับปรุงรายสัปดาห์. PDB ก่อตั้งขึ้นในปี 1971 ที่ Brookhaven ห้องปฏิบัติการแห่งชาติภายใต้การนำของวอลเตอร์แฮมิลตันและที่มีอยู่เดิม 7 โครงสร้าง หลังจากสิ้นพระชนม์แฮมิลตันทอม Koetzle เริ่มที่จะนำไปสู่ ​​PDB ในปี 1973 และจากนั้นโจเอล Sussman ในปี 1994 ในปี 1998 Collaboratory วิจัยชีวสารสนเทศศาสตร์โครงสร้าง (RCSB) กลายเป็นผู้รับผิดชอบในการจัดการของ PDB ที่ ในปี 2003 wwPDB ถูกสร้างขึ้นเพื่อเก็บรักษา PDB เดียวของข้อมูลที่มีโครงสร้างโมเลกุลที่เป็นอิสระและสาธารณชนสามารถใช้ได้กับประชาคมโลก ประกอบด้วยองค์กรที่ทำหน้าที่เป็นปลดออกจากข้อมูลการประมวลผลและศูนย์กระจายข้อมูล PDB. นอกจากนี้ PDB RCSB สนับสนุนเว็บไซต์ที่ผู้เข้าชมสามารถดำเนินการค้นหาที่ง่ายและซับซ้อนกับข้อมูลที่วิเคราะห์และเห็นภาพผล รายละเอียดเกี่ยวกับประวัติความเป็นฟังก์ชั่นความคืบหน้าและเป้าหมายในอนาคตของ PDB RCSB สามารถพบได้ในรายงานประจำปีของเราและจดหมายข่าว. PDB ที่ปรึกษาแจ้งให้ทราบกำหนดเงื่อนไขในการใช้ข้อมูลจากคลัง PDB นโยบายและหน้าอ้างอิงของเราอธิบายถึงข้อ จำกัด ลิขสิทธิ์ RCSB วัสดุ PDB นโยบายความเป็นส่วนตัวของเราและข้อมูลอ้างอิง การสะสมข้อมูลและนโยบายการเปิดตัวที่มีอยู่จาก deposit.pdb.org. พนักงาน RCSB PDB อยู่ที่ Rutgers มหาวิทยาลัยรัฐนิวเจอร์ซีย์และมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนียซานดิเอโก รายการงานสำหรับตำแหน่งที่เปิดมีการโพสต์ออนไลน์. กลุ่มรัตเกอร์สได้รับการให้ความสำคัญกับ RU-ทีวีและทีวีชีวฟิสิกส์สังคม. RCSB PDB ผู้ใช้PDB RCSB มีประชาคมระหว่างประเทศของผู้ใช้รวมทั้งนักชีววิทยา (ในสาขาต่าง ๆ เช่นชีววิทยาโครงสร้างชีวเคมีพันธุศาสตร์ เภสัชวิทยา); นักวิทยาศาสตร์อื่น ๆ (ในสาขาต่าง ๆ เช่นชีวสารสนเทศ, นักพัฒนาซอฟต์แวร์ในการวิเคราะห์ข้อมูลและการมองเห็น); นักเรียนและนักการศึกษา (ทุกระดับ); นักเขียนสื่อวาดภาพประกอบผู้เขียนตำรา; และประชาชนทั่วไป. เว็บไซต์ (rcsb.org) มีการเข้าถึงโดยประมาณ 286,000 ผู้เข้าชมที่ไม่ซ้ำกันต่อเดือนจากประมาณ 190 ประเทศ รอบ 1.3 เทราไบต์ของข้อมูลจะถูกโอนในแต่ละเดือนจากเว็บไซต์. RCSB PDB คณะกรรมการที่ปรึกษาRCSB PDB คณะกรรมการที่ปรึกษาถูกสร้างขึ้นจากทีมงานต่างประเทศของผู้เชี่ยวชาญในการ X-ray crystallography, cryoEM, NMR, ชีวสารสนเทศและการศึกษา RCSB PDB ชื่นชมข้อเสนอแนะที่มีคุณค่าที่พวกเขาให้อย่างต่อเนื่อง. ทั่วโลก PDB (wwPDB) PDB RCSB เป็นสมาชิกของ wwPDB ความพยายามร่วมกันกับ PDBe (สหราชอาณาจักร) PDBj (ญี่ปุ่น) และ BMRB (USA) เพื่อให้แน่ใจว่า เก็บ PDB เป็น บริษัท ระดับโลกและสม่ำเสมอ. ในฐานะที่เป็นผู้รักษาประตูเก็บ wwPDB ที่ PDB RCSB ปรับปรุงเก็บ PDB ที่ ftp://ftp.wwpdb.org รายสัปดาห์ โครงสร้างที่รวมอยู่ในแต่ละรุ่นที่เป็นไฮไลต์ในหน้าแรก RCSB PDB และกำหนดไว้อย่างชัดเจนบนเว็บไซต์ FTP เว็บไซต์เหล่านี้มีการบำรุงรักษาตลอด 24 ชั่วโมงต่อวันเจ็ดวันต่อสัปดาห์ ระบบล้มเหลวโดยอัตโนมัติเปลี่ยนเส้นทางการจราจรทางอินเทอร์เน็ตไปยังเว็บไซต์ของกระจกถ้าจำเป็น. RCSB PDB ประวัติความเป็นมาด้านล่างเป็นเส้นเวลาของเหตุการณ์PDB ที่สำคัญและไฮไลท์ชีววิทยาโครงสร้างจากปี 1971 กับ 2011 ซ้ายเป็นเหตุการณ์สำคัญในวิวัฒนาการของ PDB ที่ ขวาจะถูกเลือกโครงสร้างที่สำคัญในสาขาชีววิทยาโครงสร้าง นำมาจากโปรตีนข้อมูลธนาคารที่ 40: ที่ผ่านมาสะท้อนให้เห็นถึงเพื่อเตรียมความพร้อมสำหรับอนาคต. RCSB PDB ประวัติศาสตร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เกี่ยวกับการจัดเก็บและ rcsb PDB PDB

ธนาคารข้อมูลโปรตีน ( PDB ) เก็บข้อมูลทั่วโลกเดียวของข้อมูลเกี่ยวกับ 3D โครงสร้างของโมเลกุลทางชีวภาพขนาดใหญ่ ได้แก่ โปรตีน และ กรดนิวคลีอิก เหล่านี้คือโมเลกุลของสิ่งมีชีวิตที่พบในสิ่งมีชีวิตทั้งหมดรวมทั้งแบคทีเรีย , ยีสต์ , พืช แมลง สัตว์ และมนุษย์ความเข้าใจเกี่ยวกับรูปร่างของโมเลกุลสรุปบทบาทของโครงสร้างในโรคและสุขภาพของมนุษย์ และในการพัฒนายา โครงสร้างในการเก็บช่วงจากโปรตีนขนาดเล็กและบิตของดีเอ็นเอเครื่องจักรโมเลกุลที่ซับซ้อนเช่นไรโบโซม .
PDB ถาวรสามารถใช้ได้ไม่มีค่าใช้จ่ายให้กับผู้ใช้ ที่ PDB จัดเก็บการปรับปรุงรายสัปดาห์ .
ที่ PDB ก่อตั้งขึ้นในปี 1971 ที่ห้องปฏิบัติการแห่งชาติ Brookheaven ภายใต้การนําของ วอลเตอร์ แฮมิลตันและเดิมที่มีอยู่ 7 โครงสร้าง หลังจากแฮมิลตันเป็นแท้งตาย ทอม เคิร์ทเซลเริ่มที่จะนำเส้นใยใน 1973 และโจเอล ซัสแมนในปี 1994 ในปี 1998 , collaboratory งานวิจัยชีวสารสนเทศศาสตร์โครงสร้าง ( rcsb ) เป็นผู้รับผิดชอบในการจัดการของ PDB . ในปี 2003การ wwpdb ก่อตั้งขึ้นเพื่อรักษาเอกสาร PDB เดียวโครงสร้าง macromolecular ข้อมูลที่เป็นอิสระและเปิดเผยต่อสาธารณชน ให้สังคมโลก ประกอบด้วยองค์กรที่ทำหน้าที่สะสม , การประมวลผลและการกระจายศูนย์ข้อมูล PDB .
นอกจากนี้ rcsb PDB สนับสนุนเว็บไซต์ที่ผู้เข้าชมสามารถดำเนินการได้ง่ายและซับซ้อนแบบสอบถามข้อมูล วิเคราะห์และเห็นภาพผลลัพธ์ รายละเอียดเกี่ยวกับ ประวัติความเป็นมา บทบาทหน้าที่ ความก้าวหน้า และเป้าหมายในอนาคตของ rcsb PDB สามารถพบได้ในรายงานของเรา และจดหมายข่าว
PDB ที่ปรึกษาสังเกตกำหนดเงื่อนไขการใช้ข้อมูลจาก PDB ที่เก็บถาวร นโยบายของเรา&อ้างอิงหน้าอธิบายข้อ จำกัด ลิขสิทธิ์บนวัสดุเส้นใย rcsb , นโยบายความเป็นส่วนตัวของเรา และข้อมูลอ้างอิง